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TGTGAACACACGTGTGGATTGG... Professor: Christian Reis Disciplina: Biologia Molecular DNA na identificação humana Polimorfismo Genético • É a coexistência de alelos múltiplos em um lócus cromossômico; regiões do genoma nas quais existem variações entre as pessoas. • Polimorfismo de sítio de restrição (RFLP) • Polimorfismo de nucleotídeo único (SNP) • Polimorfismos de inserção/deleção (indels) • Polimorfismos de minissatélites (VNTR) – de 9 a 80pb • Polimorfismos de microssatélites (STR) – de 2 a 8 pb Qual a importância desses polimorfismos? Fonte de variabilidade; Permitem construir um perfil genético indivíduo- específco “DNA fingerprint”; importante em análise de paternidade e perícia forense (estupro, homícido, rapto de crianças.) De onde pode ser extraído o DNA? • Sangue padrão-ouro; • células epiteliais da mucosa oral: saliva, pontas de cigarro, selos e envelopes, gomas de mascar, copos, tampas de caneta mordidas,...; • Pêlos e fios de cabelo (com ou sem o bulbo capilar); • Unhas; • Esfregaços; De onde pode ser extraído o DNA? • Manchas de material biológico: líquido seminal, urina, saliva, sangue; • Tecidos de biópsias cirúrgicas; • Ossadas (carbonizadas ou não); • Tecidos mumificados ou congelados; • Células deixadas por impressão digital; • Dentes; • outras Como extrair o DNA? • Técnicas específicas para cada tipo de amostra; • CUIDADO: O sucesso da tipagem de DNA depende basicamente da qualidade e quantidade de DNA extraído Mitochondria Nuclear DNA: Chromosomes Dois tipos de DNA para testagem 1 2 DNA Nuclear ● Único em cada pessoa. ● Herança de ambos os pais. ● Usado para aplicações forenses e teste paternidade/maternidade. ● Marcadores, não são usados genes nas análises. 2 copies/célula Autossomos Chromosomes Nuclear DNA: • Apenas duas cópias/célula. • Herança de ambos os pais. • DNA único / exclusivo. DNA Nuclear Recuperação de DNA em amostras de tecidos e fluidos Amostra (tecidos e fluidos) Quantidade recuperada Análise de RFLP Análise de STR 1mL de sangue 20 a 40µg SIM SIM Manchas de sangue seco de 1cm3 200ng NÃO SIM Sêmen 150 a 300µg por mL SIM SIM Sêmen (esfregaço vaginal pós-coito) 0 a 3µg (DNA dos espermatozóides) SIM SIM Cabelo com raiz (contendo bulbo capilar) 1 a 750ng por fio NÃO SIM Saliva 1 a 10µgpor mL SIM SIM Métodos disponíveis para paternidade: • VNTRs estudados com sondas multilocais; • STRs estudados com PCR; • DNA mitocondrial (mtDNA); • STRs do Cromossomo Y; • Técnicas mais recentes • Microssatélites – Ferramentas-Padrão • Podem ser repetições de dinucleotídeos (substituídos), trinucleotídeos e tetranucleotídeos (melhor). • STRs: estrutura repetitiva de 2-8pb – Vantagem: amplificação de fragmentos curtos – Ideal para análises forenses Tipos de Unidades Repetitivas • Dinucleotídeo • Trinucleotídeo • Tetranucleotídeo • Pentanucleotídeo • Hexanucleotídeo (CA)(CA)(CA)(CA) (GCC)(GCC)(GCC) (AATG)(AATG)(AATG) (AGAAA)(AGAAA) (AGTACA)(AGTACA) TCCCAAGCTCTTCCTCTTCCCTAGATCAATACAGACAGAAGACAGGTGGATAGATA GATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATATCATTGAAAGACAAA ACAGAGATGGATGATAGATACATGCTTACAGATGCACAC 12 repetições GATA = Alelo 12 Região alvo (microssatélite) 7 repet 8 repet 9 repet 10 repet 11 repet 12 repet 13 repet Região flanqueadora Região flanqueadora Microssatélites: estrutura Teste de Paternidade Mãe Criança Homem 1 Homem 2 O suspeito estava na cena do crime? Suspeito Sangue da cena do crime vítima V C S1 S2 S3 V Vitíma C Amostra da Cena do Crime S1 Suspeito 1 S2 Suspeito 2 S3 Suspeito 3 Mais que 20 fragmentos do suspeito 1 têm tamanhos idênticos aos fragmentos encontrados na cena do crime! Perfis de DNA Teste de paternidade e análise forense STRs estudados com PCR • Princípio do método: Reação de PCR utilizada para copiar extensivamente várias regiões de STR, fornecendo fragmentos de tamanhos diferentes visualizados por eletroforese em gel de poliacrilamida ou por seqüenciamento • OBS: Quantas regiões são necessárias? ….Há uma chance de 1 em 10 que este fragmento ocorra na população… Suponha que………… …e que há uma chance de 1 em 20 que este fragmento ocorra na população… …e que há uma chance de 1 em 10 que este fragmento ocorra na população… …e que há uma chance de 1 em 30 que este fragmento ocorra na população, assim... Comparação entre fragmentos …a probabilidade das 4 bandas serem encontradas em qualquer pessoa suspeita é 1 em 10 x 1 em 20 x 1 em 10 x 1 em 30 = 1/10 x 1/20 x 1/10 x 1/30 = 1 em 60,000 =(1/10)12 = 1/1.000.000.000.000 (1 em 1 trilhão) = 99,9999999999 – 10 casas do número 9 após a vírgula. POPULAÇÃO MUNDIAL ONU 2013: 7,2 BILHOES DE PESSOAS Quanto maior número de bandas analisado, maior a probabilidade do suspeito ser único indíviduo no mundo (milhares, milhões, bilhões) Cálculo de probabilidade Apresentador Notas de apresentação *Or, in some cases, millions. Cromossomo Y ● Perfil IDÊNTICO em todos os homens de uma linhagem paterna. ● Cromossomo Y passa apenas de pai para filho. ● Usado para ajudar na determinação da linhagem masculina. ● Identificação de paternidade sem o pai (p/ filhos); ● Elucidação de estupro (mistura de DNA); (~ 78 genes) (~ 1000 genes) Y-STRs Y Prince Philip Prince Charles Princess Anne Prince Andrew Mulheres: X X Males: X Y Y-STRs Y Prince William Prince Harry Princess Beatrice Princess Eugenie Y Y Y Y X, X X, X Y-STRs Mitochondria • > 1,000 cópia/célula. • Herança Materna. • Único em cada pessoa. DNA Mitocondrial DNA Mitocondrial ● Descendentes recebem apenas da mãe permite traçar a linhagem materna de uma pessoa; ● Efetivo para análise de amostras antigas e degradas. ● É mais resistente à degradação que o DNA nuclear. ● Taxa mutacional do mtDNA é 5-10 vezes maior que a do DNA nuclear DNA bem polimórfico, que permitem a “individualização”; 1,7oo/cell • Utilizado na identificação de corpos em grandes desastres comparar a seqüência de interesse com a obtida nos possíveis irmãos ou ascendentes maternos; • Identificação de maternidade sem o pai (p/ filhos e filhas) • Não identifica um indivíduo específico; • Estudos históricos ou evolutivos. DNA Mitocondrial Queen Elizabeth II Princess Ann Prince Charles Prince Andrew Identical DNA Mitocondrial Mt-DNA da linhagem materna da Rainha Elizabeth II Mt-DNA da linhagem materna de Lady Diana Spencer Mt-DNA da linhagem materna de Lady Sarah Ferguson DNA Mitocondrial mt-DNA Técnicas mais recentes • Polimorfismo de base única. – Sequenciamento; – São muito numerosos; – Baixa taxa de mutação; – Requer maior nº de marcadores; • Polimorfismos de inserção/deleção Estudados em produtos de amplificação muito curtos (50pb ou menos) vantagem sobre STRs em estudos de DNA extremamente degradado (ex: cadáver em estado avançado de decomposição ou carbonizado) E no futuro... • Bancos completos de perfil de criminosos: – Inglaterra – CODIS – Combined DNA Index System (1994) – FBI 2013 - 10.581.700 perfis de agressores. – Regulamentação Banco Nacional de Perfis Genéticos Brasil2013 - Crimes hediondos e ou violentos de natureza grave • Amostra de DNA “retrato falado” Número do slide 1 Polimorfismo Genético Número do slide 3 De onde pode ser extraído o DNA? De onde pode ser extraído o DNA? Como extrair o DNA? Número do slide 7 Número do slide 8 Número do slide 9 Número do slide 10 Métodos disponíveis para paternidade: Número do slide 12 Tipos de Unidades Repetitivas Microssatélites: estrutura Número do slide 15 Teste de Paternidade O suspeito estava na cena do crime? Perfis de DNA Número do slide 19 STRs estudados com PCR Número do slide 21 Comparação entre fragmentos Cálculo de probabilidade Número do slide 24 Número do slide 25 Número do slide 26 Número do slide 27 Número do slide 28 Número do slide 29 DNA Mitocondrial Número do slide 31 Número do slide 32 Número do slide 33 Técnicas mais recentes E no futuro...
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