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Prof. Elizangela Leite Vargas UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MATO GROSSO DO SUL CURSO: ENGENHARIA AMBIENTAL DISCIPLINA: BIOLOGIA GERAL TRANSCRIÇÃO DO DNA 1 2 TRANSCRIÇÃO DO DNA O nome transcrição é dado a síntese de moléculas de RNA usando moléculas de DNA como molde. A síntese ocorre pela união de nucleotídeos A, U, C e G, que se alinham seguindo a ordem marcada pelos nucleotídeos complementares do DNA. O pareamento ocorre pelo estabelecimento de ligações transitórias (não covalentes) das bases do DNA com a bases do RNA em formação. 3 4 TRANSCRIÇÃO DO DNA A ligação entre os nucleotídeos consecutivos corresponde a uma ligação fosfodiéster. Nessa ligação um grupo fosfato liga ao carbono 5’ da ribose de um nucleotídeo ao C3’ da ribose do nucleotídeo seguinte. A molécula de RNA é polarizada, com um fosfato na sua extremidade 5’ e uma hidroxila na extremidade 3’. 5 Desoxirribose 2’-Desoxirribose -D-2-desoxirribofuranose H Arranjo antiparalelos dos nucleotídeos 6 Processo bastante variável para atender as necessidades fisiológicas da célula; Apenas uma das cadeias do DNA é copiada, a que tem a direção 3’ ͢ 5’. Portanto o RNA sintetizado a partir da sua extremidade 5’ e progride para a extremidade 3’ TRANSCRIÇÃO DO DNA TRANSCRIÇÃO DO DNA RNA informacional: RNA mensageiro. Sempre é codificado em polipeptídeos pela tradução; RNA funcional: nunca são traduzidos em polipeptídeos e sua ação é puramente no nível de RNA. Ex: tRNA, rRNA, e outros pequenos RNA's; 7 8 Os ribonucleotídeos se agregam um por vez, o que não torna necessária a separação das duas cadeias do DNA em toda sua extensão. Ocorre a separação de um segmento de DNA com cerca de 10 pares de nucleotídeos, o que forma uma “bolha”, que se desloca a medida que os nucleotídeos são lidos. TRANSCRIÇÃO DO DNA 9 A fita molde de DNA não é copiada por completo apenas uma porção desta fita é copiada Fitas molde e codificadora INÍCIO Reconhecimento de sequências específicas no DNA ALONGAMENTO Incorporação dos ribonucleotídeos TERMINAÇÃO Sequências no DNA são reconhecidas e a síntese é interrompida (UAA; UAG; UGA) TRANSCRIÇÃO DO DNA 11 ETAPAS DA TRANSCRIÇÃO Os monômeros com os quais as moléculas de RNA são montadas estão presentes no nucleoplasma como ribonucleotídeos trifosfatos – ATP, UTP, CTP e GTP. O DNA apresenta sequências específicas, denominadas PROMOTORES, que sinalizam exatamente onde a síntese do RNA deve ser iniciada; Os promotores são, primeiramente, reconhecidos por fatores de transcrição que, ligados ao DNA, interagem com outros fatores, formando um complexo ao qual a RNA polimerase se associa; A RNA polimerase forma uma “bolha” – separação das duas cadeias de DNA e deixa exposto o 1º nucleotídeo que vai ser lido. 12 13 ETAPAS DA TRANSCRIÇÃO Ocorre a incorporação de 2 primeiros ribonucleotídeos e a formação da ligação fosfodiéster, pela RNA polimerase e origina um dinucleotídeo; O alongamento progressivo do RNA é conduzido pela mesma RNA polimerase, que desliza sobre o DNA na direção 5’ ͢ 3’ e faz a bolha avançar ; A transcrição é concluída quando a RNA polimerase alcança a sequência de término, situada na extremidade 3’ do gene; A enzima é liberada e também o RNA é liberado – transcrito primário. 14 15 UNIDADE TRANSCRICIONAL 16 17 TRANSCRIÇÃO OBSERVADA EM MICROSCÓPIO ELETRÔNICO ATIVIDADES DA RNA POLIMERASE 1. Reconhecem e ligam-se em sequências específicas do DNA; 2. Desnaturam o DNA na altura dos nucleotídeos que serão transcritos; 3. Mantém as fitas de DNA separadas na região de síntese; 4. Estabiliza o híbrido DNA:RNA na síntese; 5. Renatura o DNA imediatamente após a síntese; 6. Termina a síntese sozinha, ou com ajuda de proteínas. 18 RNA polimerase I – localizada no nucléolo e responsável pela síntese do RNA ribossômico; RNA polimerase II – localizada no nucleoplasma e responsável pela síntese do RNA mensageiro; RNA polimerase III – também localizada no nucleoplasma e responsável pela síntese do RNA transportador. TIPOS DE RNA POLIMERASE 19 E onde fica o RNA? Nos eucariontes é sintetizado no núcleo e depois vai para o citoplasma. Mas procarionte não tem núcleo... Por isso se diz que sua transcrição é acoplada com a tradução 20 Fonte: JUNQUEIRA e CARNEIRO, 2000 21 Transcrição em procariotos 22 Em procariontes, logo após o RNA ser liberado da bolha de transcrição, os ribossomos se ligam e iniciam a tradução; ATIVIDADES PÓS-TRANSCRICIONAIS 23 Em eucariontes, os RNAs sintetizados no núcleo durante o processo de transcrição são chamados de transcritos primários; Na maioria das vezes, esses transcritos não representam a molécula madura, ou seja, aquela cuja sequência e estrutura correspondem à forma final do RNA funcional (mRNA); Esses transcritos necessitam sofrer modificações que fazem parte do processamento do RNA. ATIVIDADES PÓS-TRANSCRICIONAIS 24 25 Síntese de RNA ribossômico O início da síntese do RNAr inicia pela polimerase I associada a outro fator específico. A trancrição de cada uma das cópias do RNAr termina quando a PI alcança a sequência de terminação. Os genes que codificam os RNAt são ativados pela polimerase III e outros fatores específicos. Síntese de RNA transportador 26 Especificidades... Subunidade Sigma -- σ A subunidade sigma da RNA polimerase é fundamental para o reconhecimento específico da região promotora. Ela, juntamente ao cerne da enzima, desliza ao longo do DNA à procura do promotor, não precisando desenrolar a dupla hélice. INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO - PROMOTORES O DNA apresenta sequências específicas, denominadas PROMOTORES, que sinalizam exatamente onde a síntese do RNA deve ser iniciada; São sequências de 100 a 200 nucleotídeos próximos ao sítio de início da transcrição; Os promotores são, primeiramente, reconhecidos por fatores de transcrição que, ligados ao DNA, interagem com outros fatores, formando um complexo ao qual a RNA polimerase se associa; A RNA polimerase liga-se frouxamente à dupla fita de DNA e reconhece o promotor. No promotor, 2 sequências são altamente conservadas: a -10 pb (TATAAT) e a -35 pb (TTGACA), as quais separam-se por, aproximadamente 17 nucleotídeos; O primeiro nucleotídeo a ser transcrito é geralmente uma purina – A ou G; A região -10 recebe o nome de TATAbox; INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO - PROMOTORES 30 31 INÍCIO DA TRANSCRIÇÃO A holoenzima RNA polimerase liga-se especificamente nas regiões -10 e -35 em uma das faces da dupla fita (fita molde). Essa ligação ocorre na cavidade maior do DNA, onde as bases estão acessíveis a proteínas. 33 34 35 36 37 38 PROCESSAMENTO DO RNA Os RNAs são processados no núcleo. Modificações pós-transcricionais: processamento de RNA Conjunto de modificações que ocorre nos transcritos primários até serem convertidos em RNA funcionais. No processamento do RNA ocorre remoção dos segmentos não funcionais. RNAm de procariontes não sofrem alteração. RNAm de eucariontes sofrem grandes modificações. mRNA Proteínapré-mRNA mRNA DNA tradução transcrição processamento PROCESSAMENTO DO RNA 39 40 PROCESSAMENTO DO RNAm Remoção dos íntrons. Adição de duas estruturas: cap e poli A. Cap (extremidade 5’) e poli (extremidade 3’). As adeninas são metiladas. Após o início da transcrição da molécula de mRNA é adicionado um resíduo de guanina à sua extremidade 5’; Este resíduo chamado “cap” sofre, então, metilação (adição do radical metil – CH3) no N7 da guanina, resultando na formação de uma 7-metilguanosina – NUCLEOTÍDEO METILADO; O “cap” protege a extremidade 5’ da ação de exonucleases e, também, é utilizado para reconhecimento, pelo ribossomo, do sítio de início do processo de síntese proteica. CAP 5’ CAP 5’ 42 Recebe o nome de poliadenização a adição de adenina na extremidade 3’ do RNAm. A maioria dos mRNAs possui uma sequência de resíduos de adenina na sua extremidade 3’ que é chamada de cauda poliA (aproximadamente 250 A) e é adicionada à molécula após a transcrição pela enzima poli A polimerase; CAUDA POLI A 43 Funções: Facilitar transporte e tradução Estabilizar a molécula Quando ocorre: Após terminação CAUDA POLI A 44 CAUDA POLI A 45 CAP 5’ CAUDA 3’ 46 REMOÇÃO DE ÍNTRONS E JUNÇÃO DOS ÉXONS Mediado pela RNPpn (proteínas) e RNApn (nucleares pequenos). Ocorre a combinação com o transcrito primário que será processado – complexo molecular denominado “spliceossomo” (splicing). Remove os íntrons; Impede afastamento dos éxons; Une os éxons. PROCESSAMENTO DO RNAm Sítio de PoliA Promotor Região Codificadora hnRNA AAAAAAAAAA mRNA AAAAAAAAAA Exon Intron D N A R N A CAP CAP 47 48 A maioria dos RNAm de organismos superiores ( na maioria mamíferos) possuem o nitrogênio 6 da adenina metilado. Metilação apenas nos exons, provavelmente para proteger as regiões os segmentos funcionais do transcrito primário. METILAÇÃO DA ADENINA 49 PROCESSAMENTO ALTERNATIVO DOS TRANSCRITOS PRIMÁRIOS Um transcrito primário pode ser processado de diferentes maneiras, sendo que, o que é íntron para um mRNA pode ser éxon para outro; Casos de cortes e colagens alternativos são poucos frequentes, apesar disso um transcrito primário pode ser cortado e colado de diferentes maneiras, produzindo RNAm distintos e consequentemente, duas ou mais classes de proteínas ; Essa possibilidade de processamento diferencial em relação à retirada dos íntrons, chamamos de splicing alternativo. 50 PROCESSAMENTO DOS OUTROS RNAs O processamento do RNAr ocorre no nucléolo, ocorrendo a remoção das sequências espaçadoras. Ocorre a formação das subunidades proteicas – RNAr se complexa com várias proteínas; O processamento do RNAt inclui a remoção de um íntron e modificações dos nucleotídeos. Alguns nucleotídeos não são usuais e com isso não podem parear, o que gera uma estrutura tridimensional singular deste tipo de RNA. 51 52 1. Defina regiões promotoras e terminadoras de transcrição. 2. Quais as funções da RNA polimerase na transcrição? 3. Descreva o processo de compactação da mólecula de DNA. 4. Quais são os principais mecanismos de processamento do RNAm? Para responder! 53 Questões • Descreva sucintamente as etapas da transcrição. • No processo de transcrição vemos uma fita dupla de DNA originando o que? As duas fitas do DNA participam do processo? • Em que consiste o processamento do RNA? Para que ele ocorre? • Quais são os três tipos de RNA que podem ser transcritos? Qual o papel de cada um deles? Onde são produzidos e para onde vão? • Compare o processo de transcrição em procariontes e eucariontes. • Relacione os componentes do núcleo e suas respectivas funções. • Quais são os níveis de condensação do genoma? Como ocorre esse processo? • Descreva a organização estrutural da molécula de DNA, sua complementaridade e os tipos de ligações que estabilizam a molécula. • Qual a classificação da cromatina e em que se baseia? • Descreva a estrutura dos cromossomos e relacione com a fase de divisão celular. • Enumere as particularidades estruturais dos tipos de RNA mensageiro, evidenciando as diferenças com a molécula DNA. • Defina gene e explique sua constituição.
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