Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Aula Cinética enzimática Estudo da velocidade da reação enzimática e como ela se altera em função de diferentes parâmetros Disciplina Biorreatores Profa. Annamaria Dória • Michaelis-Menten (1913): • A enzima se complexa reversivelmente com o substrato para formar ES: 1k 2k 3k 4k PE ES SE Velocidade de uma reação enzimática Complexo enzima- substrato (ES) A teoria de Michaelis-Menten é uma simplificação. A formação do complexo ES engloba um conjunto de intermediários: + E S ES + E P ES’ EP’ EP ES da teoria de M-M • Michaelis-Menten (1913): • Considerando velocidades iniciais, a concentração de produto neste caso pode ser considerada desprezível: 1k 2k 3k 4k PE ESSE 1k 2k 3k PE ESSE Velocidade de uma reação enzimática Complexo enzima- substrato (ES) k4 • Michaelis-Menten (1913): Velocidade de uma reação enzimática Complexo enzima- substrato (ES) Após a mistura da enzima com o substrato ocorre a formação do complexo ES, que permanece numa concentração constante (variação zero!): *Formação de ES = consumo de ES 𝑑[𝐸𝑆] 𝑑𝑡 ≈ 0 1k 2k 3k PE ESSE Velocidade de uma reação enzimática 𝑑[𝐸𝑆] 𝑑𝑡 = 𝑘1 𝐸 𝑆 − 𝑘2 𝐸𝑆 − 𝑘3 𝐸𝑆 = 0 𝑘2 + 𝑘3 𝑘1 = 𝐸 𝑆 𝐸𝑆 𝑘2 + 𝑘3 𝑘1 = 𝑘𝑀 [𝐸𝑆] = 𝐸 𝑆 𝑘𝑚 kM é definido como a constante de Michaelis Menten e é um valor característico para um dado processo enzimático. Assim: 𝑑[𝐸𝑆] 𝑑𝑡 ≈ 0 1k 2k 3k PE ESSE • Conceito de velocidade relativa (v/vmáx): O total de enzima participando da reação [Eo] é igual à soma da enzima livre [E] com a enzima em forma de complexo [ES], ou seja: Visto K3 ser bem menor que K1 e K2, a transformação de ES em E + P será a etapa limitante do processo, ou seja: Se toda a enzima estiver participando da reação, então a velocidade de reação estará no seu máximo, ou seja: Então, tem-se que a velocidade relativa v/vmáx: (velocidade em função do complexo ES, não mensurável ) ESEE0 ESKv 3 03max EKv ESE ES [Eo] [ES] v v 03 3 max Ek ESk Total de enzima Substituindo: temos: Logo: Equação de Michaelis-Menten [S]Km [S] Km [E][S] [E] Km [E][S] v v max ESE ES Km [E].[S] ES [S]Km [S] vv max (Equação encontrada anteriormente) Km é chamada de constante de Michaelis, ou, constante de afinidade, pois, é uma medida da afinidade da enzima por seu substrato Exercícios SK SV V M máx 0 Exercícios min/10.67,2 /10.150 .min/10.400 /10.50/10.100 /10.50.min/10.8 6 0 6 212 0 66 66 0 0 molV Lmol Lmol V LmolLmol Lmolmol V SK SV V M máx Vídeos DETERMINAÇÃO DOS PARÂMETROS CINÉTICOS VMAX E KM Na prática é muito difícil estimar Vmax com precisão a partir de gráficos, isto implica em erros, também na determinação de Km, que depende da determinação de Vmax Existem maneiras práticas de se obter estas constantes, seguindo a técnica de linearização da equação. O método mais comumente utilizado é através da equação de Lineweaver – Burk, entretanto temos também os métodos de Eadie-Hanes e o método de Hofstee. 13 1) Equação de Lineweaver-Burk Inversão e posterior rearranjo dos termos da equação maxmax v 1 ]S[ 1 . v Km v 1 maxmax 1 . V x V Km y [S]Km [S] vv max bxay .a b b a 14 1) Equação de Lineweaver-Burk Inversão e posterior rearranjo dos termos da equação maxmax v 1 ]S[ 1 . v Km v 1 maxmax 1 . V x V Km y [S]Km [S] vv max bxay .a b b a Método de Eadie-Hanes Multiplica a linearização de Lineweaver-Burk por [S] 1 𝑣 = 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 1 𝑆 + 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑆 [𝑆] 𝑣 = 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 + 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 [𝑆] 𝑦 = 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 + 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑥 bxay . Método de Hofstee Multiplica a linearização de Lineweaver-Burk por v(vmax/kM) 1 𝑣 = 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 1 𝑆 + 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑣 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑘𝑀 𝑣 = −𝑘𝑀 𝑣 𝑆 + 𝑣𝑚𝑎𝑥 𝑦 = −𝑘𝑀𝑥 + 𝑣𝑚𝑎𝑥 bxay . 17 Método de Lineweaver-Burk L g K V K hL g V V SV VSV K V m máx m máx máx máxmáx m 622,0228,0 73,23668,0 1 Portanto, 3668,0 1 228,0 1 111 0 0 y = 0,228x + 0,3668 R 2 = 0,9991 0,0 0,4 0,8 1,2 1,6 0 1 2 3 4 5 1/[S] (L/g) 1/V o (L .h /g ) 18 Método de Lineweaver-Burk L g K V K hL g V V SV VSV K V m máx m máx máx máxmáx m 622,0228,0 73,23668,0 1 Portanto, 3668,0 1 228,0 1 111 0 0 y = 0,228x + 0,3668 R 2 = 0,9991 0,0 0,4 0,8 1,2 1,6 0 1 2 3 4 5 1/[S] (L/g) 1/V o (L .h /g ) 19 Método de Eadie-Hanes L g K V K hL g V V S V S S VV K V S m máx m máx máx máxmáx m 672,02419,0 78,23595,0 1 Portanto, 3595,02419,0 1 0 0 y = 0,3595x + 0,2419 R 2 = 0,9993 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5 3,0 0 2 4 6 8 [S] (g/L) [S ]/V o (h ) 20 Método de Eadie-Hanes L g K V K hL g V V S V S S VV K V S m máx m máx máx máxmáx m 672,02419,0 78,23595,0 1 Portanto, 3595,02419,0 1 0 0 y = 0,3595x + 0,2419 R 2 = 0,9993 0,0 0,5 1,0 1,5 2,0 2,5 3,0 0 2 4 6 8 [S] (g/L) [S ]/V o (h ) 21 Método de Hofstee 5957,15957,1 3638,4 Portanto, 3638,45957,1 KmKm v S v v v S v Kmv máx máx 22 Método de Hofstee 5957,15957,1 3638,4 Portanto, 3638,45957,1 KmKm v S v v v S v Kmv máx máx Método de Lineweaver-Burk - exemplo Para uma enzima (com concentração de 5µM), as seguintes velocidades iniciais foram determinadas como função da concentração de substrato: Substrato (mM) V0 (mM.s -1) 0,02 10,83 0,04 18,57 0,07 26,76 0,1 32,50 0,15 39,00 0,2 43,33 0,3 48,75 0,5 54,17 0,7 56,88 A partir dos dados determine: (a) O gráfico de Michaelis Menten para essa enzima (b) O gráfico de Lineweaver Burk para essa enzima (c) Os valores de kM e vmax para essa enzima 0 10 20 30 40 50 60 0 0,2 0,4 0,6 0,8 v0 ( m M /s ) [S] (mM) a) [S] v 1/[S] 1/v 0,02 10,83 50,0 0,092 0,04 18,57 25,0 0,054 0,07 26,76 14,3 0,037 0,1 32,5 10,0 0,031 0,15 39 6,7 0,026 0,2 43,33 5,0 0,023 0,3 48,75 3,3 0,021 0,5 54,17 2,0 0,018 0,7 56,88 1,4 0,018 Dados Calculados 𝑚 = ∆𝑦 ∆𝑥 = (0,018 − 0,092) (1,4 − 50) = 0,00154 b) y = 0,0015x + 0,0154 R² = 1 0,000 0,020 0,040 0,060 0,080 0,100 0,0 10,0 20,0 30,0 40,0 50,0 60,0 1 /v 0 ( m M -1 .s ) 1/S (mM-1) c) y = 0,0015x + 0,0154 R² = 1 0,000 0,050 0,100 0,0 20,0 40,0 60,0 1 /v 0 ( m M -1 .s ) 1/S (mM-1) 1 𝑣 = 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 1𝑆 + 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 1 𝑣𝑚𝑎𝑥 = 0,0154 𝑣𝑚𝑎𝑥 = 64,93 𝑚𝑀𝑠 −1 𝑘𝑀 𝑣𝑚𝑎𝑥 = 0,0015 𝑘𝑀 = 0,097𝑚𝑀
Compartilhar