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Resumo P3 – Genética Variabilidade genética e processos metabólicos Mutação Mutação genômica: alteração no número de cromossomos Mutação cromossômica: alteração na estrutura dos cromossomos Mutação gênica: alteração em genes individuais Mutação molecular: altera o material genético, a sequência de nucleotídeos Mutação evolutiva: variabilidade genética, adaptação a novos ambientes Mutante: organismo que apresenta um novo fenótipo resultante da presença de mutação. Mutação ocorre em: Células somáticas: que fazem replicação mitótica Células germinais: que fazem replicação meiótica A mutação pode ocorrer de forma espontânea (decorrente do funcionamento da célula) ou induzida (exposição a agentes mutagênicos). Genotipagem: identificação dos genes e dos alelos Sequenciamento: identificação dos nucleotídeos Projeto HapMap: diversidade do genoma nas diversas populações Variações genéticas: Mutações: variação presente em frequência muito baixa Polimorfismo: variação genética mais comum. SNP: polimorfismo de nucleotídeo único; podem alterar a função ou a transcrição dos genes. Mutação sinônima: não altera aminoácido (código degenerado) Mutação com sentido trocado não conservativa: altera aminoácido e função da proteína Mutação com sentido trocado conservativa: altera aminoácido sem alterar a função da proteína Mutação sem sentido: surge um stop códon Mutação se janela de leitura ou frameshift: deleção ou inserção de nucleotídeos em número diferente de 3 ou seus múltiplos Tipos de mutação: Transição: troca uma base nitrogenada de purina para purina ou de pirimidina para pirimidina (A-G ou C-T). Transversão: troca uma base nitrogenada purina para uma pirimidina e vice-versa (A-C; A-T; G-C; G- T). Deleção: retirada de parte da sequência de bases Inserção: acrescenta novas bases na sequência. Inversão: parte da sequência de bases é quebrada em duas extremidades, gira, e é ressoldada. Desaminação: Citosina perde uma Amina e torna-se uma Uracila Depurinação: perda de toda a base nitrogenada Reparo de DNA BER: Reparo por Excisão de base: repara uma única base com defeito NER: Reparo por Excisão de Nucleotídeos: repara uma sequência de nucleotídeos com defeito. Mecanismos que aumentam a taxa de mutação: Hot spots: regiões preferenciais para mutação Polimerases-mutases: sintetizam DNA com alta taxa de erro Duplicação gênica: aumenta o genoma e gera diversidade biológica Repetições em Tandem: sequência de códons idênticos repetidos diversas vezes. Nomenclatura Substituição de aminoácidos: letra que abrevia o aminoácido original, número do códon, letra que abrevia o aminoácido novo. Substituição de nucleotídeos: letra da base original, número da posição, letra da base nova. Deleções e inserções: abreviatura del para deleção e ins para inserção (6232-6236del: deleção do nucleotídeo 6232 até 6236; 409-410insC: inserção de C entre nucleotídeo 409 e 410) Alterações do metabolismo: base molecular, bioquímica e de herança das doenças genéticas. Erros inatos do metabolismo (EIMs) Distúrbios bioquímicos, determinados geneticamente, pelos quais as mutações prejudicam a síntese, o processamento ou as associações moleculares das proteínas. Padrões de herança Autossômica recessiva (AR): expressam-se somente em indivíduos homozigotos (dois alelos mutantes) Autossômica dominante (AD) Ligada ao cromossomo X recessivo (XR) Ligada ao cromossomo X dominante (XD) Defeitos de transporte: transporte anormal de líquidos e eletrólitos através das membranas apicais epiteliais, perda da função do cloreto. Ex.: Fibrose cística. Distúrbios de proteínas estruturais: perda da forma e consequentemente da função. Ex.: anemia falciforme. Defeitos nas proteínas receptoras: defeito nas proteínas da membrana celular que controlam a entrada de moléculas na célula. Ex.: Hipercolesterolemia (LDL) Doenças envolvendo enzimas: bloqueio enzimático. Ex.: Fenilcetonúria Acúmulo de substrato: Deficiência da enzima oxidase gerando acumulo prejudicial de substrato. Ex.: Alcaptonúria Fibrose cística Herança: autossômica recessiva (AR) Gene: CFTR Alteração fisiológica: Aumento da concentração de Na+ e Cl- no suor Duas características clínicas: Doença pulmonar crônica; beijo salgado Anemia falciforme Herança: autossômica recessiva (AR) Gene: HbS e HbA Alteração fisiológica: deformação da hemácia e adquire aspecto de foice. Duas características clínicas: anemia, infecções bacterianas, avc. Distrofia muscular Duchene Herança: Ligada ao X recessivo. Gene: DMD Alteração fisiológica: necrose das fibras musculares. Duas características clínicas: degeneração progressiva e irreversível da musculatura esquelética; fraqueza muscular generalizada. Hipercolesterolemia familiar Herança: autossômica dominante Gene: APOE Alteração fisiológica: nível plasmático elevado de lipídeos Duas características clínicas: aumenta o risco de infarto do miocárdio, dores articulares. Fenilcetonúria e alcaptonúria Herança: autossômica recessiva Gene: PAH; HGO Alteração fisiológica: bloqueio enzimático, afeta o metabolismo da tirosina. Duas características clínicas: lesão do tecido nervoso; endurecimento do tecido cartilaginoso. Deficiência de biotinidase Herança: autossômica recessiva Gene: BTD Alteração fisiológica: defeito no metabolismo da biotina Duas características clínicas: distúrbios neurológicos e cutâneos, crises epiléticas. Genbank Éxon: sequência de bases nitrogenadas que podem codificar uma proteína Íntron: sequência de bases nitrogenadas que não codifica uma proteína Região promotora: região onde começa a síntese do RNA mensageiro Região codificante: região composta por éxons Códon de início: códon de inicio da leitura do RNAm, AUG - metionina Stop códon: códons que não especificam aminoácido, param a leitura do RNAm, UAA, UAG e UGA. 5’ UTR = 5’ não traduzida: região não codificada, se estende do inicio da região promotora até o códon de iniciação. 3’ UTR = 3’ não traduzida: região não codificada, se estende do stop códon até´a cauda poli-A Localização do gene no cromossomo: número do cromossomo; braço (pequeno – p; longo – q); região; banda e sub-banda (1p36.2) Genes a montante: genes a esquerda (sentido 5’) do gene analisado Genes a jusante: genes a direita (sentido 3’) do gene analisado Farmacogenética e Farmacogenômica Farmacogenética: estuda a variabilidade de respostas às drogas em função das variações genéticas na população. Farmacogenômica: estuda o efeito de vários genes simultaneamente, efeito do genoma.
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