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Página 1 C LINICAL M ICROBIOLOGY R EVIEWS , outubro de 2007, pág. 660-694 Vol. 20, n. 4 0893-8512 / 07 / $ 08.000 doi: 10.1128 / CMR.00023-07 Copyright © 2007, Sociedade Americana de Microbiologia. Todos os direitos reservados. Coronavírus da Síndrome Respiratória Aguda Grave como agente de Infecção emergente e reemergente Vincent CC Cheng, Susanna KP Lau, Patrick CY Woo e Kwok Yung Yuen * Laboratório Estatal Chave de Doenças Infecciosas Emergentes, Departamento de Microbiologia, Centro de Pesquisa de Infecção e Imunologia, Universidade de Hong Kong, Região Administrativa Especial de Hong Kong, China INTRODUÇÃO ................................................. .................................................. .................................................. ..660 TAXONOMIA E VIROLOGIA DA SARS-CoV ........................................... .................................................. ....... 660 CICLO DE VIDA VIRAL ............................................... .................................................. ................................................. 664 SEQUÊNCIA DA EVOLUÇÃO EPIDÊMICA E MOLECULAR DE SARS DO VÍRUS ................... 664 Sequência de eventos ............................................... .................................................. ............................................... 664 Evolução Molecular ................................................ .................................................. ............................................. 665 CARACTERÍSTICAS EPIDEMIOLÓGICAS ................................................ .................................................. ....... 666 RECURSOS CLÍNICOS ................................................ .................................................. ........................................... 667 ALTERAÇÕES HISTOPATOLÓGICAS DA SARS .............................................. .................................................. ... 669 Alterações Histológicas ................................................ .................................................. ............................................ 669 Perfis imunológicos ................................................ .................................................. ....................................... 669 PATOGÊNESE, RESPOSTA IMUNE E SUSCEPTIBILIDADE DE HOSPEDAGEM .......................................... .......... 670 Interação entre fatores virais e celulares ............................................ .................................................. ... 670 Resposta imune adaptativa ............................................... .................................................. ................................. 670 Susceptibilidade do host ................................................ .................................................. ............................................... 670 DIAGNÓSTICO LABORATÓRIO DA INFECÇÃO POR SARS-CoV ........................................... ...................................... 671 Ensaios de amplificação de ácidos nucleicos .............................................. .................................................. ....................... 671 Ensaios de detecção de antígeno ............................................... .................................................. ...................................... 671 Ensaios de detecção de anticorpos ............................................... .................................................. .................................... 671 GESTÃO CLÍNICA E ANTIVIRAIS .............................................. .................................................. ..671 CONTROLE DE INFECÇÃO E SEGURANÇA LABORATÓRIA ............................................. ....................................... 674 IMUNIZAÇÃO PASSIVA E DESENVOLVIMENTO DE UMA VACINA SARS-CoV ........................................ .679 Uso de Soro de Fase Convalescente e Anticorpo Neutralizante ......................................... ............................... 679 Imunização ativa ................................................ .................................................. ............................................. 679 MODELOS ANIMAIS E ANIMAIS SUSCITÍVEIS A SARS-CoV ......................................... ...................... 682 DEVEMOS ESTAR PRONTOS PARA A REEMERGÊNCIA DA SARS? ........................................ ......................... 683 AGRADECIMENTOS ................................................. .................................................. ....................................... 683 REFERÊNCIAS ................................................. .................................................. .................................................. ....... 683 INTRODUÇÃO Coronavírus da síndrome respiratória aguda grave (SARS) (SARS-CoV) é um novo vírus que causou o primeiro grande demítica do novo milênio (89, 180, 259). A rápida eco- crescimento econômico no sul da China levou a um aumento mandi para proteínas animais, incluindo as de caça exótica animais de alimentação, como civetas. Um grande número e variedades de esses mamíferos selvagens de caça em gaiolas superlotadas e a falta medidas de biossegurança em mercados úmidos permitiram o salto de este novo vírus de animais para humanos (353, 376). Sua capacidade transmissão humano a humano, a falta de conscientização controle de infecções hospitalares e instalações aéreas internacionais a rápida disseminação global desse agente. Mais de 8.000 as pessoas foram afetadas, com uma taxa bruta de mortalidade de 10%. o impacto agudo e dramático nos sistemas de saúde, economias, e sociedades dos países afetados dentro de poucos meses O início de 2003 foi incomparável desde a última praga. O pequeno ressurgimento da SARS no final de 2003, após a retomada do mercado de vida selvagem no sul da China e a recente descoberta de vírus muito semelhante em morcegos-ferradura, SARS-CoV, sugere sugeriu que a SARS pode retornar se as condições forem adequadas para produção, mutação, amplificação e transmissão desse dano vírus geroso (45, 190, 215, 347). Aqui, revisamos a biologia de o vírus em relação à epidemiologia, apresentação clínica, patogênese, diagnóstico laboratorial, modelos animais ou hospedeiros, e opções para tratamento, imunização e infecção trol. TAXONOMIA E VIROLOGIA DE SARS-CoV O SARS-CoV é um dos 36 coronavírus da família Coronaviridae da ordem Nidovirales . Membros de Sabe-se que os coronaviridae causam infecções respiratórias ou intestinais infecções em humanos e outros animais (Fig. 1). Apesar de acentuado grau de divergência filogenética em relação a outros coronavírus, SARS-CoV juntamente com SARS-CoV de morcego são agora considerado coronavírus do grupo 2b (190, 282). Primário O isolamento do SARS-CoV foi obtido pela inoculação de * Autor correspondente. Endereço para correspondência: State Key Laboratory of Doenças Infecciosas Emergentes, Departamento de Microbiologia, Pesquisa Centro de Infecção e Imunologia, Universidade de Hong Kong, Região Administrativa Especial de Hong Kong, China. Telefone: (852) 2855 4892. Fax: (852) 2855 1241. E-mail: hkumicro@hkucc.hku.hk. 660 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Página 2 amostras de pacientes em linhas celulares de rim de macaco embrionário linhas de células FRhK-4 ou Vero E6, que produzem citopatias mudanças nos focos, onde as células se tornam redondas e refratárias 5 a 14 dias (259). Essas mudanças citopáticas iniciais se espalham nas monocamadas celulares, levando ao descolamento celular dentro de 24 a 48 h. Subculturas podem ser feitas no Vero (macaco rim), Huh-7 (câncer de fígado) (301), CACO-2 (car- noma) (79) ou outro tipo de câncer colorretal, MvLu linha celular) (104) e linhas de células POEK e PS (porco) (122). Trans- microscopia eletrônica de missão de linhas celulares infectadas mostrou partículas características de coronavírusem cisternas dilatadas de retículo endoplasmático rugoso e vesículas de membrana dupla. Aglomerados de partículas virais extracelulares aderentes à superfície da membrana plasmática também foram observados. Manchado negativamente microscopia eletrônica mostrou partículas virais de 80 a 140 nm com projeções superficiais características das proteínas da superfície do envelope lipídico (89, 180, 259). SARS-CoV tem um grau mais alto estabilidade ambiental que outras corporações humanas conhecidas naviruses (91, 276). Pode sobreviver por pelo menos 2 a 3 dias em seco superfícies à temperatura ambiente e 2 a 4 dias nas fezes (276). A aparência microscópica eletrônica e a ordem do genoma de Proteínas estruturais da 5-replicase (Orf1ab) (envelope [S] -pico) [E] -membrana [M] -nucleocapsídeo [N]) - poli (T) -3 são semelhantes a os de outros membros dos Coronaviridae (236). Igual a outros coronavírus, é um envelope único de sentido positivo vírus de RNA encalhado com um tamanho de genoma de quase 30 kb (Fig. 2) Prevê-se que o genoma tenha 14 leituras funcionais abertas quadros (ORFs) (290). Suas funções e supostos papéis são descrito na Tabela 1. Duas ORFs grandes de 5 terminais, ORFs 1a e 1b, codificam 16 proteínas não estruturais, 7 das quais provavelmente envolvidos na transcrição e replicação dos maiores genoma entre todos os vírus RNA (92, 95, 158, 166, 242, 284, 309, 316, 343, 414). As duas proteases estão envolvidas na pós-tradução processamento proteolítico internacional da poliproteína viral (5, 15, FIG. 1. Árvore filogenética de 28 coronavírus com sequências proteicas completas de helicase. Seus números de acesso são mostrados entre parênteses. O tipo itálico indica os números completos de acesso ao genoma, já que os números de acesso à sequência da proteína helicase desses coronavírus não são acessível. A helicase de outros oito coronavírus de hiena-malhada, chita, furão, puffinose, rato, pombo, ganso e pato não está incluída porque nenhuma sequência proteica completa está disponível. A classificação do coronavírus asiático para gatos-leopardo é indefinida. A árvore foi construída por o método de junção de vizinhos usando o clustalX 1,83. A barra de escala indica o número estimado de substituições por 50 nucleotídeos. (Os dados são de referências 265, 326, 339, 367, 368 e 375.) FIG. 2. Arranjo genômico de SARS-CoV. Caixas cinzas indicam protease 3CL (3CL pro ), polimerase (pol), espiga (S), envelope (E), membrana (M) e nucleocapsídeo (N). V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 661 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 3 TABELA 1. Nomenclatura e características funcionais dos produtos do gene SARS-CoV e suas interações com as células hospedeiras na patogênese da doença Nomenclatura genética (número de aminoácidos resíduos no produto) Produto gênico e / ou característica (s) (referência (s)) Efeito na resposta celular do hospedeiro (referência (s)) Orf1a / b nsp1 (180) A expressão promoveu degradação dos mRNAs endógenos do hospedeiro, que podem inibem a síntese proteica do hospedeiro e impedem o IFN-mRNA endógeno acumulação (167) Induzir expressão CCL5, CXCL10 (IP10) e CCL3 em células epiteliais do pulmão humano via ativação de NF- B; aumenta a degradação do RNA celular, que pode facilitar a replicação ou bloqueio de SARS-CoV respostas imunes (81, 192) nsp2 (638) A deleção atenua o crescimento viral e a síntese de RNA (106) nsp3 (1.922) Protease tipo papaína 2; processamento proteolítico da poliproteína viral em 3 locais e participação na síntese do segmento de RNA subgenômico (15, 121, 224) Tríade catalítica putativa (Cys1651-His1812-Asp1826) e o local de ligação ao zinco têm atividade desubiquitinante; essa atividade inesperada, além de sua papaína ADP-ribose 1-fosfatase; desfosforila o Appr-1-p, um produto secundário de emenda de tRNA celular, a ADP-ribose (271) A protease sugere uma nova estratégia viral para modular o mecanismo de ubiquitinação da célula hospedeira para sua vantagem (15, 224, 279) nsp4 (500) Não conhecido nsp5 (306) Protease do tipo 3C; processamento proteolítico da poliproteína replicativa em 11 locais específicos e formando enzimas funcionais importantes, como replicase e helicase (5, 394) Parada de crescimento e apoptose via caspase-3 e atividades caspase-9 demonstradas em SARS-CoV Células de promonócitos humanos que expressam 3CLpro com aumento da ativação do fator nuclear B- repórter dependente (222) nsp6 (290) Não conhecido nsp7 (83) Estrutura tridimensional por estudo de ressonância magnética nuclear encontrada locais potenciais para interações proteína-proteína (261) nsp8 (198) Polimerase de RNA dependente de RNA putativa; estrutura cristalina do hexadecamérico nsp7-nsp8 possui um canal central com dimensões e propriedades eletrostáticas positivas favoráveis à ligação de ácidos nucleicos; isto é provavelmente outra RNA polimerase dependente de RNA exclusiva para sua genoma grande (158, 414) nsp9 (113) Estrutura cristalina tridimensional de um dímero que liga o RNA viral e interage com nsp8 (92, 316) nsp10 (139) A estrutura cristalina sugere uma função de ligação de ácido nucleico dentro de um Complexo de proteínas de ligação a RNA para transcrição e replicação de genes virais (166, 309) Interage especificamente com a subunidade NADH 4L e citocromo oxidase II com despolarização do interior membrana mitocondrial de células humanas transfectadas fibroblasto pulmonar embrionário e extenso citopático efeito (210) nsp11 (13) Não conhecido nsp12 (932) Polimerase de RNA dependente de RNA; replicação e transcrição para produzir RNAs do tamanho de um genoma e um subgenoma de ambas as polaridades (158) nsp13 (601) Helicase (atividades de dNTPase e RNA 5-trifosfatase) (95) nsp14 (527) 335-exoribonuclease; esta atividade incomum de 335 exoribonucleases suplementa a atividade de endoribonuclease na replicação do gigante Genoma de RNA (242) nsp15 (346) Endoribonuclease específica de uridilato; Endonuclease de RNA que é criticamente envolvido no ciclo de replicação do coronavírus (284) nsp16 (298) Putativa 2- O- ribose metiltransferase (343) Orf2 (1.255) Proteína Spike; liga-se ao receptor da célula hospedeira ACE2 e outros co-receptores, medeia a entrada viral nas células hospedeiras como uma proteína de fusão viral do tipo 1; acidificação necessária dos endossomos para entrada viral eficiente mediada por S; clivagem proteolítica por membrana celular infectada abundantemente expressa fator Xa associado em S1 e S2; ativação de protease necessária para fusão célula a célula (159, 162, 206, 214, 227, 301, 334) As células T 293 transfectadas com ACE2 podem formar sincicios multinucleados com células que expressam a Espinho; injecções intraperitoneais de proteína spike em camundongos reduziram a expressão de ACE2 nos pulmões e agravada insuficiência pulmonar aguda in vivo que pode ser atenuado pelo bloqueio da renina-angiotensina via (181); baculovírus recombinante expressando diferentes fragmentos de exclusão e inserção identificados a região funcional da proteína S a partir de aminoácidos 324-688, que podem induzir a liberação de IL-8 em células pulmonares (43); induz resposta protéica desdobrada em células cultivadas como SARS-CoV com um valor substancial acúmulo de proteína S no endoplasmático retículo, que pode modular a replicação viral (30) Orf3a (274) Forma um canal iônico sensível ao potássio, pode promover o surgimento de vírus e liberação (234) A superexpressão na linha celular pode desencadear apoptose; Está A expressão das células epiteliais pulmonares A549 regula positivamente mRNA e níveis intracelulares e secretados de todos três subunidades, alfa, beta e gama, de fibrinogênio, que também é observado em SARS-CoV- células Vero E6 infectadas; é altamente imunogênico e induz anticorpos neutralizantes (193, 321); 3a / X1 e 7a / X4 foram capazes de ativar NF-B e quinase N-terminal c-Jun e significativamente aprimorada Atividade do promotorde IL-8 em células A549; melhorada produção de quimiocinas não inflamatórias conhecido por ser regulado positivamente na infecção por SARS-CoV (169) Continua na página oposta 662 CHENG ET AL. C LIN . M ICROBIOL . R EV . em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 4 121, 224, 394). A proteína S de superfície está envolvida na ligação e entrada da célula hospedeira e é, portanto, o principal alvo para anticorpos neutralizantes e peptídeos antivirais (159, 206, 227, 301, 334). N, juntamente com M, E e Orf7a, estão envolvidos na montagem do virião (97, 147, 150, 245, 359). Orf3a é um íon proteína do canal que provavelmente está envolvida na brotação viral e liberação (234). Análise de sequências genômicas de muitos isolados de SARS-CoV de humanos com civeta SARS-CoV e SARS-CoV de morcego mostrou que os genes mais variáveis com homologias cleotídicas inferiores a 90% são o gene S, Orf3 , Orf8 , nsp2 , nsp3 e nsp4 (190, 215, 282). Deleções de 82 e 415 nucleotídeos em Orf8 foram encontrados em alguns isolados humanos, Considerando que uma inserção exclusiva de assinatura de 29 nucleotídeos no Orf8 pode ser encontrado em isolados de animais (64, 117). Portanto, quanto mais TABELA 1 - Continuação Nomenclatura genética (número de aminoácidos resíduos no produto) Produto gênico e / ou característica (s) (referência (s)) Efeito na resposta celular do hospedeiro (referência (s)) Orf3b (154) Predominantemente localizado no nucléolo em diferentes células (409) Células Vero E6, mas não 293T, transfectadas com O construto para expressar o Orf3b sofreu necrose como 6 horas após a transfecção, mas foram submetidos a necrose e apoptose simultâneas posteriormente pontos; Orf3b inibe a expressão de IFN- em síntese e sinalização (175, 178) Orf4 (76) Proteína de envelope; péptidos sintéticos formam canais iónicos no lípido plano bicamadas, mais permeáveis a cátions monovalentes do que a aniões monovalentes; supostamente envolvido em brotamento e liberação viral (359) Apoptose induzida em células T Jurkat transfectadas especialmente na ausência de fatores de crescimento; um romance A região do tipo BH3 estava localizada no terminal C domínio citosólico da proteína SARS-CoV E pode se ligar ao Bcl-xL, cuja superexpressão pode antagonizar apoptose; isso pode explicar a consistente linfopenia encontrada em pacientes com SARS (397) Orf5 (221) Proteína de membrana; proteína de superfície responsável pela montagem viral e brotando Apoptose induzida pela proteína M em células HEK293T, que poderia ser suprimida por inibidores da caspase (29) Orf6 (63) Nova proteína de membrana que acelera a replicação e virulência de um coronavírus de rato recombinante que expressa Orf6; uma virulência importante fator in vivo demonstrado em um modelo de camundongo (327) Inibe a síntese e sinalização de IFN; inibido translocação nuclear, mas não fosforilação de STAT1 (178); Orf6 está localizado no endoplasmático membrana do retículo / Golgi das células infectadas; liga e interrompe a formação de complexos de importação nuclear amarrando a carioferina alfa 2 e a carioferina beta 1 para a membrana; essa retenção do complexo em retículo endoplasmático / membrana de Golgi leva a perda de transporte STAT1 para o núcleo, apesar de sinalização de IFN induzida por RNA viral; assim, bloqueia o expressão de genes ativados por STAT1, que são essencial para estabelecer um estado antiviral (100) Orf7a (122) Proteína transmembranar exclusiva do tipo I; envolvido na montagem viral por interagindo com M e E, que são essenciais para partículas semelhantes a vírus formação quando co-expresso com S e N (97, 150, 245) A expressão de Orf7a induz apoptose através de uma caspase-3- via dependente e em linhas celulares derivadas de diferentes órgãos, incluindo pulmão, rim e fígado (179, 320, 408) Orf7b (44) Não conhecido Orf8a (39) Não conhecido Orf8a foi localizado nas mitocôndrias e superexpressão resultou em aumentos na mitocôndria potencial transmembranar, espécies reativas de oxigênio produção, atividade da caspase-3 e apoptose celular; Orf8a melhora a replicação viral e induz apoptose através de uma doença dependente de mitocôndria caminho (49) Orf8b (84) Pode modular a replicação viral; expressão de E foi desregulada por Orf8b, mas não Orf8a ou Orf8ab (172) Orf9 (422) Proteína Nucleocapsid; ligação e empacotamento do RNA viral na montagem de o virião (147) N antagonizou o IFN inibindo a síntese de IFN- (130); Ativação de NF-B em células Vero E6 expressando a proteína N é dependente da dose (220); N pode causar inflamação dos pulmões ativando o gene COX-2 expressão por ligação direta ao promotor, resultando em inflamação através de múltiplos COX-2 cascatas de sinalização (393); induzida apoptose da COS- 1 rim de macaco, mas não células 293T na ausência de fatores de crescimento; reorganização de actina induzida em células desprovidas de fatores de crescimento (315) Orf9b (98) A estrutura cristalina de Orf9b , uma ORF alternativa dentro do gene N, pode ser envolvido na fixação da membrana e se associa à intracelular vesículas, consistentes com um papel na montagem do virião (241) V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 663 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 5 Orf1b conservado é geralmente escolhido para ser o alvo molecular para a concepção de testes clínicos de diagnóstico em vez destes menos regiões conservadas. CICLO DE VIDA VIRAL Trimers da proteína S formam os peplomers que irradiam do envelope lipídico e dar ao vírus uma característica aparência corona solis sob um microscópio eletrônico. S é uma proteína de fusão classe I que consiste no terminal amino S1 e subunidades S2 do terminal carboxil conectados por um peptídeo de fusão maré. As duas subunidades são indispensáveis para a ligação do receptor e fusão de membrana, respectivamente. A ligação do receptor O principal de S1 foi mapeado para os resíduos 318 a 510 (9, 365). A ligação de S1 ao receptor celular desencadeará conformidade alterações operacionais, que colocam o peptídeo de fusão a montante das duas repetições de heptad de S2 no domínio transmembranar, e, finalmente, fusão dos envelopes lipídicos virais e celulares. Além disso, esse processo pode ser facilitado pela célula infectada protease associada à membrana, como o fator Xa, que pode divida S em S1 e S2. Essa clivagem proteolítica é especificamente inibido por um inibidor de protease, Ben-HCl (90). O principal receptor da célula hospedeira ligada por S é a angiotensina. enzima conversora de pecado 2 (ACE2), que é uma metaloprotease expresso nas células do pulmão, intestino, fígado, coração, vasos endotélio largo, testículo e rim (119). Desde que o ACE2 foi mostrado para proteger contra lesão pulmonar aguda em um modelo de mouse e uma vez que a ligação da proteína S às células hospedeiras resulta na regulação negativa da ECA2, este mecanismo pode contribuir para a gravidade do dano pulmonar na SARS (181). Células expressando algumas lectinas, incluindo DC-SIGN, L-SIGN e LSECtin, têm demonstrou aumentar a entrada celular do vírus do pseudótipo expressando S, mas apenas na presença concomitante de ACE2 (40, 107, 162, 398). Células não aceitáveis que expressam essas latas na ausência de ACE2, como células dendríticas, foram capazes promover a transferência de SARS-CoV mediada por células para células aceitáveis (40). Embora os agentes lisossomotrópicos possam bloquear entrada viral, o que indica que a acidificação endossômica é necessária para a entrada, a ativação da proteína S pela protease pode contornar essa inibição e resultar em fusão célula a célula. Apesar de o papel da protease endossômica sensível ao pH catepsina L via de entrada (151, 300), a cultura viral não requer pré-tratamento com tripsina. No entanto, este catequite sensível ao pH O pecado L pode ser um alvo para agentes como a cloroquina, que eleva o pH endossômico (174,341). O processo de desmontagem viral no citoplasma para a a liberação do RNA viral para tradução e replicação permanece Enganoso. A tradução começa com duas grandes poliproteínas de Orf1a e Orf1ab , que são clivados pós-traducionalmente pelo duas proteases virais em nsp1 a nsp16. Estes produtos de clivagem formam o complexo de replicação-transcrição, que replica genoma viral e transcreve um conjunto aninhado de 3 coterminais de oito RNAs subgenômicos. Portanto, é concebível que células infectadas contêm um número maior de transcritos contendo genes para o terminal 3 do genoma viral. Nisto com base na PCR da transcriptase reversa (RT-PCR) usando o gene N pode ter uma sensibilidade melhor do que aqueles que usam os outros genes. Como em outros coronavírus, o SARS-CoV pode anexar pelo domínios hidrofóbicos de suas máquinas de replicação para o membrana limitante dos autofagossomos e formam memórias duplas vesículas de brana. Uma vez que o RNA genômico viral suficiente e acumuladas, montagem viral por brotamento de proteínas o nucleocápside helicoidal no retículo endoplasmático para o Ocorre compartimento intermediário de Golgi. Aqui, o triplo a proteína M que mede a membrana interage com a proteína N e RNA viral para gerar a estrutura básica. Também interage com as proteínas E e S para induzir brotamento e liberação viral. Ao contrário de outros coronavírus, a proteína M da SARS-CoV também incorpora outra proteína de tripla membrana de Orf3a no virião (161). A proteína N é a mais abundante proteína viral expressa expressamente em células infectadas nas quais Os níveis de mRNA foram amplificados 3 a 10 vezes mais às 12 h pós-infecção do que outros genes estruturais (138) e é, portanto, um alvo importante para imuno-histoquímica e antígeno detecção em amostras clínicas. Vários testes de diagnóstico, anti- agentes virais e vacinas são projetados com base em nossos compreensão da estrutura e função dos vários vírus virais proteínas envolvidas no ciclo de vida desse vírus. SEQUÊNCIA DA EPIDEMIA DE SARS E EVOLUÇÃO MOLECULAR DO VÍRUS Sequência de eventos A SARS foi a primeira grande pandemia conhecida causada por uma coronavírus. Durante a epidemia em 2003, 8.096 casos com 774 mortes ocorreram em mais de 30 países nos cinco continentes (89, 117, 144, 180, 182, 197, 236, 250, 259, 260, 270, 290, 292, 303, 336, 377). A doença surgiu no final de 2002, quando um surto de pneumonia atípica adquirida na comunidade aguda síndrome foi notada pela primeira vez na província de Guangdong (Tabela 2) A vigilância retrospectiva revelou casos graves da doença facilidade em cinco cidades ao redor de Guangzhou por um período de 2 meses 431 O caso índice foi relatado em Foshan, uma cidade a 24 km longe de Guangzhou. O segundo caso envolveu um chef de Heyuan que trabalhava em um restaurante em Shenzhen. O paciente mantinha contato regular com animais de caça de caça. A esposa dele, dois irmãs e sete funcionários do hospital que tiveram contato com ele também foi afetado. De 16 de novembro de 2002 a 9 de fevereiro 2003, um total de 305 casos foram relatados na China continental, com 105 desses casos envolvendo profissionais de saúde. o pandemia devastadora começou em Hong Kong, a Administração Especial Região Administrativa (HKSAR), quando um professor de nefrologia de um hospital de ensino em Guangzhou que havia adquirido o doença de seus pacientes chegou a HKSAR em 21 de fevereiro 2003. Em um dia, ele transmitiu a infecção a 16 outros pessoas no hotel onde ele residia. Seu cunhado, um nos casos secundários, foi submetida a biópsia pulmonar aberta qual o agente etiológico foi descoberto e primeiro isolado (259) Era um novo coronavírus, chamado SARS-CoV. Os casos secundários, sem saber, levaram a doença para hospitais no HKSAR e para outros países e continentes incluindo Vietnã, Canadá, Cingapura, Filipinas, o Reino Unido, Estados Unidos e de volta à China. Carlo Urbani, médico que trabalha na Organização Mundial de Saúde OMS (Organização Mundial da Saúde) em Hanói, Vietnã, foi o primeiro a notificar a OMS de casos fora de Guangdong depois de testemunhar um surto hospitalar explosivo de SARS em um hospital em Hanói, que resultou de uma pessoa que retornou de o hotel em HKSAR. A descrição de Carlo Urbani da doença, 664 CHENG ET AL. C LIN . M ICROBIOL . R EV . em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 6 ao qual sucumbiu mais tarde, alertou as autoridades de saúde em todo o mundo e acelerou a pesquisa colaborativa para identificar o vírus e combater a doença (281). Evolução Molecular Logo após o isolamento de SARS-CoV, vírus semelhante ao SARS-CoV foram encontrados truques em civetas de palma e um cão-guaxinim de mercados de animais na província de Guangdong na China (117), sugerindo que esses animais poderiam ser a fonte de infecções. Como resultado, um grande número de civetas de palma foi selecionados para remover fontes para o ressurgimento da SARS em Guangdong em janeiro de 2004. O vírus foi encontrado em muitos civetas e cães-guaxinim do mercado da vida selvagem antes da abate, mas não em mais de 1.000 civetas posteriormente amostrados em 25 fazendas em 12 províncias (168). O ponto de partida evolutivo foi um pro- grupo de tipos tipográficos que consiste em três seqüências genômicas virais de origem animal. Esse grupo de protótipos representando patógenos vírus da nicidade possui sete sites de variação de nucleotídeo único (SNV) que causou seis alterações de aminoácidos, nas posições 147, 228, 240, 479, 821 e 1080 da proteína S, envolvidos em gerando a fase inicial da epidemia de 2002 e 2003. 1 um desses foi encontrado no primeiro paciente com SARS no subseqüente epidemia de 2003 a 2004. Outros 14 SNVs causaram 11 aminoácidos TABELA 2. Sequência de eventos e evolução molecular da SARS-CoV ao longo da epidemia a Fase e data Evento importante, fase de evolução e marcador (s) genotípico (s) b Cedo................................................. .......................... A maioria dos isolados tinha marcador genotípico SNV do nucleotídeo de referência GZ02 nas posições 17564, 21721, 22222, 23823 e 27827 de G: A: C: G: C; alguns casos iniciais tiveram 29 pb inserção ou exclusão de 82 pb no Orf8 ; média de K a / K s de 1, que foi superior à do fase intermediária, que indica forte seleção positiva 16 de novembro de 2002 ............................................... Primeiro caso que atendeu à definição da OMS de SARS em Foshan, província de Guangdong, China 17 de dezembro de 2002 ............................................... Chef de Heyuan, que trabalhava em um restaurante em Shenzhen, teve pneumonia atípica 26 de dezembro de 2002 a 20 de janeiro de 2003 ............. Surto de casos semelhantes em Zhongshan Meio................................................. ....................... marcador genotípico SNV de G: A: C: T: C; A média de K a / K s foi superior à da fase tardia mas foi 1, o que indica seleção purificadora 12 de janeiro de 2003 ............................................... ..... O surto em Guangzhou resultou em casos complicados de SARS transferidos para os principais hospitais em Guangzhou 31 de janeiro de 2003 ............................................... ..... Surto em hospitais de Guanzhou envolvendo pacientes e profissionais de saúde Atrasado ................................................. ........................... marcador SNV de T: G: T: T: T; média de K a / K s mostra estabilização de mutação não sinônima taxa; alguns isolados tiveram deleção de 415 pb no Orf8 21 de fevereiro de 2003 ............................................... ... médico de 65 anos da província de Guangdong residia no "hotel M" em Hong Kong (índice paciente); indisposto desde 15 de fevereiro e internado no hospital em 22 de fevereiro; infectado 17 residentes do hotel M, alguns dos quais viajaram para o Vietnã, Cingapura e Toronto, onde eles começaram novos aglomerados locais de casos 26 de fevereiro de 2003 .................................................. O contato do hotel M foi internado em um hospital em Hanói e iniciou um surto hospitalar 4 de março de 2003 ............................................... ......... Outro contato do hotel M foi admitido no Hospital Prince of Wales em Hong Kong e começou um surto hospitalar 5 de março de 2003 ............................................... ......... Outro contato de hotel M morreu em Toronto; cinco membros da família foram afetados 12 de março de 2003 ............................................... ....... A OMS emitiu um alerta global 14 de março de 2003 ............................................... ....... Foram notificados aglomerados de pneumonia atípica em Singapura e Toronto, que foram epidemiologicamente ligado ao surto de hotel M 15 de março de 2003 ............................................... ....... A OMS nomeou esta nova doença como SARS após receber relatos de mais de 150 casos; QUEM emitiu conselhos de viagem de emergência em resposta à SARS 21 de março de 2003 ............................................... ....... Um novo coronavírus foi identificado em dois pacientes com SARS em Hong Kong; o agente, isolado em células renais de macaco rhesus (fRhk4), produziu um efeito citopático; em um ensaio de imunofluorescência, os soros de pacientes com SARS aumentaram os títulos de anticorpos contra as células infectadas por vírus 22 a 27 de março de 2003 ............................................ Isolamento de um novo coronavírus foi confirmado em laboratórios dos Estados Unidos e Alemanha 12 de abril de 2003 ............................................... ......... A sequência do genoma completo da SARS-CoV foi concluída 16 de abril de 2003 ............................................... ......... A OMS anuncia que o SARS-CoV é o agente causador do SARS Junho de 2003 ................................................ ............... Um vírus com 99,8% de identidade nucleotídica com SARS-CoV foi isolado de civetas de palma e outros mamíferos alimentares de caça 5 de julho de 2003 ............................................... .............. A ausência de novas transmissões em Taiwan sinalizou o fim da transmissão entre seres humanos Rescaldo 3 de setembro de 2003 ............................................... ..Infecção por SARS-CoV adquirida em laboratório foi relatada em Cingapura 16 de dezembro de 2003 a 8 de janeiro de 2004 ................ 4 casos sintomáticos e 1 caso assintomático de SARS devido à transmissão animal-humana ocorreu na cidade de Guangzhou, província de Guangdong, China; todos os isolados tinham 29 pb inserção de sequência de assinatura para SARS-CoV animal em Orf8 17 de dezembro de 2003 ............................................... Segunda infecção por SARS-CoV adquirida em laboratório relatada em Taiwan 25 de março e 17 de abril de 2004 ................................ Terceira e quarta infecção por SARS-CoV adquirida em laboratório, relatada em Pequim , China 16 de setembro de 2005 ............................................... Descoberta do vírus SARS-CoV em morcegos-ferradura; todos os isolados seqüenciados tinham 29 pb sequência de assinatura para SARS-CoV de morcego a Veja as referências 27, 89, 117, 182, 190, 197, 215, 218, 221, 236, 251, 252, 259, 277, 304, 377, 378, 422 e 431. b A razão K a / K s refere-se à razão entre substituições de nucleotídeos não sinônimas e substituições de nucleotídeos sinônimas durante a evolução molecular do SARS-CoV. V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 665 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 7 alterações de resíduos ácidos, nas posições 360, 462, 472, 480, 487, 609, 613, 665, 743, 765 e 1163. Essa alta patogenicidade resultante grupo de vírus causou a fase intermediária da epidemia de 2003. Finalmente, os seis SNVs restantes causaram quatro aminoácidos mudanças nas posições 227, 244, 344 e 778, o que resultou em o grupo de vírus responsável pela fase tardia e pela epidemia global (168). A taxa de mutação neutra deste vírus durante a epidemia em 2003 é quase constante, em torno de 8 10 6 nt 1 dia 1 , que é semelhante aos do RNA mais conhecido vírus (64, 304). O ancestral comum mais recente foi o estava presente em meados de novembro, o que é epidemia compatível com o primeiro caso de SARS encontrado em Foshan. Depois que a epidemia terminou, um segundo salto interespécies ocorreu no final de 2003 até o início de 2004, resultando na reemergência de quatro casos humanos na China (45, 347). Estes Acreditava-se que quatro casos eram devidos a uma inter- transmissão de espécies, em vez de casos residuais do grande epidemia, devido à afinidade muito menor por ACE2 (hACE2) das proteínas S da SARS-CoV isoladas de esses pacientes e civetas de palma do que os dos principais isolados epidêmicos de pacientes com SARS, que utilizaram civeta humana e de palma ACE2 com eficiência (216). Como S contém domínio de ligação ao receptor para o receptor hospedeiro e é munogênico, está sob seleção no hospedeiro e se torna o proteína de evolução mais rápida, com a maioria das mutações localizadas o domínio S1 e especialmente o domínio de ligação ao receptor. A análise bioinformática identificou três principais res- idues nas posições 360, 479 e 487 responsáveis por ligação específica do host (17). A maioria dos isolados humanos em 2003 epidemia têm N479 e T487 em seu S, enquanto a maioria isolados têm K / R479 e S487. A baixa afinidade do programa S com as combinações K479 e S487 para hACE2 foi confirmado por ensaios de ligação ao pseudótipo. No entanto, o ser humano e isolados de civeta do surto de 2003 a 2004 tiveram N479 e S487, que sugeriu que este é um estágio intermediário de mutação da proteína S. Mudanças adicionais no N479 e A combinação T487 permitirá uma eficiente transferência de humano para humano missão (275). Além do surto menor subsequente, três surtos associados a laboratório foram relatados em Taiwan, e Pequim de setembro de 2003 a maio de 2004 (221, 251, 252, 256). Em Pequim, o surto também envolveu casos secundários e terciários. Análise filogenética da proteína S de 139 SARS-CoV isolados no surto de Hong Kong mostraram que várias ocorreram duções de vírus, mas apenas uma delas foi associado ao grande surto de HKSAR e no resto da o mundo (116). Algumas das cepas encontradas nos estágios iniciais do surto eram filogeneticamente distintos dos principais aglomerado e estavam mais perto de alguns dos locais de Guangdong e Pequim Deformação. Isso concordou com o fato de o paciente índice de o surto de HKSAR era um médico de Guangzhou que tinha viajado para HKSAR. Outra epidemiologia molecular estudo do surto de Guangdong sugeriu que a doença se espalhou de Guangdong para HKSAR e o resto do mundo, e o caso índice era um chef que tratava de animais de caça (431). A vigilância subsequente de animais na China recuperou coronavírus isolados de rus com 99,8% de identidade nucleotídica com SARS- CoV (117). Uma inserção característica de 29 pb entre Orf8a e Orf8b (também conhecido inicialmente como Orf10 e Orf11 ) foi encontrado em esses animais isolados (117, 302). Este segmento de 29 nucleotídeos foi excluído antes ou logo após o cruzamento das espécies barreira para os seres humanos. O efeito biológico dessa exclusão é rede indescritível. Vários isolados de SARS-CoV nos últimos estágios da epidemia mostraram deleções maiores em torno deste local (64) Dois estudos epidemiológicos moleculares independentes comparando os genomas completos de 12 e 63 isolados de vírus também encontraram evidências de forte seleção positiva no início epidemia, seguida de uma seleção purificadora de , como indicado pela taxa de substituição de aminoácidos em S, Orf3a e nsp3 (64, 304, 402). Ambos os estudos sugeriram que adaptação molecular do vírus ocorreu após interpe- transmissão de animais para humanos. Nos pequenos em Guangzhou, em 2004, todos os quatro isolados humanos pertenciam a uma sub-linhagem separada dos animaisconcorrentes isolados que eram distintos dos vírus pandêmicos ou animais humanos 2003. Embora o SARS-CoV seja distinto dos três grupos de coronavírus, pode estar mais próximo do grupo II porque 19 de 20 cisteínas encontradas no domínio S1 da proteína S são conservadas espacialmente em comparação com o consenso do grupo II seqüência, enquanto apenas cinco resíduos de cisteína são conservados comparados com os dos grupos I e III (93, 302). Desde que acredita-se que os naviruses tenham evoluído com seus animais hospedeiros, é possível que ratos, camundongos e gado abrigem grupos Os coronavírus II são mais propensos a ser o hospedeiro animal SARS-CoV do que gatos, que abrigam o coronavírus do grupo I. Quão- sempre, quando uma comparação das árvores filogenéticas para 11 espécies hospedeiras conhecidas e sequências nucleocapsídicas de 36 vírus foi realizada usando uma abordagem de inferência com análise de janela, houve incongruência estatística, que determina múltiplas mudanças de espécies hospedeiras entre os coronavírus de muitos animais que são filogeneticamente distantes (283). Portanto, não seria muito inesperado se outros mamíferos fossem os verdadeiros reservatório de animais em vez de camundongos e ratos. No entanto, civetas e outros mamíferos relacionados haviam pelo menos servido como um dos principais hospedeiro de amplificação nos mercados do sul da China, independentemente do reservatório animal original. O controle dessas mercados e mercados tiveram um papel central na epidemia controle lógico do SARS (304). Em vista da baixa taxa de detecção de SARS-CoV em civetas selvagens e agrícolas (338), a uma taxa muito alta em civetas engaioladas nos mercados de vida selvagem, foram feitos esforços para encontrar o reservatório natural de SARS-CoV em pássaros, porcos, gado, ovelhas, ratos e ratos, que acabaram ser negativo. No entanto, vírus do tipo SARS-CoV com cerca de 90% de identidade genômica com SARS-CoV foram independentemente descoberto em morcegos-ferradura ( Rhinolophus spp.) em HKSAR e China continental (190). A alta soroprevalência e carga de morcegos-ferradura chineses infectados, Rhinolophus sinicus , É altamente recomendável que os morcegos sejam o reservatório natural da SARS- Vírus do tipo CoV, semelhantes à situação dos morcegos que carregam Vírus Hendra ou vírus Nipah (363). CARACTERÍSTICAS EPIDEMIOLÓGICAS A ligação epidemiológica dos casos humanos iniciais dos Pandemia de 2003 a animais selvagens de caça sugeriu que a SARS- O CoV é de origem zoonótica (431). O isolamento de SARS-CoV- como vírus de palmeiras e, posteriormente, morcegos-ferradura apoiou ainda mais essa afirmação (117, 190). Foi relatado que uma taxa de soroprevalência de cerca de 80% foi encontrada em civetas em 666 CHENG ET AL. C LIN . M ICROBIOL . R EV . em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 8 mercados de animais em Guangzhou (338). No entanto, pessoa a pessoa transmissão do filho tem sido o principal modo de disseminação do epidemia, que ocorreu em unidades de saúde, locais, casas e transporte público. O mais importante A rota de disseminação pessoa a pessoa parece ser direta ou contato direto das mucosas com gotículas respiratórias infecciosas ou fomitos (296). O SARS-CoV foi detectado nas vias respiratórias secreções, fezes, urina e lágrimas de indivíduos infectados (42, 229) A transmissão hospitalar de SARS foi facilitada pela nebulizadores, aspiração, intubação, broncoscopia ou cardio- ressuscitação pulmonar em pacientes com SARS, quando grande foram geradas partículas de gotículas infecciosas (70, 197, 340). Dentro De fato, quase metade dos casos de SARS no HKSAR foram infecções mentais adquiridas nas unidades de saúde e instituições (202). A taxa de ataque entre os profissionais de saúde foi maior quando o número de pacientes com SARS foi maior (187) Embora a transmissão aérea seja considerada incomum Segundo, uma forma única de transmissão aérea foi considerada uma provável explicação para um grande surto comunitário em uma conjunto habitacional chamado Jardim Amoy em HKSAR. Contaminados aerossóis gerados em vasos sanitários por exaustores acoplados a Armadilhas em U de esgotos, que subiram à luz bem diferentes pés, causou um surto explosivo que afetou centenas de pessoas (71, 405). A presença de vírus nas fezes, frequentemente com altas cargas virais (156, 258), também sugeriu a possibilidade de transmissão feco-oral, embora isso não tenha sido provado conclusivamente. Foi sugerido que a SARS fosse transmitida em aeronaves comerciais durante a epidemia. De um total das 40 lutas investigadas, 5 foram associadas a provável luta contra a transmissão SARS, afetando 37 passageiros (254). A maioria dos passageiros afetados estavam sentados a cinco filas do caso de índice. O risco geral de transmissão parece ser baixo, em torno de 1 em 156 (358). No maior incidente, durante uma luta de 3 horas 120 passageiros que viajam de HKSAR a Pequim, um super- evento de disseminação (SSE) infectou 22 passageiros (254). O padrão envolvimento foi atípico, considerando a curta duração exposição de 3 horas eo amplo envolvimento de pacientes sentados dentro de sete linhas na frente e cinco linhas por trás do caso de índice. Embora a transmissão aérea fosse considerada uma possível explicação, outros modos potenciais transmissão, como contato de passageiros com o índice caso antes ou depois da luta, não pode ser excluído, principalmente uma vez que 17 das 22 pessoas infectadas eram de dois turistas grupos (254). Em outro estudo, um paciente com SARS viajou entre entre o HKSAR e os países europeus durante o período pré- período sintomático e precoce e sem transmissão entre os passageiros sentados nas proximidades do índice foi encontrado, sugerindo que a transmissão de SARS no combate não é comum (23). Pacientes com SARS sintomáticos pareciam transmitir infecções a bordo muito mais rapidamente do que tomam (23, 254, 358). Início dos procedimentos de triagem para detectar pessoas com febre antes do embarque foi usado em uma tentativa de reduzir o risco de transmissão em combate do SARS, mas a eficácia ainda é incerta (342). Em 17 estudos que relataram soroepidemiologia, a sorologia prevalência variou de 0 a 1,81% para a população em geral, 0 a 2,92% para profissionais de saúde assintomáticos, 0 a 0,19% para contatos domésticos assintomáticos e 12,99 a 40% para manipuladores de animais assintomáticos (28, 37, 45, 69, 117, 141, 198, 201, 203, 207, 209, 228, 352, 369, 387, 406, 429). A última descoberta é bastante esperado, uma vez que desafios zoonóticos freqüentes de estirpes patogénicas de nível de SARS-CoV antes de 2003 em animais manipuladores do sul da China provavelmente teriam causado tais uma alta soroprevalência nesse grupo de risco. Assíncrona genuína infecção vertical com antigenemia detectada por imunoenzimática noassay (EIA) e soroconversão confirmada por neutralização O teste de anticorpos foi documentado em um trabalhador de restaurante que trabalhou no mesmo restaurante que o caso-índice dos intervalo de 2003 a 2004 (45). Contudo, em 2003, a exposição sustentada certeza dos manipuladores de animais para essas civetas infectadas e outras animais selvagens resultaria na introdução de uma moderada transmissível e mais virulenta do vírus SARS-CoV, que teria mudado da estirpe animal e adaptado ao infectar seres humanos com mais eficiência. O resultado foi uma enorme expansão global surto, mas a taxa geral de infecção assintomática ainda era relativamente baixo com esse vírus adaptado ao ser humano mais virulento população em geral, profissionais de saúde e famílias Contatos. Uma metanálise deu taxas gerais de soroprevalência de 0,1% para a população em geral e 0,23% para cuidados de saúde trabalhadores (203). Também é importante lembrar que esses estudos de soroprevalência não são diretamente comparáveis, pois métodos sorológicos diferentes de várias sensibilidades ou especificidades laços foram utilizados com ou sem confirmação por outroteste. Assim, a verdadeira incidência de infecção assintomática permanece Enganoso. O período de incubação da SARS é de 2 a 14 dias, embora casos ocasionais com períodos de incubação mais longos foram portado (41). O número médio de casos secundários resultantes de um único caso foram de dois a quatro (225, 285). Ao contrário da influenza vírus, onde os pacientes foram mais infecciosos nos primeiros 2 dias doença, a transmissão de pacientes sintomáticos com SARS ocorreu no quinto dia após o início da doença, o que está alinhado com o aumento da carga viral nas secreções nasofaríngeas que atingiu o pico por volta do dia 10 (258). Houve especulações sobre a incidência de SARS e temperatura ambiente (319), mas uma sazonalidade definida não pôde ser concluída. SSEs foram observados para desempenhar um papel importante na propagação do surto de SARS, o que gera um aumento desproporcional número de casos secundários, como no Jardim Amoy de HKSAR. Um estudo comparando as características clínicas e ambientais de Os casos de SSE e não-SSE mostraram que as SSEs provavelmente relacionados a uma combinação de fatores, incluindo atraso no isolamento, internação em uma ala de não-isolamento e doença grave no tempo de isolamento (53). RECURSOS CLÍNICOS A apresentação clínica típica da SARS é a da infecção viral pneumonia com deterioração respiratória rápida (Tabela 3). Fe- calafrios, mialgia, mal-estar e tosse improdutiva são os principais sintomas presentes, enquanto rinorreia e dor garganta são vistos com menos frequência (7, 21, 37, 149, 197, 258, 259, 270, 278, 336, 411, 425). Deterioração clínica, freqüentemente por diarréia aquosa, ocorre geralmente 1 semana após a início da doença (58, 258). Semelhante a outras causas de atipia pneumonia, os sinais físicos ao exame torácico são mínimos comparados com os achados radiográficos. Radiografias de tórax normalmente mostram opacidades em vidro fosco e consolidações focais, especialmente nas regiões periféricas e subpleurais da região zonas. O envolvimento progressivo de ambos os pulmões não é incomum V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 667 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 9 (113, 148, 184, 362). Mudança de sombras radiográficas e pode ocorrer pneumomediastino espontâneo (74, 258). Um ret- análise retrospectiva de radiografias seriadas de tórax em todos os casos de SARS pacientes do HKSAR mostraram que a extensão inicial e pro- A confissão de opacidades radiográficas pode ser útil para prognósticos previsão (6). A diarréia é a manifestação extrapulmonar mais comum. seguida de disfunção hepática; tontura, que pode ser relacionados ao comprometimento cardíaco diastólico e pressão arterial pulmonar trombose; exame de urina anormal; petéquias; miosite; neuro- anormalidades musculares; epilépticos (44, 58, 188, 211, 248, 335, 346, 383). Os idosos podem apresentar-se atipicamente sem febre ou sintomas respiratórios (68, 361). Enquanto infecções em crianças parecem ser mais leves do que os adultos (20, 144, 183), a SARS em mulheres grávidas apresenta um risco significativo de mortalidade (364, 410). Cargas virais nasofaríngeas e séricas mais elevadas foram associadas TABELA 3. Correlação entre achados clínicos, virológicos, imunológicos e histopatológicos Características clínicas e laboratoriais (% isolados positivos [no. de isolados estudado / número total.]) (referência) a Carga viral no (s) dia (s) indicado (s) após o início dos sintomas (referência) Perfil imunológico do sangue ou característica histopatológica (referência) Envolvimento sistêmico Média de 1,1 cópias de log / ml entre os dias 10 e 15 em Concentrações séricas médias aumentadas de IL-16, TNF- e Febre (99,9 [751/752]) soro (156) fator de crescimento 1 transformador, mas diminuiu a IL-18 entre Relaxamento ou rigidez (51,5 [377/732]) dias 3 e 27 (16); aumento de IFN- e inffamatório Mal-estar (58,8 [317/539]) citocinas IL-1, IL-6 e IL-12 por pelo menos 2 semanas; quimiocina perfil demonstrou aumento da quimiocina neutrófila IL-8, Quimiocina MCP-1 e Th1 IP-10 (360); soro aumentado O número de IP10, MIG e IL-8 durante a primeira semana foi associado a resultado adverso ou morte (325) Envolvimento respiratório Média de 2,4 cópias de log / ml entre os dias 10 e 15 para IP10 é altamente expresso nos tecidos pulmonar e linfóide, com Rinorreia (13,8 [50/362]) NPA (156), 9,58 10 2 –5,93 10 6 cópias / ml para infiltração de monócitos-macrófagos e depleção de Dor de garganta (16,5 [91/552]) cotonete na garganta e 7,08 10 2 - 6,38 10 8 cópias / ml para linfócitos (163); aumento de macrófagos alveolares e CD8 Tosse (65,5 [460/702]) saliva entre os dias 2 e 9 (349) e 2 10 4 –1 CD4 para CD8 e aumento do TNF-, Dispnéia (45,9 [282/614]) 10 10 cópias / ml entre os dias 5 e 51 para pulmão tecido (96) Níveis de IL-6, IL-8, RANTES e MCP-1 em pacientes broncoalveolares amostras de lavagem (124, 344); IP10 aumentou no tecido pulmonar de pacientes que morreram de SARS (325); diferencial aumentado expressão de citocinas dentro desses tecidos pulmonares, incluindo Stat1, fator regulador de IFN 1, IL-6, IL-8 e IL-18, frequentemente característica de pacientes com dificuldade respiratória aguda síndrome (8) Envolvimento cardiovascular 1 10 4 -2,8 10 7 cópias / ml entre os dias 5 e 23 Compromisso diastólico subclínico sem envolvimento sistólico, mas Taquicardia (46,1 [71/154]) para tecido cardíaco (96) infiltrado linfocítico intersticial ou necrose miocítica em Bradicardia (14,9 [18/121]) (403) histologia (211); tromboembolismo pulmonar grave e Hipotensão (50,4 [61/121]) (403) vegetações valvulares cardíacas em algumas autópsias (67) Envolvimento gastrointestinal Média de 6,1 log cópias / ml entre os dias 10 e 15 para Ruptura arquitetural mínima, apesar da replicação viral ativa Diarréia (20,1 [130/647]) (156), com maior carga viral média no NPA obtido no dia 10 significativamente associado à diarréia (58); 2.7 10 3 –2,7 10 9 cópias / ml entre os dias 10 e 29 para o tecido intestinal delgado e 5.3 10 3 -3,7 10 8 cópias / ml entre os dias 10 e 43 para o intestino grosso (96) em enterócitos do íleo terminal e biópsia do cólon espécimes; sem atrofia das vilosidades ou inflamação (205); atrofia de tecido linfóide da mucosa (298) Outros sintomas Mialgia (48,5 [365/752]) Necrose focal de miofibra com escassa infiltração de macrófagos pode estar relacionado ao tratamento com esteroides (204) Dor de cabeça (38,8 [292/752]) RT-PCR positivo para algum líquido cefalorraquidiano (188) Necrose de células neuronais e hiperplasia ampla de gliocytes (389) Tontura (27,3 [163/597]) Envolvimento hematológico Linfopenia prolongada com nadir durante os dias 7 a 9, retornando ao Anemia (12,6 [17/135]) normal após 5 semanas; morte e gravidade estão associadas a Leucopenia (24,2 [114/472]) linfopenia CD4 e CD8 profunda; pouca mudança Linfopenia (66,4 [296/446]) Relação CD4 / CD8 (136) Trombocitopenia (29,7 [140/472]) Envolvimento bioquímico Alanina sérica aumentada níveis de aminotransferase (44,1 [208/472]) RT-PCR positivo para tecido hepático (44), 6 10 3 –5 10 4 cópias / ml entre os dias 2 e 9 para tecido hepático (96) Balonismo de hepatócitos e alterações lobulares leves a moderadas infiltração linfocítica (44) Creatinina sérica prejudicada (6,7 [36/536]) (76) Média de 1,3 cópias de log / ml entre os dias 10 e 15 para urina (156) e 4,3 10 3 –7,4 10 5 cópias / ml entre os dias 11 e 27 para tecido renal (96) Necrose tubular aguda (76) Diminuição da tri-iodotironina sérica e tiroxina Apoptose celular extensa e esfoliação do folículo epitélio em folículos distorcidos, dilatados ou colapsados (354) De outros Orquite histológica (388) Destruição generalizada de células germinativas, poucos ou nenhum espermatozóide no túbulo seminífero, membrana basal espessada e infiltração de leucócitos com linfócitos T e macrófagos em o tecido intersticial (388) a Consulte as referências 7, 21, 37, 149, 197, 258, 259, 270,278, 336 e 425 para obter recursos clínicos e laboratoriais, a menos que especificado de outra forma na tabela. 668 CHENG ET AL. C LIN . M ICROBIOL . R EV . em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 10 associados à dessaturação de oxigênio, ventilação mecânica e mortalidade; maiores cargas virais nas fezes foram associadas a diarreia ema; altas cargas virais na urina foram associadas a anormalidades exame de urina mal (58, 75, 156). A correlação significativa dos cargas virais nessas amostras com a gravidade da situação clínica ou resultados laboratoriais sugeriram que a replicação viral extrapulmonar cação estava contribuindo para manifestações clínicas (156). Quanto aos parâmetros hematológicos, os níveis sangüíneos periféricos fenopenia e enzimas parenquimatosas hepáticas elevadas são com ou sem trombocitopenia ou aumento de D dímeros e tempo parcial de tromboplastina ativada (197). Sobre 20% a 30% dos pacientes desenvolveram insuficiência respiratória exigindo ventilação mecânica e a taxa de mortalidade geral foi cerca de 15%. Idade, presença de comorbidades, aumento de lactato desidrogenase, hipouricemia, insuficiência renal aguda, mais extenso envolvimento radiológico pulmonar na apresentação, e uma alta contagem de neutrófilos no momento da admissão é ruim indicadores prognósticos (153, 197, 385). Função pulmonar restritiva anormalidades devidas a fibrose pulmonar residual e fraqueza muscular são comuns na fase convalescente (34, 247, 255). Entre os sobreviventes da SARS em HKSAR 1 ano após a doença, comprometimento significativo da capacidade de difusão foi observado em 23,7% dos sujeitos estudados. A capacidade de exercício e o estado de saúde de Os sobreviventes da SARS também foram notavelmente mais baixos do que os da população saudável (154). Um estudo sobre as mudanças patológicas testículos de seis pacientes que morreram de SARS indicaram que orquite também foi uma complicação e sugeriu que a reprodução funções positivas em pacientes do sexo masculino que se recuperaram da SARS deve ser monitorado (388). Depressão e pós-traumático transtorno de estresse são especialmente comuns entre os profissionais de saúde trabalhadores e pacientes com familiares afetados (57, 66, 238, 310). Complicações devido ao uso de corticosteróides incluindo psicose, insuficiência adrenal e osteoartrose avascular necrose também foi relatada (36, 112, 145, 195, 200). ALTERAÇÕES HISTOPATOLÓGICAS DA SARS Alterações Histológicas O dano alveolar difuso agudo com edema no espaço aéreo foi o característica mais proeminente em pacientes que morreram antes do dia 10 dia após o início da doença (99, 250). Membranas hialinas, inter- edema inicial, infiltrados intersticiais de células inflamatórias, bron- lesão quiolar com perda de cílios, denites epiteliais bronquiolares e deposição focal de fibrina no porão exposto outras membranas foram observadas (157). Pacientes que morreu após o décimo dia da doença exibiu uma mistura de alterações e as da fase organizadora de alveolar difuso danificar. Houve proliferação intersticial e de fibroblastos do espaço aéreo hiperplasia de pneumócitos tipo II e metaplasia escamosa sia do epitélio brônquico. Os espaços alveolares continham combinação de macrófagos, pneumócitos descamados e células gigantes multinucleadas. Hemofagocitose na região alveolar exsudatos e trombose das vênulas foram observados em alguns casos. Outras complicações pulmonares podem incluir baciloscopia secundária broncopneumonia terial e aspergilose invasiva (345). Sys- vasculite temica envolvendo as paredes de pequenas veias com edema, necrose fibrinóide e infiltração de monócitos, linfócitos, e células plasmáticas foram observadas em um relatório (87). Nenhuma destruição tecidual ou processo inflamatório grave associada a infecção viral foi observada em outros órgãos ou tecidos, mas partículas virais podem ser detectadas em pneumócitos e enterócitos por hibridação in situ (331). Inflamação, apoptose celular ou atrofia de microvilosidades de não foi encontrado grau na mucosa intestinal para explicar a diarréia aquosa. A coloração imuno-histoquímica mostrou presença de nucleoproteínas virais em pneumócitos tipo II e ocasionalmente macrófagos pulmonares. Necrose ou atrofia phy no tecido linfóide dos linfonodos e polpa branca de baço são comumente observados extrapulmonares ogies. Perfis imunológicos O exame citométrico de fluxo do sangue periférico em o tempo de admissão antes do uso de esteróide mostrou diminui os níveis de subconjuntos de células dendríticas, natural killer células, linfócitos T CD4 e CD8 e linfócitos B (82, 213, 420). Um estudo de três pacientes com SARS sugeriu que uma infecção autolimitada ou abortiva do sangue periférico células mononucleares podem ocorrer, como é evidente pela presença de RNA de cadeia negativa, o intermediário replicativo do vírus durante a semana inicial da doença (208). Estudos das citocinas O perfil vacinal de pacientes com SARS mostrou resultados conflitantes, que pode ser devido ao uso de muitos imunomoduladores incluindo esteróides. No entanto, esses estudos geralmente mostraram elevações consistentes e significativas da quimioterapia interferão gama de kines (IFN -) - proteína induzível 10 (IP10 [CXCL10]), proteína quimiotática 1 de monócitos (MCP-1 [CCL2]) e interleucina-8 (IL-8). Em alguns estudos, os níveis de citocinas relacionadas ao Th1 IFN- e IL-12 e inffam- citocinas matemáticas IL-1 e IL-6, que podem induzir uma resposta inflamatória tensa também aumentaram (63, 152, 163, 165, 325, 360). Em um estudo, pacientes com doença grave facilidade tendia a aumentar os níveis plasmáticos de IFN-, IFN- e CXCL10 e níveis diminuídos de IL-12p70, IL-2, fator de necrose tumoral alfa (TNF-) durante a fase aguda Estágio. Na fase tardia, pacientes com doença grave apresentaram aumentou significativamente os níveis plasmáticos de quimiocina de IL-8, CXCL10 e CCL2, mas diminuíram os níveis de citocinas de IL- 12p70, IL-2, TNF e IFN- comparados com casos leves de SARS (26). Essas respostas do host podem ser responsáveis pela recrutamento e acúmulo de macrófagos alveolares e polimorfos e ativação de imunoglobulina Th1 mediada por células pela estimulação do assassino natural e do citotóxico T linfócitos, respectivamente. Como o SARS-CoV parece evitar o desencadeamento de IFN- e IFN- em macro-humanos fagos in vitro (61, 280), a falta de um antiviral inato resposta imune pode permitir replicação viral descontrolada progressivo aumento da carga viral e acompanhamento resposta sistêmica pró-inflamatória. Esta situação con- continua até a segunda semana de doença até o aparecimento da resposta imune adaptativa, que traz replicação viral cação sob controle. Além disso, transcriptomal comparativo A análise por microarray mostrou que o SARS-CoV, em vez de CoV-229E acentuadamente regulou genes associados a optose, inflamação, resposta ao estresse e procoagulação durante a fase inicial da infecção de um fígado humano linha celular de câncer (Huh7) (322). Ambas as observações ajudam a explicar a gravidade clínica da SARS em relação à alta V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 669 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 11 carga viral em até 2 semanas de doença e a intensa infecção resposta matemática como evidente nos perfis séricos de citocinas e histopatologia. A maioria dos pacientes com SARS resolveu as respostas pró-inflamatórias a citocinas e quimiocinas em a fase aguda e expressou genes imunes adaptativos. Dentro Por outro lado, pacientes que posteriormente sucumbiram apresentaram desvio Expressão gênica estimulada por IFN e gene da imunoglobulina níveis persistentes de quimiocinas e deficiência de anti-SARS pico de produção de anticorpos. Especulou-se que não respostas IFN associadas durante a fase aguda podem levar a mau funcionamento do interruptor da imunidade inata para a adaptativa imunidade.De fato, os pacientes recuperados foram encontrados para ter níveis mais altos e sustentáveis de anticorpos específicos para N e Respostas de anticorpos neutralizantes específicos de S, enquanto pacientes que depois sucumbiram tiveram um aumento inicial e depois uma queda no níveis de anticorpos imediatamente antes da morte, sugerindo que é provável que a resposta desempenhe um papel importante na determinação o resultado final da doença (417). PATOGÊNESE, RESPOSTA IMUNE E SUSCEPTIBILIDADE Interação entre fatores virais e celulares O mecanismo exato de como o vírus produz danos em células, tecidos e órgãos até os níveis clínicos permanecem indescritíveis. Sim- semelhante a outros vírus, como o vírus da influenza A, o vírus Nipah ou Vírus Ebola, o SARS-CoV deve possuir a capacidade de evitar a resposta antiviral inata das células, a fim de replicar suficientemente no host. Experimentos de transfecção com Orf3b, Orf6, e N nas células 293T mostraram que essas proteínas virais são IFN antagonistas que podem interferir na síntese de IFN e seus vias de sinalização a jusante (178). No entanto, isso não pode explicar a aparente discrepância de IFN- / produção em linha celular Caco-2 intestinal humana infectada (253) ea falta de produção no sangue periférico de pacientes com SARS células claras ou em macrófagos primários humanos com SARS-CoV, apesar da ativação de vários IFN- genes estimulados no último caso (61). Por outro lado, isso pode explicar o aumento do nível sérico de IFN de algumas SARS pacientes, que podem ter uma fonte intestinal. Devido à falta de uma linha celular de pneumócitos tipo 2 suscetível à SARS- CoV, a relevância desses achados não pode ser verificada para células epiteliais do pulmão. Uma vez que o vírus possa superar a resposta imune inata em o nível celular, ele pode assumir o aparelho metabólico do hospedeiro pela degradação do mRNA do hospedeiro pelo nsp1 e pelo da via de ubiquitinação do hospedeiro por nsp3 (15, 81, 192, 224, 279). A replicação viral eficiente ocorre e as células o dano ocorre por citólise ou imunopatologia induzida por vírus. As linhas celulares infectadas e os tecidos pulmonares pós-morte mostraram alterações citopáticas devido a apoptose, necrose ou ocasionalmente formação de sincício. Expressão de nsp5, nsp10, Orf3a, Orf3b, Orf7a, Orf8a, E, M e N em diferentes linhas celulares por transfecção pode causar apoptose celular (Tabela 1). Expressão de S em células transfectadas podem levar à formação de sincício com células expressando ACE2 (181). Paradoxalmente, pouco efeito citopático ou inflamação foi encontrada em amostras de biópsia intestinal de Pacientes com SARS, apesar da acentuada replicação viral observada com microscopia tron (205). O perfil transcriptomal de vírus infectados As células Caco-2 mostraram uma acentuada regulação positiva da potente fator de crescimento transformador da citocina munossupressora e resposta celular do hospedeiro antiapoptótico, o que pode explicar a diarréia secretora não inflamatória e grande quantidade de vírus derramamento nas fezes (79). Portanto, o quadro clínico ou histopatológico manifestações lógicas em vários órgãos ou tecidos não determinam dependem unicamente da presença do receptor relevante e receptores ou a produtividade viral como afetada pela carga viral. As respostas inflamatórias e apoptóticas da célula desencadearam pelo vírus e pelo poder ou função regenerativa compensatória reserva regional desse órgão pode ser igualmente importante terminando as manifestações e o resultado da infecção. A expressão nsp1 nas células epiteliais A549 do pulmão humano pode aumentam a expressão das quimiocinas IP10, CCL3 e CCL5 através da via NF-B (192). Isso correlacionou bem com o perfil de quimiocina plasmática de pacientes com SARS e os coloração imuno-histoquímica dos pulmões infectados. IP10 pressionado contra pneumócitos é um potente quimioatraente para linfócitos T citotóxicos, células assassinas naturais e monócitos citócitos, que podem infiltrar-se no interstício e alvéolos de pulmões de pacientes com SARS. Administração de uma fragmento S binant entre as posições 324 e 688 e Orf3a A expressão nas células pulmonares pode estimular a produção de IL-8 (43, 169) A expressão de N nas células transfectadas também pode ativar a cascata não inflamatória Cox2 (393). Se o SARS-CoV puder suprimir a resposta imune inata precoce do IFN- / em pneumócitos tipo 2 sem ativar o estímulo estimulado por IFN genes e, portanto, também permite uma replicação viral descontrolada cação nas células adjacentes, a ativação concomitante de quimiocinas e citocinas pró-inflamatórias explicariam a manifestação dominante e altamente fatal da SARS nos pulmões. Resposta imune adaptativa Em geral, anticorpo sérico específico contra SARS- CoV por imunofluorescência indireta ou testes de neutralização começa a aparecer por volta do dia 7, platôs por volta do segundo mês e é mantida por mais de 12 meses. Imunoglobulina M (IgM) e IgG apareceram na mesma época, mas o o primeiro não foi detectado após 2 a 3 meses (371). Sérum O teste por EIA de nucleocapsídeo recombinante pode detectar tal anticorpo logo no quinto dia após o início dos sintomas (46) A resposta imune mediada por células T específica para vírus é não está claramente definido. Em um estudo, a imunidade mediada por células específica de S a comunidade mediada por células CD4 e CD8 durou mais de mais de 1 ano (395). Suscetibilidade do host Alguns estudos sugeriram uma possível associação de HLA- B * 4601 com suscetibilidade e gravidade da SARS entre os População chinesa em Taiwan (223), mas a descoberta não foi confirmado nos casos de HKSAR SARS. Entre os chineses em HKSAR, associações semelhantes com HLA-B * 0703 e a variante genética ICAM3 Gly143 foi encontrada (35, 249). A lectina de baixa ligação à manose que produz o haplótipo YB tem um risco aumentado de adquirir SARS (160, 416). No outro Por outro lado, indivíduos com HLA-DRB1 * 0301 ou homozigotos verificou-se que as repetições em tandem CLEC4M eram menos sustentáveis. aceitável para infecção por SARS-CoV (40, 249). No entanto, este último 670 CHENG ET AL. C LIN . M ICROBIOL . R EV . em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 12 essa descoberta foi fortemente contestada em dois estudos subsequentes (324, 430). DIAGNÓSTICO LABORATÓRIO DA INFECÇÃO POR SARS-COV Não podem ser utilizados sinais ou sintomas patognomônicos de SARS diferenciar a SARS de outras causas de causas comunitárias ou pneumonia adquirida no hospital. Diagnóstico etiológico e diferenças indução de outras causas de pneumonia atípica pode ser feita apenas por confirmação laboratorial. Uma cultura viral positiva respiratória, fecal e, ocasionalmente, urina ou tecido. ienes ou um aumento de quatro vezes no título de anticorpos neutralizantes amostras de soro colhidas na admissão e 28 dias após a evidência mais definitiva de infecção. No entanto, tanto os vírus cultura e teste de anticorpos neutralizantes exigiram uma biossegurança laboratório de nível 3, que não está disponível na maioria dos hospitais. Detecção rápida por amplificação de ácidos nucleicos, como RT-PCR ou a detecção de antígenos por EIA é a alternativa. É importante que a maioria desses testes rápidos nunca foi completa investigados em ensaios de campo prospectivos devido à curta duração natureza da epidemia de SARS. Assim, a maioria dos nossos dados sobre esses Os ensaios provieram de avaliações de amostras clínicas armazenadas. Como para a coleta de espécimes clínicos, embora os líquido de lavagem veolar e tecido de biópsia pulmonar deve ser o ideal amostras no início da doença, esses procedimentos são invasivos e pode ser perigoso para os profissionais de saúde. Nasofaríngeo aspirados e lavagens da garganta, tomados com precauções respiratórias preservadas em meio de transporte viral, continuam sendo as mais amostras de diagnóstico importantes. Ensaios de amplificação de ácidos nucleicos A maioria dos testes de amplificaçãode ácidos nucléicos são projetados com o Orf1b ou gene da nucleoproteína (32, 56, 88, 108, 155, 189, 264, 266, 268, 349, 384, 391, 413). O último gene tem a teo- vantagem retical de ser mais abundante nas células infectadas e, portanto, de maior sensibilidade, mas isso não foi claramente comprovado em estudos clínicos. Desses métodos, real- RT-PCR quantitativa no tempo (Tabela 4) do sistema nasofaríngeo aspirado é o método mais sensível e rápido para ajudar na diagnóstico clínico e pode atingir uma sensibilidade de 80% com boa especificidade, mesmo se coletada nos primeiros 5 dias de doença (266). Os testes qualitativos de RT-PCR internos são geralmente menos sensível e propenso a contaminação. Positivo Os resultados dos testes de uma única amostra devem ser confirmados por um repita o teste detectando uma região diferente do SARS-CoV genoma na mesma amostra. Se possível, outra repetição a amostra também deve ser testada para excluir resultados falso-positivos devido à transferência de amplicons. Desde a carga viral na nasofagia o aspirado ríngeo geralmente atingia seu auge no décimo dia após o início dos sintomas, casos suspeitos de SARS devem ter a testes repetidos à medida que a doença evolui para evitar falsos negativos resultados (32, 258). As amostras de fezes também devem ser rotineiramente enviado para teste, uma vez que uma porcentagem muito alta de pacientes desenvolver diarréia e vírus derramado durante a segunda semana de doença (58). Determinação da carga viral nasofaríngea amostras ou soro após a apresentação podem ter quadro clínico valor, pois é um importante fator prognóstico (72, 73, 75, 156) O monitoramento longitudinal da carga viral seria um parte importante de qualquer teste de tratamento no futuro. Ensaios de detecção de antígenos A detecção de antígenos com anticorpos monoclonais ou Foi encontrado um anticorpo policlonal específico contra a proteína N um teste sensível e específico para o diagnóstico de SARS (Tabela 5) Num grande estudo com soros coletados de 317 pacientes com SARS em diferentes momentos da doença, a detecção por EIA da SARS N foi realizada utilizando um painel de três anticorpos monoclonais (46) Mais de 80% dos casos de SARS podem ser detectados nos primeiros 7 dias após o início da doença. Como níveis séricos de anticorpos começou a aumentar no dia 7, a sensibilidade do antígeno sérico ensaio diminuiu progressivamente para 0% no dia 21 (46). Antígeno detecção com EIA em amostras não séricas é geralmente menos sensível ao RT-PCR porque o valor de corte é geralmente definido em um nível muito superior ao das amostras de soro para superar os altos valores de densidade óptica de fundo em especificações não séricas. imens (189, 191). Ensaios de detecção de anticorpos Para o teste de anticorpos (Tabela 6), a imunofluorescência indireta teste de anticorpos é mais comumente realizado do que o teste de anticorpo, já que o primeiro envolve manipulação mínima infecção de vírus infeccioso e, portanto, traz menos risco de risco biológico. O teste geralmente não é útil durante a primeira semana de doença. Resultados positivos baixos de baixo título podem estar relacionados a reações cruzadas com outros coronavírus humanos (31, 47). UMA AIA nucleocapsídica recombinante pode ser usada como uma rápida triagem teste e possui uma sensibilidade mais alta, com detecção como logo no dia 5 após o início da doença (46), mas, novamente, resultados positivos devido a reações cruzadas com HCoV-O43 e HCoV-229E pode ocorrer e requer confirmação por Western transferência contra o polipeptídeo S de SARS-CoV (372). Sérum IgG, IgM e IgA apareceram na mesma época, entre dias 5 e 17 após o início dos sintomas e paralelamente ao aparecimento de atividade de anticorpos neutralizantes, mas um estudo relataram que a IgM apareceu três dias antes usando um AIA contra nucleoproteína (404). O título de neutralização o pico de anticorpos nos dias 20 a 30 e foi mantido por um longo Tempo. É interessante que o nível de anticorpos neutralizantes de aqueles que morreram atingiram o pico no dia 14 e depois começaram a cair, enquanto aqueles que sobreviveram tinham um nível sustentado de anticorpos (417) Um novo ensaio de imunofluorescência usando a proteína S e uma proteína de fusão NS recombinante como antígeno foi descrito. Os resultados são comparáveis aos obtidos com ensaios de imunofluorescência baseados em vírus inteiro (128, 235). o três surtos laboratoriais de SARS levaram ao uso de vírus pseudotipados para pesquisa e anticorpo de neutralização testes, mas faltam dados sobre avaliação sistemática. GESTÃO CLÍNICA E ANTIVIRAS Uma vez que não existe um agente antiviral eficaz comprovado por ensaio clínico controlado com placebo (Tabela 7), tratamento clínico A SARS confiou em grande parte nos cuidados de suporte. Amplo espectro cobertura antimicrobiana para pneumonia adquirida na comunidade deve ser dada enquanto a confirmação virológica estiver pendente. Tal antibióticos devem ser interrompidos assim que o diagnóstico de SARS for confirmadas, mas infecções nosocomiais como resultado de prolongada V OL . 20, 2007 SARS-CoV COMO AGENTE DE INFECÇÃO EMERGENTE / REEMERGENTE 671 em 21 de maio de 2015 pela BIBLIOTECA DO CENTRO DE MEDICINA DA NYU http://cmr.asm.org/ Transferido de Page 13 TABELA 4. Avaliação clínica dos testes de diagnóstico molecular para SARS-CoV Método de diagnóstico e gene alvo Amostra clínica Padrão ouro de diagnóstico Tempo de coleta após o início da sintomas (nº de amostras) % De sensibilidade (carga viral [cópias / ml]) Referência RT-PCR interno RNA pol a NPA Laboratório confirmado b Dias 1–5 c (72) 59,7 d 391 Dias 1-5 (98) 29,6 32. RNA pol NPA Critérios da OMS, provável SARS Dias 0–5 (501) 41.1 56. Dias 6-11 (211) 58,8 Dias 12-20 (62) 37,1 Dia 21 (15) 13,3 RNA pol Cotonete na garganta Critérios da OMS, provável SARS Dias 1 a 13 (590) 37,5 384 RNA pol a Cotonete para o nariz e a garganta Laboratório confirmado b Dias 1–5 c (54) 61,1 d 391 Dias 1-5 (53) 28,3 32. RNA pol Respiratório superior e Critérios da OMS, provável SARS Dias 0–5 (212) 31,1 56. Dias 6-11 (73) 37. Dias 12–20 (45) 31,1 Dia 21 (159) 5,7 RNA pol a Respiratório f Laboratório confirmado b 1 semana (243) 26,3 39. 2 semanas (134) 30,6 3-4 semanas (94) 18,1 RNA pol Banqueta Laboratório confirmado b Dias 5–10 c (19) 57,9 d 391 Dias 1–5 (25) 20 32. 1 semana (21) 42,9 39. 2 semanas (25) 68 3-4 semanas (80) 42,5 RNA pol Banqueta Critérios da OMS, provável SARS Dias 0–5 (77) 23,4 56. Dias 6-11 (86) 57 Dias 12–20 (72) 52,8 Dia 21 (297) 15,2 RNA pol Urina Laboratório confirmado b Dias 5–10 c (78) 50 d 391 Dias 1–5 (15) 0 0 32. 1 semana (75) 2.7 39. 2 semanas (82) 6.1 3–4 semanas (54) 11.1 RNA pol Urina Critérios da OMS, provável SARS Dias 0–11 (16) 12,5 56. Dias 12-20 (21) 4.8 Dias 21-23 (161) 1.9 RNA pol Soro sanguíneo) Critérios da OMS, provável SARS Dias 0–5 (64) 17,2 56. Dias 6-11 (14) 35,7 Dias 12–20 (9) 11.1 RNA aninhado pol Plasma sanguíneo) Laboratório confirmado b Dias 1-3 (24) 79,2 108 PCR quantitativo interno ORF 1b a NPA Laboratório confirmado b Dias 1-3 (32) 50. 263 Dias 4-6 (35) 31,4 Dias 7 a 10 (31) 51,6 ORF 1b g NPA Laboratório confirmado b Dia 1 (8) 62,5 d 264 Dia 2 (16) 87,5 d Dia 3 (26) 80,1 d ORF 1b NPA Critérios da OMS, provável SARS ou confirmado por laboratório b Dias 10–15 (142) 42,3 (2,4 log [médio]) 156 ORF em 1 etapa 1b g NPA Laboratório confirmado b Dias 1-3 (29) 96,6 d 266 Dias 4-9 (57) 80,7 d ORF 1b de 1 etapa Lavagem da garganta Critérios da OMS, Dias 2–9 (17) 9,58 10 2 (min) - 5,93 10 6 (máx.) 349 Saliva SARS confirmado Dias 2–9 (17) 7.08 10 2 (min) - 6,38 10 8 (máx.) N H respiratório Critérios da OMS, SARS confirmado Dias 2-54 (31) 74,2 88 N NPA e fezes Critérios da OMS, provável SARS Dias 1-4 (32) 18,8 155 Dias 5–10 (37) 35,1 RNA pol Banqueta Laboratório confirmado b Dias 1–10 (8) 75 189 Dias 11-20 (27) 81,5 Dias 21-30 (5) 80 ORF 1b Banqueta Critérios da OMS, provável SARS Dias 1-3 (6) 66,7 263 ou confirmado por laboratório b Dias 4-6 (15) 80 Dias