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PRESERVAÇÃO DE CULTURAS MICROBIANAS UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ DEPARTAMENTO DE BIOLOGIA OBJETIVOS Discutir sobre diversos métodos de conservação de micro-organismos. Demonstrar alguns procedimentos de preservação para fungos e bactérias. INTRODUÇÃO Uma vez obtida uma cultura satisfatória, a mesma deve ser mantida pura e viável e para isso é preciso: transferir periodicamente a cultura em um meio de cultura adequado (repiques). incubar até que a cultura atinja a fase máxima de crescimento (final da fase logarítmica, início da fase estacionária). estocar em temperatura apropriada para impedir maior crescimento (concentração de células recomendada = 108 1010 céls/mL). INTRODUÇÃO A manutenção e preservação de culturas puras no laboratório apresentam grande importância. Manter a bacterioteca requer técnicas especializadas com objetivo de preservar as bactérias viáveis e com suas características típicas por meses (manutenção) ou anos (preservação). Isolamento e melhoramento são processos caros. Vantagens de manter culturas-estoques As culturas estão disponíveis para repique sem interferir nas culturas-estoques. Método pode ser aplicado para colônias ou biomassa de culturas. Nenhum selamento com rolhas de borracha é necessário. Nenhum equipamento especial é requerido. As primeiras tentativas de Coleções de Culturas remontam o início do século XX, por um professor tcheco (Frantisesk Kral). Em 1915, sua coleção foi transferida para a Universidade de Viena e perdeu-se toda na Segunda Guerra Mundial. Exceto o que havia sido levado para Chicago. Em 1970, foi formada a World Federation of Culture Collections com informações de 329 coleções de 52 países. INTRODUÇÃO Objetivos da Preservação Um dos objetivos principais da conservação evitar a formação excessiva de mutações que mudem as características do micro-organismo. O repique contínuo pode gerar mutações. ↓ número de gerações filhas dos micro-organismos conservados permitem que não haja grande variação da célula-mãe. Conservar micro-organismos selecionados e melhorados geneticamente de forma a evitar a perda da modificação. Além de evitar mutações indesejáveis, também favorece a máxima preservação da vitalidade das células e o bom número de células viáveis. Importância de uma Coleção de Culturas Pesquisa Indústria / Biotecnologia Ex: fermentações Valor didático No caso de um laboratório acadêmico, a tendência é comprar espécies “padronizadas”, utilizá-las para fins didáticos, e eventualmente manter uma bacterioteca e uma micoteca. Problemas com o cultivo Contaminação Perda de viabilidade Mutação Resíduos metabólicos Solução: metodologia de preservação Diminuir o crescimento e as atividades metabólicas Manipulação de fatores ambientais: Meio de cultura Temperatura pH Aeração, etc. Meio mínimo Preservação em longo prazo: Evita problemas com novo isolamento. Economia de tempo, mão de obra e custos. A composição do meio de cultura pode afetar a resistência da célula. Meio rico x meio pobre. Meio pobre: evita o crescimento acelerado e geração de mutantes indesejáveis. É um sinal para reorganização do metabolismo da célula estocagem de energia em alguns casos o meio de cultivo rico é recomendado por causa da percentagem de células viáveis ser maior em relação ao meio pobre. Acúmulo de proteínas, carboidratos e lipídios podem também aumentar a resistência das células ao tratamento por liofilização. Escolha do método de preservação PONTOS A SEREM CONSIDERADOS: Manutenção da viabilidade. Manutenção das propriedades originais. Custos de preservação e manutenção. Tamanho estimado do acervo. Importância do acervo. Necessidade de acesso e uso da cultura. Disponibilidade de equipamentos e de recursos humanos e financeiros. Métodos de preservação CURTO PRAZO: Repique contínuo MÉDIO PRAZO: Preservação sob óleo mineral Preservação em água (método de Castellani) Congelamento a -20°C Secagem em solo Secagem em papel de filtro Secagem em sílica LONGO PRAZO: Liofilização Congelamento a -80°C Criopreservação em nitrogênio líquido Repique contínuo Princípio: Diminuição do metabolismo. Fatores a serem considerados: Meio adequado. Temperatura de estocagem. Frequência entre as transferências. Minimizar o n° de repiques. Examinar a pureza em cada transferência. Conservar em duplicata. Repique contínuo Repique contínuo Vantagens Baixo custo. Não requer equipamentos especializados. O manuseio é simples. Desvantagens Riscos de contaminação e possível perda da linhagem. Perda de características morfológicas, fisiológicas ou patogenicidade. Seleção de células atípicas (variantes ou mutantes). Mão-de-obra. Espaço relativamente grande para a armazenamento. Preservação em água (Castellani) Princípio: Diminuição da atividade metabólica Fatores a serem considerado (Castellani): Espessura do ágar Número de blocos na água Blocos de ágar de 4-6 mm3 Preservação em água (Castellani) Geladeira Blocos de ágar de 4-6 mm3 10-15 mL água destilada esterilizada Preservação em água (Castellani) VANTAGENS boa taxa de viabilidade evita contaminação por ácaros DESVANTAGENS limitado a organismos que aderem ao ágar (Castellani) dificuldade da retirada dos cubos na reativação (Castellani) crescimento durante a estocagem requer espaço para armazenamento riscos de contaminação armazenamento em geladeira Preservação em óleo mineral Princípio: Diminuição da atividade metabólica Preservação sob óleo mineral Tubo em camada alta Preservação em óleo mineral Preservação em óleo armazenamento em geladeira Princípio diminuição da atividade metabólica Vantagens ↓ custo de equipamento evita contaminação por ácaros Desvantagens necessidade de mais transferências até que a cultura revigore requer espaço para armazenamento OBS: quando micro-organismos são submetidos a uma temperatura inferior à mínima de crescimento, ainda conseguem sobreviver, já a temperatura acima da máxima, tem efeito letal. Os micro-organismos permanecem vivos em estado latente a baixas temperaturas por longos períodos de tempo. Secagem Princípio: Diminuição do metabolismo por desidratação e conservação em geladeira. Fatores a serem considerados: Tipo de célula Idade da cultura Concentração celular Condições de estocagem Secagem Vantagens Simples e de baixo custo Não requer equipamento especial Estabilidade elevada Ácaros não sobrevivem Desvantagens Métodos limitados a bactérias e fungos filamentosos esporulados Risco de contaminação devido ao manuseio sucessivo Papel: poucos dados sobre o sucesso do método PRESERVAÇÃO EM SOLO PRESERVAÇÃO EM SOLO Secagem em discos ou tiras de papel Vantagens: simples e de baixo custo não requer equipamento especial estabilidade elevada Desvantagens risco de contaminação devido ao manuseio sucessivo Secagem em discos ou tiras de papel PRESERVAÇÃO EM SÍLICA GEL Métodos de Longo Prazo: Liofilização e congelamentos em ultrafreezer e N2 líquido Princípio: Remoção da água por sublimação (liofilização)Indução da dormência do micro-organismo Armazenamento a - 80°C e -196 °C Liofilização Princípio Remoção da água por sublimação Fatores a serem considerados Tipo de células Idade da cultura Concentração celular Agentes crioprotetores Condições de estocagem Método de reidratação Liofilização Agentes crioprotetores Reduzem danos durante o congelamento e descongelamento Estabilidade ao micro-organismo contra os efeitos adversos da estocagem • Leite desnatado (skim milk) 10% • Leite desnatado 10% + inositol 5% • Sacarose 7% + peptona 7% • Inositol 5% em soro de sangue de cavalo Liofilização 3 mL Skim Milk Cultura pura 0,2 mL na ampola Maçarico Liofilizador Maçarico Liofilização - reativação Liofilização Vantagens Vedação total da amostra Longa viabilidade Estabilidade elevada em muitas espécies Produção em larga escala Não requer armazenamento especial (somente ao abrigo da luz) Fácil distribuição e transporte Desvantagens Muitas espécies não sobrevivem ao processo Viabilidade ocasionalmente insatisfatória Mão-de-obra especializada Requer equipamentos sofisticado Congelamento em ultrafreezer Princípio Indução da dormência do micro-organismo Armazenamento a - 80˚C Fatores a serem considerados Tipo de micro-organismo Idade da cultura Concentração celular Agente crioprotetor (dimetilsufoxido 10%; glicerol 10% ou concentração maior) Condições de estocagem Método de descongelamento Congelamento 10 mL Fungos filamentosos não esporulados Bactérias, arqueas e leveduras Fungos filamentosos esporulados 7 mL 1 mL 1 mL 1 mL Congelamento em nitrogênio líquido Princípio Indução da dormência do micro-organismo armazenamento a - 196˚C Fatores a serem considerados tipo de micro-organismo idade da cultura concentração celular agente crioprotetor condições de estocagem método de descongelamento Congelamento em nitrogênio líquido Congelamento em nitrogênio líquido Vantagens Condições estáveis por longos períodos Vedação completa, evitando contaminação Utilização para esporulados e não esporulados Desvantagens Viabilidade ocasionalmente insatisfatória Requer equipamento sofisticado Suprimento contínuo de N2 Boa infra-estrutura – caso de acidentes de vazamento Controle de qualidade da preservação Contagem de população viável antes e após preservação. Determinar a taxa de mortalidade do micro-organismo específico no protocolo utilizado. Aplicável a métodos de médio e longo-termo. Imprescindível para garantia de preservação de longo-termo. Viabilidade. Primeira: até um mês após o processamento. Segunda: anualmente. Controle de qualidade de preservação Suspensão de células em crioprotetor 0,1 mL 0,1 mL 0,1 mL 0,1 mL (10-8) (10-6) (10-4) (10-2) 9,9 mL água + 0,1% ágar 10-2 10-4 10-8 10-6 no de células mL-1 inoculados na ampola = (no de colônias em 0,1 mL = 3 gotas) x 10 x (fator de diluição) UFC/mL Coleções de Cultura de Referência Cepas de referência Provedores de cepas de referência: ATCC (American Type Culture Collection). CECT (Colección española de cultivos tipos). CNCM (Collection Nationale de Cultures de Microorganismes) lNSTITUT PASTEUR Segunda opção: Provedores creditados por ISO 9001 que realizam repiques a partir cepas adquiridas em coleções reconhecidas.
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