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Purificação de Proteínas Propriedades usadas na purificação de proteínas através de cromatografia líquida Na separação a amostra contendo a mistura de proteínas é preparada em solução aquosa, a solução é colocada em contato com um suporte sólido poroso (fase estacionária) e eluída através deste suporte com uma solução aquosa (fase móvel). A separação ocorre devido a diferenças entre as propriedades das diferentes proteínas. Propriedades exploradas: Tamanho (massa molecular) Carga líquida Polaridade (hidrofobicidade) Afinidade química (especificidade) Coluna cromatográfica amostra Detector UV 280nm Coletor de frações Sistema para FPLC Recuperação da atividade enzimática Recuperação = 80% = 80 U/100 U 100 U 80 U 2ml de lisado contendo 50 U/mL Etapa de purificação Recuperação: indica qual a porcentagem de atividade enzimática recuperada após o procedimento de purificação 10ml de material contendo 8 U/mL 0 0.2 0.4 0.6 0.8 1 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 etapas Re cu pe ra çã o em re la çã o ao in íc io Recuperação de 90% em cada etapa 100 U de alfa-glicosidase 10 mg de proteína 100 U de alfa-glicosidase 1 mg de proteína 100 U de alfa-glicosidase 2 mg de proteína 100U/mg 50U/mg 10U/mg Enriquecimento 100 U/mg 200 U/mg Etapa de purificação Enriquecimento = 2 = 200/100 Enriquecimento: indica o aumento da atividade específica após o procedimento de purificação. Filtração em Gel ou Cromatografia de Exclusão Molecular Tamanho: 100 kD 20 kD Fluxo de solução tamponante através da coluna volume abs280 5 µm fluxo fluxo volume Seletividade As dimensões dos poros da matriz determinam a faixa de peso molecular das proteínas que podem ser separadas na cromatografia. Tipos de resina Sephacryl (dextrana + bis-acrilamida) 50 µm Sepharose (dextrana + epiclorohidrina) 10 – 120 µm Cálculo de peso molecular relativo utilizando cromatografia de filtração em gel Definições ve = volume de eluição da amostra (proteína de interesse) vo = volume morto ou “void”. Volume no qual são eluídas proteínas totalmente excluídas dos poros das resinas. Corresponde ao volume externo aos grãos da resina vt = volume total da coluna. Pode ser calculado geometricamente a partir das dimensões da coluna. ve = volume de eluição da amostra (proteína de interesse) vo = volume morto ou “void”. Volume no qual são eluídas proteínas totalmente excluídas dos poros das resinas. Corresponde ao volume externo aos grãos da resina Pode ser medido usando macromoléculas muito grandes, em geral “blue dextrana” (milhões de Daltons) vt = volume total da coluna. Pode ser calculado a partir das dimensões da coluna. Definições “razão de eluição” Kav = (ve – vo)/(vt-vo) Kav Log PM Cromatografia de Troca Iônica Carga líquida: Aminoácidos possuem cadeias laterais ionizáveis; Proteínas possuem terminais C e N ionizáveis. pI (ponto isoelétrico) = pH no qual o número total de cargas positivas é igual ao número total de cargas negativas. Logo, a proteína não tem carga líquida. Se o pH > pI, a carga líquida da proteína é negativa Se o pH < pI, a carga líquida da proteína é positiva + Fluxo de solução tamponante com pH definido + Fluxo de solução tamponante com pH definido volume + Fluxo com solução tamponante contendo NaCl Na+ Na+ Na+ Na+ Na+ Na+ Na+ Cl- Cl- Cl- Cl- Cl- Cl- Cl- Cl- Cl- volume NaCl + +++ pI = 7 pI = 9 pH = 6 F α q1.q2 + +++ +++ volume NaCl Tipos de resina Cromatografia de Hidrofobicidade Adição de sal Polaridade: Série de Hofmeister Cátions: NH4+ > K+ > Na+ > Li+ > Mg+2 > Ca+2 > guanidina Ânions: SO4-2> HPO4-2>acetato>citrato>tartarato> Cl-> NO3-> SCN- Efeito precipitante Adição de sal Precipitação por sulfato de amônio é usada para concentrar e/ou purificar parcialmente amostras contendo proteínas Cromatografia de Hidrofobicidade Polaridade: (NH4)2SO4 (NH4)2SO4 volume Abs 280 Fase estacionária apolar (NH4)2SO4 volume Abs 280 volume Abs 280 Tipos de resina Cromatografia líquida de fase reversa Polaridade: (Material poroso apolar é a fase estacionária) Proteína ricas em aminoácidos mais apolares: mais retidas Proteínas ricas em aminoácidos mais polares: menos retidas Eluição: aumento da % de solvente orgânico na solução eluente 1o. 2o. Número do slide 1 Número do slide 2 Número do slide 3 Número do slide 4 Número do slide 5 Número do slide 6 Enriquecimento: indica o aumento da atividade específica após o procedimento de purificação. Número do slide 8 Número do slide 9 Número do slide 10 Número do slide 11 Número do slide 12 Número do slide 13 Número do slide 14 Número do slide 15 Número do slide 16 Número do slide 17 Número do slide 18 Número do slide 19 Número do slide 20 Número do slide 21 Número do slide 22 Número do slide 23 Número do slide 24 Número do slide 25 Número do slide 26 Número do slide 27 Número do slide 28 Número do slide 29 Número do slide 30 Número do slide 31 Número do slide 32 Número do slide 33 Número do slide 34
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