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Proteínas: Estrutura e função Prof. Sandro Gomes Soares Conteúdo ! Síntese proteica; ! Aminoácidos; ! Ligações não covalentes; ! Estrutura; ! Funções. • Controlam praticamente todos os processos que ocorrem nas células; • São as macromoléculas biológicas mais abundantes; • Ocorrem em grande variedade; • São os produtos finais mais importantes das vias de informação vindas do DNA; • Subunidades monoméricas relativamente simples fornecem a chave da estrutura de milhares de proteínas diferentes. PROTEÍNAS " As proteínas de cada organismo, da mais simples das bactérias aos seres humanos, são construídas a partir do mesmo conjunto onipresente de 20 aminoácidos. Milhares de funções a partir de milhares de combinações Alfabeto Sua associação pode formar mais de 400 mil palavras na língua portuguesa Alfabeto Código binário Alfabeto Código binário Código ASCII Kisspeptina: YNWNSFGLRF GnRH: EHWSYGLRPG Kisspeptina: YNWNSFGLRF GnRH: EHWSYGLRPG Sequencia mínima que ativa a sinalização de GPR54 GnRH-I, causa a liberação dos hormônios FSH e LH Cadeia leve do Adalimumab: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNYLAWYQQKPGKAPKLLI YAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQRYNRAPYT FGQGTKVEIK Cadeia pesada do Adalimumab: EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLE WVSAITWNSGHIDYADSVEGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAV YYCAKVSYLSTASSLDYWGQGTLVTVS Cadeia leve de um anticorpo monoclonal humano do tipo IgM. DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISNYLAWYQQKPGKVPKLLI YAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQKYNSAPYT FGQGTKLEIK Cadeia pesada do anticorpo tipo IgM: EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYSMNWVRQAPGKGLE WVSSISSSSSYIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYY CARDLLIAVAGHWGQGTLVTVS TNF-alfa Cadeia leve do Adalimumab: DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGIRNYLAWYQQKPGKAPKLLI YAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQRYNRAPYT FGQGTKVEIK Cadeia pesada do Adalimumab: EVQLVESGGGLVQPGRSLRLSCAASGFTFDDYAMHWVRQAPGKGLE WVSAITWNSGHIDYADSVEGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAV YYCAKVSYLSTASSLDYWGQGTLVTVS Cadeia leve de um anticorpo monoclonal humano do tipo IgM. DIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQGISNYLAWYQQKPGKVPKLLI YAASTLQSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQPEDVATYYCQKYNSAPYT FGQGTKLEIK Cadeia pesada do anticorpo tipo IgM: EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYSMNWVRQAPGKGLE WVSSISSSSSYIYYADSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYY CARDLLIAVAGHWGQGTLVTVS " A síntese proteica chega a consumir 90% do total de energia utilizada por uma célula para reações biossintéticas. " As proteínas são produzidas de forma extraordinariamente rápida. " Um polipeptídeo de 100 resíduos de aminoácidos é sintetizado em uma célula de Escherichia coli (a 37°C) em cerca de 5 segundos. " A síntese de milhares de proteínas diferentes em uma célula é firmemente regulada, de modo que as cópias são feitas apenas em números suficientes para suprir as necessidades metabólicas daquele dado momento . " Para manter a combinação e as concentrações apropriadas de proteínas, os processos de endereçamento e degradação devem estar sincronizados com o de síntese. M AY 2 01 7 w w w .a d ip o g e n .c o m info@adipogen.com www.adipogen.com info@adipogen.com www.adipogen.com Notch Signaling Pathway Activation, Signaling & Regulation • Mais de 70 proteínas ribossomais diferentes; • 20 ou mais enzimas para ativar os precursores de aminoácidos; • Uma dúzia ou mais de enzimas auxiliares e outros fatores proteicos para as etapas de iniciação, alongamento e término de polipeptídeos; • Talvez 100 enzimas adicionais para o processamento final das diferentes proteínas, e 40 ou mais tipos de RNAs transportadores e ribossomais. Ao todo, quase 300 macromoléculas diferentes cooperam para a síntese de polipeptídeos. Muitas dessas macromoléculas estão organizadas dentro da complexa estrutura tridimensional do ribossomo. A síntese proteica em eucariotos envolve: Tipo Função Componentes das membranas celulares Desempenham diversas funções: determinam o diâmetro dos poros; auxiliam os hormônios no “reconhecimento” celular Colágeno Componente estrutural dos músculos e tendões Queratina Parte da pele e do pelo Hormônios peptídicos (p. ex., insulina, hormônio do crescimento) Muitos hormônios são proteínas e exercem efeitos sobre diversos sistemas orgânicos Hemoglobina Transporte de oxigênio Anticorpos Protegem o corpo contra organismos causadores de doenças Proteínas plasmáticas Coágulo sanguíneo; equilíbrio de líquidos Proteínas musculares Tornam o músculo capaz de contrair Enzimas (variadas e especializadas ) Regulam os padrões das reações químicas Proteínas 02/03/2018 https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/a9/Amino_Acids.svg https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/a/a9/Amino_Acids.svg 1/1 Ligadas a essa cadeia repetitiva estão as porções dos aminoácidos que não estão envolvidas na formação da ligação peptídica e que conferem a cada aminoácido suas propriedades únicas: as 20 diferentes cadeias laterais dos aminoácidos. A sequencia repetitiva dos átomos ao longo do centro da cadeia polipeptídica e denominada cadeia principal polipeptídica. Alanina, valina, leucina e isoleucina tendem a se agrupar no interior de proteínas, estabilizando a estrutura proteica por meio de interações hidrofóbicas. Prolina reduz flexibilidade. Todos podem participar em interações hidrofóbicas. O grupo hidroxila da tirosina pode formar ligações de hidrogênio e é um importante grupo funcional em algumas enzimas São mais solúveis em água, ou mais hidrofílicos do que os aminoácidos apolares, porque eles contêm grupos funcionais que formam ligações de hidrogênio com a água. São mais hidrofílicos e seus resíduos facilitam muitas reações catalisadas por enzimas, funcionando como doadores/ aceptores de prótons. Igualmente hidrofílicos O enovelamento de uma cadeia polipeptídica é, entretanto, adicionalmente limitado por diferentes conjuntos de ligações não- covalentes fracas que se formam entre uma parte e outra da cadeia. Essas ligações envolvem tanto átomos da cadeia principal polipeptídica quanto átomos da cadeia lateral dos aminoácidos. Existem quatro tipos de ligações fracas: • Ligações de hidrogênio • Atrações eletrostáticas • Atrações de van der Waals • Interações hidrofóbicas Ligações de hidrogênio. Essas ligações correspondem a uma forma especial de interação na qual um átomo de hidrogênio, eletropositivo, é parcialmente compartilhado com átomos eletronegativos. Atrações eletrostáticas (iônicas) resultam de formas de atração entre átomos carregados com cargas opostas. cátions ânions Atrações de van der Waals. A nuvem eletrônica ao redor de um átomo apolar flutua formando um dipolo oscilante. Como muitos átomos podem estar simultaneamente em contato, quando as superfícies de duas moléculas se encaixam perfeitamente, o resultado final frequentemente é uma atração de van der Waals. Proteína albumina Conformação normal Proteína albumina desnaturada • As proteínas apresentam uma ampla variedade de formas e em geral têm entre 50 e 2.000 aminoácidos. • Quando comparamos as estruturas tridimensionais de diversas moléculas de proteínas diferentes, toma-se claro que, embora a conformação final de cada proteína seja única, dois padrões de enovelamento frequentemente são encontrados como parte delas. Esses dois padrões estruturais são particularmente comuns, pois resultam da formação de ligações de hidrogênio entre os grupos N-H e C=O na cadeia principal polipeptídica, sem envolveras cadeias laterais dos aminoácidos. Alfa-hélice Folha beta Existem quatro níveis de organização na estrutura de uma proteína. 1. A sequência de aminoácidos e conhecida como estrutura primária. 2. Os trechos da cadeia polipeptídica que formam hélices α e folhas β constituem a estrutura secundária da proteína. 3. A conformação tridimensional completa da cadeia polipeptídica algumas vezes é chamada de estrutura terciária. 4. Se uma proteína em particular é formada por um complexo de mais de uma cadeia polipeptídica, a estrutura completa e designada estrutura quaternária. 1 2 3 4 Sequência de aminoácidos Hélice α Cadeia polipeptídica Proteína completa com suas Subunidades polipeptídicas Hélices α (alfa) Ligações de hidrogênio entre os grupos N-H e C=O Uma hélice α e formada quando uma única cadeia polipeptídica enrola-se sobre si mesma para formar um cilindro rígido. As regiões de hélice α são particularmente abundantes em proteínas localizadas nas membranas celulares, como proteínas transportadoras e receptores. Super hélices Cabelo Proteína miosina Folhas β A parte central de um domínio pode ser composta por hélices α, folhas β e por diversas combinações desses dois elementos fundamentais de enovelamento. As grandes moléculas proteicas geralmente contêm mais de uma cadeia polipeptídica As mesmas ligações fracas não- covalentes que permitem a uma cadeia proteica se enovelar em uma conformação específica também permitem que as proteínas se liguem umas as outras para produzir estruturas maiores na célula. Sítio de ligação – região de uma superfície de uma proteína que interage com outra molécula. Subunidades proteicas Muitas moléculas proteicas apresentam formas alongadas e fibrosas formada por polipeptídios altamente desordenados Funções das proteínas Sem as proteínas, a vida na Terra não prevaleceria. Elas desempenham diversas funções nos mais variados organismos vivos. Catalítica: acelera as reações. Ex.: amilase (hidrolisa o amido). Transportadora: transporta diversos componentes. Ex.: Lipoproteínas (transportam colesterol) e hemoglobina (transporta O2) pelo sangue. Lipoproteínas Apo A-1 (Roxo) Lipídios (amarelo) HDL levando colesterol Reserva: guardam e contêm aminoácidos essenciais para o desenvolvimento dos animais. Ex.: caseína (leite de vaca) e albumina (ovos de aves). Caseína Albumina presente na clara do ovo Contração: promovem os movimentos de estruturas celulares, músculos. Ex.: Filamentos de actina e miosina. Reguladora/hormonal: atuam como mensageiras químicas. Ex.: insulina (faz a glicose entrar na célula). Rosa - Insulina Azul – receptor de insulina. Branco – glicose Roxo – Transportador de glicose. Modelo animado de absorção de glicose pela célula Estrutural: participam na composição de várias estruturas do organismo, sustentando e promovendo rigidez. Ex.: colágeno, elastina. Estrutura molecular Modelo 3D do colágeno Microscopia eletrônica (córnea de rato) Defesa e proteção: promovem a defesa do organismo contra microrganismos e substâncias estranhas. Ex.: imunoglobulinas (anticorpos). Leucócito fagocitando um patógeno encoberto por anticorpos Genética: atuam se envolvendo com os ácidos nucleicos para várias funções (transcrição e replicação). Ex.: RNA polimerase. Animação da ativação da enzima nuclear RNA polimerase
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