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Aula 2: Replicação do DNA Curso BQM101 Bioquímica - Farmácia Adriana S. Hemerly-IBqM - UFRJ Funções do DNA: Herança genética Informação genética (expressão de genes) DNA RNA Proteína Replicação Transcrição Tradução Transcrição Reversa Relembrando... DNA RNA Proteína Replicação Transcrição Tradução Transcrição Reversa DNA: possui a informação genética e que precisa ser transmitida fielmente para as células-filhas Herança genética Dogma Central da Biologia Molecular DNA: possui a informação que precisa ser transmitida fielmente para as células-filhas E como essa informação é passada de célula a célula, durante a multiplicação das células? Ciclo Celular : sequência ordenada de eventos que levam à duplicação do DNA e divisão da célula “A função primordial do ciclo celular é garantir que o DNA replique corretamente (fase S) e que seja distribuído igualmente entre as células filhas (fase M)” Nós somos diplóides – 2n – dois cromossomos 2n 2n2n 4n n= 23 cromossomos (haplóide) 2n= 2 vezes 23 cromossomos (diplóide) A aHerança materna Herança paterna Individuo diplóide Aa n= 23 cromossomos (haplóide) 2n= 2 vezes 23 cromossomos (diplóide) Nós somos diplóides – 2n – dois cromossomos Estrutura do DNA: Relembrando... Replicação de DNA: fatos A replicação de DNA é semiconservativa: cada fita de DNA é usada como molde para a replicação de uma fita complementar de DNA Síntese do DNA: ligação fosfodiéster Direção de síntese: 5’ para 3’ DNA polimerase cataliza a adição sucessiva de deoxiribonucleotídeos 5’ trifosfato DNA polimerase cataliza a síntese a partir de um molde Precisam de primer com um grupo 3’ OH livre. No DNA genômico este primer é feito de RNA. Especificidade da seleção de bases complementares: Antes: checa se a base a ser adicionada é complementar, atividade de síntese 5’- 3’ Depois: Remove base adicionada que não seja complementar, atividade exonucleásica 3’ –5’ Diferentes Enzimas: diferentes atividades Em E.coli: DNA POL I, elongação 5’ – 3’, exonuclease 3’ – 5’, exonuclease 5’- 3’ síntese/reparo DNA POL II, elongação 5’ – 3’, exonuclease 3’ – 5’ reparo DNA POL III, elongação 5’ – 3’, exonuclease 3’ – 5’ síntese: replicação Em E. coli: 1 erro/109 a 1010 nucleotídeos, esperado 1 erro/104 a 105 Polimerases virais frequentemente não possuem atividade de exonuclease (editoração ou “proofreading”) Mecanismo de replicação de DNA: Enzima Função Atividade 3’- 5’ exonuclease Fidelidade Procariotos Pol I Reparo de DNA e remoção do RNA iniciador Sim Alta Pol II Reparo de DNA Sim Moderada Pol III Replicação Não Alta Pol IV Reparo de DNA; síntese translesão Não ? Pol V síntese translesão Não ? Eucariotos Pol α Síntese de iniciador de RNA Não Média Pol β Reparo de DNA Sim Baixa Pol γ Replicação e reparo de DNA mitocondrial Sim Alta Pol δ Síntese da fita descontínua do DNA e reparo de DNA Sim Alta Pol ε Síntese da fita contínua e reparo de DNA Sim Alta Pol ζ Síntese translesão Sim ? Pol η Síntese translesão Não ? Pol θ Reparo de DNA Sim Pol ι Síntese translesão e hipermutação somática Não ? Pol κ Síntese translesão Não ? Pol λ Reparo de DNA Não ? Pol μ Hipermutação somática Não ? Rev1p Síntese translesão Sim ? Mecanismo de Replicação do DNA: As fitas de DNA parentais são completamente desenroladas antes que cada uma seja replicada? A replicação se inicia em locais aleatórios ou em um único ponto? Após a iniciação, a replicação segue em uma direção ou em ambas? Origens de replicação: Onde, quando e como começa a replicação do DNA - Origens de replicação: sítios específicos no DNA aonde se ligam proteínas iniciadoras que determinam o local e quando começa a síntese da nova fita de DNA. - Proteínas iniciadoras: ORC e complexo pré-replicativo (preRC) Replicação de DNA: início (pre-RC) DNA (origem de replicação) cdc6 MCM cdt1 Procariotos Eucariotos Replicon: unidade de replicação do DNA contendo uma origem de replicação (região fixa do DNA) onde se inicia a replicação. O inicio da replicação gera uma forquilha de replicação A replicação é bidirecional Replicação de DNA: início •Topoisomerase: corta transientemente o DNA, relaxando o DNA superhelicoidizado, e religa o DNA • Helicases: desenovelam pequenas regiões de DNA • DBP: se ligam à fita simples de DNA e estabilizam Forquilhas de replicação •Topoisomerase: corta transientemente o DNA, relaxando o DNA superhelicoidizado, e religa o DNA • Helicases: desenovelam pequenas regiões de DNA • DBP: se ligam à fita simples de DNA e estabilizam • Primase sintetiza primer de RNA (5’- 3’) • Fita 5’-3’ replicada continuamente Síntese do DNA 5’ •Topoisomerase: corta transientemente o DNA, relaxando o DNA superhelicoidizado, e religa o DNA • Helicases: desenovelam pequenas regiões de DNA • DBP: se ligam à fita simples de DNA e estabilizam • Primase sintetiza primer de RNA (5’- 3’) • Fita 5’-3’ replicada continuamente, fita 3’-5’ descontinuamente • DNA POL III, contínua; DNA POL I remove primers (exonuclease 5’-3’) • DNA Ligase cataliza as pontes fosfodiester restantes Síntese do DNA Procariotos Eucariotos Origens de replicação Ori C Não determinado Proteínas iniciadoras Pré-RC (DnaA, DnaB, DnaC) Pré-RC (ORC1-6, Cdc6, Cdt1, MCM2-7) Helicase DnaB MCM2-7 Topoisomerase Topoisomerase II Topoisomerase I e II Proteínas estabilizadoras de DNA fita simples SSB RP-A Síntese do iniciador de RNA Primase DNA pol a:primase DNA polimerase utilizada na elongação DNA pol III DNA pol d e DNA pol e Ligação dos Fragmentos de Okazaki DNA ligase DNA ligase Terminação da replicação Topoisomerase II Telomerase Quadro comparativo entre proteínas envolvidas na replicação de procariotos e eucariotos.
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