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Eletroforese Princípios da técnica • Separa as macromoléculas – Por diferenças de tamanho – Por diferenças na conformação estrutural – Por diferenças na carga elétrica Técnica Separação Separação Materiais analisados • DNA – DNA total – Produtos de amplificação de DNA – DNA digerido por endonucleases – Marcadores moleculares de diferentes setores do genoma • Proteína – Proteína total desnaturada (SDS) – Isoenzimas • RNA Aplicação da eletroforese • Controle de purificação de macromoléculas • Isolamento de macromoléculas • Caracterização de moléculas • Determinação de perfis moleculares Purificação Tipos de eletroforese • Eletroforese comum (vertical ou horizontal) – As moléculas migram em um mesmo sentido pela ação de uma corrente elétrica • Eletroforese de campo pulsado – A migração se dá em duas direções. Pulsos emitidos alternadamente em dois sentidos Eletroforese de campo pulsado Eletroforese unidirecional Tipos de eletroforese unidimensional • Eletroforese horizontal – Gel de agarose – Gel de amido • Eletroforese vertical – Poliacrilamida Eletroforese horizontal gel de agarose Eletroforese vertical Gel de poliacrilamida Variáveis que são consideradas na escolha da eletroforese • Tipo de eletroforese – comum x campo pulsado • Tipo de gel – Agarose x acrilamida • Concentração do gel – Agarose (0,3 a 2%) – Poliacrfilamida (7% a 12%) Tamanho do fragmento a ser separado Concentração do gel e separação do material analisado Separação de Moléculas amplificadas pela técnica de RAPD Passos para eletroforese • Preparo do gel – Tampão do gel (TBE ou TAE 1X) – Concentração do gel- tamanho da macromolécula • Corrida eletroforética – Tampão de corrida (TBE ou TAE 1X) – 50 a 120 Volts • Revelação das bandas – Brometo de etídeo (DNA e RNA) – Nitrato de prata (Proteínas, DNA e RNA) – Cromassie Blue (proteínas) Corrida Tampões de corrida e do gel Revelação de bandas por Brometo de etídeo Coloração com brometo de etídeo visualização com UV Coloração com Nitrato de prata Coloração com prata visualização direta Registro e análise de dados Interpretação PCR Amplificação de DNA in vitro PCR Produto de PCR
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