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UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA Estudo Dirigido: Cinética Enzimática 1. A atividade enzimática pode ser medida pela velocidade da reação enzimática. Como podemos medir a velocidade da reação catalisada por enzima? O que se quer obter é a velocidade inicial da reação, quando se acaba de combinar a enzima e o substrato, e a enzima catalisa a reação o mais rápido possível para aquela concentração específica de substrato (posteriormente a velocidade de reação diminuirá para zero conforme o substrato vai sendo utilizado). Portanto, deve-se medir a quantidade de produto produzido por unidade de tempo bem no começo da reação, quando a concentração do produto está crescendo linearmente. Esse valor, a quantidade de produto produzido por unidade de tempo no início da reação, é chamado de velocidade inicial, ou , para aquela concentração. 2. A atividade enzimática é influenciada por vários fatores. Explique a influência dos fatores relacionados abaixo e represente graficamente cada caso: a) pH O pH tem grande influência na atividade enzimática, havendo um pH ótimo de funcionamento para cada enzima. Quanto mais próximo ao pH ótimo, maior a atividade enzimática. Quanto mais distante, menor. b) temperatura A temperatura tem grande importância na atividade enzimática. Conforme a temperatura aumenta, ocorre ativação térmica e, portanto, maior atividade enzimática até atingir o ponto ótimo. Temperaturas superiores ao ponto ótimo da enzima são capazes de desnaturá-la, fazendo com que ela deixe de exercer sua função. A temperatura ótima varia de acordo com a enzima em questão. c) concentração de enzima Quanto mais substrato é adicionado, mais rápida é a reação, até que é atingido um limite de saturação e a velocidade da reação permanece constante. Isso ocorre devido a saturação dos sítios ativos das enzimas presentes, uma vez que estes sítios ativos estejam ocupados, não pode ocorrer a reação, não importando quanto substrato seja adicionado. A adição de substrato somente irá aumentar a velocidade de reação enquanto houver sítios ativos disponíveis. UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA 3. Em relação à influência da concentração de substrato sobre a velocidade da reação enzimática, explique quando a reação será de primeira ordem e quando será de ordem zero. • Em baixas concentrações de substrato a velocidade de reação é de primeira ordem — isto é, é proporcional a concentração de substrato; • Em altas concentrações de substrato, a velocidade da reação é de ordem zero – isto é, é constante e independente da concentração de substrato. 4. A atividade enzimática depende do poder catalítico da enzima. Explique. O poder catalítico de uma enzima é a capacidade da enzima de transformar o substrato ligado ao complexo ES em produto por unidade de tempo — ES → E + P. Dessa forma, com um alto poder catalítico, a atividade enzimática é intensa. 5. A atividade enzimática depende afinidade da enzima pelo substrato, ou seja, a maior ou menor capacidade da enzima de se ligar ao substrato. A constante de Michaelis, Km, reflete essa da enzima pelo seu substrato. Em relação às características do Km, quais as afirmativas são verdadeiras: a) O Km é característico da enzima e de seu substrato específico. Sim, o Km é específico para cada enzima. b) O Km não varia com a concentração da enzima. Sim, o Km não varia com a concentração da enzima. c) O Km é numericamente igual à concentração de substrato em que a velocidade é ½ da Velocidade máxima da reação. Se Km=[S] — de acordo com a explicação matemática de Michaelis e Menten — e, numericamente, Km pode ser expresso como a [substrato] necessária para que a velocidade da reação seja metade da velocidade máxima, então, sim, Km = [S] ½ Vmax. 6. A enzima fictícia “E” possui especificidade relativa, podendo agir sobre dois substratos: S1 e S2. Ela age sobre eles com afinidades diferentes. O Km para o substrato S1 (Km1) é maior do que o Km para o substrato S2 (Km2). Com qual subtrato a enzima E possui maior afinidade? Estabilidade do complexo ES pode ser expressa pela relação entre as velocidades de dissociação e de formação do complexo UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA Quando a [S] é muito maior que Km a velocidade da reação é constante e igual a Vmax Reação é de ORDEM ZERO Quando a [S] for menor que o Km (até atingir a saturação da enzima) a velocidade da reação é proporcional à [S] Reação de 1 a ORDEM V el o ci d ad e d a re aç ão Como Km2 é menor que Km1, significa que, para atingir a metade da velocidade máxima, com o substrato 1, é necessária uma menor [S]. Dessa forma, como Km1 é maior, significa que S2 precisa estar mais concentrado para atingir a mesma velocidade. [S] A enzima possui maior afinidade com o conjunto que apresenta menor Km, ou seja, para o conjunto que necessita uma menor concentração de substrato para atingir a metade da velocidade máxima. Dessa forma, o Km2, sendo menor que o Km1, indica que a enzima E possui maior afinidade pelo substrato S2. 7. Represente a situação anterior graficamente: a) Gráfico da hipérbole b) Gráfico de Lineweaver-Burk (Duplo-recíproco) Lineweaver e Burke foram os responsáveis por essa demonstração. É obtida tomando-se o inverso da equação. 8. O que são enzimas alostéricas? As enzimas de Michaelis-Menten — as enzimas vistas até aqui — são diferentes das enzimas alostéricas. Enzimas alostéricas têm, tipicamente, múltiplos sítios ativos e geralmente apresentam cooperatividade, o que significa que a ligação de um substrato a um sítio ativo aumenta a habilidade de outros sítios ativos ligarem-se e processarem substratos. Enzimas alostéricas são enzimas que contém uma região separada daquela em que se liga o substrato, na qual pequenas moléculas regulatórias podem se ligar e modificar a atividade catalítica destas enzimas. As modificações no sítio catalítico podem diminuir ou acelerar a velocidade da reação. S2 S1 UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA 9. O que é sítio alostérico? Sítio em uma enzima que ao ligar-se a um modulador, leva a enzima a sofrer uma mudança conformacional que pode alterar as propriedades catalíticas ou de ligação da enzima. Geralmente, é nos sítios alostéricos que os inibidores irão se ligar para comprometer a atividade enzimática. 10. Qual o efeito da ligação do modulador alostérico positivo sobre a conformação e função a enzima alostérica? Rompe o equilíbrio em favor da forma R — relaxada — da proteína. 11. E qual o efeito da ligação do modulador negativo? Rompe o equilíbrio em favor da forma T — tensa — da proteína. 12. Enzimas alostéricas não seguem a cinética Micheliniana. Explique. Enzimas cooperativas são mais sensíveis em sua resposta a mudanças nas concentrações do substrato que outras enzimas e apresentam uma transição "do tipo interruptor" da taxa de reação baixa para alta à medida que a concentração do substrato aumenta. Isso corresponde a uma curva velocidade vs. substrato que tem o formato de S, como representado abaixo.
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