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Tecnologia do DNA recombinante BIOLOGIA MOLECULAR 1. DNA recombinante 2. Enzimas de restrição 3. Vetores de clonagem - Plasmídios - Bacteriófagos - Cosmídeos 4. Etapas de clonagem molecular 5. Aplicações Conteúdo HISTÓRICO Watson & Crick Estrutura do química do DNA (1953) Nature, 25 - Abr - 1953 Tecnologia DNA recombinante Insulina recombinante (1978) Ian Wilmut clonagem de mamífero (1997) HISTÓRICO Prática clínica Testes genéticos (1995...) PGH Conhecer genoma H. sapiens (1995-2003) Transgenia (1995...) O que é um DNA recombinante? - É uma molécula de DNA formada pela ligação de duas moléculas de origens diferentes (Ex. DNA de planta ligado a um plasmídio) “A engenharia genética atua no nível molecular, onde as diferenças entre espécies desaparecem” ENZIMAS DE RESTRIÇÃO ENZIMAS DE RESTRIÇÃO W. Alber H. Smith D. Nathans • Uma enzima de restrição ou endonuclease de restrição é um tipo de nuclease que cliva fita dupla de DNA sempre que identificar uma seqüência particular de nucleotídios que seja o sítio de restrição da enzima; Descritas em 1970, ENZIMAS DE RESTRIÇÃO Função Natural: proteger o DNA bacteriano do DNA exógeno A enzima BamHI reconhece a seqüência dupla fita: ENZIMAS DE RESTRIÇÃO - reconhecem seqüências específicas de nucleotídeos no DNA, atuando como verdadeiras tesouras moleculares BamHI • BamHI - Bacillus amyloliquefaciens H 5’ G/GATCC 3’ • EcoRI - Escherichia coli R 5’ G/AATTC 3’ • HaeIII - Haemophilus aegyptius 5’ GG/CC 3’ • PstI - Providencia stuartii 5’ CTGCA/G 3’ ENZIMAS DE RESTRIÇÃO Nomenclatura 370 C, 1 hora, com tampão adequado ENZIMAS DE RESTRIÇÃO EcoRI ENZIMAS DE RESTRIÇÃO Tipos de cortes: - Produção de terminais coesivos (adesivos, protuberantes) - Produção de terminais abruptos (ou cegos) NarI ~~~~~~ 181 ACCATATGCG GTGTGAAATA CCGCACAGAT GCGTAAGGAG AAAATACCGC ATCAGGCGCC TGGTATACGC CACACTTTAT GGCGTGTCTA CGCATTCCTC TTTTATGGCG TAGTCCGCGG 241 ATTCGCCATT CAGGCTGCGC AACTGTTGGG AAGGGCGATC GGTGCGGGCC TCTTCGCTAT TAAGCGGTAA GTCCGACGCG TTGACAACCC TTCCCGCTAG CCACGCCCGG AGAAGCGATA 301 TACGCCAGCT GGCGAAAGGG GGATGTGCTG CAAGGCGATT AAGTTGGGTA ACGCCAGGGT ATGCGGTCGA CCGCTTTCCC CCTACACGAC GTTCCGCTAA TTCAACCCAT TGCGGTCCCA HindIII PstI ~~~~~~~ ~~~~~~ 361 TTTCCCAGTC ACGACGTTGT AAAACGACGG CCAGTGCCAA GCTTGCATGC CTGCAGGTCG AAAGGGTCAG TGCTGCAACA TTTTGCTGCC GGTCACGGTT CGAACGTACG GACGTCCAGC XbaI BamHI KpnI EcoRI ~~~~~~~~~~~~~ ~~~~~~~ ~~~~~~~ 421 ACTCTAGAGG ATCCCCGGGT ACCGAGCTCG AATTCGTAAT CATGGTCATA GCTGTTTCCT TGAGATCTCC TAGGGGCCCA TGGCTCGAGC TTAAGCATTA GTACCAGTAT CGACAAAGGA ENZIMAS DE RESTRIÇÃO TIPOS DE VETORES TIPOS DE VETORES Vetores Hospedeiros Plasmídeos Cosmídeos Bactérias / leveduras clonagem Bacteriófagos Utilização • Plasmídios são moléculas de DNA circular, fita dupla, extracromossomais, que ocorrem naturalmente em bactérias e algumas leveduras – pUC18 – pBR322 – pUP310 Ob.: Utilizados para clonar fragmentos de até 9 kb VETORES PLASMIDIAIS VETORES PLASMIDIAIS pUS974 4039 pb rCanamicina MT19 oriM hsp60 RBS oriE HindIII XbaI Vetor de Expressão em Procarioto pTarget 5670 bp rNeomicina rAmpicilina Intron Poly A Promotor CMV BamHI (1257) EcoRI (1251) EcoRI (1319) HindIII (1326) VETORES PLASMIDIAIS Vetor de Expressão em Eucariotos pUS973 3984 bp rCanamicina oriM Promotor hsp60 RBS oriE HindIII XbaI Vacina Vetorizada (rBCG) pUS974 4039 pb rCanamicina MT19 oriM hsp60 RBS oriE HindIII XbaI pUS977 3984 bp rCanamicina oriM Promotor pAN RBS oriE HindIII XbaI pUS20003759pb Kan(R) OriM p18kDa oriC XbaI HindIII Vetor de Expressão em Eucariotos VETORES PLASMIDIAIS - Vírus que infectam bactérias; - Utilizados para clonar fragmentos de 9kb a 25 kb BACTERIÓFAGO BACTERIÓFAGO Ciclo Lítico Ciclo Lisogênico - São híbridos entre plasmídios e bacteriófagos; - Utilizados para clonar fragmentos de 25 a 35 kb; COSMÍDEOS Características essenciais • Replicação autônoma • Marcador de seleção (antibiótico) • Sítio único de clonagem VETORES DE CLONAGEM • Necessitam de um promotor forte, de um RBS e de ATG • Promotores induzíveis • Sinais de secreção • Fusão com proteínas carreadoras VETORES DE EXPRESSÃO CLONAGEM MOLECULAR • É o isolamento e a propagação em um organismo de moléculas idênticas de DNA CLONAGEM MOLECULAR CONSTRUÇÃO DE UM MICRORGANISMO RECOMBINANTE 1. Obtenção do DNA a ser clonado 2. Preparação do vetor 3. Ligação do vetor com o “inserto” 4. Transformação da bactéria 5. Seleção dos clones recombinantes - Extração de DNA; - PCR - Digestão - Purificação 1.Obtenção do DNA a ser clonado 1.Obtenção do DNA a ser clonado 94 0C por 5 min 94 0C por 1 min 55 0C por 1 min 72 0C por 1 min 72 0C por 5 min 4 0C 35 ciclos PCR Eletroforese em gel de agarose Visualização do DNA em luz ultravioleta • Digestão • Purificação 3.Preparação do vetor Plasmídeo Circular Plasmídeo linear Digestão com Enzimas de restrição Extremidades coesivas Fragmento de DNA - inserto DNA plasmidial - vetor LIGASE 4. Ligação 5.Transformação da bactéria 5.Transformação da bactéria 5.Transformação da bactéria EL ET R O P O R A Ç Ã O 6.Seleção dos clones recombinantes Construção do DNA Recombinante Molécula de DNA de um plasmídeo circular Clivagem com enzima de restrição Molécula de DNA de um plasmídeo linear com extremidades coesivas anelamento Ligação covalente pela DNA ligase Molécula de DNA plasmidial contendo o inserto Inserção em uma célula hospedeira Extração de DNA de L. interrogans Leptospira interrogans meio EMJH Extração de DNA PCR 94ºC – 5 min 94ºC – 1 min 50ºC – 1 min 72ºC – 1 min 72ºC – 7 min 30 ciclos lipL32 768 pb Primer RPrimer F PCR Clonagem em Vetores de expressão Transformação E. coli Seleção dos Clones recombinantes 768 pb Triagem Digestão Construção dos Vetores lipL32 768 pb Extração Expressão de Proteínas Recombinantes Purificação da Proteína Cultura de Células Transformação da E. coli pAE 2831 bp rAmpicilina 6X His f1 ori oriE Promotor T7 BamHI (137) HindIII (178) XbaI (59) Purificação de proteínas recombinantes Ligação Transformação por Eletroporação E. Coli DH5 Extração de DNA plasmidial pLysS codon pluss SI DE3 Transformação por Choque Térmico Cepas de E. coli para expressão de proteínas pAE/LipL32 3547 bp AmpR LipL32 6x His f1 ori pUC ori pT7 Bam H I (468) Eco R I (887) Hin d III (894) Xba I (59) Xho I (131) E. coli (BL21) SDS-PAGE SDS-PAGE (Eletroforese de proteínas) Expressão em diferentes cepas de E.coli Expressão de Proteínas Recombinantes 1 2 3 4 30kDa 1. BENCHMARKTM Protein Ladder em kDa 2, 3 e 4. LipL32 purificada (eluições). Gel de poliacrilamida 15%. Purificação de Proteínas Recombinantes Akta Prime APLICAÇÕES VACINAS RECOMBINANTES 1. PCR 2. Clonagens 3. Multiplicação Proteína Recombinante 4. Vacinação lipL32 7 68 bp LipL32 0906 Primer RPRIMER F Bam HI (342) Hin dIII (7 61 )Xba I (4) Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial L. interrogans pAE Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidial Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al Vetor Plasmidi al pTARGET pUS973 pUS974 pUS977 E.coli (BL21) E.coli TOP10 E.coli TOP10 Vacina de DNA BCGr lipL32 ANIMAIS TRANSGÊNICOS PLANTAS TRANSGÊNICAS
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