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Enzimas Dra. Thaís Duarte Bifano Professora de Bioquímica 1 Existem 2 condições fundamentais para a vida: - O organismo vivo deve ser capaz de se auto- replicar - O organismo vivo deve ser capaz de catalisar reações químicas com eficiência Características das enzimas - A maioria das enzimas são proteínas (algumas são RNA) - São produtos naturais biológicos - Apresentam um alto grau de especificidade por seus substratos - Possuem mecanismo de “turnover”, desempenhando a mesma função consecutivamente, sem serem consumidas no processo - São altamente eficientes, acelerando a velocidade das reações de 108 a 1011 vezes - São econômicas, reduzindo a energia de ativação necessária para a reação catalisada - Não são tóxicas As enzimas são fundamentais para qualquer processo bioquímico! Aplicabilidade - São usadas no diagnóstico de doenças – medicina - Podem ser aplicadas nas indústrias fabricação de papel, colas, couro, tratamento de efluentes, área têxtil – indústria química - Uso em processos como fermentar uvas para fabricar o vinho, ou alterar o leite e produzir queijo – processamento de alimentos - As enzimas podem, por exemplo, melhorar o aproveitamento do bagaço de cana na produção de etanol de segunda geração – agricultura Classificação das enzimas A International Union of Biochemistry and Molecular Biology (IUBMB) classificou as enzimas em seis grandes grupos (Classes), de acordo com o tipo de reação que catalisam. Cada enzima descrita recebe um número de classificação, conhecido por “E.C.” (Enzyme Commission of the IUBMB), que é composto por 4 dígitos: 1. Nome da classe 2. Subclasse 3. Grupos químicos específicos que participam da reação 4. a enzima, propriamente dita EXEMPLO: Quimotripsina: E.C. 3.4.21.1 3 → Classe: Hidrolase (catalisa reações de hidrólise de ligações covalentes) 4 → Subclasse: Peptidase (hidrolisa ligações peptídicas) 21 → Serino-endopeptidases: (enzimas contendo serina no sítio ativo) 1 → Quimotripsina Classes das enzimas Classes das enzimas 1. Óxidoredutases São todas as enzimas que catalisam reações de oxidação- redução. O substrato oxidado é um hidrogênio ou doador de elétron. O nome mais comum é “desidrogenase” (sempre que possível). “Oxidase” é também usado quando o O2 é um aceptor. A lactato desidrogenase (E.C. 1.1.2.4), transforma lactato em piruvato: 2. Transferases São enzimas que catalisam a transferência de grupos funcionais entre duas moléculas. O doador pode ser um cofator (coenzima) que carrega o grupo a ser transferido. A alanina aminotransferase (E.C. 2.6.1.2) catalisa a transferência de um grupamento amino da alanina para o α-cetoglutarato: alanina α-cetoglutarato glutamato piruvato 3. Hidrolases Catalisam a reação de hidrólise de várias ligações covalentes. Ocorre a transferência de grupos funcionais para a água. O nome, em geral, é dado pelo “substrato” + o sufixo “ase”, como é o caso das peptidades (E.C. 3.4), que catalisam a hidrólise de ligações peptídicas: 4. Liases Liases são enzimas que catalisam a clivagem de ligações covalentes e a adicionam grupos às duplas ligações ou formção de duplas ligações por meio de remoção de grupos. A piruvato descarboxilase (E.C. 4.1.1.1) transforma piruvato em acetaldeído + CO2: 5. Isomerases Catalisam a transferência de grupos dentro da mesma molécula para formar isômeros. Alanina racemase (E.C. 5.1.1.1): 6. Ligases Catalisam reações de síntese de uma nova molécula a partir da ligação entre duas moléculas, com a concomitante hidrólise de ATP ou outro composto trifosfatado. São conhecidas como Ligases, Carboxilases ou Sintetases. Glutamina sintetase (EC 6.3.1.2): Mecanismo de ação enzimática As enzimas afetam a velocidade mas não o equilíbrio químico das reações. A função do catalisador é aumentar a velocidade de uma reação sem afetar o equilíbrio da reação. Os catalisadores aumentam a velocidade das reações diminuindo a energia de ativação Interação Enzima-Substrato (ES) As enzimas fornecem um ambiente específico onde uma dada reação é energeticamente mais favorável. A superfície do centro ativo é contornada por resíduos de aa cujos grupos constituintes se ligam ao substrato e catalisam a sua transformação. - Ocupam um volume relativamente pequeno da molécula da enzima. - São entidades tridimensionais. - Os substratos se ligam por forças fracas nos sítios ativos. - Os sítios ativos em geral são bolsões ou cavidades na superfície da enzima. - A especificidade da ligação depende do arranjo dos átomos no centro ativo. Os Sítios Ativos apresentam certas características em comum: Efeitos do pH na atividade enzimática A eficiência da catálise depende do meio. Efeitos da temperatura na atividade enzimática Cinética da reação enzimática Enzima e substrato formam um complexo transitório. k1>k2>k3 v1 = k1 [E][S] v2 = k2 [ES] v3= k3 [ES] 1ª Etapa 2ª Etapa Etapa mais lenta e limitante do processo Cinética da reação enzimática Constante de Michaelis-Menten - KM A velocidade da reação é diretamente proporcional à concentração da enzima Transformação de Lineweaver-Burk facilita a determinação do KM Inverso KM de algumas enzimas e seus substratos A eficiência catalítica das enzimas A constante catalítica, Kcat é uma constante de velocidade de primeira ordem cuja unidade é recíproco do tempo. Também chamado como número de renovação. É equivalente ao número de moléculas do substrato convertidas em produto por uma molécula de enzima em uma dada unidade de tempo. Kcat= Vmax/[Et] Associando o valor de Kcat com KM pode-se definir a constante Kcat /KM Inibidores enzimáticos Irreversíveis Reversíveis Competitiva Não-competitiva São agentes moleculares que interferem com a catálise, diminuindo ou interrompendo as reações enzimáticas. Inibição Irreversível Os inibidores irreversíveis reagem quimicamente com as enzimas, levando a uma inativação praticamente definitiva. Inibição Reversível Competitiva Os inibidores reversíveis competitivos competem com o substrato pelo centro ativo da enzima. Efeito do inibidor competitivo Inibição Reversível Não-competitiva Os inibidores não-competitivos reagem quimicamente com as enzimas, ligando-se a regiões diferentes do sítio ativo. Efeito do inibidor não-competitivo Resumo da ação dos inibidores reversíveis Inibidor competitivo: Vmax = Km ≠ Inibidor não-competitivo: Vmax ≠ Km = Cofatores enzimáticos Cofatores são imprescindíveis para a atividade de inúmeras enzimas. Estudo dirigido
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