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UNIVERSIDADE FEDERAL DO CEARÁ CENTRO DE CIÊNCIAS DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA E BIOLOGIA MOLECULAR BACHARELADO EM BIOTECNOLOGIA Biofísica Atividade extra Ana Letícia Alex Martins Camila Sillos Samuel Castro Victor Gabriel FORTALEZA 2017 Biofísica Página 1 Questão 1: Questão 2: Carga do íon m/z +28 913,1152 +27 946,7591 +26 983,3605 +25 1022,5803 +24 1065,1986 +23 1111,4161 +22 1161,0470 +21 1217,1180 +20 1278,0426 +19 1345,1819 Biofísica Página 2 Questão 3: M = (m/z)xn –nH M = (946,9733 x 20) – 20x1 M = 18919,466 Da. Questão 4: M = (m/z)xn –nH M = (545x2) –2x1 M = 1088 Da. Questão 5: Para definir o íon imônio presente no espectro deve-se analisar os picos com baixa massa e comparar a m/z desses picos com a coluna da tabela correspondente ao íon imônio. Feito isso, obteve-se: Com 88 o íon imônio correspondente é o Ácido Aspártico. Na m/z 120, o íon correspondente é a Fenilalanina. Por fim, a m/z 129 corresponde ao resíduo Arginina. Questão 6: É possível estimar pela massa obtida de quantidades de aminoácidos que formam o peptídeo a espectrometria de massas. Pois, pode-se tirar a média de todos os aminoácidos a desejar devida a massa total do peptídeo por essa média, uma MS/MS é feita desse maneira, determinando-se sua possibilidade. Questão 7: Para o sequenciamento deve ser considerada a diferença de massa/carga entre os picos desde o íon pai utilizando a coluna de massa monoisotópica para determinar os aminoácidos. Do íon pai ao início do espectro é determinada a sequencia do N para o C terminal, a massa final deve corresponder ao aminoácido que a enzima cortou no peptídeo. Sequência: P – V – N – Q – F – F- I/L –D – Q Biofísica Página 3 503,38 – 356,26 = 147,12 (Fenilalanima) -> F 356,26 – 243,15 = 133,11 (Isoleucina/Leucina) -> I/L 243,15 -128,10 = 115,05 (Ácido aspártico) - > D 128,10 – 0= 128,10 (Glutamina) -> Q
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