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Frequências alélicas e Genotípicas e Lei de Hardy-Weinberg Genética de Populações Prof. Dr. Rafael Guimarães Departamento de Genética Universidade Federal de Pernambuco rafael.lguimaraes@ufpe.br quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Tristão da Cunha quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Tristão da Cunha • U m a p e q u e n a i l h a i s o l a d a geograficamente dos continentes • D e s c o b e r t o e m 1 5 0 6 p e l o navegador português Tristão da Cunha quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Tristão da Cunha • U m a p e q u e n a i l h a i s o l a d a geograficamente dos continentes • D e s c o b e r t o e m 1 5 0 6 p e l o navegador português Tristão da Cunha • Uma alta incidência de Asma na população dessa ilha quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Tristão da Cunha • U m a p e q u e n a i l h a i s o l a d a geograficamente dos continentes • D e s c o b e r t o e m 1 5 0 6 p e l o navegador português Tristão da Cunha • Uma alta incidência de Asma na população dessa ilha . quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Vila quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Estrutura populacional • A População apresenta muitos genes (alelos) em comum: – Poucos fundadores; – População pequena; – isolamento geográfico; – Desastres naturais; – Reprodução entre familiares. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Definição Genética de Populações • É o estudo da distribuição dos genes nas populações e de como a frequência dos genes e genótipos são mantidas ou alteradas. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Em outras palavras... quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Em outras palavras... • Quando se estuda a variação dos alelos na população, estamos avaliando a sua evolução. • Estuda a constituição genética de um grupo de indivíduos e a sua mudança ao longo do tempo. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Estrutura populacional • A População apresenta muitos genes (alelos) em comum: – Poucos fundadores; – População pequena; – isolamento geográfico; – Desastres naturais; – Reprodução entre familiares. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Estrutura populacional • A População apresenta muitos genes (alelos) em comum: – Poucos fundadores; – População pequena; – isolamento geográfico; – Desastres naturais; – Reprodução entre familiares. •Fixação do alelo para asma •Aumento da incidência para asma quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Estrutura populacional • A População apresenta muitos genes (alelos) em comum: – Poucos fundadores; – População pequena; – isolamento geográfico; – Desastres naturais; – Reprodução entre familiares. •Fixação do alelo para asma •Aumento da incidência para asma Ao#acaso!!## quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Em termos práticos estuda-se: • Variação genética... quarta-feira, 12 de dezembro de 12 O#QUÃO#VARIADOS#OS# ORGANISMOS#SÃO? Grau de Variabilidade... quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Variabilidade Genética Acaso Base de toda a evolução Adaptação quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Como se avalia? Análise das Frequências Alélicas Genotípicas quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Frequência Genotípica ! Somatório das frequências genotípicas: f (AA) = Número de indivíduos AA N f (Aa) = Número de indivíduos Aa N f (aa) = Número de indivíduos aa N f (AA) + f (Aa) + f (aa) = 1 !Somar o número de indivíduos que possuem o genótipo e dividir pelo número total de indivíduos da amostra (N); !Para lócus com 3 genótipos, calculamos: quarta-feira, 12 de dezembro de 12 EXEMPLO A1A1 A1A2 A2A2 880/1600 = 0,55 608/1600 = 0,38 112/1600 = 0,07 55% 38% 7% 100% quarta-feira, 12 de dezembro de 12 FREQUÊNCIA DOS GENÓTIPOS Proporção ou porcentagem dos indivíduos que pertencem a um dado genótipo A1A1 A1A2 A2A2 Total 55 38 7 100 0,55 0,38 0,07 1,00 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Cálculo da Frequência Alélica por Contagem Direta ! Contamos o número de cópias de um determinado alelo presentes em uma amostra e dividimos pelo número total de alelos na amostra. Frequência do alelo = Número de Cópias do Alelo o Número de Cópias de Todos os Alelos no Lócus ! Simbolicamente as frequências alélicas são representadas por “p” e “q” em lócus com dois alelos; ! Soma das frequências alélicas p e q sempre deve ser igual a 1. p + q = 1 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Cálculo da Frequência Alélica por Contagem Direta ! Em um lócus com dois alelos (A e a), as frequências podem ser calculadas por: p = f (A) = 2 nAA + nAa 2N q = f (a) = 2 naa + nAa 2N q = 1 - p Números(individuais(de( AA,(Aa(e(aa Dobro(do(número(total( de(indivíduos(diplóides ! Após ter sido obtido “p”, “q” pode ser determinado assim: quarta-feira, 12 de dezembro de 12 EXEMPLO quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Frequências alélicas Por frequência genotípica: p = f (A1A1) + ½ f (A1A2) q = f (A2A2) + ½ f (A1A2) Assim,#por#exemplo,#se#na#geração#inicial#dessa#população#teórica#os#genóEpos# em#discussão#Evessem#frequências#AA"="0,30,#Aa"="0,50"e#aa#="0,20# as# frequências# p# do# gene# A# e# q# de# seu# alelo# a,# nessa# geração,# seriam# iguais,# respecEvamente,#a#55%#e#45%,#pois:# p#=#0,30#+#0,25#=#0,55# q#=#0,20#+0,25#=#0,45#ou#q#=#1#–#0,55#=#0,45 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 • Quais as frequências alélicas e genptípicas? – AA = 50 – Aa = 40 – aa = 10 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Aplicação ! Duas populações humanas foram estudadas quanto aos grupos sanguíneos M (genótipo MM), MN (genótipo MN) e N (genótipo NN) do sistema MN e foram obtidos os seguintes dados: Amostra GenótiposGenótiposGenótipos TotalAmostra MM MN NN Total Xavantes 41 30 8 79 Brasileiros 30 50 20 100 ! Calcule as frequências genotípicas e alélicas para cada população. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Aplicação 0 15,0 30,0 45,0 60,0 Xavantes Brasileiros 20,0 10,1 50 38 30,0 51,9 Frequências,Geno/picas MM MN NN 0 0,200 0,400 0,600 0,800 Xavantes Brasileiros 0,450 0,291 0,550 0,709 Frequências,Alélicas M N quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exemplo • Os( anHgenos( do( grupo( sanguíneo( MN( humano( são( determinados(por(dois(alelos(codominantes,(LM(e(LN.(Os(Opos( sanguíneos( MN( e( os( correspondentes( genóOpos( de( 398( finlandeses(de(Kajarla(são(tabulados(aqui: 26 MM 182 MN 172 NN 44 Calcule(as(frequências(genoHpicas(e(alélicas quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! Genética de populações - entender o processo de formação de um pool gênico de uma população. ! Qual o efeito da reprodução e dos princípios Mendelianos nas frequências genotípicas e alélicas? ! Como a segregação dos alelos na formação dos gametas e a combinação dos alelos na fertilização influencia o pool gênico? Genética de Populações quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! Formulada independentemente por Godfrey H. Hardy e Wilhelm Weinberg em 1908; ! Modelo matemático que avalia o efeito da reprodução nas frequências alélicas e genotípicas; ! Faz várias suposições simplificadas sobre a população e fornece duasprevisões fundamentais. Lei de Hardy-Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! Para um lócus autossômico com dois alelos, a Lei de Hardy- Weinberg pode ser aplicada: Hipótese: se a população é grande, os cruzamentos são aleatórios e não são afetados por mutações, migração ou seleção natural. Predição 1 – frequências alélicas da população não mudam; Predição 2 – frequências genotípicas estabilizam-se depois de uma geração em uma proporção p2 (AA), 2pq (Aa) e q2 (aa), onde “p’’ corresponde a frequência do alelo A e ‘’q’’ do alelo a. p2 + 2pq + q2 Lei de Hardy-Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Acasalamento aleatório ... quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Freqüências dos genótipos após uma geração de acasalamento ao acaso 2 SPTZ Óvulo quarta-feira, 12 de dezembro de 12 As frequências dos genes são estáveis ou variam ao longo do tempo? quarta-feira, 12 de dezembro de 12 • Suposições cumpridas - reprodução sozinha não altera as frequências alélicas e genotípicas e as frequências alélicas determinam as frequências genotípicas; • Enquadramento a lei – uma geração de cruzamento aleatório; • Genótipos esperados – proporções p2, 2pq, e q2 – população em equilíbrio de Hardy-Weinberg; • Atingido o equilíbrio – frequências alélicas e genótipicas – não mudam – observância dos pressupostos da lei; Lei de Hardy-Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! População é grande: " Teoria - infinitamente grande; " Prática – grande o bastante para que os desvios das taxas esperadas não causem mudanças nas frequências alélicas; ! Cruzamento aleatório ! Frequência alélica não é afetada por seleção natural, migração e mutação. ! Único lócus: " Equilíbrio de Hardy-Weinberg para um lócus mas não para outros. Pressupostos da Lei de Hardy-Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! Primeira: A população não pode evoluir se ela atende as suposições da Lei, porque a evolução consiste alterar frequências alélicas de uma população, portanto a lei nos diz que a reprodução só não trará evolução. ! Segunda: Quando a população está em equilíbrio, as frequencias genotípicas são determinadas pelas frequencias alélicas; ! Para lócus com 2 alelos, a frequencia de heterozigotos é grande quando as frequências alélicas estão entre 0.33 e 0.66 e está no máximo quando a frequencia alélica para cada 0.5; ! A frequencia de heterozigotos também nunca excede 0.5 ! Terceira: Uma única geração de cruzamento aleatório produz o equilíbrio das frequencias p2, 2pq e q2; Implicações da Lei de Hardy-Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 ! Calculamos frequências alélicas e genotípicas; ! Calculamos as frequências genotípicas esperadas; ! Comparamos as frequências observadas e esperadas usando o teste do Qui-quadrado; ! Calculamos o grau de liberdade; ! Verificação do equilíbrio. Testando as Proporções de Hardy- Weinberg quarta-feira, 12 de dezembro de 12 APLICAÇÕES DO TEOREMA DE HARDY-WEINBERG Exemplo Com o emprego dos soros anti-M e anti-N foram determinados os grupos sangüíneos M, MN e N de uma amostra aleatória de 100 indivíduos de uma população, encontrando-se os seguintes valores: M=30%, MN=50% e N=20% quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exemplo MM(((((((MN(((((((((((NN(((((((((TOTAL (( (30( ((((50(((((((((((20( (((((((((((100(( ( quarta-feira, 12 de dezembro de 12 a) Quais as frequências dos alelos M e N dessa amostra? b) Pode-se considerar que essa amostra está em equilíbrio de Hardy-Weinberg com relação aos grupos sangüíneos M, MN e N? c) Qual o percentual de casais heterozigotos MN x MN que devemos esperar na população representada pela amostra? quarta-feira, 12 de dezembro de 12 a) Quais as frequências dos alelos M e N dessa amostra? MM MN NN TOTAL 30 50 20 100 0,55 200 110 200 5060 alelosdetotalNº MalelosdeNº p == + == Frequência alélica quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Cont. q#+#p#=#1 0,45#+#0,55#=#1 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Frequência genotípica observada quarta-feira, 12 de dezembro de 12 MM(((((((MN(((((((((((NN(((((((((TOTAL ((30((((((50(((((((((((((20(((((((((((((100(( ( Grupo N observado Freqüência observada Freqüência Genotípica Esperada M 30 0,3 P2 MN 50 0,5 2pq N 20 0,2 q2 Total 100 1 p2+2pq+q2=1 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Freq.(GenoHpica(Esperada N Esperado P2=(0,552)=0,3025 Np2 =100(0,552)=30,25 2pq=2(0,55)(0,45)=0,4950 N2pq =49,50 q2=(0,45) 2=0,2025 Nq2 =20,25 1 100,00 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Comparação Grupo N observado N Esperado Diferença (Diferença)2 M 30 30,25 0,25 0,0625 MN 50 49,50 0,5 0,25 N 20 20,25 0,25 0,0625 Total 100 100,00 1 0,375 quarta-feira, 12 de dezembro de 12 c) Qual o percentual de casais heterozigotos MN x MN que devemos esperar na população representada pela amostra? MN = 2pq = 2(0,55)(0,45) = 0,4950 MN x MN = 0,495 x 0,495 = 0,2450 Resposta: 24,50% quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Aplicação • Jeffrey Mitton e seus colegas encontram três genótipos (R2R2, R2R3 e R3R3) em um lócus codificante por uma enzima peroxidase em árvores de pinheiro crescidas no Colorado. Os números observados destes genótipos no Lago Glacial do Colorado, foram: • Será que o lócus de peroxidase nesta população está em equilíbrio de Hardy-Weinberg. GenóOpos Números(Observados R2R2 135 R2R3 44 R3R3 11 Aplicação quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exercício(1 1.(Em(uma(população,(as(frequências(genoHpicas(absolutas(são(as(seguintes:( AA(Aa(aa( 100(300(380( Responda:( a)quais(são(as(freqüências(alélicas(e(genoHpicas(relaOvas?( b)esta(população(está(em(equilíbrio(de(HardydWeinberg(com(relação(a(este(par(de( alelos?( c)qual(é(a(freqüência(esperada(de(cruzamentos(AA(x(aa(?( quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exercício(2 Numa(população(infinitamente(grande,(em(que(os(cruzamentos(ocorrem(ao(acaso,(a( frequência(do(alelo(dominante(autossômico(é(de(0,6.(A(frequência(dos(indivíduos( heterozigotos((Aa)(para(esse(gene,(nesta(população,(é(de: quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exercício(3 3.(Um(total(de(6.129(caucasianos(nortedamericanos(foram(Opados(quanto(ao(locus( de(Opo(sanguineo(MN,(que(é(determinado(por(dois(alelos(codominantes,(LM(e(LN#.( Foram(obOdos(os(seguintes(dados: Tipo(Sanguineo((((((((((((((Número ((((((((M(((((((((((((((((((((((((((((1.787 ((((((((MN((((((((((((((((((((((((((3.039 (((((((((N((((((((((((((((((((((((((((1.303 Responda: Há(atuação(de(fatores(como(migração,(seleção(natural(ou(mutação(alterando(as( frequências(relacionadas(a(esse(caráter?(JusOfique. quarta-feira, 12 de dezembro de 12 Exercício(4 4.(Em(uma(população(de(ovinos,(um(gene(causador(de(dificuldades(na(reprodução( foi(analisado,(os(números(de(indivíduos(portadores(de(cada(genóOpo(foram(os( seguintes: A1A1#–(135(indivíduos A1A2(–(44(indivíduos A2A2(–(11(indivíduos Quais(as(frequências(alélicas,(genoHpicas(e(a(população(está(em(equilíbrio(de(Hd W? quarta-feira, 12 de dezembro de 12
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