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UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA Estudo Dirigido Enzimas: Nomenclatura, Classificação e Propriedades 1. O que são enzimas? Enzimas são grupos de substâncias orgânicas de natureza normalmente proteica (existem também enzimas constituídas de RNA, as ribozimas), com atividade intra ou extracelular que têm funções catalisadoras, catalisando reações químicas que, sem a sua presença, dificilmente aconteceriam. 2. As enzimas são classificadas de acordo com o tipo de reação que podem catalisar. Comente e exemplifique. Classe 1 Oxirredutase s Catalisam reações de oxirredução, transferindo elétrons, hidretos (H-) ou prótons (H+). Classe 2 Transferases Transferem grupos químicos entre moléculas. Classe 3 Hidrolases Utilizam a água como receptor de grupos funcionais de outras moléculas. Classe 4 Liases Formam ou destroem ligações duplas, respectivamente retirando ou adicionando grupos funcionais. Classe 5 Isomerases Transformam uma molécula num isómero. Classe 6 Ligases Formam ligações químicas por reacções de condensação, consumindo energia sob a forma de ATP. Classe 7 Translocases Catalisam o movimento de íons e moléculas entre membranas. 3. O que é substrato? Molécula sobre a qual atua uma enzima. Uma enzima atua sobre o substrato, combinando-se com ele e ativando-se de tal modo que o substrato sofre uma alteração química posterior, ao mesmo tempo que deixa de se combinar com a enzima. Por esta razão, a enzima não se consome na reação, e no fim desta está novamente livre para atuar sobre mais substrato. UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA 4. O que é complexo enzima-substrato? Quando ele se forma e quando se desfaz? É o conjunto formado por uma enzima específica e um substrato específico. Para cada enzima há um substrato específico, ou seja, o substrato que se "encaixa" em uma determinada enzima não se "encaixa" em outra. Quando as enzimas interagem com os substratos, forma-se, temporariamente, o chamado complexo enzima-substrato. Assim que ocorre a reação química com os substratos, desfaz-se o complexo enzima-substrato. Liberam-se os produtos e a enzima volta a atrair novos substratos para a formação de outros complexos. 5. O que é sítio ou centro ativo ou catalítico? Qual a sua importância para a catálise enzimática? O sítio ativo ou centro ativo é a pequena região de uma enzima onde ocorrerá uma reação química. As enzimas são muito específicas para os seus substratos. Esta especificidade se deve à existência, na superfície da enzima, de um local denominado sítio de ligação do substrato. O sítio de ligação do substrato de uma enzima é um arranjo tridimensional de aminoácidos de uma determinada região da molécula, geralmente complementar à molécula do substrato, e ideal espacial e eletricamente para a ligação dele. O sítio de ligação do substrato é capaz de reconhecer inclusive isômeros óticos "D" e "L" de um mesmo composto. Este sítio pode conter um segundo sítio, chamado sítio catalítico ou sítio ativo, ou estar próximo dele; é neste sítio ativo que ocorre a reação enzimática. A presença do sítio ativo é importante pois, como as enzimas são altamente específicas para determinados substratos, faz com que as enzimas se liguem com o substrato correto, fazendo com que a reação ideal ocorra. UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA 6. Explique a propriedade de eficiência catalítica. Basicamente, enzimas são catalizadores capazes de aumentar enormemente a velocidade de reações químicas específicas sem serem consumidos no processo. 7. O que é número de renovação? O número de renovação é o número máximo de mols de substrato que podem ser em produto por mol de enzima em uma unidade de tempo. 8. Comente sobre a especificidade das enzimas. As enzimas são altamente específicas, o que significa que cada uma age como catalisadora biológica de apenas uma reação. Isso ocorre porque a enzima possui um centro ativo que se combina com o composto que irá sofrer a ação enzimática. Esse composto é chamado de substrato. É como se a enzima fosse a chave de uma fechadura (substrato). 9. O que é grupo prostético? Um grupo prostético é um componente de natureza não-proteica de proteínas conjugadas que é essencial para a atividade biológica dessas proteínas. 10. O que são coenzimas e cofatores? Todas as enzimas necessitam de cofatores ou coenzimas para funcionarem? Justifique. • Cofatores são substâncias, inorgânicas ou orgânicas, indispensáveis para o funcionamento das enzimas. Os cofatores orgânicos são chamados de coenzimas; • Coenzimas são moléculas metalorgânicas ou orgânicas que, juntamente com as enzimas, têm função catalítica (sendo necessária ao funcionamento dela). As coenzimas têm como característica o fato possuírem, entre si, ligações fracas. Após a catálise ela se desligam das enzimas. o Principais coenzimas: vitaminas, que são substâncias orgânicas exógenas, de natureza química variável, necessárias em pequenas quantidades. Muitas enzimas não necessitam de cofatores ou coenzimas para serem ativas. Outras necessitam da presença de ambos para que ocorra a catálise enzimática. Onde [Et] é a concentração total de enzima. UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA 11. O que são holoenzimas e apoenzimas? • Apoenzima: a fração proteica de uma enzima — na a ausência do seu cofator ou coenzima; • Holoenzima: enzima + cofator e/ou coenzima. 12. Por que as diferentes enzimas se localizam em diferentes ambientes dentro da célula? Muitas enzimas estão localizadas em organelas específicas dentro das células. Isso garante o meio favorável para a reação e organiza as milhares de enzimas presentes nas células dentro de vias definidas. 13. Há duas perspectivas para explicar como as enzimas funcionam. Comente cada uma delas (não esqueça de abordar energia de ativação, estado de transição, energia de ligação e o modelo encaixe induzido). • Alterações de energia que ocorrem durante a reação: o Reações químicas têm uma barreira de energia separando reagentes e produtos denominada Energia de ativação que representa a diferença de energia dos reagentes e aquela do intermediário de alta energia que ocorre durante a formação do produto. Uma enzima permite que uma reação ocorra mais rapidamente nas condições normais da célula, oferecendo uma rota alternativa, com uma menor energia livre de ativação. • Química do sítio ativo: o O sítio ativo não é um receptáculo passivo para a ligação do substrato. Emprega uma diversidade de mecanismos químicos para facilitar a conversão de substrato em produto. ▪ Estabiliza o estado de transição: UFCSPA MAIRON MATEUS MACHADO CURSO DE MEDICINA DISCIPLINA DE BIOQUÍMICA • O sítio ativo, em geral, atua como um molde flexível que se liga ao substrato em uma estrutura geométrica similar ao estado de transição ativado da molécula; ▪ Pode fornecer grupos catalíticos que aumentem a probabilidade de se formar o estado de transição: • Em algumas enzimas estes grupos podem participar de uma catálise ácido/básica geral na qual resíduos de aminoácidos doam ou aceitam prótons em outras a catálise podeenvolver a formação transitória de um complexo covalente enzima-substrato (ES). o Ligação da Enzima ao Substrato → 2 modelos propostos: chave-fechadura e encaixe induzido: ▪ Chave-fechadura: o complexo enzima-substrato obedeceria a um modelo “chave-fechadura”. A especificidade da enzima se dá pelo fato de o sítio ativo ter um formato complementar ao seu substrato, promovendo um encaixe perfeito, como uma chave que encaixa em determinada fechadura; ▪ Encaixe induzido: há casos em que tanto enzima quanto substrato apresentam certa plasticidade e podem mudar sua configuração. Dessa forma, um se adapta ao outro para uma melhor ligação.
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