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Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 DO DNA ▸ ocorre durante a fase S nos eucariontes (nos procariontes ocorre a todo momento). ▸ os dois filamentos complementares da dupla hélice se desenrolam e se separam. Cada filamento guia a síntese de um novo filamento complementar. ▸ a replicação é semiconservativa (conserva metade da molécula parental) e bidirecional. ▸ precisa ocorrer de forma rápida e correta. ▸ a sequência de bases do filamento parental é usado como molde. ▸ os cromossomos eucariotos tem múltiplas origens de replicação, além de usarem 2 ou mais polimerases e muitas enzimas. ▸ processo composto por 3 fases: iniciação, alongamento e terminação. Origem de replicação ▸ cada origem de replicação controla o processo de uma unidade de DNA chamada réplicon. ▸ nos vírus e bactérias/procariontes há apenas um ponto (um único réplicon). ▸ os eucariotos possuem muitos réplicons/origens. Possui vias de origem com sequências específicas (geralmente nas ligação A-T) ▸ forma-se a bolha de replicação nas ligações A-T e a estrutura em formato de Y que inicia a bolha é a forquilha de replicação . Desenrolamento da fita ▸ para desenrolar os filamentos de DNA parental é preciso uma DNA topoisomerase e uma DNA helicase . ▸ os filamentos desenrolados são mantidos nesse estado por conta de uma proteína de ligação chamada proteína de replicação A (RpA) Extensão - síntese da nova fita ▸ a enzima DNA polimerase só funciona no sentido 5’ ➝ 3’ e precisa de um OH livre para ficar ativa. 0 3 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 ▸ a síntese de filamentos ocorre em torno da forquilha de replicação. - fita líder (leading strand): é contínua, adicionando nucleotídeos no sentido 5’ ➝ 3’ - fita atrasada (laggind strand): é fracionada (descontínua), no sentido 3’ ➝ 5’ ↳ presença de fragmentos de Okazaki (pedaços de DNA feitos pela polimerase usando o primer de RNA como base) Replissomo: estrutura no momento onde todos os processos estão acontecendo. DNA/RNA primase: produzem primers de RNA no terminal/início 3’OH’ para iniciar a síntese da fita atrasada. Ribonucleases: fazem a remoção dos primers de RNA, deixando cortes na fita. DNA ligase: fecham os cortes por meio de ligações covalentes, deixando ambas as fitas contínuas.(junto com a DNA polimerase) Proteínas/enzimas envolvidas no processo: 0 4 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 ▸ transforma o código genético em mRNA que depois será transformado em proteína. ▸ um filamento de DNA em um gene é usado como molde para sintetizar um filamento complementar de RNA chamado transcrito gênico . ▸ código genético : especificação de aminoácidos por trinucleotídeos ➝ códons ▸ mRNA são moléculas de RNA, sintetizadas a partir do molde de DNA e traduzidas em ribossomos. ↳ nos procariotos o transcrito primário geralmente equivale a molécula de mRNA ↳ nos eucariotos é preciso processar os transcritos primários por excisão de sequências específicas e modificar as terminações antes de traduzir. ● transcritos primários ➝ precursores de mRNA ➝ pré-mRNA ● a maioria dos genes tem sequência não codificadoras, os íntrons, que separam as sequências expressas, os éxons ● As sequências completas desses genes interrompidos são transcritas em pré mRNA. ● as sequências de íntrons não codificadoras são removidas por reações de recomposição (splicing). * Splicing : retirada dos íntrons pelos espliceossomos. TIPOS DE RNA: ▸ é preciso que mensageiros transportem as informações genéticas do núcleo para o citoplasma. SÍNTESE DE RNA ▸ muito semelhante com a síntese de DNA, mas com algumas diferenças: ↳ os precursores são trifosfato de ribonucleosídeos. ↳ só um filamento de DNA é usado como molde para a síntese da cadeia de RNA complementar de uma região. ↳ é possivel iniciar novas cadeias de RNA sem a presença de um filamento iniciador preexistente (primer). ▸ a molécula de RNA produzida será complementar e antiparalela ao filamento molde de DNA e quase idêntica ao filamento não molde de DNA (exceto por ser Uracila e não Timina). Filamento sense de RNA ▸ as sequência de nucleotídeos “fazem sentido”, especificam sequências de aminoácidos das proteínas. ▸ uma molécula de RNA complementar a uma mRNA é chamada de RNA antisense . 0 5 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 1. as RNA polimerases ligam-se nas sequências nucleotídicas específicas chamadas promotores . 2. com a ajuda de proteínas chamadas fatores de transcrição , iniciam a síntese de moléculas de RNA nos locais de início da transcrição perto dos promotores. ▸ os procariontes tem apenas uma RNA polimerase. ▸ os eucariontes tem 5 tipos de RNA polimerases diferentes (cada uma responsável pela síntese de uma classe de RNA) ▸ a sequência de RNA ocorre em um segmento desenrolado de DNA, na bolha de transcrição. Regiões upstream e downstream ▸ upstream : região próxima à extremidade 5’ de determinado gene. ▸ downstream : região próxima à extremidade 3’ - final RNA polimerase nos procariotos ▸ cerne da enzima possui 2 polipeptídeos, um β e um β’. ▸ adição do fator sigma (σ) permite a iniciação nos sítios promotores, formando a holoenzima. Transcrição em procariotos: processo dividido em três estágios: a) iniciação: seleção do local de início, sendo próximo aos promotores e aparecimento da bolha de transcrição. ▸ a iniciação da cadeia ocorre em 3 etapas: 1) formação da holoenzima RNA polimerase a uma região promotora no DNA. 2) desenrolamento nos primeiros filamentos de DNA pela RNA polimerase. 3) formação de ligações fosfodiéster entre os 1° s ribonucleotídeos na cadeia de RNA nascente. ▸ depois da adição de 8/9 nucleotídeos de mRNA, o fator sigma se desliga e o cerne da enzima continuatrabalhando no alongamento. b) alongamento : começa com um pequeno início da construção da fita de RNA, alongando e aumentando a fita. O cerne da enzima vai passando e adicionando nucleotídeos. c) término: ocorre quando a RNA polimerase encontra um sinal de término, então o complexo de transcrição se dissocia e libera a molécula de RNA nascente. ▸ pode ocorrer de duas formas (uma ou outra): ↳ terminadores rho-independentes: sem a presença da proteína rho, onde as regiões transcritas produzem estruturas em grampo ricas em A e U no final da estrutura. ↳ terminadores rho-dependentes : com a presença da proteína rho em um processo parecido com o independente, com formação de um grampo de ligações de hidrogênio. A proteína rho se liga a sequência rut e se move 5’➝3’, reconhece o sítio final de ligação, cliva as ligações 0 6 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 do filamento molde de DNA com a fita de mRNA, liberando o transcrito de mRNA. ▸ nos procariotos, a tradução e a degradação de uma molécula de mRNA geralmente começam antes da conclusão da sua síntese (transcrição). ▸ os 3 processos ocorrem simultaneamente na mesma molécula de RNA pois não possuem envoltório nuclear. Sequências numeradas ▸ essa numeração é útil na hora de encontrar nucleotídeos específicos. ▸ sequência de consenso : essas sequências são conservadas, ou seja, independente do organismo (com exceções), esses números são iguais. * as sequências que antecedem o local de iniciação, levam um prefixo negativo (- número) como por exemplo a sequência - 10. * as sequências que sucedem o local de iniciação, levam um prefixo positivo (+ número). Transcrição em eucariontes : processo mais complexo. ▸ o RNA é sintetizado no núcleo e a maior parte do RNA que codifica proteínas tem de ser transportada até o citoplasma para tradução nos ribossomos. ▸ muitos dos transcritos eucarióticos são específicos, ou seja, contém a região codificadora de um único gene (monogênica) ▸ porém, mRNA eucarióticos podem ser monogênicos ou multigênicos. transcrito primário = mRNA (maturação) ▸ a maioria dos transcritos primários passam por 3 importantes modificações antes de irem para o citoplasma: 1. adição de caps de 7-metilguanosina na extremidade 5’. 2. adição de caudas poli(A) no 3’. 3. excitação das sequências de íntrons. * as modificações 1 e 2 servem para proteger o mRNA da degradação durante o processo. CINCO RNA POLIMERASES: Iniciação ▸ para começar a transcrição é preciso da ajuda de fatores de transcrição proteico que se ligam a região promotora no DNA, formando o complexo de iniciação, então o RNA polimerase se liga e inicia o processo. ▸ a iniciação da transcrição acarreta no desenrolamento de uma parte de DNA, com a interação de vários fatores de transcrição. Alongamento: construção da fita igual a dos procariotos. Término ▸ ocorre por meio da clivagem da cadeia e acréscimo das caudas poli(A)3’. ▸ a extremidade 3’ dos transcritos de RNA são produzidas por clivagem endonucleolítica dos transcritos primários. ▸ depois da clivagem, a enzima polimerase poli(A) acrescenta caudas poli(A) às extremidades 3' dos transcritos. ▸ os íntrons de hnRNA são removidos pelos espliceossomos no processo de splicing. 0 7 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 ▸ acontece dentro do citoplasma (sai do núcleo). ▸ proteínas ➝ polipeptídeos ➝ codificados por um gene ▸ a tradução ocorrre nos ribossomos ▸ a sequência de nucleotídeos no transcrito de RNA é convertida na sequência de aminoácidos ➝ produto gênico polipeptídico Estrutura das proteínas ↳ macromoléculas complexas compostas por 20 aminoácidos diferentes - identificados por códon específicos. ↳ a estrutura primária é especificada pela sequência nucleotídica de um gene, sendo a estrutura que vai ser inicialmente traduzida. ▸ cada aminoácido em um polipeptídeo é especificado por 3 nucleotídeos. Start codon: AUG Stop codon: UAA, UAG ▸ um códon se liga a um anticódon. “Atores” principais da síntese de polipeptídeo s ▸ mRNA ▸ ribossomo ▸ tRNA ▸ o processo é complexo e exige participação de várias macromoléculas: ▸ participam da tradução 3 tipos de RNA, sendo todos transcritos de moldes de DNA ↳ mRNA, rRNA e tRNA ▸ Os aminoácidos são anexados às moléculas corretas de tRNA pelas aminoacil ‐tRNA sintetases, um grupo de enzimas ativadoras. ▸ os ribossomos são inespecíficos, podem sintetizar qualquer polipeptídeo (qualquer sequência de aminoácidos) codificado por um mRNA específico, até mesmo pelo mRNA de outra espécie. ▸ cada mRNA é traduzido por vários ribossomos simultaneamente, formando um polirribossomo ou polissomo. ▸ nos procariontes, os ribossomos estão distribuídos por toda a célula e nos eucariontes apenas no citoplasma (na malha de membranas intracelulares do retículo endoplasmático). tRNA ▸ “molécula adaptadora”, medeia a especificação de aminoácidos por códons no mRNA durante a síntese proteica. ▸ interações diretas (sem o tRNA) entre aminoác. e códons no mRNA são improváveis. 0 8 Resumo Genética - 3° semestre - 2021.1 04/03/2021 - 24/03/2021 ▸ contêm uma sequência de trinucleotídeos ‐ o anticódon ‐ que é complementar à sequência do códon no mRNA e emparelha suas bases com a sequência de códon durante a tradução. Cada ribossomo tem três sítios de ligação ao tRNA - conhecidos como sítios EPA ▸ sítio E: local de saída do tRNA ▸ sitio P: local de ligação ao peptidil-tRNA ▸ sítio A: local de ligação ao aminoacil-tRNA ▸ a síntese polipeptídica tem 3 processos: iniciação, alongamento e finalização. 0 9
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