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Bioquímica – Aula 3: Enzimas • Grupo de substâncias orgânicas de natureza normalmente proteica; • Diminuem a energia de ativação; • São catalisadores biológicos ; Importância pratica das enzimas Doenças, deficiências, ausências, ou excessos de atividade enzimática. Doenças: intolerância a lactose, pessoa não produz a lactase. Excessos de atividade enzimática: nocleases que quebram ácidos nucleicos. Nomenclatura das enzimas Sufixo “ase” Ex.: lactase, peptdase Nomes sistemáticos: o nome da enzima diz o que ela faz. Ex.: Nome usual: consagrados pelo uso. Ex.: tripsina (liberado pelo pâncreas para digerir proteínas), pepsina (no estomago). Propriedades Sitio ativo: local onde o substrato se liga na enzima. Possui cadeias laterais de resíduos de aminoácidos que interagem com o substrato. Complexo ENZIMA => SUBSTRATO. Determinada enzima localizada em um lugar com pH 5, começa a ter um meio ao redor dela pH 8, qual a consequência para a atividade enzimática, justifique bioquimicamente. Devido a alteração do pH pode ocorrer protonação ou desprotonação dos grupos potencialmente ionizáveis de modo que isso afeta diretamente a interação das cadeias laterais dos aminoácidos do sitio ativo com o substrato, de modo que se afetar negativamente não haverá a ligação do substrato com a enzima, portanto a atividade enzimática a conversão do substrato em produto fica comprometida. Eficiência catalítica: enzimas são altamente eficientes. Realizam um trabalho bem feito em pouco tempo. Transformam 100 a 1000 moléculas de substrato em produto por segundo. Especificidade: indica que a enzima faz sempre a mesma reação. Catalisa apenas um tipo de reação química. • Cofatores: pequenas moléculas orgânicas ou inorgânicas que não estão ligadas permanentemente as moléculas da enzima, mas na ausência deles a enzima é inativa, enzima só fica ativa quando esta ligada a um cofator. Porém, nem todas as enzimas precisam de cofatores, mas aquelas que dependem de cofatores somente estarão ativas se estiverem ligadas ao mesmo. Cofator orgânico: coenzima Cofator inorgânico: ions metálicos usuario Destacar usuario Destacar usuario Destacar Regulação: nem todas as enzimas sofrem regulação. Atividade enzimática pode ser regulada por ativação ou inibição de modo que a velocidade de formação do produto responda as necessidades celulares. Regulação covalente: a partir de uma ligação covalente, pode deixar a enzima tanto inativa como ativa. Ex.: adição de um grupo fosfato a uma ligação covalente. Regulação alostérica: nem todas as enzimas sofrem essa regulação. Sitio alosterico é um local onde uma molécula alostérica vai se ligar a enzima. Na enzima alostérica tem dois sítios, o sitio ativo e o sitio alostérico. Quando uma molécula alostérica se liga ao sitio alostérico, ela gera uma mudança na enzima; essa mudança pode favorecer ou não o aparecimento do sitio ativo, se favorece o aparecimento, estará favorecendo a ligação do substrato e da enzima, com isso esta ATIVANDO a enzima. Se a ligação da molécula alosterica no sitio alosterico gera uma mudança formacional, é impedido o aparecimento do sitio ativo, portanto essa molécula alosterica estará INATIVANDO a enzima. Como funciona uma enzima: Energia de ativação= energia necessária pra transformar substrato em produto Quando diminui a energia de ativação a reação é favorecida por ser mais rápido. Química do sitio ativo= ajuste induzido (substrato se aproxima da enzima e favorece o aparecimento do sitio ativo) Tensão do substrato= favorece a conversão dele em produto NÃO EXISTE MODELO CHAVE-FECHADURA Fatores que alteram a velocidade de uma reação enzimática 1- Concentração do substrato: à medida que a concentração aumenta a velocidade da reação também aumenta, até atingir a velocidade máxima, e nesse momento as enzimas estão saturadas. Não adianta colocar mais substrato quando a enzima já esta na velocidade máxima. 2- Temperatura: aumento da velocidade com a temperatura e diminuição da velocidade com a temperatura. 3- pH: cada enzima tem um pH ótimo para agir. Extremos de pH desnaturam a enzima. E+S=ES reversível ES: complexo enzima substrato Sempre na medida em que a concentração do substrato aumenta a velocidade também aumenta ata atingir a velocidade máxima. V= Vmax[S] Km+[S] Km= constante de Michaeles; Reflete a afinidade da enzima por um determinado substrato; Quanto menor o valor do km maior será a afinidade da enzima pelo seu substrato. usuario Destacar usuario Destacar usuario Destacar A cinética de Michaelis-Menten Relação entre a velocidade e a concentração da enzima. A medida que aumenta a concentração de enzima aumenta a velocidade da reação enzimática, desde que se tenha substrato disponível. Inibição da atividade enzimática Inibidores reversíveis: liga-se a enzima por meio de ligações não covalentes (fraca). Inibidores irreversíveis: liga-se a enzima por meio de ligações covalentes (forte). Inibição competitiva: o inibidor liga-se reversivelmente ao mesmo sitio ativo que o substrato. i. Efeito sobre a velocidade máxima: o efeito é reversivo pelo aumento da concentração do substrato. ii. Efeito sobre o km: aumenta o km aparente para determinado substrato (mais substrato será necessário para se atingir a velocidade máxima). Inibidor não competitivo= o inibidor e o substrato ligam-se a sítios diferentes sob a enzima i. Efeito sobre a velocidade máxima: a inibição não pode ser superada pelo aumento da concentração de substrato. Os inibidores não competitivos diminuem a Vmax da reação. ii. Efeito sobre o Km: não interferem na ligação do substrato com a enzima, assim sendo, a enzima mostra o mesmo km. Muitas enzimas catalisam reações que envolvem dois ou mais substratos Envolvem a transferência de um átomo ou um grupo funcional de um substrato para o outro. Ambos (ou mais) os substratos estão ligados a enzima ao mesmo tempo podendo formar um complexo ternário. ENZIMAS A maioria é proteica, OU SEJA, nem todas são proteínas (toda enzima é uma proteína está errado). Definição: Grupo de substâncias orgânicas de natureza normalmente proteica (existem também enzimas constituídas de RNA- as ribozimas- que são aquelas enzimas que fazem a ligação, participam do processo de síntese de proteína) especializadas na catálise de reações biológicas e que possuem grande especificidade. **** Não é exclusivamente proteica. usuario Destacar usuario Destacar Professor: Experimentalmente, em um laboratório, se você colocar em um recipiente, e tem uma substancia qualquer lá. Você sabe que ela vai ser convertida em algum produto, mas ela precisa de energia para isso. Adicionar nesse recipiente energia (através da forma de calor). Se você adiciona muito calor, você aumenta a energia dela e começa a acontecer ali uma série de interações, e esta molécula pode ser convertida em outra molécula. No nosso organismo, a gente pode submetê-lo a uma alta concentração de calor? NÂO! Então a evolução biológica, colocou no nosso organismo a possibilidade de existir uma substancia que consiga fornecer uma rota alternativa, sem necessariamente encher de calor, e conseguir converter um substrato em produto – AS ENZIMAS. Por isso, em uma reação enzimática, você sempre vai ter UM SUBSTRATO sendo convertido em PRODUTO. Sempre em uma reação enzimática, a enzima, no final, não é consumida. No final do processo, ela está livre para se ligar novamente com um novo Substrato. Só para ilustrar: você tem uma enzima (sacarase) que tem como substrato - a sacarose (dissacarídeo). Quando o substrato se liga a enzima, forma o complexo ENZIMA SUBSTRATO. Esse substrato vai ser convertido em produto, de modo a formar o complexo ENZIMAPRODUTO, para posteriormente, o produto ser liberado e a enzima estar livre e pronta para iniciar outra catalise.Lembrando que enzima não é de vida eterna, ela tem um tempo de vida, e pelo menos durante o período de vida dela ela vai conseguir participar das reações sem ser consumida. Ela sempre vai acelerar a velocidade, e MUITO, DE UMA REAÇÃO. Visão Geral Envolvimento nas necessidades do organismo (auto-replicação, eficiência e seletividade na catálise); Sem a catálise as reações vitais não ocorrem na escala útil de tempo. Ex: a reação com a anidrase carbônica é 10 *7 vezes mais rápida do que sem essa enzima. Importância prática das enzimas: - doenças (deficiências, ausências ou excesso de atividades enzimática). Ex: deficiência e ausência – INTOLERANCIA A LACTOSE é um processo que vai acontecer pois ou o sujeito não produz a lactase, ou se ele produz, produz em quantidade muito reduzida. Ex: excesso de atividade enzimática – GOTA. (Algumas nucleases que quebram ác. Nucleicos em excesso- formando muito ác. Úrico) - Ação de fármacos (a maioria esta ligada com inibição ou ativação de enzimas). Ex: Antiinflamatórios estão ligados a inibição da produção de prostaglandinas, que são originadas pelo precursor ác. Araquidonio, que vai gerar os mediadores pro- inflamatórios (prostaglandinas). Ác araquidonio para prostaglandina necessita de uma enzima (ciclo oxigenasse 1 e 2). ***ANTIINFLAMÁTORIO INIBE A CICLO OXIGENASSE. - Área Medica, indústrias químicas, processo de alimentos e na agricultura. NOMENCLATURA DAS ENZIMAS: - Professor diz que não vai exigir os nomes das enzimas. As que ele achar que a gente tem que saber, ele vai avisar. Nome recomendado: com sufixo –ASE. Ex: hexoquinase, peptidase, uréase (está presente em bactérias que estão na boca, elas quebram ureia, libera amônia, amônia aumenta o PH, gera precipitação de sais de cálcio). Nome sistemático: dá informações sobre a função metabólica da enzima. Ex: ATP- glicose fosfotranferase (transfere o grupo fosfato do ATP para a glicose). Nomes usuais: Consagrados pelo uso. Ex: tripsina (pâncreas), pepsina (estômago), ptialina (saliva ou amilase salivar). CLASSES DE ENZIMAS: *** Apenas para cumprir protocolo, não é importante para a gente. NÃO VAI CAIR EM PROVA! NÃO VAI EXIGIR. 1- Oxidoredutases, 2- Transferases, 3- Hidrolases, 4- Liase, 5- Isomerases, 6- Ligases. PROPRIEDADES DAS ENZIMAS: - Sítio Ativo: Região especifica que se liga ao substrato (local onde o substrato se liga a enzima); Contém cadeias laterais de resíduos de aminoácidos; se liga ao substrato formando o complexo enzima-substrato, depois se dissocia em enzima e produto. ***OBS: Se você tem uma cadeia lateral com resíduos de aminoácidos positivos (na enzima), você vai interagir com substrato negativo. Quando o substrato se liga a enzima ocorre uma mudança conformacional na enzima. Pergunta do professor: Uma determinada enzima localiza em um meio de PH 5, ela começa a ter um ao seu redor um meio de PH 7 ou 8. Qual é a consequência para a atividade enzimática? Justifique bioquimicamente sua resposta. R: Devido a alteração do PH, pode ocorrer protonação ou desprotonação dos núcleos potencialmente ionizáveis de modo que isso afeta drasticamente a interação das cadeias laterais de aminoácidos do sitio ativo com o substrato. De modo que se alterar negativamente, não haverá a ligação do substrato com a enzima, portanto a atividade enzimática e a conversão de substrato em produto fica comprometida. Se meche no PH, é preciso que se aumente a interação química das cadeias laterais de resíduos de aminoácidos com o substrato. - Eficiência catalítica: São altamente eficientes (realiza algo bem feito em tempo menor). Cada molécula de enzima é capaz de transformar 100 a 1000 moléculas de substrato em produto por segundo. - Especifidade: São altamente especificas (seletivas, só vai fazer a reação com aquele substrato), interagindo com um ou alguns poucos substratos, catalizando apenas um tipo de reação química. Algumas podem ser ate estereoespecificas. Não esta apenas atrelada a especifidade do substrato, mas a especifidade da enzima indica que é sempre a mesma coisa, que o tipo de reação que ela faz é SEMPRE A MESMA (especifidade referente a reação). - Cofatores: Pequenas moléculas orgânicas (geralmente coenzimas) e inorgânicas que não estão ligadas permanentemente (geralmente) à molécula de enzima, mas na ausência deles, a enzima é inativa. Incluem íons metálicos (Zn, Fe, Mg) e coenzimas. *** Nem todas as enzimas precisam de cofator, mas aquelas que precisam somente estarão ativas se estiverem LIGADOS à cofatores. Se não estiverem ligadas a eles, se só estiver próximo, elas continuarão inativas. Cofator não necessariamente tem uma função enzimática. Ex: hemoglobina não é enzima mas necessita de um cofator- um grupo prostético (grupamento M), que está ligado permanentemente na hemoglobina. Sem o grupamento M, a hemoglobina perde sua função. usuario Destacar - Regulação: A atividade enzimática pode ser regulada por ativação ou inibição, de modo que a velocidade de formação do produto responda as necessidades celulares. Regulação Covalente: Significa que a partir de uma regulação covalente, você pode deixar uma enzima mais ativa ou menos ativa. Ex: ligação com o grupo fosfato. Quando ela não está ligada ao grupo fosfato ela está inativa, quando sofre fosforilação através de regulação covalente ela passa para a forma ativa. (APENAS NESSE EXEMPLO), pode correr do grupo se ligar e ficar inativa e vice e versa. Regulação Alostérica: possui um outro local além do sítio ativo, sítio alostérico (local onde uma molécula alostérica ou regulatória, vai se ligar a enzima). Nem todas as enzimas sofrem regulação alostérica, algumas tem as duas regulações. Ex: A ligação com está molécula vai gerar uma mudança na forma desta enzima, está mudança vai favorecer o aparecimento do sítio ativo que posteriormente vai favorecer a ligação do substrato na enzima, deste modo está ATIVANDO a enzima. *** OBS: Esta mudança conformacional pode favorecer ou não o aparecimento do sítio ativo. SE favorece, temos uma ativação. *** Célula está precisando de energia, as enzimas vão estar funcionando mais (vão estar trabalhando mais –mais ativas). ***NEM TODAS AS ENZIMAS SOFREM REGULAÇÂO. COMO ELAS FUNCIONAM: Energia de ativação: é a quantidade de energia necessária para se converter substrato em produto. - Alteração de energia durante as reações – Diminuem a energia de ativação, de modo a diminuir o tempo de reação e aumentar a velocidade de reação. Gera uma rota alternativa da reação que acontece entre substrato e enzima. - Química do sítio ativo: Tipo ajuste induzido: A medida que o substrato se aproxima da enzima, ele vai induzir nesta enzima o aparecimento do sítio ativo. (A aproximação da enzima ao substrato induz a formação do sítio ativo) ou A aproximação do substrato ao sitio ativo leva ao aparecimento do sítio ativo e devido esta mudança conformacional você vai ter uma tensão do substrato, esta tensão é justamente para favorecer a conversão dele em produto. ( A tensão do substrato induzida pela ligação do substrato a enzima, contorce o substrato e “ativa” o substrato.) Tipo chave e fechadura: esqueça, é errado. FATORES QUE AFETAM A VELOCIDADE DE UMA REAÇÃO ENZIMÁTICA: - Concentração de substratos: se aumentar a concentração de subs, aumenta a V. até chegar a Vmáx- todas as enzimas estão saturadas com substratos, portanto não adianta colocar mais substratos se já se tem Vmáx em uma reação enzimática. - Temperatura: Existe uma temperatura ótima para cada enzima. Diretamente proporcional. Porém não pode Aumentar demais, se não desnatura. (mais ativa ou menos ativa). -PH: PH ótimo varia de acordo com a enzima. Extremos de PH desnaturam as proteínas.
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