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Enzimas DEFINIÇÃO Enzimas são proteínas que agem como catalizadores biológicos: Enzimas: São catalisadores biológicos específicos de estrutura protéica, que aceleram as reações em condições fisiológicas de temperatura e pH. Catalizador é uma substância que acelera uma reação química até torná-la instantânea ou quase, mas NÃO PARTICIPA DA REAÇÃO. Algumas enzimas são constituídas somente de aminoácidos Outras podem conter: · Carboidratos · Grupos fosfato · Cofatores: íons metálicos, coenzimas, grupos prostéticos Algumas proteínas, enzimas em especial, contêm em sua molécula uma porção não proteica, que é essencial para atividade biológica. Cofatores de origem orgânica Maioria deriva de vitaminas hidrossolúveis • Muitos organismos não conseguem sintetizar certas porções das coenzimas essenciais. Tais substâncias devem estar presentes na dieta desses organismos e são, portanto, chamadas de vitaminas. • Classificam-se em: • transportadoras de hidrogênio • transportadoras de grupos químicos. NOMENCLATURA-ENZIMAS Nome recomendado (nome clássico): utiliza-se o sufixo “ase” unido ao substrato da reação. Ex: glicosidase (glicose), urease (uréia), sacarase (sacarose). Ou uma descrição da ação realizada. Ex: lactato desidrogenase (retira um H do lactato). Nome sistemático (nome oficial): segundo a União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUBMB). As enzimas são divididas em 6 classes, cada qual com numerosos subgrupos. O sufixo “ase” é unido a uma descrição complexa da reação química catalizada. Ex: D-gliceraldeído 3- fosfato:NAD oxiredutase. Nome trivial: consagrados pelo uso: tripsina, pepsina e ptialina. • Século XX - quantidade de enzimas descritas • Nomenclatura existente se tornou ineficaz • 1955 - IUB - União Internacional de Bioquímica adotou um novo sistema de nomenclatura e classificação • mais complexo • sem ambigüidades • baseado no mecanismo de reação. • Cada enzima código com 4 dígitos que caracteriza o tipo de reação catalisada: • (E.C.- Enzime Comission) • 1° dígito – classe • 2° dígito – subclasse • 3° dígito - sub-subclasse • 4° dígito - indica o substrato. CLASSIFICAÇÃO DAS ENZIMAS Exemplo: ATP + D-Glicose ADP + D-Glicose-6-fosfato Glicose fosfotransferase E.C 2 - Classe - Transferase 7 - Subclasse - Fosfotransferases 1 - Sub-subclasse - Fosfotransferase que utiliza grupoNome trivial: Hexoquinase hidroxila como receptor 1 - Indica ser a D-glicose o receptor do grupo fosfato FUNÇÕES • Praticamente todas as reações que caracterizam o metabolismo celular são catalisadas por enzimas. • Como catalisadores celulares extremamente poderosos, as enzimas aceleram a velocidade de uma reação sem, no entanto, participar dela como reagente ou produto. • As enzimas atuam ainda como reguladoras deste conjunto complexo de reações. • As enzimas são consideradas as unidades funcionais do metabolismo celular • São muito importantes devido à especificidade quanto ao substrato: sítio ativo. CARACTERÍSTICAS DO CATALISADOR - Modificar a velocidade da reação sem ser nela consumido ou aparecer entre os produtos; - Não apresentar efeito termodinâmico global (a energia livre liberada ou absorvida na reação independe da presença ou ausência do catalisador). - Atuar pela redução da energia de ativação; - Gerar estados de transição mais estáveis. Enzima Substrato(s)---------> Produto(s) PROPRIEDADE DAS ENZIMAS: ESPECIFICIDADE As enzimas interagem com um ou com alguns substratos ESPECÍFICOS e catalisando somente um tipo de reação química. Especificidade de Grupo: Uma enzima pode apresentar especificidade de grupo, ou seja, um grupo de compostos pode servir como substrato. MECANISMO DE AÇÃO • A reação enzimática ocorre em duas etapas: • 2 modelos: • Modelo chave-fechadura • Modelo do ajuste induzido MECANISMO DE AÇÃO MODELO DE AÇÃO “CHAVE-FECHADURA” Modelos propostos para explicar o tipo de ligação estabelecida entre enzima e substrato: Em 1894 Emil Fischer enunciou a sua teoria na qual a especificidade enzimática é comparada a um conjunto de chave e fechadura onde a chave, neste caso o substrato, deve se ajustar a fechadura, neste caso a enzima. MECANISMO DE AÇÃO SISTEMA DE AÇÃO: AJUSTE INDUZIDO Em 1958, koshland propôs este modelo para explicar o poder catalítico e a especificidade apresentada pelas enzimas. Considera que o sitio ativo não precisa preexistir sob uma forma geométrica rígida. O arranjo espacial se dá induzido pelo contato com o substrato. Estudos por raio X indicam que os sítios de ligação aos substratos da maioria das enzimas são, em grande parte, pré-formados, mas sofrem mudanças conformacionais no momento da ligação do substrato (um fenômeno denominado ajuste induzido). PROPRIEDADE DAS ENZIMAS: REGULAÇÃO A atividade das enzimas pode ser regulada: Isto é, as enzimas podem ser ativadas ou inibidas de modo que a velocidade de formação do produto responde as necessidades da célula. 1. Controle da disponibilidade da enzima na célula: hormonal 2. Controle da atividade da enzima efetuado por mudanças estruturais nas moléculas em função do ambiente: Algumas enzimas podem ter suas atividades reguladas, atuando assim como moduladoras do metabolismo celular. Esta modulação é essencial na coordenação dos inúmeros processos metabólicos pela célula. Modulação Alostérica e Modulação covalente PROPRIEDADE DAS ENZIMAS REGULAÇÃO POR MODIFICAÇÃO ESTRUTURAL Um modulador alostérico (moléculas que se ligam a outro sitio diferente do sitio ativo) que pode ser positivo (ativa a enzima) ou negativo (inibe a enzima). Um modelo muito comum de regulação alostérica é a inibição por "feed-back", onde o próprio produto da reação atua como modulador da enzima que a catalisa. Fosfofrutoquinase – inibida alostericamente por excesso de ATP. Modulação Covalente: Ocorre frequentemente por adição/remoção de grupamentos fosfato de resíduos específicos de serina, treonina ou tirosina da enzima. A fosforilação das proteínas é reconhecida como uma das formas primárias pelas quais o metabolismo celular é regulado. COMO FUNCIONAM AS ENZIMAS? Velocidade de reação Para as moléculas reagirem devem conter energia suficiente para superar a barreira do estado de transição. A velocidade da reação é determinada pelo número de moléculas energizadas. Em geral quanto menor a energia livre de ativação, mais moléculas tem energia suficiente para superar o estado de transição e assim mais rápida é a velocidade da reação. Uma enzima permite que a reação ocorra rapidamente sob condições normais, oferecendo uma rota de reação alternativa com uma menor energia livre de ativação. CINÉTICA ENZIMÁTICA É a parte da enzimologia que estuda a velocidade das reações enzimáticas, e os atores que influenciam nesta velocidade. A cinética de uma enzima é estudada avaliando-se a quantidade de produto formado ou a quantidade de substrato consumido por unidade de tempo de reação. PRINCIPAIS FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DA REAÇÃO (ATIVIDADE ENZIMÁTICA) • Concentração de substrato • Temperatura • pH • Concentração da Enzima • Concentração da Enzima A velocidade máxima da reação é uma função da quantidade de enzima disponível (existindo substrato em excesso). Figura: Efeito da [ ] da enzima sobre a velocidade inicial (V0) com de substrato em excesso. Velocidade máxima (Vmax): (quantidade de moléculas de substrato convertidas em produto por unidade de tempo – micromoles/min). A Vmax de uma reação ocorre a elevadas concentrações de substrato na qual a enzima está saturada, está inteiramente na forma enzimasubstrato (ES). FATORES QUE INFLUENCIAM A ATIVIDADE ENZIMÁTICA - TEMPERATURA Temperatura: Quanto maior a temperatura, maior a velocidade da reação, até se atingir a TEMPERATURA ÓTIMA (aumenta o número de moléculas com energia suficiente para reagir); a partir dela, a atividade volta a diminuir, por desnaturação térmica da enzima. FATORES QUE INFLUENCIAM A ATIVIDADE ENZIMÁTICA - PH pH: existe um pH ÓTIMO, onde a distribuição de cargas elétricas da molécula da enzima e, em especial do sítio catalítico,é ideal para a catálise. Acima ou abaixo desse valor, a atividade enzimática é diminuída. CONVERSÃO DE ZIMOGÊNIOS EM ENZIMAS ATIVAS INIBIÇÃO ENZIMÁTICA • Grande parte do arsenal farmacêutico (Por ex. tratamento da AIDS feito com drogas que inibem a atividade de certas enzimas virais.) INIBIÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA Os inibidores podem ser reversíveis ou irreversíveis Os inibidores reversíveis se ligam por ligações covalentes, e podem desligados da enzima com recuperação da atividade enzimática. Os inibidores irreversíveis não permitem que a enzima retome sua atividade enzimática. •Competitivo : Compete pelo centro ativo. Uma molécula apresenta estrutura semelhante ao substrato da enzima que se liga para realizar a catálise, ela poderá aceitar esta molécula no seu local de ligação, mas não pode levar ao processo catalítico, pois ocupando o sítio ativo do substrato correto. Portanto o inibidor compete pelo mesmo local do substrato. O efeito é revertido aumentando-se a concentração de substrato. Este tipo de inibição depende das concentrações de substrato e de inibidor. INIBIÇÃO DA ATIVIDADE ENZIMÁTICA - INIBIDORES REVERSÍVEIS •Competitivo: Compete pelo centro ativo. Uma molécula apresenta estrutura semelhante ao substrato da enzima que se liga para realizar a catálise, ela poderá aceitar esta molécula no seu local de ligação, mas não pode levar ao processo catalítico, pois ocupando o sítio ativo do substrato correto. Portanto o inibidor compete pelo mesmo local do substrato. Não Competitivo: Ocorre quando uma molécula ou íon pode se ligar em um segundo local na superfície enzimática (não no sítio ativo). Isto pode distorcer a enzima tornando o processo catalítico ineficiente. Este tipo de inibição depende apenas da concentração do inibidor. TRATAMENTO DE ENVENENAMENTO COM METANOL Metanol: muito tóxico, 30mL pode causar morte humana. Toxidade: não é do metanol, mas do formaldeído, que é produto metabólico. Metanol é oxidado para formaldeído pela enzima álcool desidrogenase no fígado. • Tratamento: Ministrar ao paciente etanol, através de via oral ou intravenosa, em grandes quantidades. Inibidores não competitivos • Inibidores de tripsina presentes em soja: não competitivos. • Inibidores de proteases: arroz, trigo, milho, batata inglesa, batata doce. • Ascaris Lumbricoides: produz inibidores de pepsina e tripsina. O verme não é digerido no intestino. Ex: metais pesados como Hg2+, Pb2+ e Ag2+, que reagem com os grupos -SH das proteínas. Inibidores irreversíveis Há modificação covalente e definitiva no sítio de ligação ou no sítio catalítico da enzima, ou seja, acaba com a atividade enzimática. Ex: Inibição da enzima ciclo-oxigenase pelo acetilsalicilato Inibição por armas Químicas Ex: DIPF = Diisopropilfluorofosfato ( gás dos nervos). Inibe a enzima acetilcolinesterase, que tem papel importante na transmissão do impulso nervoso. O ácido cianídrico e grande número de pesticidas, como o DDT, são exemplos. Ex: compostos compostos organofosforados organofosforados → formam ligações ligações covalentes covalentes com o grupo -OH de resíduos de serina Penicilina → liga-se especificamente as enzimas da via de síntese da parede bacteriana, tornando-as susceptíveis à lise
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