TESTE BIOINFORMÁTICA

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1a Questão
Qual dos cientistas a seguir teve grande contribuição para o avanço da bioinformática como área da ciência?
Alexander Fleming, com a descoberta da penicilina.
Charles Darwin, com a publicação do livro ¿A origem das espécies¿.
Marie Curie, pela sua pesquisa sobre dois novos elementos químicos: o rádio e polônio.
  Magaret Dayhoff, que usou computadores para o estudo de proteínas, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿.
Werner Karl Heisenberg, pela criação da mecânica quântica.
Respondido em 07/05/2020 15:10:32
Explicação:
A brilhante Magaret Dayhoff  desvendou a ordem dos aminoácidos que formavam algumas proteínas e a forma que essas 
proteínas tinham, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿. Este é considerado um dos primeiros experimentos em 
bioinformática, que foi publicado em 1965.
a Questão
Qual das alternativas apresenta um par de estruturas homólogas?
Concha de caramujo e escama de peixe.
Nadadeira de peixe e asa de borboleta.
Asa de ave e asa de morcego.
 Carapaça de tatu e concha de caramujo.
  Asa de morcego e asa de borboleta.
Respondido em 07/05/2020 15:10:49
Explicação:
As asas de aves e morcegos, apesar de possuírem funções diferentes, apresentam esqueletos homólogos. 
 
  2a Questão
Sobre a Teoria Sintética de Evolução, assinale V (verdadeiro) e F (falso) as afirmações abaixo, em seguida marque a letra com
SEQUÊNCIA CORRETA:
(  ) Há dois fatores principais na variabilidade genética: mutações e recombinações genéticas;
(  ) Mutação não é a única maneira de surgirem novos genes em uma população;
(  ) Alterações provocadas pelo ambiente nas características físicas de um indivíduo adulto são transmitidas a sua prole;
(  ) A Teoria Sintética de Evolução conseguiu explicar o rearranjo dos genes que chegam aos gametas, permitindo 
variabilidade genética a partir de fenômenos como a Reprodução Sexuada e Crossing-Over;
(  ) A mutação mistura novos genes e a recombinação cria os genes já existentes;
  V-F-F-V-F
V-F-V-F-F
V-F-F-F-V
 
V-V-F-V-F
F-F-V-V-V
Respondido em 07/05/2020 15:11:07
Explicação:
Resposta correta é a letra E, pois a mutação não é o unico mecanismo associado a variação gênica e as alterações associadas 
a células sométicas (caracteristicas físicas) não são passadas para prole, apenas as alterações em células gaméticas que são 
herdadas pela prole. Além disso a mutação leva a alteração de um gene já existente: subsitituição, adição, deleção ...
 
  3a Questão
A respeito dos computadores, marque a(S) alternativa(S) INCORRETA(S).
Os supercomputadores são aqueles que apresentam uma velocidade maior no processamento de dados, sendo ideal 
para serem utilizados em estudos de bioinformática.
  Todo computador é divido em dois sistemas eletrônicos: software e hardware
O software dos computadores nada é do que o sistema e o programa que executam os comandos do usuário.
Os computadores podem ser classificados quanto a sua utilização em: pessoais, científico e comercias.
Software é composto por programas como o Windows, pelo HD e memória enquanto o hardware é composto por 
placa mãe e memória secundária
Respondido em 07/05/2020 15:11:08
Explicação:
Todo computador necessita de um sofware e um hardware para funcionar.
 
  4a Questão
Alguns organismos de espécies diferentes possuem órgãos que exercem a mesma função, mas que possuem origem 
embrionária diferenciada. A asa de uma borboleta e a de uma ave, por exemplo, obedecem a esse princípio.
Analise as alternativas a seguir e marque aquela que indica corretamente o nome dado a esses órgãos.
 vestigiais.
 homólogos.
divergentes.
  análogos.
convergentes. 
Respondido em 07/05/2020 15:11:27
Explicação:
Os órgãos análogos são aqueles que desempenham funções semelhantes em espécies diferentes, mas não possuem a mesma 
origem embrionária.
1a Questão
A partir do Dogma Central da Biologia Molecular, podemos entender como uma molécula de DNA pode ocasionar a formação 
de uma proteína. Sobre a síntese proteica, marque a alternativa correta:
  Para formar uma proteína, é necessária a união de vários aminoácidos, correspondendo ao padrão de códons 
presentes no RNAm.
Uma proteína é formada a partir da leitura, pelos ribossomos, de uma sequência do DNA.
Para que a tradução ocorra, é necessário que se forme uma molécula de RNA por replicação de DNA.
Uma proteína é formada a partir de um ácido nucleico, e o processo inverso é denominado transcrição reversa.
O processo de síntese proteica é denominado transcrição.
Respondido em 07/05/2020 15:12:39
Explicação:
A única alternativa correta é a letra "b".
 
  2a Questão
Uma molécula de RNA é formada a partir de uma molécula de DNA, que atua como um molde. Esse processo é denominado 
de:
 replicação.
transcrição reversa.
tradução.
  transcrição.
reprodução
Respondido em 07/05/2020 15:12:50
Explicação:
Transcrição é o nome do processo em que a molécula de RNA é formada a partir do DNA como molde.
 
  3a Questão
Sobre o splicing, é incorreto afirmar que:
Necessária a formação de grandes arranjos compostos por snRNPs e precursores de RNAm.
  Antes considerados DNA lixo, sabe-se atualmente que os éxons permitem a codificação de múltiplas proteínas por 
um mesmo gene, através do splicing alternativo.
Consiste em um processamento necessário para tornar o mRNA funcional.
Consiste na retirada de sequências não codificadoras denominadas íntrons.
Mecanismo complexo, altamente regulado, onde uma mutação em um elemento regulador, pode ocasionar uma falha
no processo.
Respondido em 07/05/2020 15:12:40
Explicação:
Antes considerados DNA lixo, sabe-se atualmente que os íntrons permitem a codificação de múltiplas proteínas por um mesmo
gene, através do splicing alternativo.
 
  4a Questão
São afirmativas relacionadas à terapia gênica, exceto:
 
Manipulação ou correção da expressão gênica em células-alvo.
Técnica em que são inseridos genes funcionais em uma célula para que ela interrompa a produção de proteínas 
defeituosas.
  Não há risco na sua utilização e, desta forma, a terapia gênica não apresenta potencial para desencadear outras 
doenças.
Transferência de genes para células com finalidade terapêutica.
Forma de tratamento que consiste na transferência de material genético exógeno para dentro de células de um 
indivíduo.
Respondido em 07/05/2020 15:12:46
Explicação:
Apesar dos enormes benefícios relacionados à terapia gênica, há o risco do tratamento desencadear outras doenças, como 
câncer.
 
  5a Questão
Qual das alternativas abaixo não está relacionada ao controle pós-transcricional de um gene?
Remoção de íntrons e união dos éxons.
  Atuação de ativadores e de repressores eucarióticos por meio de vários mecanismos.
Ocorrência após a RNA-polimerase ter se ligado ao promotor do gene e iniciado a síntese do RNA.
Modificação covalente de ambas as extremidades do RNA.
Adição de cauda poli-A e do CAP 5'. 
Respondido em 07/05/2020 15:13:05
Explicação:
Os ativadores e os repressores eucarióticos atuam por meio de vários mecanismos ¿ geralmente alterando a estrutura local da
cromatina e controlando a associação dos fatores gerais de transcrição e da RNA-polimerase no promotor e estão envolvidos 
no controle transcricional do gene.
1a Questão
A coleta e o armazenamento de amostras destinadas as técnicas de biologia molecular devem ser realizadas com muito 
cuidado devido ao alto risco de degradação das moléculas de ácidos nucleicos. A respeito destes processos marque a 
alternativa CORRETA.  
As amostras de tecido destinadas a extração do DNA devem obrigatoriamente ser armazenadas em nitrogênio
líquido.
  Para amostras de sangue e de medula as amostras destinadas a extração do RNA devem ser armazenadas em
freezer -70ºC
A coleta de tecido proveniente de biópsia pode ser armazenado e transporta resfriado a temperatura de 2º a
8ºC
Independente do tipo de amostra, a coleta de espécimes clínicos destinados a extração de DNA e RNA devem ser 
realizadas com estabilizadores
Não há necessidadede transportar as amostras coletadas em caixas isotérmicas com gelo seco.
Respondido em 07/05/2020 15:13:32
Explicação:
Neste tipo de amostras o RNA só se mantem instavel por algum tempo se armazenado em temperaturas superiores a -70ºC
 
  2a Questão
O  processo   de   extração   tem   como   objetivo   isolar   o   ácidos   nucleico   dos   demais
componentes celulares. Baseado neste processo marque a alternativa incorreta
O fenol clorofórmio é um insumo muito utilizado para promover a precipitação
de proteínas.
A remoção do RNA é uma etapa exclusiva da extração de DNA
  A primeira etapa da extração é a lise de membranas onde são utilizados substância com ação de solvente
A precipitação do ácido nucleico pode se realizada com etanol ou álcool isopropílico.
Substâncias com ação de detergentes podem ser utilizadas para remoção dos lipídios da amostra
Respondido em 07/05/2020 15:13:37
Explicação:
Letra A. São substância detergentes e não solventes. 
 
  3a Questão
Eduardo está desenvolvendo uma pesquisa para investigar a associado de mutações em células da mucosa da laringe com o
desenvolvimento de câncer. Assim, ele recrutou pacientes saudáveis e com câncer de laringe para fazer a coleta do material.
Após a biopsia Eduardo não sabia como armazenar este espécime clinico e de uma forma precisa e correta sua amiga Luana o
orientou a: 
Manter  o tecido em geladeira (2º a 8ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da
laringe
 
 
Armazenar o tecido em nitrogênio líquido (-196ºC) para posterior extração do DNA das células do
tecido da laringe
 
Manter o tecido no freezer (2º a 8ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
 
Armazenar o tecido no freezer (-10ºC ) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
   
Manter o tecido no freezer (-70ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
Respondido em 07/05/2020 15:13:45
Explicação:
Para a extração da DNA é suficiente armazenar em freezer -70º graus
1a Questão
Uma fita de DNA apresenta a seguinte sequência:
TCAAGT
Marque a alternativa que indica corretamente a sequência encontrada na fita complementar:
ATAAUA
  AGTTCA
AGUUCA
UCTTGU
AGUUGA
Respondido em 07/05/2020 15:14:10
Explicação:
 É importante perceber que o DNA é composto por duas fitas e que uma complementa a outra. Sabemos que na molécula de 
DNA a adenina sempre se une à timina e que a citosina sempre se liga à guanina. Sendo assim, uma sequência TCAAGT liga-
se a uma sequência AGTTCA.
 
  2a Questão
Em relação às macromoléculas que constituem a maioria dos seres vivos, é correto afirmar que
os lipídeos e os peptideoglicanos compõem a membrana plasmática de todos os eucariotos.
os triglicerídeos e polissacarídeos são carboidratos
as enzimas e os esteroides são proteínas.
   os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são formados por várias unidades chamadas de nucleotídeos.
o glicogênio e o amido são polissacarídeos produzidos pelas células vegetais
Respondido em 07/05/2020 15:14:03
Explicação:
Os ácidos nucleicos, DNA e RNA, são polímeros de monômeros denominados nucleotídeos.
 
  3a Questão
(PUC-SP) [¿] De outro lado, o galardão de química ficou com os inventores de ferramentas para estudar proteínas, os 
verdadeiros atores do drama molecular da vida.
É verdade que a Fundação Nobel ainda fala no DNA como o diretor da cena a comandar a ação das proteínas, mas talvez não 
seja pretensioso supor que foi um lapso, e que o sinal emitido por essas premiações aponta o verdadeiro futuro das pesquisas
biológicas e médicas muito além do genoma e de seu sequenciamento (uma simples soletração). (¿)
* LEITE, Marcelo. De volta ao sequenciamento. Folha de S. Paulo- 20 out. 2002.
O autor refere-se às proteínas como ¿atores do drama molecular¿ e ao DNA como ¿diretor de cena¿. Essa referência deve-se 
ao fato de:
  o DNA controlar a produção de proteínas e estas controlarem a atividade celular.
o material genético ser constituído por proteínas.
o DNA controlar a produção de proteínas e também atuar como catalisador de reações químicas celulares.
as proteínas não terem controle sobre o metabolismo celular.
não ocorrer uma correlação funcional entre DNA e proteínas no meio celular.
Respondido em 07/05/2020 15:14:20
Explicação:
O DNA possui sequências de nucleotídeos que serão usadas para a síntese de proteínas, que atuam em todas as atividades do
nosso organismo.
a Questão
Com relação aos bancos de dados e uma melhor cobertura das análises metabolômicas, podemos afirmar que: 
Os dados gerados por microarranjos de DNA são suficientes para gerar bancos de dados completos. 
A normalização dos dados é desnecessária em quaisquer análises metabolômicas.
Atualmente, os bancos de dados são atualizados o suficiente para garantir uma ampla cobertura sem entradas 
replicadas. 
As ferramentas usadas para as análises de transcriptômica e proteômica são totalmente apropriadas para as análises 
metabolômicas. 
  Para garantir maior confiabilidade, as análises não devem se restringir ao uso de uma única base de dados . 
Respondido em 07/05/2020 15:14:35
Explicação:
A única alternativa correta é a letra "a".
 
  2a Questão
São aspectos relacionados à transcriptômica, exceto:
Uma de suas limitações está relacionada ao fato de que a abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada 
com a abundância da proteína.
  Tem sido utilizada para o estudo das respostas metabólicas de organismos a fatores bióticos e abióticos.
Tem como objetivo determinar os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
Várias técnicas podem ser aplicadas para seu estudo, a exemplo dos microarranjos de DNA.
Sua análise é característica de cada tipo de célula, e pode diferir em função de diferentes situações fisiológicas ou 
patológicas.
Respondido em 07/05/2020 15:14:23
Explicação:
A metabolômica estuda as mudanças na expressão de pequenas moléculas orgânicas, conhecidas como metabólitos.
 
  3a Questão
As alternativas a seguir estão relacionadas à transcriptômica, exceto:
A atividade das proteínas codificadas pelos mRNAs é regulada em vários níveis após a sua expressão
Várias técnicas podem ser aplicadas para o estudo, dentre elas, a técnica de microarranjos de DNA 
(DNA microarray).
  É usada para quantificar a abundância, modificação e interação de peptídeos.
Determina os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
A abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada com a abundância da proteína.
Respondido em 07/05/2020 15:14:28
Explicação:
A proteômica, por sua vez, faz parte das ômicas e é usada para quantificar a abundância, modificação e interação de 
peptídeos, além de determinar sua localização sub-celular.
 
  4a Questão
Em relação às ômicas e sua importância para as pesquisas científicas, qual das alternativas a seguir está incorreta:
  Um projeto de pesquisa só pode ser iniciado a partir de sequências genômicas conhecidas, não havendo 
possibilidade de efetuar estudos com sequências desconhecidas.
Entre os grandes dificultadores nos estudos de biologia molecular estão a necessidade de acesso a várias fontes 
de dados para responder uma questão simples e a utilização de ferramentas de análise sofisticadas.
A metabolômica pode auxiliar na demonstração de como os genótipos estão associados aos fenótipos, além de 
permitir simulações de mecanismos celulares em larga escala.
A genômica pode ser estrutural ou funcional; a primeira objetiva a caracterização da natureza física dos genomas 
completos e a segunda busca caracterizar a função biológica dos genes.
A tecnologia de microarranjos de DNA possibilita a avaliação simultânea da expressão de milhares de genes em 
diferentes tecidos de um determinado organismo, e em diferentes estágios de desenvolvimento ou condições 
ambientais.
Respondido em 07/05/2020 15:14:48
Explicação:
Um projeto de pesquisa pode iniciar com uma série de sequências genômicas, conhecidas ou não. As sequênciasdesconhecidas podem ser submetidas a uma busca em bancos de dados por sequências similares, como será visto na próxima
aula, ou podem ter suas identidades e funções preditas por meio do uso de algoritmos computacionais.
 
  5a Questão
Assinale a alternativa que corresponde à descrição a seguir: "consiste na análise global e em larga escala dos conjuntos de 
proteínas e suas isoformas expressas em uma amostra biológica, ou seja, em um organismo, tecido, biofluido ou célula."
genômica
metagenômica
transcriptômica
  proteômica
metabolômica
Respondido em 07/05/2020 15:14:45
Explicação:
A proteômica consiste na análise global e em larga escala dos proteomas, que são o conjunto de proteínas e suas isoformas 
expressas em uma amostra biológica, ou seja, em um organismo, tecido, biofluido ou célula.
1a Questão
O BLAST e o CLUSTALW são ferramentas comuns utilizadas nos estudos de 
bioinformática, mas essas ferramentas são constituídas de algoritmos distintos
que vão buscar parâmetros diferentes. A respeito desta afirmativa assinale a 
questão incorreta sobre essas ferramentas.
De maneira geral, a opção pelo uso do Blast ou do ClustalW vai depender do objetivo da pesquisa. 
O BLAST é um algoritmo de alinhamento local que busca de forma rápida pequenas regiões de similaridades
 O BLAST efetua um alinhamentos mais simples que comparam apenas regiões de alta similaridade entre apenas 
duas sequências.
   O Clustal é um algoritmo de alinhamento múltiplo local que se baseia na distância evolutiva.
 
ClustalW efetua um alinhamento mais complexo que estabelece a relação evolutiva entre todas as sequências 
utilizadas.
Respondido em 07/05/2020 15:15:03
Explicação:
O clustalW é uma ferramenta de alinhamento global. 
 
  2a Questão
Á respeito da temática "alinhamento genômico" marque a opção correta.
  Softwares de alinhamento genômico analisam os diferentes tipos de alinhamentos e nos sugerem o ¿alinhamento 
ótimo¿ no final do processo. 
O BLAST é uma ferramenta de busca por alinhamento global básico par-a-par 
Os alinhamentos genômicos são técnicas de comparação entre sequências biológicas, que utilizam algoritmos 
computacionais apenas para apontar as diferenças localizadas na mesma posição das sequências analisadas
Os alinhamentos multiplos globais são método  que exigem pouca capacidade computacional e, dependendo da 
quantidade de sequências envolvidas, pode requerer tempos curtos para processamento.
Os traços que podem aparecer nas sequencias após o alinhamento  são os indels, que representam as translocações 
que foram realizadas naquele genoma.
Respondido em 07/05/2020 15:15:08
Explicação:
Resposta correta letra C
1a Questão
Em relação ao desenho de primers, é incorreto, afirmar que:
O tamanho dos primers determina especificidade e afeta seu anelamento com o DNA molde
O número máximo de repetições aceitável é de 4 dinucleotdeos
Primers de tamanho muito curto leva a  baixa especifcidade, resultando em amplifcação não específca
Incompatibilidade signifcativa do par de primers pode levar à má amplifcação
  Repetições não aumenta o potencial de anelamento incorreto/inespecífco
Respondido em 07/05/2020 15:15:23
Explicação:
Repetições longas aumenta o potencial de anelamento inespecífco, pois pode ocorrer um erro de leitura da fita. O ideal é que 
no desenho de primers, não exista repetições longas para que não ocorra o anelamento inespecífico.
 
  2a Questão
Em relação ao alinhamento de sequência, ela pode ocorrer sendo alinhamento global ou local. Em relação ao alinhamento 
global, é correto, afirmar que:
identificam regiões de similaridade dentro de sequencias longas que são geralmente bastante divergentes em um 
todo.
Ocorre pelo programa clustal W
Localiza similaridades apenas de um ponto específico da sequência.
É realizado através do desenho primer
  é uma forma de otimização global que "força" o alinhamento a cobrir todo o comprimento de todas as sequencias 
interrogadas (query).
Respondido em 07/05/2020 15:15:27
Explicação:
É um tipo de alinhamento, aonde ocorre a leitura de toda a sequência para que posteriormente, possam ser analisados os 
pontos de similaridade.
1a Questão
"Um programa usado para anotação gênica de procariotos normalmente pode ser utilizado para anotação gênica de 
eucariotos". Julgue a afirmativa anterior.
Falsa, porque existem poucas espécies de bactérias e milhares de espécies de organismos eucariotos.
Falsa, devido à ausência de membrana nuclear nos procariotos e a dispersão do DNA pela célula.
Verdadeira, pois os dois grupos de organismos possuem DNA como material genético.
  Falsa, devido à complexidade da estrutura gênica em eucariotos, que possuem íntrons interrompendo as regiões 
codificantes, por exemplo.
Verdadeira, devido a característica universal do código genético.
Respondido em 07/05/2020 16:24:43
Explicação:
Predição gênica é a mesma coisa que encontrar um gene em meio a uma sequencia de DNA. A organização do genoma de 
procariotos é mais simples quando comparada aos eucariotos. 
 
  2a Questão
Escolha a sequência correta de etapas envolvidas no processo de interpretação do genoma de um organismo:
extração do DNA -> sequenciamento -> anotação funcional -> predição gênica.
extração do DNA -> predição gênica -> sequenciamento -> anotação funcional.
  extração do DNA -> sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional.
sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional -> extração do DNA.
predição gênica -> extração do DNA -> anotação funcional -> sequenciamento.
Respondido em 07/05/2020 15:15:57
Explicação:
Primeiro é necessário obter o material biológico (DNA), determinar sua sequência de bases nitrogenadas, encontrar os genes 
e por fim determinar a função dessses genes.
 
  3a Questão
A anotação funcional de um gene inclui saber a função da proteína codificada pelo gene e também identificar a qual processo 
biológico aquela proteína faz parte. Dentre os processos que ocorrem em uma célula podemos incluir as reações metabólicas e
o processamento da informação genética.  Qual dos bancos de dados abaixo auxilia na busca por informações sobre processos
biológicos?
GenBank.
PDB.
Nenhuma das opções anteriores.
SWISS-Prot.
  KEGG.
Respondido em 07/05/2020 15:16:05
Explicação:
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) é um banco de dados extremamente completo. Conseguimos extrair dele 
informações como qual via metabólica a proteína está inserida, doenças relacionadas, dentre outras.
a Questão
O repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos é o:
SWISS-Prot.
GenBank.
  PDB.
Gene Ontology (GO).
KEGG.
Respondido em 07/05/2020 15:16:01
Explicação:
PDB: Protein Data Banking
 
  2a Questão
Julgue as afirmativas abaixo usando seus conhecimentos sobre bancos de dados biológicos utilizados para anotação gênica.
I- Diversos bancos de dados podem ser utilizados para anotação de um gene, cada um deles focando em um conjunto de 
informações, como sequência, estrutura e vias metabólicas.
II- Os bancos de dados biológicos usados para anotação gênica só podem ser acessados mediante o pagamento de uma 
mensalidade pelo usuário.
As afirmativas I e II são proposições verdadeiras.
Nenhuma das afirmativas anteriores.
As afirmativas I e II são proposições falsas.
  A afirmativa I é uma proposição verdadeira, e a II é uma proposição falsa.
A afirmativa I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira.
Respondido em 07/05/2020 15:16:06
Explicação:
Todos os bancos de dados citados nas apostilas são de livre acesso para toda comunidade.