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FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AV1 HELINE COSTA SOARES CONTEÚDO DESTA AULA Estrutura e função das biomoléculas Bioquímica dos aminoácidos Bioquímica das proteínas Enzimas e cinética enzimática Desnaturação de proteínas Introdução ao metabolismo FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA O que distingue os organismos vivos dos seres inanimados? 1) Estrutura complexa e alto índice de organização; 2) Adaptação ao meio e evolução; 3) Capacidade de auto replicação e auto montagem; 4) Extração, transformação e utilização da energia que encontram no meio ambiente, sob forma de nutrientes químicos ou luz solar. A Bioquímica e a Condição Vital X www.freepik.com/free-photos-vectors FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ÁTOMOS E MOLÉCULAS ÁTOMO PRÓTONS ELETROSFERA NÊUTRONS NÚCLEO ELÉTRONS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA • Ex. Água e sais minerais. COMPOSTOS INORGÂNICOS ÁCIDO CLORÍDRICOCLORETO DE SÓDIO O H H ÁGUA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA • Carboidratos, proteínas, lipídeos, vitaminas, ácidos nucleicos COMPOSTOS ORGÂNICOS CAFEÍNA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ÁTOMO MOLÉCULAS ORGANELAS CÉLULAS TECIDOS ÓRGÃOS SISTEMAS CORPO https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Watermolecule.svg ÁGUA https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Wasserstoffbr%C3%BCckenbindungen-Wasser.svg Ligações de Hidrogênio Ligação covalente FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA SOLUBILIDADE DAS MOLÉCULAS HIDROFÍLICAS POLARES HIDROFÓBICAS APOLARES ANFIPÁTICAS X X FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Qual a polaridade das moléculas? https://commons.wikimedia.org/wiki /File:SaltInWaterSolutionLiquid.jpg Ácidos e Bases a) Ácidos - Moléculas que liberam íons H+ quando os átomos se dissociam, aumentando sua quantidade na solução. b) Bases - Moléculas que liberam íons OH- quando os átomos se dissociam, aumentando sua quantidade na solução. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Medida de pH – Potencial hidrogeniônico Indica a concentração de íons H+ ou H3O + em uma solução aquosa, indicando acidez ou alcalinidade. Quanto mais íons H+, mais ácida é a solução e menor é o valor do pH. https://pt.wikipedia.org/wiki/PH#/media/File:EscalapH.png FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Medida de pH – Potencial hidrogeniônico pH= -log10 [H +] Coca-cola – pH =3,0 Café – pH= 5,0 Sangue – pH= 7,4 10.000x 100x A escala de pH é logarítmica e não aritmética, ou seja, dizer que duas concentrações diferem por 1 unidade, significa que uma solução possui 10 vezes a concentração de H+ da outra. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Medida de pH – Potencial hidrogeniônico O pH de soluções aquosas pode ser medido de várias formas tais como soluções indicadoras, fitas indicadoras ou através de eletrodos de vidro sensíveis a concentrações de H+. https://pt.wikipedia.org/wiki/PHmetro#/media/File:PH_meter.JPG FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Sistema Tampão – É um sistema aquoso que resiste a alterações do seu pH quando pequenas quantidades de ácido (H+) ou base (OH-) são adicionadas. Consiste de um ácido fraco e sua base conjugada em concentrações aproximadamente iguais. • Tamponamento - Capacidade de uma solução resistir a variações de pH. TAMPÕES BIOLÓGICOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA H2O https://pt.wikipedia.org/wiki/Ficheiro:Titula%C3%A7%C3%A3o.tif TAMPÕES BIOLÓGICOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Os principais sistemas-tampão em nosso organismo são: tampão fosfato, tampão bicarbonato e a proteína hemoglobina. (Wilkins, R.L., 2010) FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA MONÔMEROS X MACROMOLÉCULAS PROTEÍNAS AMINOÁCIDOS CARBOIDRATOS MONOSSACARÍDEOS LIPÍDIOS ÁCIDOS GRAXOS NUCLEOTÍDEOS ÁCIDOS NUCLÉICOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA REVISANDO AS PROTEÍNAS • Biomoléculas orgânicas mais abundantes nos seres vivos depois da água. • Formadas por : C, O, N e H. • Polímeros constituídos por aminoácidos Estrutura básica Aminoácido * Carbono α * FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Existem 20 aminoácidos comumente encontrados nas proteínas. O átomo de carbono α é um centro quiral ou centro assimétrico. Nas proteínas são encontrados estereoisômeros L. * exceção da glicina * * FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Em pH fisiológico (aproximadamente 7,4), o grupo carboxila encontra-se dissociado, formando o íon carboxilato, carregado negativamente (–COO–), e o grupo amino encontra-se protonado (–NH+). Os 20 AA se dividem em apolares, polares desprovidos de carga e polares com carga Classificação dos 20 aminoácidos comumente encontrados nas proteínas de acordo com a carga e a polaridade: FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Grupo R apolar FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Grupo R polar, não carregado FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA AMINOÁCIDOS Grupo R polar, carregado positivamente Grupo R polar, carregado negativamente FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA • Classificação dos aminoácidos de acordo com a sua essencialidade AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNÇÕES DOS AMINOÁCIDOS • Fonte de energia (ATP) • Tampão de pH intracelular • Matéria prima para produção de proteínas • São encontrados polimerizados formando proteínas ou livres • Alguns atuam como neurotransmissores • Alguns são biotransformados em neurotransmissores • Alguns são biotransformados em hormônios. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Exemplos de aminoácidos que apresentam funções específicas e de fundamental importância para diferentes funções bioquímicas. • Glicina, GABA, Taurina – neurotransmissores inibitórios no sistema nervoso; • Aspartato e Glutamato - neurotransmissores excitatórios no sistema nervoso • Triptofano - precursor de serotonina e também pode atuar como neurotransmissor; • Tirosina - precursor da adrenalina, noradrenalina e dopamina, bem como dos hormônios produzidos pela glândula tireoide, T3 e T4; • Histamina - derivado de aminoácido que participa como mediador de reações alérgicas. FUNÇÕES DOS AMINOÁCIDOS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA LIGAÇÃO PEPTÍDICA • Função mais relevante dos aminoácidos é atuar como unidade básica (monômero) para a formação das proteínas. • A união de até 10 aa : oligopeptídeo. • Se superior a 10 aa: polipeptídeo. • Se o n for superior a 50 aa: proteína. https://www.youtube.com/watch?v=D3fOXt4MrOM FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA LIGAÇÃO PEPTÍDICA https://www.youtube.com/watch?v=cgf1l3YQPXo Ligação simples: C-N = 1,49 Å Ligação dupla: C=N = 1,27 Å Ligação peptídica = 1,33 Å Unidade peptídica é rígida e plana FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA LIGAÇÃO PEPTÍDICA @ p ro fh el in e Ligação Peptídica (Ligação Covalente) FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Uma cadeia polipeptídica é constituída de uma parte repetida regularmente, cadeia principal ou espinha dorsal, e de uma parte variável, compreendendo as distintas cadeias laterais ou grupos R. ESTRUTURA DE PROTEÍNAS Ser Gly Tyr Ala Leu C - terminalN - terminal FUNÇÕES DAS PROTEÍNAS ✓ Estrutural ✓ Transporte ✓ Defesa✓ Enzimática ✓ Hormonal https://pdb101.rcsb.org/motm/14 ✓ Contração muscular https://www.youtube.com/watch?v=ousflrOzQHc FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CLASSIFICAÇÃO DAS PROTEÍNAS: 1) Proteínas Simples: Formadas somente pelo encadeamento de aminoácidos. Ex: globulinas, albuminas. 2) Proteínas Complexas: Formadas por aminoácidos mais um radical não- proteico (prostético). Ex: cromoproteínas (hemoglobina); glicoproteínas; fosfoproteínas; nucleoproteínas; lipoproteínas. ESTRUTURAS DAS PROTEÍNAS a – Estrutura primária = sequência específica de aminoácidos, unidos porligações peptídicas. b – Estrutura secundária = As cadeias polipeptídicas podem formar alfa-hélices ou estruturas beta- pregueadas, que são estabilizadas por ligações de hidrogênio. c – Estrutura terciária = é o arranjo tridimensional de todos os átomos, conformação das cadeias laterais, posição dos grupos prostéticos, e o arranjo das - hélices e -pregueadas com relação uma as outras. d – Estrutura Quaternária = está presente em proteínas que possuem mais de uma cadeia polipeptídica (subunidades), é a interação espacial entre as subunidades. https://commons.wikimedia.org/wiki/File:225_Peptide_Bond-01.jpg#/media/File:225_Peptide_Bond- 01_labeled.jpg FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA ESPACIAL O enovelamento de proteínas (arranjo espacial) que resulta nas estruturas secundária, terciária e quaternária é obtido através de ligações fracas (forças não-covalentes): • ligações de hidrogênio; • forças de interação hidrofóbica; • interação iônica. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA ESPACIAL FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Cada proteína tem uma função química e uma estrutura específica. Cada proteína tem um pequeno número de formas estruturalmente estáveis. A estabilidade das proteínas é determinada principalmente por interações não-covalentes. As proteínas possuem alguns padrões estruturais comuns. Ex. Insulina em várias espécies. FUNÇÕES x ESTRUTURA PROTEICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNÇÕES x ESTRUTURA PROTEICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA DAS PROTEÍNAS Quando uma proteína é sintetizada na célula, sua estrutura primária dobra-se espontaneamente, originando as estruturas secundária, terciária e quaternária. A proteína assume então, sua conformação NATIVA. DESNATURAÇÃO - Alteração ou destruição da estrutura espacial das proteínas, mantendo somente a estrutura primária. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA DESNATURAÇÃO DAS PROTEÍNAS FATORES: • Temperatura. • pH. • Ação de solventes orgânicos. • Agentes oxidantes e redutores. • Agitação intensa. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CONSEQUÊNCIAS DA DESNATURAÇÃO • Diminuição de solubilidade. • Perda da atividade biológica. • Alterações na viscosidade e coeficiente de sedimentação. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA BIOMOLÉCULAS - REVISANDO AS ENZIMAS ✓ ENZIMAS • São proteínas que apresentam atividade catalítica. Algumas são feitas de RNA • São altamente específicas. • Não são gastas nas reações químicas. Harvey e Ferrier, 2012 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CINÉTICA ENZIMÁTICA Para que as moléculas reajam, é necessária uma quantidade inicial de energia no sistema: energia de ativação. ` As enzimas (catalisadores) diminuem a energia de ativação, acelerando a reação, à custa da energia de ligação liberada das ligações entre a enzima e o substrato. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ENZIMAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA PROPRIEDADES DAS ENZIMAS A região a qual o substrato se liga à enzima é chamada centro ativo (ou sítio ativo) da enzima. O centro ativo é formado por resíduos de aminoácidos que estão próximos devido à sua estrutura terciária. O centro ativo constitui uma cavidade com forma definida, que permite à enzima “reconhecer ” o substrato. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNCIONAMENTO ENZIMÁTICO Modelo de encaixe induzido FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Cofator Inorgânico: Íons metálicos Orgânico: Coenzima cofator Apoenzima (inativa) + cofator holoenzima (ativa) - A atividade de uma enzima depende de sua integridade e conformação nativas. - A atividade de algumas enzimas depende de cofatores ENZIMAS FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CINÉTICA ENZIMÁTICA Fatores que interferem na velocidade das reações enzimáticas • Fatores externos • Temperatura • pH • Fatores internos • [ ] de substrato • [ ] de enzima • Presença de inibidores FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CINÉTICA ENZIMÁTICA Substrato x atividade enzimática FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA INIBIDOR ENZIMÁTICO • Inibição reversível • Inibição irreversível. - Inibidor é uma substância que diminui a velocidade de uma reação - Papel regulador importante FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA INIBIDOR ENZIMÁTICO - Inibição competitiva: Inibidor compete com o substrato pelo sítio ativo enzimático. - Inibição não-competitiva: Inibidor se liga a um ponto diferente do sítio ativo, inibindo o complexo ES. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Cada proteína tem uma função química e uma estrutura específica. Cada proteína tem um pequeno número de formas estruturalmente estáveis. A estabilidade das proteínas é determinada principalmente por interações não-covalentes. As proteínas possuem alguns padrões estruturais comuns. Ex. Insulina em várias espécies. FUNÇÕES x ESTRUTURA PROTEICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA ESTRUTURA DAS PROTEÍNAS Quando uma proteína é sintetizada na célula, sua estrutura primária dobra-se espontaneamente, originando as estruturas secundária, terciária e quaternária. A proteína assume então, sua conformação NATIVA. DESNATURAÇÃO - Alteração ou destruição da estrutura espacial das proteínas, mantendo somente a estrutura primária. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA DESNATURAÇÃO DAS PROTEÍNAS FATORES: • Temperatura. • pH. • Ação de solventes orgânicos. • Agentes oxidantes e redutores. • Agitação intensa. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA CONSEQUÊNCIAS DA DESNATURAÇÃO • Diminuição de solubilidade. • Perda da atividade biológica. • Alterações na viscosidade e coeficiente de sedimentação. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABOLISMO • É o conjunto de processos físicos e de reações que ocorrem em um sistema vivo e resulta na montagem ou quebra de moléculas complexas. É constituído por reações anabólicas e catabólicas. Anabolismo • Reações de síntese • Absorvem energia • Exemplo: Glicogênese Catabolismo • Reações de degradação • Liberam energia • Exemplo: Glicólise Glicogenólise FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNÇÕES DO METABOLISMO • Obter energia química capturando energia solar ou degradando nutrientes; • Converter moléculas dos nutrientes e da célula em precursores de macromoléculas. • Polimerizar precursores em macromoléculas. • Sintetizar e degradar biomoléculas de acordo com a necessidade celular. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA Proteínas Polissacarídeos Lipídeos Ác. Nucleicos Aminoácidos Açúcares Ácidos Graxos Bases Nitrogenadas Carboidratos Gorduras Proteínas CO2 H2O NH3 FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA METABOLISMO FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA TIPOS DE VIAS METABÓLICAS • As vias consistem em uma sequência de passos catalisados por enzimas. • As enzimas podem estar: ✓ Separadas; ✓ Formando complexos multienzimáticos; ✓ Formar sistemas associados as membranas. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA REGULAÇÃO DO METABOLISMO • Síntese e degradação de uma molécula não podem ocorrer simultaneamente na mesma célula ou tecido. • Para que as rotas sejam controladas devem utilizar enzimas distintas e compartimentos celulares diferentes. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 1 Na estrutura de uma proteína os aminoácidos são ligados em sequência definida através de ligações: A) De hidrogênio B) Peptídicas C) Glicosídicas D) Fosfodiéster E) Interações iônicas FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 1 Na estrutura de uma proteína os aminoácidos são ligados em sequência definida através de ligações: A) De hidrogênio B) Peptídicas C) Glicosídicas D) Fosfodiéster E) Interações iônicas FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO2 2) A respeito do pH assinale a alternativa INCORRETA: A) o pH é uma medida da concentração de íons H+ em uma solução aquosa. B) Como a medida de pH é logarítmica e não aritmética, a variação em uma unidade de pH significa que houve alteração de dez vezes na concentração de íons H+. C) Alterações de pH dos compartimentos biológicos não altera a maioria dos processos bioquímicos, já que macromoléculas como proteínas não são sensíveis a alterações de pH. D) Os sistemas tampão do organismo ajudam a manter o pH fisiológico. E) O sistema tampão bicarbonato é importante para manter o pH sanguíneo. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 2 2) A respeito do pH assinale a alternativa INCORRETA: A) o pH é uma medida da concentração de íons H+ em uma solução aquosa. B) Como a medida de pH é logarítmica e não aritmética, a variação em uma unidade de pH significa que houve alteração de dez vezes na concentração de íons H+. C) Alterações de pH dos compartimentos biológicos não altera a maioria dos processos bioquímicos, já que macromoléculas como proteínas não são sensíveis a alterações de pH. D) Os sistemas tampão do organismo ajudam a manter o pH fisiológico. E) O sistema tampão bicarbonato é importante para manter o pH sanguíneo. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 3 A mudança na cor e textura dos ovos após fritura é resultado da desnaturação proteica. Em relação a esse fenômeno é correto afirmar que: A) Há perda da estrutura tridimensional da proteína, que invariavelmente leva a perda da função, geralmente conservando as estruturas secundária, terciária e quaternária da proteína. B) A sequência de aminoácidos da estrutura primária é mantida. C) Alterações de pH não comprometem a estrutura e não desencadeiam o processo de desnaturação. D) Há conservação da função da proteína. E) A estrutura tridimensional é conservada. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 3 A mudança na cor e textura dos ovos após fritura é resultado da desnaturação proteica. Em relação a esse fenômeno é correto afirmar que: A) Há perda da estrutura tridimensional da proteína, que invariavelmente leva a perda da função, geralmente conservando as estruturas secundária, terciária e quaternária da proteína. B) A sequência de aminoácidos da estrutura primária é mantida. C) Alterações de pH não comprometem a estrutura e não desencadeiam o processo de desnaturação. D) Há conservação da função da proteína. E) A estrutura tridimensional é conservada. FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 4 Vários medicamentos atuam como inibidores enzimáticos. A lovastatina é um deles. Ela se liga de forma não covalente no sítio ativo da enzima 3-hidroxi 3- metilglutaril-coenzimaA (HMG-CoA) redutase, que é a responsável pela etapa inicial da síntese de colesterol. Por isso, é considerado um agente redutor do colesterol no organismo. Essas características evidenciam que a lovastatina é um inibidor enzimático do tipo: A) Competitivo reversível B) Competitivo irreversível. C) Não competitivo D) misto E) alostérico FUNDAMENTOS DE BIOQUÍMICA QUESTÃO 4 Vários medicamentos atuam como inibidores enzimáticos. A lovastatina é um deles. Ela se liga de forma não covalente no sítio ativo da enzima 3-hidroxi 3- metilglutaril-coenzimaA (HMG-CoA) redutase, que é a responsável pela etapa inicial da síntese de colesterol. Por isso, é considerado um agente redutor do colesterol no organismo. Essas características evidenciam que a lovastatina é um inibidor enzimático do tipo: A) Competitivo reversível B) Competitivo irreversível. C) Não competitivo D) misto E) alostérico
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