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Introdução a Bioquímica PROF. MARIANA REIS GUEDES DISC. BIOQUÍMICA Bioquímica Questiona como as extraordinárias propriedades dos organismos vivos se originaram a partir de milhares de moléculas de biomoléculas diferentes; Quando essas moléculas são isoladas e examinadas individualmente, elas seguem todas as leis físicas e químicas que descrevem o comportamento da matéria inanimada. O estudo da bioquímica mostra como o conjunto de moléculas inanimadas que constituem os organismos vivos interagem para manter e perpetuar a vida Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Polímeros muito longos, cada qual com sua sequencia característica de subunidades Sua estrutura tridimensional única Seletividade de parceiros para interação na célula Elevado grau de complexidade química e organização microscópica: Milhares de moléculas diferentes formam as intricadas estruturas celulares internas Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Permite aos organismos construir e manter suas intricadas estruturas: realizar trabalho mecânico, químico, osmótico e elétrico, o que neutraliza a tendência da matéria decair para um estado mais desorganizado equilíbrio com o ambiente Sistema para extrair, transformar e utilizar a energia do ambiente Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Mudança em um componente causam mudanças coordenadas ou compensatórias em outro, com o todo manifestando uma característica além das partes individuais O conjunto de moléculas realiza um programa, cujo resultado final é a reprodução e a autopreservação do conjunto de moléculas isso é a vida! Funções definidas para cada componentes de um organismo e interações reguladas entre eles, valido para estruturas macroscópicas e intracelulares microscópicas e compostos químicos individuais. Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Os organismos constantemente se ajustam a essas mudanças por adaptações de sua química interna ou de sua localização no ambiente. Mecanismos para sentir e responder às alterações no seu ambiente Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Uma célula bacteriana isolada disposta em meio nutritivo estéril pode dar origem, em 24 horas, a um bilhão de “filhas idênticas” devido ao material genético da célula original Em maior escala: a prole de um animal vertebrado mostra uma semelhança marcante com seus pais, também como consequência da herança genética Capacidade para se autorreplicar e automontar com precisão Bioquímica De fato: os organismos vivos têm propriedades extraordinárias que os distinguem das outras porções da matéria; Quais propriedades peculiares dos organismos vivos? Os organismos alteram suas estratégias de vida herdadas, a passos muito pequenos, para sobreviver em circunstâncias novas. O resultado de eras de evolução é uma enorme diversidade de formas de vida, muito diferentes superficialmente, mas fundamentalmente relacionadas por sua ancestralidade comum. Capacidade de se alterar ao longo do tempo por evolução gradual Bioquímica A bioquímica descreve em termos moleculares as estruturas, os mecanismos e os processos químicos compartilhados por todos os organismos e estabelece princípios de organização que são a base da vida em todas as suas formas, princípios esses referidos como A LÓGICA MOLECULAR DA VIDA. Fundamentos Celulares A unidade e a diversidade dos organismos se tornam aparentes mesmo em nível celular. Os menores organismos consistem em células isoladas e são microscópicas Os organismos multicelulares maiores têm muitos tipos celulares diferentes, os quais variam de tamanho, forma e função especializada. Apesar dessas diferenças óbvias, todas as células dos organismos, desde as mais simples ao mais complexo, compartilham determinadas propriedades fundamentais, que podem ser vistas em nível bioquímico Fundamentos Celulares Células compartilham algumas características em comum: Membrana plasmática: define o contorno, separando seu conteúdo do ambiente. o Composta por: moléculas de lipídeos e proteínas; o Barreira fina, resistente, flexível e hidrofóbica; o Impede a passagem: íons inorgânicos, compostos carregados ou polares; o Proteínas de transporte: permite a passagem de determinados íons e moléculas; o Proteínas receptoras: transmitem sinais para o interior da célula; o Enzimas de membranas: participam de rotas de reações Fundamentos Celulares Células compartilham algumas características em comum: Citoplasma: volume interno envolto pela membrana plasmática o Composta por: solução aquosa – citosol e partículas em suspensão com funções específicas, como: mitocôndria e cloroplastos, ribossomos e proteossomos Fundamentos Celulares Células compartilham algumas características em comum: Núcleo – nucleoide: local onde se encontra o genoma: genes compostos por DNA o Núcleo: Confinado dentro de uma dupla membrana no citoplasma. o Nucleoide: região de forma irregular dentro da célula de um procariota Fundamentos Químicos A bioquímica tenta explicar as formas e as funções biológicas em termos químicos concluíram que a matéria viva era impressionantemente diferente daquela do mundo inanimado. A simplicidade do “mundo mineral” se contrastou com a com a complexidade dos mundos “animal e vegetal” Constituídos de compostos ricos em elementos: - Carbono - Oxigênio - Nitrogênio - Fósforo Fundamentos Químicos A química dos organismos vivos está organizada em torno do carbono, que contribui com mais da metade do peso seco das células. O carbono pode formar ligações simples com átomos de hidrogênio e ligações simples e duplas com átomos de oxigênio e nitrogênio A capacidade dos átomos de carbono de formar ligações simples estáveis com até quatro átomos de carbono é de grande importância para a biologia, formando duplas ou triplas ligações. Fundamentos Químicos Arranjo tetraédrico 4 Ligações químicas simples Ligação simples C-C Liberdade de rotação Ligações duplas são curtas Não permite rotação Fundamentos Químicos Átomos de carbono covalentemente ligados em biomoléculas podem formar cadeias lineares, ramificadas e estruturas cíclicas. A versatilidade de ligação do carbono com outro carbono e com outros elementos foi o principal fator na seleção dos compostos de carbono para a maquinaria molecular das células durante a origem e a evolução dos organismos vivos. Nenhum outro elemento químico consegue formar moléculas com tanta diversidade de tamanhos, formas e composição Fundamentos Físicos As células e organismos vivos precisam realizar trabalho para se manterem vivos e se reproduzir; As reações que ocorrem dentro das células, exigem o consumo de energia (movimentos, descarga elétrica,..) O armazenamento e a expressão de informação requerem energia, sem a qual estruturas ricas em informações inevitavelmente se tornam desordenadas e sem sentido Fundamentos Físicos No curso da evolução, as células desenvolveram mecanismosaltamente eficientes para aproveitar a energia: Luz solar Combustível químico BIOQUÍMICA Compreender em termos químicos e quantitativos, os meios pelos quais a energia é extraída, armazenada e canalizada para o trabalho nas células Fundamentos Físicos Um organismo vivo é um sistema aberto, ele troca matéria quanto energia com seu meio Os organismos obtém energia do meio de duas formas: 1- Absorvendo combustível químico (glicose) do seu meio e extraindo energia pela oxidação desses combustíveis 2- Absorvendo energia da luz solar A primeira lei da termodinâmica: em qualquer mudança física ou química, a quantidade total de energia no universo permanece constante, embora a forma da energia possa mudar. Isso significa que, quando a energia é “usada” pelo sistema, ela não é “gasta”, mas convertida de uma forma em outra Estrutura química da vida Para essas estruturas, os átomos necessitam estabelecer ligações químicas (ligações iônicas, covalentes) entre si para ficarem estáveis; Através das ligações químicas são formadas as moléculas as quais constituem as estruturas químicas que formam as células; As moléculas que constituem uma célula podem desempenhar diversas funções, dentre elas podemos destacar: estrutural, energética e enzimática. Estrutura química da vida Dentre essas moléculas que fazem parte da constituição celular, podemos destacar: Água Proteínas Lipídeos Carboidratos Ácidos Nucleicos Minerais Grupos funcionais presentes nas biomoléculas Hidrocarbonetos Grupamentos contendo oxigênio Funcionalidade nos sistemas biológicos Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos Olhos visão Pernas locomoção Intestino digestão Isso também é verdade a nível celular Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue) transporte de O2 Neurônios sinalização e processamento nervoso Funcionalidade nos sistemas biológicos E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias metabólicas Anticorpos(proteínas) Enzimas(proteínas) Glicose Via glicolítica Via da biossíntese de glicogênio Compreender a função de cada sistema bioquímico é muito importante porque só assim é possível saber porque, afinal de contas, ele existe e como ele interage com outros sistemas cada um com sua função Resposta imune Catálise Combustível biológico Obtenção de energia pela oxidação da glicose Armazenamento de combustível na forma de glicogênio
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