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Biologia Molecular Profª. Alice Ornelas @ornelas_alicem Aula 5 e 6. SÍNTESE PROTEICA ✓ TRANSCRIÇÃO ✓ PROCESSAMENTO DO RNAm: cap (5’), splicing e cauda poli A (3’) ✓ TRADUÇÃO Dogma Central da Biologia Genética AULA 5: REPLICAÇÃO E TRANSCRIÇÃO GÊNICAS GENE: É um segmento do DNA que possui a informação para a produção de uma ou mais proteínas. Proteínas são sintetizadas em duas etapas: • transcrição, onde o gene serve como molde para a síntese de RNA. • tradução, onde a sequência de nucleotídeos do RNAm é traduzida em proteína. Importância do Gene para a síntese proteica Genética AULA 5: REPLICAÇÃO E TRANSCRIÇÃO GÊNICAS • Região Codificadora formada de : • sequências codificantes (ÉXONS) e • sequências não codificantes (ÍNTRONS). • Sequências nucleotídicas adjacentes que sinalizam o “início” e “fim” de transcrição de um gene. • Na extremidade 5’ está a região promotora, que é onde a transcrição tem início. • Na extremidade 3’ está a região de término da transcrição. Região de término Estrutura do GENE Transcrição ❖ É o mecanismo de produção de um RNA, a partir de um molde de DNA. ❖ Diferenças com a replicação: ❖ Somente uma das fitas de DNA é usada como molde; ❖ Não existe a necessidade de um primer (iniciador) para a adição do 1º ribonucleotídeo. ❖ Semelhanças com a replicação: ❖ Ocorre na orientação 5’ → 3’. ❖Assim a molécula produzida é complementar à fita molde de DNA (troca de T →U) ❖ A fita de DNA usada como molde é a 3’ → 5’ Transcrição ❖ É o mecanismo de produção de um RNA, a partir de um molde de DNA. Transcrição ❖ Envolve 3 etapas: ▪ Iniciação ▪ Alongamento ▪ Término Transcrição em Procariotos ▪ Iniciação: ▪ RNA polimerase de E. coli é uma enzima multimérica: formada por várias subunidades: 2 α, β, β’ e σ (sigma). • ligação da RNA pol ao promotor • abertura do DNA molde • formação das ligações fosfodiéster entre os primeiros 8 nucleotídeos. que reconhece o promotor RNA pol abre a dupla fita de DNA Iniciação da transcrição passo a passo Iniciação da transcrição passo a passo → Iniciando o alongamento Alongamento ❖ O desligamento do fator σ faz com que a RNA pol sintetize o RNA muito rapidamente; ❖ A RNA pol é capaz de desenrolar o DNA molde e romper as ligações de hidrogênio, abrindo as fitas e, também, é capaz de restaurar o pareamento de bases do DNA, logo em seguida. ❖ A síntese do RNA termina quando a RNA pol atingir a região de término no DNA molde. Término ❖ A região de término no DNA propicia a formação de uma estrutura que favorece o rompimento do complexo: RNApol/DNA/RNA. ❖ Dois tipos de término em E.coli: ▪ dependente de rho: Uma proteína que se liga ao complexo no sítio de término e libera o RNA recém sintetizado. ▪ independente de rho: ocorre a formação de um grampo (hairpin) Transcrição em Procariotos ❖ A transcrição e Tradução ocorrem SIMULTANEAMENTE; ❖ Não ocorre Processamento do RNAm. ❖ Ocorre no citoplasma (Procariotos não possuem núcleo). Transcrição em Eucariotos ❖ Ocorre no núcleo; ❖ O RNAm recém sintetizado é chamado de transcrito primário (pré RNAm) e somente após sofrer o Processamento, torna-se RNAm maduro. ❖ O RNAm processado vai para o citoplasma onde ocorrerá a tradução. Iniciação ❖ Existem 3 RNA polimerases (10 ou + subunidades) ▪ RNA pol I: sintetiza todos os RNAr, com exceção do RNAr 5S ▪RNA pol II: sintetiza o RNAm ▪RnA pol III: sintetiza os RNAt, o RNAr 5S e pequenos RNAs nucleares (snRNA). ❖ As RNA polimerases de eucariotos precisam de fatores de transcrição, os quais reconhecem o promotor e se ligam a ele, possibilitando a ligação da Rna pol. Transcrição em Eucariotos ❖Fatores de ligação necessários para o funcionamento da RNA pol II Transcrição em Eucariotos Região promotora TFIIF ajuda a levar a RNA pol II até região promotora Possui função helicase, permitindo a abertura da dupla fita de DNA; fosforila a RNA pol II o que permite o início da transcrição Síntese de 60-70 nucleotídeos iniciais Alongamento e Término ❖ O TFIIF fica associado à RNA pol II durante todo o alongamento;] ❖ A atividade da RNA pol II aumenta após ligação dos fatores de alongamento; ❖ Ao término da síntese do RNAm, a RNA pol II é defosforilada e reciclada, podendo ser reutilizada para sintetizar outra RNAm. Processamento do RNAm Consiste em 3 etapas: ▪ Capeamento da extremidade 5’ do RNAm ▪ Splicing ▪ Poliadenilação da extremidade 3’ do RNAm Capeamento do RNAm ❖ Enquanto a cadeia de RNAm está sendo alongada (30 nucleotídeos), a extremidade 5’ é modificada pela adição de uma guanosina metilada (cap) Poliadenilação do RNAm ❖ A RNA pol II transcreve um segmento de DNA bem maior que o necessário para produzir o RNAm. ❖poli A polimerase após reconhecer uma sequência AAUAAA, adiciona uma cauda poliA, formada por cerca de 200 Adenosina, na extremidade 3’. AAAAAA... Splicing do RNAm ❖ É o processo de remoção dos Íntrons e união dos Éxons. Splicing Splicing do RNAm ❖ É necessário ribonucleoproteínas, as quais reconhecem sequências específicas do RNAm e retiram o íntron na forma de uma alça. ❖ Ribonucleoproteínas são associações de snRNAs (RNA nucleares pequenos) com proteínas. ❖ As ribonucleoproteínas U1, U2, U3, U4, U5 e U6 se ligam ao íntron formando uma alça. Essa estrutura é chamada de spliceossomo Splicing alternativo ❖ É a utilização de diferentes éxons de um pré RNAm para formar RNAm maduros diferentes; ❖Estima-se que 5% dos pré RNAm de eucariotos realizam splicing alternativo. Splicing alternativo ❖Exemplo: gene que codifina a tropomiosina, um único pré RNAm é capaz de formar 7 tipos de RNAs mensageiros. Ainda não se sabe como quais éxons são escolhidos! TRADUÇÃO DO RNA Transcrição Tradução Replicação DNA Proteínas O CÓDIGO GENÉTICO 4 nucleotídeos 20 aminoácidos O CÓDIGO GENÉTICO 64 códons: ➢61 códons → Traduzidos em AAs ➢3 stop códons → NÃO SÃO TRADUZIDOS: UAG UGA UAA ➢1 códon de iniciação: AUG Códon: Tríade de nucleotídeos encontrados no RNAm O CÓDIGO GENÉTICO As 3 características do Código Genético: • Universal: os códons têm o mesmo significado em quase todos os organismos. Assim, o códon AAU codifica o aminoácido Asparagina (Asn) tanto em um ser humano como em um Streptococcus. •Degenerado: Significa que um mesmo aminoácido pode ser codificado por diferentes códons. Mas lembre-se o OPOSTO NÃO é VERDADE: Um CÓDON NÃO pode codificar mais de um AA. O CÓDIGO GENÉTICO As 3 características do Código Genético: • Não-superposto: A leitura dos códons não se sobrepõe. Não- Superposto Superposto Tradução (Síntese Proteica) ❖ 3 RNAs são necessários para efetuar a síntese protéica: • RNAm maduro: carrega a “informação”(ou seja, os códons) para a síntese da proteína. • RNAr (RNA ribossômico): é um constituinte estrutural e funcional dos ribossomos, aonde a síntese proteica vai acontecer • RNAt (RNA transportador): carrega os aminoácidos que serão adicionados a proteína nascente, e faz a “leitura”da sequência de bases do RNAm. Isso quer dizer que o RNAt é a molecula que decodifica o código genético. Os ribossomos • Constituídos por 65% rRNA e 35 % proteínas ribossomais. • Alguns ribossomos estão livres no citosol, mas a maioria está ligada a membrana externa de algumas regiões do retículo endoplasmático, que passa a ser chamado de RER. • Todos os ribossomos são constituídos por duas subunidades: Os ribossomos • A unidade de medida dos ribossomos é o Svedberg(S), que mede a velocidade de sedimentação em um centrifugacão. • Procariotos tem ribossomos 70S, contituídos de uma unidade 30S (16S RNAr e 21 proteínas) e outra 50S (5S RNAr, 23S RNAr e 34 proteínas). • Eucariotos tem ribossomos 80S, constituídos de uma unidade 40S (18S RNAr e 33 proteínas) e uma 60S (5S RNAr, 28S RNAr, 5,8S RNAr e ~49 proteínas). SÍNTESE DE PROTEÍNAS OCORRE NOS RIBOSSOMOS PROCARIOTOS EUCARIOTOS RNAt (reconhece os códons do RNA e carrega os aminoácidos)O reconhecimento dos códons se dá pelo anticódon (trinca de nucleotídeos complementares aos códons presentes no RNAm) SÍNTESE DE PROTEÍNAS 1) Ativação dos AAs: formação do aminoacil-RNAt 2. Iniciação: ligação da subunidade menor do ribossomo e da metionina-tRNA no códon AUG • Em procariotos: O 1º AA é uma metionina formilada: formilmetionina • Em eucariotos: O 1º AA é uma metionina não formilada: metionina • Além disso, seqüências específicas de nucleotídeos no RNAm ajudam o complexo de iniciação a identificar o códon AUG iniciador: •Em procariotos: seqüências Shine-Dalgarno •Em eucariotos: seqüências Kozac *R = purina (A ou G) Procariotos e Eucariotos INICIAÇÃO A subunidade menor ribossômica juntamente com os fatores de iniciação (IFs) e o Met-RNAt se ligam ao RNAm e iniciam a varredura pelo códon de iniciação (AUG). Após encontrar o AUG inicial , os fatores de iniciação saem e a subunidade maior se liga à menor formando o ribossomo. Procariotos e Eucariotos Sítios Ativos do Ribossomo AminoacilExit Peptidil Sítio ASítio PSítio E Procariotos e Eucariotos Ribossomo caminha no sentido 5’ 3’ INICIAÇÃO Procariotos: Formil-metionina Tradução simultânea à transcrição Eucariotos: Metionina Tradução após o processamento do RNAm Procariotos e Eucariotos RNAt Met fica posicionado no sítio P quando o ribossomo se fecha; Sítio A livre para novo aminoacil RNAt que pareia com 2º códon; Aminoacil RNAt são acompanhados de Fatores de alongamento +GTP. Se o pareamento está correto cliva GTP em GDP e o fator é liberado; Ligação Peptídica entre os 2 aas promovida pela peptidil transferase; Transferência da Met para o aminoacil RNAt do sítio A e o RNAt do sítio P fica descarregado ; Ribossomo move-se 1 códon no sentido 5’ 3’ com participação de Fatores de alongamento + GTP e desloca o RNAt vazio para o sítio E e o RNAt com os AAs ligados para o sítio P; Sítio A livre para próximo aminoacil RNAt. 3) Alongamento Procariotos e Eucariotos 1 2 3 4 5 A E E Processo continua até aparecer o códon de terminação no sítio A. 1. Códons de terminação são reconhecidos por Fatores de liberação (RF) no sítio A. 2. A ausência de tRNA no sítio A promove a dissociação das duas subunidades do ribossomo 3. Liberação da proteína 4. Término da tradução Procariotos e Eucariotos * “Release Factor” = Fator de Liberação 6 7 8 9 10 4) Término Expressão da Informação genética contida no DNA ocorre em 2 etapas Núcleo Núcleo/Citoplasma Citoplasma RESUMO DA AULA
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