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1 ELETROFORESE A eletroforese é uma técnica baseada na separação de moléculas/partículas de uma amostra, a qual são dissolvidas ou suspensa em um eletrólito sob uma malha, através do qual uma corrente elétrica é aplicada. Esta técnica consiste na migração de moléculas ionizadas, em solução, de acordo com suas cargas elétricas e pesos moleculares em campo elétrico. Moléculas com CARGA NEGATIVA (-) migram para o POLO POSITIVO (+) – ÂNODO Moléculas com CARGA POSITIVA (+) migram para o POLO NEGATIVO (-) – CÁTODO GEL DE AGAROSE Feito de polímeros de polipeptídios, a agarose é composta por ágar e pectina, que juntas conseguem fazer uma malha do tipo peneira. Após preparo do gel, adiciona-se brometo de etídio (corante fluorófilo com alta afinidade por DNA, porém de alto risco à vida por ser carcinógeno) que se intercala na dupla hélice de DNA possibilitando a visualização dos fragmentos quando em exposição a luz UV. PONTOS IMPORTANTES QUE INFLUENCIAM NA EFICÁCIA EM GEL DE AGAROSE O tamanho do fragmento de DNA, pois quanto maior for, mais retida ficará; A concentração do gel de agarose, pois quanto mais concentrado estiver, mais moléculas irá reter; A corrente elétrica aplicada, pois quanto mais corrente for aplicada, mais rápido será a separação das moléculas; O tipo de tampão, pois o tipo do tampão utilizado pode afetar ou beneficiar a velocidade da partícula no gel. Separar as moléculas de proteínas ou ácidos nucleicos (DNA e RNA possuem carga elétrica negativa, logo, migram para o polo positivo e quanto menores forem as moléculas, mais migrarão) de acordo com o seu peso molecular. 2 GEL DE POLIACRILAMIDA Feito de uma mistura de dois polímeros, acrilamida e bisacrilamida, o gel de poliacrilamida possui a capacidade de separar fragmentos muito pequenos de DNA e também separar proteínas. Porém, o gel de agarose é o mais utilizado pois, o gel de poliacrilamida é neurotóxico e cancerígeno. A eletroforese em gel de poliacrilamida é geralmente feita em cubas verticais. Visualizador de fragmentos; Marcador de peso molecular.
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