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1 UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS DEPTO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR ENZIMAS 1. Faça a distinção entre os modelos chave-fechadura e encaixe-induzido para a ligação do substrato a uma enzima, relacionando-os com os diferentes tipos de especificidade. 2. No gráfico de Michaelis-Menten mostre as regiões que denotam reações de 1a ordem e de ordem zero. Explique 3. Para uma enzima que manifesta a cinética de Michaelis-Menten, qual é a velocidade da reação, V (em percentagem de Vmáx), observada em: (a) [S] = Km; (b) [S] = 0,5 Km e (c) [S] = 10 Km. 4. Determine os valores de Km e Vmáx para a descarboxilação de um -cetoácido a partir dos seguintes dados: [S] (moles L -1 ) Velocidade (mM min -1 ) 2,500 0,588 1,000 0,500 0,714 0,417 0,526 0,370 0,250 0,256 5. Uma enzima segue a cinética de Michaelis-Menten. Diga como os parâmetros cinéticos seriam alterados, ou se não seriam se for o caso, pelos fatores listados abaixo. Km Vmáx Nenhum Ambos Inibidor competitivo Inibidor incompetitivo Inibidor não- competitivo Agente desnaturante (urea 6 M) Aumento da [S] 6. O oxaloacetato é substrato da oxalacetato desidrogenase. Analisando as estruturas a seguir, responda: 2 a. Por que o oxalato é um potente inibidor dessa enzima? Qual o tipo de inibição observada? b. Desenhe um gráfico hipotético de velocidade da reação (Vo) da oxaloacetato desidrogenase em função da concentração de substrato [S] para as reações na ausência e presença do inibidor. c. Desenhe o gráfico de duplos recíprocos que permite determinar Km e Vmáx nos dois casos (ausência e presença de oxalato), indicando como é possível obter esses valores cinéticos a partir do gráfico. 7. Para a seguinte reação da aspartase na presença do inibidor hidroximetilaspartato, identifique o tipo de inibição e cite 3 características desse tipo de inibição. [S] M V (sem inibidor) M min -1 V, (com inibidor) M min -1 1 x 10 -4 0,026 0,010 1,5 x 10 -4 0,136 0,086 2,5 x 10 -4 0,150 0,120 5 x 10 -4 0,165 0,142 8. O metanol é altamente tóxico porque no organismo humano ele é convertido em formaldeído numa reação catalisada pela álcool desidrogenase: NAD + + metanol NADH + H+ + formaldeído Parte do tratamento médico para envenenamento com metanol é administrar ao paciente etanol em grandes quantidades. Por que esse tratamento é indicado para o caso. Justifique. 9. A lactato desidrogenase catalisa a reação reversível de transformação do piruvato em lactato (ver reação abaixo). Em um teste de laboratório, foi utilizado lactato como substrato e NAD + como cofator, havendo a formação de NADH + H + que absorve a 340 nm. Essa reação foi realizada em 4 condições diferentes, conforme mostrado no gráfico que se segue. Observando os resultados, responda: a) Que tipo de informação pode ser obtida pelas curvas abaixo? b) Quais são as possíveis modificações que foram realizadas entre as experiências 1, 2, 3 e 4 para que os resultados fossem diferentes? Justifique sua(s) resposta(s). 3 10. Uma enzima foi representada esquematicamente (abaixo), onde a localização espacial de seus resíduos do sítio ativo foi numerada de I a VII. As posições desses resíduos na cadeia polipeptídica estão indicadas ao lado. Essa enzima somente é ativa quando fosforilada. O mapeamento dos sítios ativo e de fosforilação da enzima foi possível através dos efeitos causados pelas mutações descritas em a, b, c e d. Através da análise das mutações, descreva quais resíduos estão envolvidos nos sítios ativo, de ligação de substrato e de fosforilação. 4 a. O resíduo II foi modificado para glutamina: O substrato se liga na enzima, mas ela tornou-se inativa. b. O resíduo VII foi modificado para arginina: a enzima passou a catalisar a reação com outro substrato. c. O resíduo V foi modificado para alanina e a enzima continuou catalisando a reação com o substrato original, mas com um perfil cinético diferente da enzima nativa. O resultado dessa mudança está mostrado no gráfico a seguir: d. Quando o resíduo VIII foi modificado para fenilalanina, a enzima tornou-se inativa. 11. A atividade de uma enzima foi determinada em uma solução tampão a pH 7,5 em diferentes valores de temperatura, sendo que o perfil obtido para a atividade em função da temperatura encontra-se no gráfico a seguir. Explique o que está ocorrendo nos pontos A, B e C indicados no gráfico, relacionando estrutura e função. 5 12. O efeito do pH na enzima da questão anterior foi estudado à temperatura constante de 37 oC (ver gráfico a seguir). Como ficaria esse gráfico caso o mesmo experimento fosse realizado a 25 o C? E a 60 o C? Desenhe os gráficos solicitados nesse mesmo gráfico. 13. Mostre graficamente a dependência da velocidade da reação em relação à concentração de substrato para uma enzima que segue a cinética de Michelis-Menten e para uma enzima alostérica. Comente as principais características dos dois modelos.
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