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UNIDADE IX ELETROFORESE 1 Prof. Me. Augusto César R. Araújo UNIDADE IX Eletroforese 2 PRINCÍPIOS DA TÉCNICA FATORES QUE INFLUENCIAM A ELETROFORESE TIPOS DE ELETROFORESE APLICAÇÕES DA ELETROFORESE PRINCÍPIOS DA TÉCNICA 3 Princípios da Técnica • Um dos métodos mais utilizados em laboratório de bioquímica e biologia molecular; • Consiste em uma técnica de separação de componentes de um sistema através da aplicação de CAMPO ELÉTRICO; • Migração e separação de moléculas ionizadas ao se aplicar um diferença de potencial elétrico segue a lei de Coulomb. • Separação se processa em função da CARGA e do PESO MOLECULAR. 4 Princípios da Técnica • Componente negativos migram para lado positivo; • Componente positivos migram para o lado negativo; • Partículas de cargas diferentes – Análise Qualitativa; • Partículas de mesma carga – Análise Quantitativa; • Proteínas – Anfóteras ( requerendo utilização de sistema tampão); 5 Princípios da Técnica 6 Princípios da Técnica 7 Princípios da Técnica 8 FATORES QUE INFLUENCIAM A ELETROFORESE 9 Fatores que influenciam a eletroforese • Todos os fatores irão influenciar na velocidade de arraste, ou seja, na MOBILIDADE das partículas: pH do meio; pI ou pK das substâncias; Eletrólitos utilizados; Interações com fase fixa; Temperatura; 10 TIPOS DE ELETROFORESE 11 Tipos de Eletroforese 1. Eletroforese em Placa de Gel ( Papel Filtro – Celulose – Agarose – Poliacrilamida); 2. Eletroforese em Disco; 3. Eletroforese por Focalização Isoelétrica; 4. Eletroforese Bidimensional; 5. Técnicas de Blotting ( Southern – Northern – Western); 6. Eletroforese Capilar; 12 Tipos de Eletroforese • Eletroforese em Placa de Gel De acordo com tipo de suporte Papel filtro; Acetato de celulose; Gel de Agarose; Gel de Poliacrilamida. 13 SÓLIDO SEMI-SÓLIDO Tipos de Eletroforese Papel Filtro Umas das primeiras técnicas utilizadas; Eficiente para separação de partículas com grande diferença de cargas; Separação de proteínas (composição de diferentes aminoácidos); Entrou em desuso pela baixa reprodutibilidade. 14 Tipos de Eletroforese Papel Filtro 15 Tipos de Eletroforese Acetato de Celulose Método mais prático e econômico; Tem a vantagem de ser quimicamente mais homogêneo e tornar-se transparente; Permite excelente grau de separação e quantificação de frações proteicas; Fácil manipulação e rapidez na análise. 16 Tipos de Eletroforese • Gel de Agarose Polissacarídeo extraído de algas marinhas; Polimerização mais rápida e o gel pode ser reciclado; Evita que suporte fique mole para ser utilizado; Utilizado para proteínas de alto peso molecular; 17 Tipos de Eletroforese • Gel de Agarose Eletroendosmose Interferência no campo elétrico pelas cargas negativas no Agar que é o componente do gel de agarose; Gera dificuldade no processo de separação das frações de proteínas; Para se reduzir este efeito deve-se utilizar agarose hiper- purificada. 18 Tipos de Eletroforese Gel de Poliacrilamida (PAGE) Surgiu a partir de uma polimerização vinílica da acrilamida e bisacrilamida; Características melhoradas de densidade, elasticidade, transparência e tamanho dos poros; Mais utilizado em pesquisa por conta do custo (melhor resolução). 19 Tipos de Eletroforese Gel de Poliacrilamida (SDS-PAGE) SDS – Dodecil sulfato de sódio Desnaturação das proteínas - Romper as interações não covalentes entre as subunidades de proteína. Mede com precisão a massa de uma subunidade proteica ao invés da proteína intacta. 20 Tipos de Eletroforese Revelação Eletroforese em gel Azul brilhante de Comassie; Coloração com Prata; Fluorescamina. Brometo de Etídio 21 Tipos de Eletroforese • Eletroforese em Disco Eletroforese com pH descontínuo; Utiliza 2 géis ( Gel de corrida e o gel de empilhamento) e vários tampões; Movimentam da extremidade superior para inferior . pH descontínuo porque os íons ao migrarem para gel de empilhamento encontram um pH diferente do pK, adotando forma neutra e portanto imóveis; 22 Tipos de Eletroforese • Eletroforese em Disco • Ocorre uma migração dos íons macromoleculares até encontrarem região contendo os íons do tampão do gel de empilhamento, com isso uma diminuição da velocidade. • É chamada em disco porque os íons macromoleculares ao chegarem no gel de corrida empilhados formam bandas ou disco estreitos que são ordenados de acordo com a mobilidade. 23 Tipos de Eletroforese • Eletroforese em Disco 24 Tipos de Eletroforese • Eletroforese por Focalização Isoelétrica (IEF) • Separação de compostos anfóteros (grupos funcionais positivos e negativos na molécula); • Ponto Isoelétrico – Valor de pH com carga elétrica nula; • Migração irá ocorrer para uma zona onde o pH = pI da proteina; • Nesse ponto a carga da proteína zera e a migração cessa. 25 Tipos de Eletroforese • Eletroforese por Focalização Isoelétrica 26 Tipos de Eletroforese • Eletroforese Bidimensional Estudar famílias de proteínas e pesquisar diferenças genéticas ou de doenças ; Estudar conteúdo proteico das células; Usa a técnica IEF dependente de carga na 1ª dimensão; Usa a eletroforese dependente de peso molecular na segunda dimensão; 27 Tipos de Eletroforese • Técnicas Blotting - Southern Blotting Edward Southern – 1975; Amplamente utilizada em Biologia Molecular; Blotting - Transferência Identifica sequência específica de DNA - Determinar a presença, a posição e o número de cópias de um gene em um genoma; 28 Tipos de Eletroforese • Técnicas Blotting - Northern Blotting Analogia a técnica anterior; Separar e detectar RNAm; • Técnicas Blotting - Western Blotting Separar, detectar e identificar uma ou mais proteínas em uma mistura complexa; 29 Tipos de Eletroforese • Técnicas Blotting - Western Blotting Também chamada de protein blotting ou immunoblotting; Imunodetecção de proteínas após a separação destas por eletroforese em gel e transferência para uma membrana adsorvente; Detectar, Caracterizar e quantificar as múltiplas proteínas. 30 Tipos de Eletroforese • Técnicas Blotting - Western Blotting (Vantagens) Membrana úmidas não maleáveis Fácil manuseio; Proteínas imobilizadas são rapidamente e uniformemente acessíveis a diferentes ligantes; Pequena quantidade de reagente é necessário para análise de transferência; A mesma proteína isolada pode ser usada em múltiplas analises. 31 Tipos de Eletroforese • Eletroforese Capilar Técnica mais recente a ser utilizada; É uma modificação de uma técnica clássica utilizando um tubo capilar de sílica fundida de diâmetro interno pequeno. Tubocapilar irá atuar como câmara eletroforética capilar; 32 Tipos de Eletroforese • Eletroforese Capilar - Vantagens Permite maior dissipação de calor ao aplicar altas voltagens; Permite excelente grau de separação e quantificação de frações proteicas; Reduz o tempo de separação ( em torno de 1 minuto). 33 Tipos de Eletroforese • Eletroforese Capilar 34 Tipos de Eletroforese • Eletroforese Capilar 35 APLICAÇÕES DA ELETROFORESE 36 Aplicações da eletroforese Análise de enzimas, proteínas e ácidos nucléicos; Estudos de taxonomia (classificação biológica); Bioquímica, fisiologia e genética humana, de plantas, animais e microorganismos; Caracterização de fitopatógenos; Amplificação de DNA (PCR). 37 Aplicações da eletroforese • Hemoglobina Hemoglobina –Proteína de estrutura quaternária presente nas Hemácias composta de 4 cadeias de globulinas e um grupo heme; Hemoglobina A – 95% hemoglobina em adultos (2α e 2β); Hemoglobina A2 – 3% hemoglobina em adultos (2α e 2δ); Hemoglobina F – 2% hemoglobina em adultos(2α e 2γ) produzida durante a gestação; 38 Aplicações da eletroforese • Hemoglobina 39 Aplicações da eletroforese • Hemoglobinopatias Grupo heterogêneo de doenças causadas por uma interrupção do padrão normal de expressão dos genes; Variantes estruturais em que a mudança na estrutura da Hb se dá pela substituição de um aminoácido em uma de suas cadeias polipeptídicas; Por deficiência de síntese ou talessemias em que ocorre um desequilibrio na produção de uma ou mais cadeias de globulinas. 40 Aplicações da eletroforese • Hemoglobinopatias - Anemia Falciforme (HbS) 41 Aplicações da eletroforese • Hemoglobinopatias - Talessemia beta menor 42 Aplicações da eletroforese Hemoglobinopatias - Talessemia beta maior 43 Aplicações da eletroforese • Inflamação Aguda 44 Aplicações da eletroforese • Hepatites Virais 45 Aplicações da eletroforese • Mieloma múltiplo 46 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 47 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 1) Sobre o processo de eletroforese assinale a alternativa incorreta: a) Técnica se processa sob aplicação de campo magnético. b) Separação ocorre em função da carga e do peso molecular. c) Ao se analisar partículas de mesma carga estamos efetuando uma análise qualitativa. d) Proteinas somente apresentam carga negativa e não requerem solução tampão. 48 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 2) Diversos fatores podem influenciam na mobilidade das partículas, exceto: a) pH do meio b) pK da substância c) Pressão d) Temperatura e) Interações com fase fixa 49 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 3) De acordo com o conceito a seguir identifique qual o tipo de eletroforese: Durante processo de eletroforese de proteinas pode desenvolver eletroendosmose a) Eletroforese em gel de poliacrilamida b) Eletroforese bidimensional c) Eletroforese em papel filtro d) Eletroforese em gel de agarose e) Eletroforese capilar 50 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 4) De acordo com o conceito a seguir identifique qual o tipo de eletroforese: Migração irá ocorrer para uma zona onde o pH = pI da proteina. a) Eletroforese em gel de poliacrilamida b) Eletroforese bidimensional c) Eletroforese em papel filtro d) Eletroforese em gel de agarose e) Eletroforese por Focalização Isoeletrica 51 EXERCÍCIOS DE FIXAÇÃO 5) Existe um família de eletroforese chamada de técnicas blotting. Assinale a alternativa correta a) Southern Blotting identifica sequência de RNAm b) Northern Blotting identifica sequência de DNA c) Northern Blotting identifica sequência de RNAm d) Southern Blotting identifica sequência de proteínas e) Western Blotting identifica sequência de DNA 52
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