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Aluno (a): Victoria Zambon Brondani Curso: Odontologia Disciplina: Bioquímica Odontológica Professora Naiara Stefanello Aula 2 – Proteínas 1. O crescente entendimento de como as proteínas se dobram permite que os pesquisadores façam predições sobre a estrutura de uma proteína, com base em dados sobre sua sequência primária de aminoácidos. Considere a seguinte sequência de aminoácidos: a) Onde devem ocorrer dobras ou voltas b? b) Onde devem se formar ligações dissulfeto intramoleculares? c) Assumindo que esta sequência é parte de uma proteína globular maior, indique a localização provável (na superfície externa ou no interior da proteína) dos seguintes resíduos de aminoácido: Asp, Ile, Thr, Ala, Gln, Lys. Explique sua resposta. 2. Cite as funções biológicas das proteínas. 3. Como podem ser classificados os aminoácidos de acordo com as cadeias laterais? 4. Explique os tipos de ligações químicas importantes para a manutenção da estrutura terciaria das proteínas. 5. Desenhe a estrutura química básica de um aminoácido e coloque nomes nas suas estruturas. 6. Diga quais as estruturas das proteínas. 7. Defina desnaturação proteica. E quais os fatores que podem alterar a conformação nativa de uma proteína? 8. Os aminoácidos encontrados nas proteínas são denominados alfa L aminoácidos. Explicar por que são assim denominados. 9. Descreva a curva de titulação de um aminoácido com o grupo lateral não ionizado. Possuem curva de titulação parecida com a da glicinaEm ph muito baixo, a espécie iônica predominante da glicina é a sua forma totalmente protonada. No ponto médio do primeiro estágio da titulação, estão presentes concentrações equimolares da forma doadora de prótons e da forma receptora de prótons. No ponto médio de qualquer titulação, um ponto de inflexão é atingido, no qual o pH é igual ao pK do grupo protonado que está sendo titulado 10. Defina ligação peptídica e dizer como ela é formada. 11. O que são proteínas fibrosas e globulares, cite exemplos. 12. De que forma a vitamina C está interligada a molécula de colágeno? 2. As proteínas desempenham inúmeras funções, como: a enzimática, catalisando reações químicas; estrutural, permitindo a realização de movimentos; estrutural, como o próprio nome já diz, fornece estrutura, como a queratina, encontrada nos cabelos e unhas; proteínas transportadoras que é o caso da hemoglobina que transporta o oxigênio. 3. Aminoácidos de cadeias laterais apolares (promovem interações hidrofóbicas), polares (promovem pontes de hidrogênio e, no caso da cisteina, através do grupo SH também pode fazer pontes de hidrogênio), aminoácidos de cadeias laterais ácidas (doadores de prótons) e aminoácidos de cadeia lateral básica (receptores de prótons). 4. As pontes dissulfetos contribuem para a estabilidade da conformação tridimensional da molécula proteica e evita que elas se tornem desnaturadas no meio extracelular; as interações hidrofóbicas, as cadeias laterais apolares dos aminoácidos tendem a agrupar se no interior da proteína; as pontes de hidrogênio; as interações iônicas. 6. Estrutura primária: sequência de aminoácidos existente na molécula, a nível mais simples. Pode variar em números de aminoácidos, sequência e natureza dos aminoácidos. Estrutura secundária: refere-se ao arranjo espacial de radicais de aminoácidos que estejam perto um do outro na sequência linear (estrutura primária). Ex: alfa hélice. Estrutura terciária: resulta de dobras na estrutura da proteína estabilizadas por interações entre os radicais dos aminoácidos. Ex: mioglobina. Estrutura quartenária: associação de duas ou mais cadeias polipeptídicas em uma só proteína. Ex: hemoglobina. 7. Desnaturação proteica é quando a proteína perde sua forma tridimensional, ou seja, a forma em que ela desempenha corretamente suas funções. As proteínas podem perder a sua estrutura se postas em condições químicas adversas, como: mudanças de PH, mudanças de temperatura, solventes orgânicos, detergentes, ureia. 8. São denominas dessa maneira devido depender da posição do agrupamento amino, ou seja, se o agrupamento amino estiver na esquerda, ele recebe o nome de alfa L ou, se estiver na direita, ele vai se chamar alfa D aminoácido. Todavia, a ocorrência de alfa L aminoácidos é bem mais frequente. 9. Possuem curva de titulação parecida com a da glicina. Em ph muito baixo, a espécie iônica predominante da glicina é a sua forma totalmente protonada. No ponto médio do primeiro estágio da titulação, estão presentes concentrações equimolares da forma doadora de prótons e da forma receptora de prótons. No ponto médio de qualquer titulação, um ponto de inflexão é atingido, no qual o pH é igual ao pK do grupo protonado que está sendo titulado. 10. A ligação peptídica é a união de aminoácidos para formar peptídeos, sendo unidos covalentemente. Essa união é sempre entre a carboxila de uma unidade e a amina da unidade vizinha. 11. As proteínas fibrosas apresentam propriedades responsáveis pela força e flexibilidade das estruturas onde ocorrem, como é o caso da queratina e do colágeno. As proteínas globulares formam estruturas com formato esférico. Nesse grupo, são encontradas importantes proteínas, tais como as enzimas e anticorpos. 12. Em caso de deficiência de vitamina C as fibras do colágeno não podem estabelecer ligações cruzadas, diminuindo enormemente a resistência à tensão nas fibras reunidas.