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DNA Instituto de Biologia Departamento de Genética Disciplina: Genética Molecular Descobrindo a estrutura e composição da molécula de DNA • 1953 - ano da descoberta da estrutura do DNA Quais as descobertas científicas feitas antes de 1953 auxiliaram Watson e Crick a desvendar a estrutura da molécula? • A origem da genética está baseada nos trabalhos de Gregor Mendel – no início do séc XIX - 1865 • Postulou, entre outros: • Fatores hereditários – genes • Propôs que as plantas tinham duas cópias dos genes – Iguais ou não – alelos • Durante a reprodução as cópias são aleatoriamente incorporada em diferentes células sexuais • Alelos de genes diferentes são herdados independentemente Os trabalhos de Mendel são considerados a base dos princípios da genética até hoje! Pai da genética • Publicação dos resultados de Mendel – 1866 – 6 anos após a morte – 1900 - teve reconhecimento – Hugo de Vries, na Holanda; Carl Correns, na Alemanha; e Tschermak, na Áustria. E as descobertas continuam... • Joham Friedrich Miescher (1869) isolou o DNA pela primeira vez – Estudando o núcleo de glóbulos brancos do pus – chamou-o de nucleína • Walter Flemming (1882) corpos em formatos de bastão - cromossomos A primeira peça do quebra-cabeças • Friedrich Miescher (1869) – químico Suiço – isolou o DNA pela primeira vez – Nucleína, ácido nucléico e ácido desoxirribonucléico • Objetivo: isolar proteínas - componentes de leucócitos • Alto teor de fósforo e resistente a proteólise – Pepsina • 50 anos depois a descoberta de Miescher foi reconhecida • A descoberta de Miescher foi única entre as descobertas dos principais componentes celulares: – Polissacarídeos, lipídeos, proteínas e ácidos nucléicos Deveria ter sido “Datado precisamente… a um homem, um lugar, uma data” Chargaff (1961) • Walter Sutton e Theodor Boveri (1902) – as partículas da hereditariedade estariam nos cromossomos – Teoria cromossômica da hereditariedade • Wilhelm Johansen (1909) – introduziu os conceitos genes, fenótipos e genótipos 10 • 1910 - Thomas Hunt Morgan - Os genes estão organizados de maneira linear em cada cromossomo. • A ligação podia ser rompida pela recombinação. Transição da genética mendeliana clássica para a genética moderna. Descoberta da transformação • Frederick Griffith (1928) • Bactéria Streptococcus peneumoniae – Letal em camundongos Cápsula de polissarídeo - R • Usou duas linhagens • R - não virulenta – polissacarídeo ausente e aspecto rugoso • S – virulenta e mortal – polissacarídeo e aspecto liso Descoberta da transformação • Ferveu células virulentas ( tipo S) • Injetou as mortas por aquecimento nos camundongos • Os camundongos sobreviveram! Descoberta da transformação Passo a passo do experimento de Griffith • Misturou células S aquecidas e células não virulentas (R) vivas • Injetou-as nos camundongos • Os camundongos morreram! • Células virulentas vivas podiam ser recuperadas nos mortos. Processo de Transformação Descoberta da transformação Quais fatores químicos tinham provocado a transformação? • Oswald Avery, C.M. MacLeod e M. McCarty (1944) Oswald Avery, C.M. MacLeod e M. McCarty (1944) • Destruíram quimicamente todas as substâncias no extrato de um célula morta um de cada vez. – Polissacarídeo – RNA – Proteínas – DNA Experimento do Avery et al (1944) • Perda da habilidade apenas quando usava uma enzima desoxirribonuclease (DNase) • Logo, Concluíram que os genes (material hereditário) eram compostos de DNA – transformante. Descoberta da transformação Evidências adicionais de que o DNA era o material genético • Alfred Hershey e Martha Chase, 1952 • Fago T2 – infecta bactérias – E. coli Hipótese Se... O fago injetar partículas que causa a reprodução de novas partículas virais Então... Poderiam descobrir qual o material genético do fago. Descoberta da transformação Experimentos de Hershey e Chase • Marcaram o DNA e a proteína do fago – radioisótopos – 32P e 35S • Rastrear os dois materiais durante a infecção – 32P - DNA – 35S - Proteínas • Infectaram duas placas 32P encontrado dentro da célula 35S encontrado na capa do fago Que informações Watson e Crick dispunham? 1. Os fatores hereditários (descritos por Gregor Mendel, 1865) 2. As mutações 3. Teoria um gene - uma proteína – (Beadle e Tatum, 1940) 4. Genes estavam nos cromossomos 5. Os cromossomos eram constituídos por DNA e proteína 6. O DNA era o material genético • Natureza química da “nucleína” • Phoebus Levene - 1919 - Bioquímico Russo A segunda peça do quebra-cabeças • Contribuições de Levene (1929) • Descobriu: – a ordem dos nucleotídeos (fosfato -açúcar- base) Contribuições de Levene (1929) – os componentes de hidratos de carbono de RNA (ribose) e do DNA (desoxirribose) • Nem todos os ácidos nucléicos continham ribosa, alguns continham um tipo de ribosa ao qual faltava um átomo de oxigênio, a desoxirribosa. Desoxirribose Ribose *Monossacarídeos - moléculas orgânicas formadas por átomos de carbono (C), hidrogênio (H) e oxigênio (O) na proporção 1: 2: 1, respectivamente, apresentando fórmula geral (CH2O) n, em que “n” pode variar de 3 a 7. tetroses, pentoses, hexoses e heptoses. • Albrecht Kossel descobriu que os compostos nitrogenados dos ácidos nucléicos eram bases aminadas cíclicas – Do grupo purina (adenina e guanina) – com um anel – Do grupo pirimidina (citosina e timina) – com dois anéis • Ligadas ao carbono 1’ da pentose – ligação n glicosídica “Durante a década de 20, a opinião generalizada, era de que o DNA era muito simples, formado de pequenas moléculas. Por esse motivo, Levene defendeu que não podia carregar o código genético, e sua opinião pesou muito.” 2. As regras de Chargaff da composição das bases • Regras sobre a quantidade de cada tipo de nucleotídeos encontrado no DNA • 1. quantidade de pirimidínicos (T+C) = quantidade de purínos ((A+G) • 2. quantidade de A = T, quantidade de C = G, mas A+T ≠ G+C Estrutura do DNA Em 1952, John Griffith, químico e matemático galês, • calculou que, entre as quatro bases aminadas que formam parte do DNA, a adenina tende a atrair timina, e a citosina, a guanina. • Linus Pauling • Propôs que a molécula possuía três filamentos • Watson e Crick – Processo construção do modelo – Usando informações já disponíveis “Sem essas informações Watson e Crick talvez nunca tivessem concluído em 1953, que a molécula de DNA existe na forma de uma dupla hélice tridimensional.” A estrutura do DNA • Watson e Crick (1953) • Estrutura tridimensional – Duas cadeias lado a lado de filamentos torcidos de uma dupla hélice Estrutura do DNA • Os dois filamentos de nucleotídeos são mantidos juntos por pontes de hidrogênio entre as bases • Cada filamento é composto de unidades alternadas de fosfato, desoxirribose – conectados por ligações fosfodiéster • os carbonos do açúcar são numerados de 1’ a 5’ – Ligação fosfodiéster – átomo de carbono 5’ ao átomo de carbono 3’ da desoxirribose adjacente Estrutura do DNA Estrutura do DNA • Polaridade ou sentido 5’ para 3’ • Filamentos em orientação oposta – polaridade inversa • As bases estão no centro da dupla hélice – excluindo moléculas de água do espaço entre os pares de bases (hidrofóbica) • Pontes de hidrogênio C –G – três pontes – mais estável – desnaturação com temperaturas mais elevadas A – T – duas pontes de hidrogênio Estrutura do DNA • A ligação ocorreentre a OH do C-1’ do açúcar com o N-9 das BN púricas ou N-1 das BN pirimídicas, liberando água. Estrutura do DNA • Empilhamento associado com a estabilidade da molécula – Sulcos com tamanhos distintos – Sulco maior e sulco menor – Associação DNA-proteínas no sulco maior • Hélice com giro para direita Estrutura do DNA Estrutura do DNA Distância entre as cadeias – 20 Angström A cada 10 pares de nucleotídeos, a estrutura se repete – 34 Angström 1 Angström = 0,1 nanômetro (nm) 10-4 micromêtro (μm) 10-7 milímetro (mm) 10-8 centímetros (cm) Formas estruturais do DNA • A forma "B" --> descrita por Watson e Crick em 1953, é a forma mais comum; a hélice é voltada para a direita e com 10 nucleotídeos por volta, com planos de bases perpendiculares ao eixo helical. • A forma "A" --> Obtida pela desidratação moderada da forma "B", também é voltada para a direita, mas possui 11 nucleotídeos por volta e as bases estão em um ângulo de 20 graus em relação ao eixo helical. • A forma "Z" --> A hélice nesta forma é voltada para a esquerda e contém cerca de 12 nucleotídeos por volta. A transição entre as formas de DNA pode desempenhar um papel importante na regulação da expressão genética. Descoberta de Watson e Crick • Descoberta mais importante do século XX • Prêmio Nobel para Maurice Wilkins (1962) “Não escapou à nossa percepção que o pareamento específico que postulamos sugere imediatamente um possível mecanismo de cópia para o material genético” (Watson e Crick, 1953) Estrutura do DNA Organização do DNA Etapas de condensação do DNA • Nucleossomos • Solenóides • Cromômeros (alças) • Cromossomo Metafásico (espirais) 1) Nucleossomo - associação da dupla hélice do DNA com um grupo específico de histonas. • Duas cópias de cada uma - H2A, H2B, H3, H4 • O octâmero circundado por duas voltas de DNA – Cerca de 140 bases • Após um segmento de DNA curto (20 a 60 bases), forma-se o centro seguinte de complexo de DNA - contas num cordão. – Este primeiro nível de compactação reduz o tamanho da molécula de DNA em 6 a 7 vezes. • 2) Solenóides - A histona H1 ocupa lugar na região entre os nucleossomos – forçando outro tipo de compactação • estruturas secundárias helicoides - solenóides. – Compactação de 6 a 7 nucleossomos. • Essa nova fibra é a unidade fundamental da organização da cromatina. • O solenóide é capaz de condensar aproximadamente 1200 bases de DNA. • Nucleossomos Solenóide • 3) Alças - proteínas não-histônicas formam estruturas em alças ou domínios. – Início de espessamentos parecidos com nós, denominados cromômeros. – À medida que os cromossomos se condensam mais, os cromômeros adjacentes fundem-se em estruturas maiores, que depois se tornam às bandas cromossômicas. • 4) Cromossomos - Encontramos essas formas na metáfase, quando há a maior condensação da cromatina. É o enrolamento final, do qual participa a topoisomerase II.
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