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ENZIMAS Profa. Maria Santos Reis Bonorino Figueiredo Disciplina: BQA 1 2 •https://www.youtube.com/watch?v=zwZwQO0lAJg Para maior entendimento consulte: Enzimas – Histórico • Louis Pasteur (1822 -1895) foi um dos primeiros cientistas a estudar reações catalisadas por enzimas. Ele acreditava que leveduras ou bactérias vivas eram necessárias para estas reações, a que denominou fermentações - por exemplo, a conversão de glicose em álcool por leveduras. • Em 1897, Eduard Büchner fez um filtrado sem células, que continha enzimas preparadas, triturando células de leveduras com areia bem fina. • As enzimas contidas neste filtrado converteram glicose em álcool, provando assim que para a atividade enzimática não era necessária a presença de células vivas. Búchner recebeu o Prémio Nobel de química em 1907 por este trabalho. 3Enzimas 1.O que são enzimas? • Todas as enzimas são PROTEÍNAS que aceleram reações bioquímicas; Enzimas 4Enzimas 2. Características (Propriedades) das Enzimas 1. São catalisadores extremamente eficientes e aceleram em média 109 a 1012 vezes a velocidade da reação. 2. Atuam em concentrações muito baixas; 3. Possuem todas as características das proteínas; 4. Requerem condições brandas para atuar (temperatura, pH); 5. Possuem alta especificidade em relação aos substratos e aos produtos, isto é cada reação é catalisada por uma enzima específica; 6. Possuem a capacidade de serem reguladas; 7. Possuem sítio catalítico/sítio ativo; 5Enzimas 3. Aplicação das Enzimas a) Na agricultura Caracterização de variedades de milho, feijão, soja, etc., através de isoenzimas; b) Na indústria: transformação industrial de dissacarídeos em frutose pela frutose isomerase; c) Na Biologia e Genética Molecular - Engenharia Genética - Enzimas de restrição, etc. d) Fabricação de pães, vinhos, cervejas, etc., produtos fermentados; . 6Enzimas 7 e) No tratamento de efluentes: O desenvolvimento das chamadas tecnologias limpas, ou seja, que reduzem o impacto ambiental de uma atividade industrial, conta com a participação de enzimas. Um exemplo é o uso na produção de polpa de celulose e no branqueamento desta. O objetivo do branqueamento é remover da polpa de papel as impurezas de lignina com tonalidade escura e obter um certo nível de qualidade. No branqueamento tradicional é utilizado o cloro molecular ou gasoso em combinação com outros produtos químicos que contém cloro e hiplocorito. Combinadas com técnicas de processamento, as enzimas permitem reduzir ou até eliminar o uso de cloro nessas atividades industriais, evitando a emissão de substâncias organocloradas – altamente tóxicas e mesmo cancerígenas – para o ambiente. Enzimas no tratamento de efluentes e resíduos industriais. As águas residuais das indústrias alimentícias, por exemplo, contêm gorduras sólidas ou líquidas (graxas e óleos), que causam sérios problemas de poluição, ao formar filmes na superfície dos corpos receptores (impedindo o fluxo do oxigênio necessário à vida aquática) e ao causar entupimentos. A adição de lipases a esses efluentes gera substâncias mais simples, facilmente degradadas, evitando tais problemas. f) Na clínica: As enzimas podem ser utilizadas nas Análises Clínicas: Como indicadoras de lesão celular e tecidual O extravasamento de enzimas do meio intra para o meio extracelular leva a um aumento da atividade destas no sangue; Esta atividade pode ser medida e fornece importante informação diagnóstica e de evolução de um quadro clínico. Exemplos de doenças que podem ser diagnosticadas e acompanhadas enzimaticamente são: O Infarto Agudo do Miocárdio As Hepatites A Pancreatite 8Enzimas 4. Componentes da Reação Enzimática E + S E S E + P E - Enzima S - Substrato(s) ES - Complexo Enzima -Substrato P – Produto(s) Obs. No final da reação a enzima é regenerada, podendo catalisar nova reação. 9Enzimas 5. Centro Catalítico/Sítio Ativo Região da molécula enzimática onde o substrato se liga; É formado por grupos funcionais dos radicais de alguns aminoácidos (ex. : ácidos, básicos, alcoólicos, cisteína etc.) 10Enzimas Glicose Hexoquinase Complexo Hexoquinase-Glicose + Figura 1. Ligação do substrato ao sítio ativo da enzima e alteração conformacional da enzima. Alteração conformacional da Hexoquinase 11Enzimas http://www.chem.ucsb.edu/~molvisual/ABLE/induced_fit/index.html https://www.rcsb.org/pdb/home/sitemap.do Fig 2. Interações entre radicais de aminoácidos do sítio ativo da enzima e substrato. 12Enzimas 13Enzimas Enzimas - Cofatores Porção protéica APOENZIMA Cofator HOLOENZIMA Íon Coenzima Grupamento prostético Algumas enzimas requerem para sua atividade substâncias orgânicas (maioria deriva de vitaminas hidrossolúveis) ou inorgânicas (ions com Fe, Cu) COFATORES Enzimas E + S + Cofator (C) E S C E + P 6.Como determinar a Atividade Enzimática Na prática usa-se 2 formas para se determinar a atividade enzimática: a) Pelo consumo do substrato; b) Pelo aparecimento do produto; 15Enzimas 7. Medida da Atividade Enzimática Unidade Internacional de Enzima (U) é definida como nº de μmols de substrato transformado ou produto formado por mL de solução por minuto em pH e temperatura padronizados. Expressa como:U= μM/mL/min ou U= μMmL-1 min-1 Atividade Internacional de Enzima (U){ 16Enzimas Enzimas Catalisadores Aumentam a velocidade das reações Atuam diminuindo a energia de ativação 8. Mecanismo de ação das enzimas 17Enzimas a) Energia de Ativação - É a mínima quantidade de energia necessária para que ocorra colisão entre as partículas dos reagentes resultando em reação; - 18Enzimas 19 a) Energia de Ativação - É a mínima quantidade de energia necessária para que ocorra colisão entre as partículas dos reagentes resultando em reação; - 20Enzimas 12. Cinética Enzimática É a parte da enzimologia que estuda a velocidade das reações enzimáticas, e os fatores que influenciam nesta velocidade. Uma reação enzimática pode ser expressa pela seguinte equação: E + S <==> [ES] ==> E + P 21Enzimas A velocidade de uma reação enzimática depende de fatores como: Temperatura, pH, Concentrações de ENZIMA , Concentrações de SUBSTRATO, 22Enzimas 23 a) Efeito do pH sobre a atividade enzimática Variações do pH afeta substrato com grupos ionizáveis; Cada enzima possui um pH ÓTIMO, onde a distribuição de cargas elétricas da molécula, em especial do sítio ativo é ideal para a catálise. A partir daí a atividade é reduzida devido a desnaturação da enzima. Enzimas Enzyme pH Optimum Lipase (pancreas) 8.0 Lipase (stomach) 4.0 - 5.0 Pepsin 1.5 - 1.6 Trypsin 7.8 - 8.7 Amylase (pancreas) 6.7 - 7.0 24 6. b) Efeito Temperatura sobre a atividade enzimática Quanto > a temp. > a vel.da reação, até se atingir a TEMPERATURA ÓTIMA; A partir dai, a atividade , por desnaturação; Em Temp. as reações + lentas da energia cinética do sistema. Enzimas 25 6.c) Efeito da concentração do substrato No gráfico podemos observar o efeito da concentração do substrato sobre a velocidade de uma reação catalisada por uma enzima A forma da curva é hiperbólica para a maioria das enzimas, chamada de curva de Michaelis - Menten; Em altas conc. de substrato as Enzimas são saturadas pelo substrato,por isso a curva se mantém quase constante. 26Enzimas Enzima Substratos Km (mM) Hexoquinase D-glicose 0,05D-frutose 1,5 ATP 0,4 Importância da constante de Michaelis-Menten (Km) Km é a S que fornece a ½ da Vmáx km = “afinidade” da enzima pelo substrato: Km afinidade Os Km de muitas enzimas são próximos das concentrações fisiológicas de seus substratos, de forma que pequenas variações nas S podem levam a grandes variações na velocidade. Conforme tabela: A hexoquinase mostra: afinidade pela D-glicose. 27Enzimas 13. Inibição Enzimática Os inibidores enzimáticos são compostos que podem diminuir a atividade de uma enzima. Servem como forma de regulação do metabolismo, inibindo as reações quando necessário. Mas nem todas as enzimas são reguladas por inibidores. 28Enzimas Podem ser : 7.a). Inibidor Irreversível 29Enzimas Caracteristicas: Liga-se covalentemente à enzima formando um complexo estável, e não se desliga; É o que ocorre com: • Metais pesados; • Certos agrotóxicos; • Alguns medicamentos Exemplo - Aplicação dos inibidores Irreversíveis na clínica Inibição da enzima ciclo-oxigenase pelo acetilsalicilato (aspirina) Ciclo-oxigenase Prostaglandinas Processos fisiológicos, como sensação de dor e resposta inflamatória Ácido araquidônico 30Enzimas 13.2. Inibição Enzimática Reversível Inibidor forma com a enzima um complexo INSTÁVEL Inibição NÃO envolve modificação COVALENTE Inibidores reversíveis podem ser: Competitivos Não competitivos 31Enzimas Inibição Reversível Competitiva Inibidor tem semelhança estrutural com o substrato O inibidor se liga no sítio ativo da enzima Inibição depende das S e I . Assim o aumento da [substrato] diminui a inibição 32Enzimas 33Enzimas Exemplo de Inibição Competitiva na Clínica Intoxicação por Metanol Causa lesão tecidual cegueira Metanol Álcool desidrogenase Infusão EV Etanol URINA Formaldeído A intoxicação por metanol pode ser revertida pela infusão de etanol. O etanol competem com o metanol pelo sitio ativo da álcool desidrogenase. Desta forma não ocorre a formação de formaldeído (tóxico, e que causa lesão tecidual e cegueira) e o metanol é eliminado pela urina. CH3 – CH2 - OH Inibição Reversível Não-Competitiva • Inibidor não tem semelhança estrutural com o substrato ; • NÃO se liga no sítio ativo da enzima; • Exemplos: 34Enzimas 14. Mecanismos de Regulação da Atividade Enzimática • Algumas enzimas podem ter suas atividades reguladas, atuando assim como moduladoras do metabolismo celular. Esta modulação é essencial na coordenação dos inúmeros processos metabólicos pela célula. • A regulação mais comum é a Regulação por Alosterismo - enzimas alostéricas 35Enzimas 36 a) Regulação por alosterismo Ocorre nas enzimas alostéricas. Enzimas alostéricas possuem além do sítio ativo, outro sítio, SÍTIO ALOSTÉRICO, onde se ligam de forma não-covalente ativadores ou inibidores (moduladores ou efetores alostéricos) . Um modelo muito comum de regulação alostérica é a inibição por "FEED-BACK", onde o próprio produto da reação atua como modulador da enzima que a catalisa. Enzimas A ligação do modulador induz modificações conformacionais na estrutura da enzima, modificando a afinidade desta para com os seus substratos; 37 Enzimas Alostéricas (Caracteristicas) São geralmente oligoméricas (2 subunidades ou mais ); Contêm sítios ativos + sítio regulatórios (sítio alostérico); No sítio alostérico podem se ligar : Inibidores ou ativadores; Apresentam cinética sigmóide de velocidade e não obedecem a cinética de Michaelis-Mentem; Enzimas 14. Nomenclatura das enzimas Existem 3 métodos para nomenclatura enzimática: Nome recomendado: -Sufixo “-ase” adicionado ao nome do substrato da reação ou à descrição da ação realizada.Ex: Glicosidase, urease, sacarase, Hexoquinase, Peptidase. Nome Sistemático:-União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular, desenvolveu um sistema dividindo as enzimas em 6 classes principais. - Mais complexo, nos dá informações precisas sobre a função metabólica da enzima. Ex: ATP-Glicose-Fosfo-Transferase; Nome Usual : Consagrados pelo uso; Exs: Tripsina, Pepsina, Ptialina. 38 39 A enzima urease de acordo com a União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUMBM) recebe o nome de uréia amidohidrolase e tem a seguinte classificação: EC 3.5.1.5, Onde: EC – Classificação enzimática 3. – Classe das Hidrolases 5. – Subclasse das Hidrolases que quebram ligações C-N 1. – Subclasse das Hidrolases que quebram ligações C-N em amida linear 5. – Número de ordem da enzima 40Enzimas Número Classificação Propriedades Bioquímicas 1. Oxidoredutases Agem em muitos grupos químicos, adicionando ou removendo hidrogênio. 2. Transferases Transferem grupos funcionais entre moléculas doadoras e moléculas aceptoras. 3. Hidrolases Adicionam água a uma ligação, hidrolizando-a. 4. Liases Adicionam água, amônia ou dióxido de carbono a duplas ligações, ou removem estes elementos para produzirem duplas ligações. 5. Isomerases Catalisam uma variedade de reações de isomerização: do tipo L para D, reações de mutação (troca de grupos químicos) entre outras. 6. Ligases Catalisam reações em que dois grupos químicos são unidos utilizando energia fornecida pelo ATP. 15. Classificação internacional das enzimas (classe, código e tipo de reação catalisada) 41 42 ESTUDO DIRIGIDO (ENZIMAS) 1. Explicar a importância das enzimas para os seres vivos. 2. Conceituar enzimas e dizer quais são suas características catalíticas. 3. Dizer quais são os componentes das reações enzimáticas. 4. Explicar sítio ativo. 5. Explicar as formas de ligação do substrato ao sítio ativo e correlacionar com especificidade enzimática. 6. Explicar energia de ativação. 7. Explicar qual é a unidade de medida do poder catalítico das enzimas. 8. Explicar como se pode medir a atividade das enzimas. 9. Conceituar cinética enzimática e citar os fatores que influenciam a velocidade das reações enzimáticas. 10. Explique as figuras apresentadas abaixo (Figuras 1, 2 e 3) Figura 1 Figura 2 Figura 3 11. Caracterizar inibidores enzimáticos reconhecendo as diferenças entre eles: a) Irreversível; b) Reversível competitivo; c) Reversível não Competitivo. Citar exemplos e aplicações para os mesmos. 15. Explicar a regulação alostéricas das enzimas. 43 pH está relacionado com a H+; Como a H+admissível nas células está na faixa de 1 a 10-14 M, estes valores foram transformados em –log H+, obtendo-se números inteiros (de 0 a 14) denominados de pH. Por isso a escala de pH vai de 0 a 14. As células admitem uma H+= 10-7 , equivalente ao pH 7,0, compatíve com suas funções. Abaixo ou acima desta concentração as proteínas são desnaturadas e perdem suas funções biológicas. Revisão 2 O que significa pH? 44 Revisão 2 Escala de pH
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