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1 Aula 1 19/08/2019 ENZIMOLOGIA INDUSTRIAL 2019.2 Profa. Ana Maria Souto-Maior Departamento de Antibióticos Laboratório de Processos Biotecnológicos soutomaior@ufpe.br PROGRAMA Semana Teórica Prática 1 09/AGO Apresentação das aulas práticas 2 12/AGO 16/AGO Introdução - enzimas e enzimologia industrial; enzimas versus catalisadores químicos; biocatalisadores industriais; reações catalisadas e classificação das enzimas; fontes de enzimas; mercado. Construção da curva-padrão de açúcares redutores. 3 19/AGO 23/AGO Cinética enzimática - velocidade de reação; efeito das espécies reagentes; modelo cinético de Michaelis-Menten; determinação de parâmetros cinéticos. Construção da curva-padrão de açúcares redutores. 4 26/AGO 30/AGO Cinética enzimática - ; efeitos do pH e da temperatura na cinética das reações enzimáticas; inibição das reações enzimáticas; modelos cinéticos de inibição e determinação de parâmetros cinéticos. Obtenção e caracterização de enzimas. 5 2/SET 6/SET Determinação de parâmetros cinéticos - apresentação dos resultados de cálculo de constantes cinéticas (Km , Vmax e KI) a partir de linearizações da equação de Michaelis-Menten utilizando software Excel. Obtenção e caracterização de enzimas. 6 9/SET 13/SET Processos enzimáticos - processo industrial genérico; reatores enzimáticos; processos com células ou enzimas livres; imobilização do biocatalisador. Fatores que afetam a atividade enzimática - efeito do pH na atividade enzimática. 7 16/SET 20/SET Aula de revisão Fatores que afetam a atividade enzimática - efeito da temperatura na atividade enzimática. 8 23/SET 27/SET 1° EXERCÍCIO Fatores que afetam a atividade enzimática - efeito da concentração inicial de substrato. 9 30/SET 4/OUT Aplicação da biologia molecular na produção de enzimas - regulação da síntese de enzimas; engenharia genética; engenharia de proteínas. Fatores que afetam a atividade enzimática - efeito de inibidores na atividade enzimática. 10 07/OUT 11/OUT Aplicação da biologia molecular na produção de enzimas - ferramentas "ômicas"; metagenômica; engenharia metabólica. Reatores bioquímicos - montagem, instrumentação, amostragem. 11 14/OUT 18/OUT Bioprocessos para a produção de enzimas - micro-organismos produtores de enzimas comerciais; meios de cultura; cultivos submerso e semissólido. Quantificação de substratos e produtos por cromatografia líquida de alta eficiência. 12 21/OUT 25/OUT Bioprocessos para a produção de enzimas - operações unitárias e biorreatores. Hidrólise enzimática em frasco agitado - acompanhamento e retirada de amostras. 13 28/OUT 01/NOV FERIADO Hidrólise enzimática em biorreator tipo tanque agitado - acompanhamento, retirada de amostras. 14 04/NOV 08/NOV Seminário 1 - Enzimas na produção de alimentos e bebidas. Seminário 2 - Enzimas na indústria de cosméticos. Seminário 3 - Enzimas em medicamentos e diagnósticos. Seminário 4 - Enzimas em síntese orgânica. Hidrólise enzimática - processamento e quantificação das amostras. 15 11/NOV 15/NOV Seminário 5 - Lipases em biocatálise. Seminário 6 - Enzimas proteolíticas. Seminário 7 - Enzimas na produção de etanol. Seminário 8 - Enzimas em catálise ambiental. FERIADO 16 18/NOV 22/NOV Seminário 9 - Enzimas para dessulfurização de combustíveis. Seminário 10 - Enzimas queratinolíticas. Seminário 11 - Enzimas no processamento de fibras têxteis. Seminário 12 - Enzimas na indústria de polpa e papel. Fechamento das aulas práticas. 17 25/NOV Aula de Revisão 18 02/DEZ 2° EXERCÍCIO 19 09/DEZ SEGUNDA CHAMADA 20 16/DEZ PROVA FINAL BIBLIOGRAFIA 2 Aula 1 19/08/2019 3 Aula 1 19/08/2019 Aula 1 INTRODUÇÃO Proteínas* globulares que catalisam as reações biológicas. * RNAs catalíticos são conhecidos como ribozimas. Enzimas Aminoácidos* Carbono α (centro quiral) Grupo carboxila Grupo amino Grupo R (cadeia lateral) * * Exceto a prolina Os 20 aminoácidos padrão das proteínas Os aminoácidos das proteínas possuem todos a configuração L Isômero L Isômero D 4 Aula 1 19/08/2019 Ligação Peptídica Estrutura das Proteínas Estrutura primária Estrutura secundária Estrutura terciária Estrutura quaternária α - hélice Síntese das Proteínas Enzimas possuem Sítios Ativos Enzima Alostérica Sítios catalíticos Sítios catalíticos Sítios alostéricos O estudo das enzimas na área biológica tem como finalidade última o entendimento do papel crucial que estes catalisadores desempenham nos processos metabólicos de organismos vivos. Enzimologia 5 Aula 1 19/08/2019 Principais Vias Metabólicas das Células Enzimas são alvos para desenvolvimento de fármacos (exemplo: estatinas) Estudo das enzimas com a finalidade de aplicação da sua capacidade catalítica em processos industriais. Enzimologia Industrial Composto capaz de aumentar a velocidade de uma reação química sem alterar a proporção entre reagentes e produtos encontrada no final da reação. Catalisador Cinética versus Termodinâmica Um catalisador participa efetivamente da reação, sofrendo alterações de sua estrutura química durante o processo, mas é regenerado ao final de um ciclo de etapas. 2 SO2(g) + O2(g) → 2 SO3(g) Etapa 1: 2 SO2 (g) + 2 NO2 (g)→ 2 SO3 (g) + 2 NO(g) Etapa 2: 2 NO (g) + 1 O2 (g) → 2 NO2 (g) Reação global: 2 SO2 (g) + O2 (g) → 2 SO3 (g) 6 Aula 1 19/08/2019 Um catalisador fornece um novo caminho de reação com energia de ativação mais baixa Catálise Enzimática Cofatores Enzimáticos Muitas enzimas necessitam de associações com cofatores não proteicos (molécula orgânica ou inorgânica) para exercerem as suas atividades catalíticas. Os cofatores inorgânicos são geralmente íons metálicos: O cofator orgânico é denominado coenzima. As coenzimas são derivadas de modificações químicas de vitaminas. Os cofatores se ligam transitoriamente aos sítios ativos por interações químicas não-covalente ou podem se ligar permanentemente por ligação covalente. Quando o cofator se liga firme e permanentemente ao sítio da enzima, é denominado grupo prostético A porção proteica da enzima conjugada é denominada apoenzima. A proteína conjugada, cataliticamente ativa, é denominada holoenzima. Processos químicos: tranformações químicas com catalisadores químicos. Processos enzimáticos: tranformações químicas com enzimas (biotransformação industrial). Processos biológicos : tranformações químicas realizadas por micro-organismos, células animais ou vegetais através do metabolismo (fermentação). Catálise em Processos Industriais 7 Aula 1 19/08/2019 Por que utilizar enzimas na indústria? As enzimas apresentam alto poder catalítico. Podem acelerar a velocidade de reações químicas multiplicando-a por fatores de 106 -1017. Os incrementos observados são sempre várias ordens de grandezas superiores aos obtidos com catalisadores não-enzimáticos. Condição da Reação Energia de ativação (KJ/mol) Velocidade relativa Sem catalisador 75,2 1 Platina 48,9 2,77 x 104 Catalase 23,0 6,51 x 108 2H2O2 2H20 + O2 As enzimas são capazes de acelerar velocidades de reações nas condições do ambiente celular, ou seja, enzimas catalisam as reações em condições moderadas de temperatura, pressão e pH. A catálise inorgânica requer, geralmente, temperaturas elevadas e valores extremos de pressão e pH. Biocatálise é uma tecnologia relativamente verde, que economiza energia normalmente necessária para processamento. As enzimas podem ser extraordinariamente específicas, tanto em relação aos seus substratos como em relação aos seus produtos – muito mais que os catalisadores químicos.Estereoespecificidade (Especificidade Absoluta) Especificidade por ligação e estrutura semelhantes (Especificidade Relativa) Biotransformações altamente quimio-, regio- e estereosseletivas podem simplificar processos de manufatura, e torná-los mais atrativos economicamente e mais aceitos ambientalmente. Hoje, as ferramentas de biologia molecular e engenharia de proteínas permitem aumentar a estabilidade, especificidade e o potencial de aplicação industrial das enzimas. Biocatalisadores Industriais Enzimas Micro-organismos Células (Animal/vegetal) FERMENTAÇÃO: várias passos catalíticos entre o substrato e o produto. BIOTRANSFORMAÇÃO: uma ou duas etapas realizadas por enzima, micro-organismo, célula animal ou célula vegetal. Biorredução realizada com células ou extrato de células de Acinetobacter calcoaceticus Fermentação alcoólica realizada por Saccharomyces cerevisiae 8 Aula 1 19/08/2019 Fermentação Industrial E – penicilina acilase Ácido fenilacético 7-ADCA Biotransformação Industrial Cefalosporina G Tipos de biocatalisadores utilizados em biotrasformações industriais. Liese et alii, 2006 Nomenclatura das Enzimas Nome Recomendado: utilizado no dia a dia de quem trabalha com enzimas; utiliza o sufixo "ase" para caracterizar a enzima. Exemplos: peptidase, urease, hexoquinase. Nome usual : consagrados pelo uso. Exemplos: tripsina, pepsina, ptialina. Nome Sistemático (IUBMB): fornece informações precisas sobre a função metabólica da enzima. Exemplo: ATP-glicose-fosfotransferase Classificação das Enzimas União Internacional de Bioquímica e Biologia Molecular (IUBMB) Número EC: EC (i).(ii).(iii).(iv) (i) Classe principal (ii) Subclasse, indica o tipo de substrato, o tipo de grupo funcional transferido ou a natureza de uma ligação específica envolvida na reação catalisada. (iii) Sub-subclasse, expressa a natureza do substrato ou co-substrato. (iv) Número arbitrário glicose + ATP glicose-6-P + ADP Nome trivial: Hexoquinase Nome sistemático: ATP:glicose fosfotransferase (EC 2.7.1.1) 2: transferase 7: fosfotransferase 1: fosfotransferase com grupo OH como receptor 1: fosfotransferase com grupo OH da glicose como receptor EC 2.7.1.1 Enzima 9 Aula 1 19/08/2019 Enzimas das várias classes utilizadas em biotrasformações industriais. Liese et alii, 2006 1 – Oxidorredutase 2 – Transferase Exemplo para cada classe de Reação Utilizado para a síntese de LY 300164, uma benzodiazepina oralmente ativa Utilizada para a síntese de agroquímicos 3 – Hidrolase 4 – Liase 5 - Isomerase Origem das Enzimas Industriais Produção de Enzimas por Micro-organismos As enzimas industriais são, em sua maioria, de origem microbiana. Os micro-organismos produzem grande diversidade de atividades catalíticas. A produção por processo fermentativo é realizada em escala industrial de forma regular (não depende de sazonalidade). A maior parte das enzimas industriais são extracelulares, produzidas por fungos e bactérias. 10 Aula 1 19/08/2019 Micro-organismos Produtores de Enzimas Industriais Produção de Enzimas por Micro-organismos Recombinantes Genes que codificam enzimas de interesse (de origem animal, vegetal ou de micro-organismos) podem ser expressos em micro-organismos hospedeiros (bem adaptados à fermentação em escala industrial), utilizando- se a Tecnologia do DNA Recombinante. Micro-organismos Recombinantes Produtores de Enzimas Industriais Mercado Global de Enzimas Mercado Global de Enzimas
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