BIOINFORMÁTICA todos simulados

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BIOINFORMÁTICA
	
		Lupa
	 
	Calc.
	
	
	 
	 
	 
	 
	
	SDE4449_A1_202004064631_V1
	
	
	
	
		Aluno: KARINA RAFAEL DO NASCIMENTO
	Matr.: 202004064631
	Disc.: BIOINFORMÁTICA 
	2021.2 - F (G) / EX
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		 A seguir temos três afirmativas sobre as potencialidades da bioinformática. Julgue-as como verdadeiras ou falsas.
I) A análise de sequências possibilita comparar várias sequências de genes e determinar a relação evolutiva entra elas.
II) A análise de sequências permite encontrar genes em meio a longas sequências de DNA.
III) Com apenas a sequência do gene não é possível determinar sua através de métodos de bioinformática.
	
	
	
	As afirmativas I e II estão corretas.
	
	
	Apenas a afirmativa I está correta.
	
	
	Apenas a afirmativa II está correta.
	
	
	Todas as afirmativas estão corretas.
	
	
	Apenas a afirmativa III está correta.
	
Explicação:
Pode ser realizado um alinhamento usando a sequência do gene contra sequências presentes em um banco de dados para determinar sua função, por exemplo.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Os _______________________ guardam informações como sequências de nucleotídeos e aminoácidos, artigos científicos ou estrutura de proteínas. Além de organizar essas informações, eles permitem que elas sejam atualizadas, consultadas e recuperadas.
	
	
	
	Bancos de dados biológicos.
	
	
	Fragmentos de DNA
	
	
	Materiais genéticos
	
	
	DNA e RNA
	
	
	Indivíduos
	
Explicação:
Os chamados bancos de dados biológicos guardam informações como sequências de nucleotídeos e aminoácidos, artigos científicos ou estrutura de proteínas. Além de organizar essas informações, eles permitem que elas sejam atualizadas, consultadas e recuperadas.
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Sobre a bioinformática, qual das afirmativas abaixo está incorreta?
	
	
	
	O desenvolvimento de tecnologias para sequenciar o DNA foi um dos principais pilares para o surgimento da bioinformática.
	
	
	Um bioinformata não é capaz de desenvolver ferramentas computacionais que ajudam na interpretação de dados obtidos de experimentos na bancada, ele só utiliza essas ferramentas.
	
	
	A bioinformática usa ferramentas computacionais para estudar informações biológicas.
	
	
	Um bioinformata atua interpretando dados biológicos e desenvolvendo/aprimorando algoritmos computacionais.
	
	
	A bioinformática é considerada uma área interdisciplinar, que envolve profissionais de diferentes graduações.
	
Explicação:
O bioinformata pode sim desenvolver ferramentas computacionais.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Um profissional em bioinformática precisa ter conhecimento em qual das seguintes áreas abaixo?
	
	
	
	Matemática.
	
	
	Biologia molecular.
	
	
	Computação.
	
	
	Todas as alternativas anteriores.
	
	
	Estatística.
	
Explicação:
A bioinformática é uma área interdisciplinar.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		Qual dos cientistas a seguir teve grande contribuição para o avanço da bioinformática como área da ciência?
	
	
	
	Alexander Fleming, com a descoberta da penicilina.
	
	
	Charles Darwin, com a publicação do livro ¿A origem das espécies¿.
	
	
	Werner Karl Heisenberg, pela criação da mecânica quântica.
	
	
	Marie Curie, pela sua pesquisa sobre dois novos elementos químicos: o rádio e polônio.
	
	
	Magaret Dayhoff, que usou computadores para o estudo de proteínas, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿.
	
Explicação:
A brilhante Magaret Dayhoff  desvendou a ordem dos aminoácidos que formavam algumas proteínas e a forma que essas proteínas tinham, criando o primeiro ¿Atlas de Proteínas¿. Este é considerado um dos primeiros experimentos em bioinformática, que foi publicado em 1965.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		1. QUAL A ASSOCIAÇÃO PODEMOS REALIZAR ENTRE A ÁRVORE GENEALÓGICA E AS SEQUÊNCIAS DOS INDIVÍDUOS?
	
	
	
	O ESTUDO DA RELAÇÃO EVOLUTIVA NÃO INFLUENCIA NA AVALIAÇÃO DA SEQUÊNCIA
	
	
	NÃO SÃO IMPORTANTES, POIS O ESTUDO DA EVOLUÇÃO NÃO FAZ PARTE DA BIOINFORMÁTICA
	
	
	NÃO EXISTE NENHUMA RELAÇÃO ENTRE O ESTUDO DA ÁRVORE GENEALÓGICA COM AS SEQUENCIAS DE CADA INDIVIDUO
	
	
	NÃO É PRECISO ENTENDER ESSA EVOLUÇÃO DENTRO DA AVALIAÇÃO DAS SEQUENCIAS.
	
	
	É IMPORTANTE POIS CONSEGUIMOS AVALIAR A RELAÇÃO EVOLUTIVA ENTRE AS SEQUÊNCIAS OBSERVADAS
	
Explicação:
AATRAVÉS DO ESTUDO DA ÁRVORE GENEALÓGICA, É POSSÍVEL ENTÃO, DETERMINAR QUAIS OS HISTÓRICOS DA EVOLUÇÃO DOS SERES.
		rezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		Sobre os processos evolutivos de analogia e homologia, marque a opção correta.
	
	
	
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
	
	
	A analogia é um processo evolutivo que associa indivíduos não relacionados à semelhanças anatômicas e funcional.
 
	
	
	 A homologia é um processo evolutivo que relaciona semelhança anatômica e semelhança funcional.
	
	
	 
Tanto a homologia quanto a analogia relaciona, ancestralidade comum e as divergências funcionais
 
	
	
	Tanto a homologia quanto a analogia relacionam ancestralidade comum, semelhança anatômicas e divergência funcional.
	
Explicação:
Letra D. A analogia é um processo evolutivo relacionado a convergência evolutiva
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Qual das alternativas apresenta um par de estruturas homólogas?
	
	
	
	Asa de ave e asa de morcego.
	
	
	Nadadeira de peixe e asa de borboleta.
	
	
	Concha de caramujo e escama de peixe.
	
	
	Asa de morcego e asa de borboleta.
	
	
	 Carapaça de tatu e concha de caramujo.
	
Explicação:
As asas de aves e morcegos, apesar de possuírem funções diferentes, apresentam esqueletos homólogos. 
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Alguns organismos de espécies diferentes possuem órgãos que exercem a mesma função, mas que possuem origem embrionária diferenciada. A asa de uma borboleta e a de uma ave, por exemplo, obedecem a esse princípio.
Analise as alternativas a seguir e marque aquela que indica corretamente o nome dado a esses órgãos.
	
	
	
	convergentes. 
	
	
	 vestigiais.
	
	
	 homólogos.
	
	
	análogos.
	
	
	divergentes.
	
Explicação:
Os órgãos análogos são aqueles que desempenham funções semelhantes em espécies diferentes, mas não possuem a mesma origem embrionária.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		A respeito dos computadores, marque a(S) alternativa(S) INCORRETA(S).
	
	
	
	Todo computador é divido em dois sistemas eletrônicos: software e hardware
	
	
	O software dos computadores nada é do que o sistema e o programa que executam os comandos do usuário.
	
	
	Os supercomputadores são aqueles que apresentam uma velocidade maior no processamento de dados, sendo ideal para serem utilizados em estudos de bioinformática.
	
	
	Os computadores podem ser classificados quanto a sua utilização em: pessoais, científico e comercias.
	
	
	Software é composto por programas como o Windows, pelo HD e memória enquanto o hardware é composto por placa mãe e memória secundária
	
Explicação:
Todo computador necessita de um sofware e um hardware para funcionar.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		(FGV) Atualmente são bem conhecidos os efeitos adversos à saúde humana causados por diversos poluentes ambientais, especialmenteaqueles que possuem potencialidades mutagênicas ou carcinogênicas, os quais, devido à sua interação com mecanismos genéticos, podem causar mutações e doenças nas gerações futuras. Assinale as afirmações corretas.
 
I. Mutações são modificações bruscas do material genético que podem ser transmitidas à prole (descendência ou células-filhas).
 
II. A mutação pode ser espontânea ou induzida por agentes físicos, químicos ou biológicos com potencial mutagênico.
 
III. Mutação é toda alteração do material genético que resulta sempre de segregação ou recombinação cromossômica.
 
IV. Mutações gênicas podem ser causadas por poluentes ambientais e provocar alterações responsáveis pelo aparecimento de genótipos diferentes em uma população.
 
A alternativa que contém as afirmações corretas é:
	
	
	
	II e III.
	
	
	III.
	
	
	I e III.
	
	
	IV e III.
	
	
	I, II e IV.
	
Explicação:
 A alternativa II está errada porque as mutações são alterações no DNA causadas por uma replicação incorreta ou por fatores externos, como radiação e exposição a produtos químicos.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Sobre a Teoria Sintética de Evolução, assinale V (verdadeiro) e F (falso) as afirmações abaixo, em seguida marque a letra com SEQUÊNCIA CORRETA:
(  ) Há dois fatores principais na variabilidade genética: mutações e recombinações genéticas;
(  ) Mutação não é a única maneira de surgirem novos genes em uma população;
(  ) Alterações provocadas pelo ambiente nas características físicas de um indivíduo adulto são transmitidas a sua prole;
(  ) A Teoria Sintética de Evolução conseguiu explicar o rearranjo dos genes que chegam aos gametas, permitindo variabilidade genética a partir de fenômenos como a Reprodução Sexuada e Crossing-Over;
(  ) A mutação mistura novos genes e a recombinação cria os genes já existentes;
	
	
	
	V-F-V-F-F
	
	
	F-F-V-V-V
	
	
	V-F-F-F-V
 
	
	
	V-F-F-V-F
	
	
	V-V-F-V-F
	
Explicação:
Resposta correta é a letra E, pois a mutação não é o unico mecanismo associado a variação gênica e as alterações associadas a células sométicas (caracteristicas físicas) não são passadas para prole, apenas as alterações em células gaméticas que são herdadas pela prole. Além disso a mutação leva a alteração de um gene já existente: subsitituição, adição, deleção ...
	
	
	
	 
		
	
		7.
		A especiação é um evolutivo que contribuiu para biodiversidade, podendo ser  classificada como simpátrica e alopátrica. A respeito desta temática, marque a alternativa correta;
	
	
	
	 a especiação simpátrica, o fluxo gênico entre as populações é interrompido, mas elas não compartilham a mesma região geográfica.
	
	
	O processo de especiação alopátrica é raro na natureza quando comparado com a simpátrica.
 
	
	
	 Na especiação simpatrica, a interrupção do fluxo gênico se dá a partir do surgimento de uma barreira geográfica que separou as duas populações
	
	
	 Na especiação alopátrica, a interrupção do fluxo gênico se dá a partir do surgimento de uma barreira geográfica que separou as duas populações
	
	
	a especiação alopátrica, o fluxo gênico entre as populações é interrompido, mas as  elas ainda compartilham a mesma região geográfica.
	
Explicação:
Resposta correta letra c
 
	
	
	
	 
		
	
		8.
		Quais são os principais eventos genéticos responsáveis pela variação gênica dos organismos ?
 
	
	
	
	Mutação e duplicação cromossômica
 
	
	
	Translocação cromossômica e mutação
	
	
	Mutação e duplicação gênica
	
	
	Inversão e duplicação gênica
 
	
	
	Inserção e translocação genica
 
	
Explicação:
Letra C
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		A prestigiada revista Science elegeu como um dos principais avanços científicos de 2017 um caso de terapia gênica em crianças portadoras de atrofia muscular espinhal do tipo 1, uma doença genética caracterizada pela atrofia progressiva dos músculos esqueléticos e morte precoce antes dos 2 anos de idade. A doença é causada por um gene defeituoso, que deixa de codificar uma proteína essencial para o funcionamento dos neurônios. No estudo, vírus não patogênicos que continham uma cópia normal do gene em questão foram injetados em quinze crianças doentes. As crianças tratadas sobreviveram além dos 2 anos e apresentaram melhoras na capacidade de movimento.
(Disponível em https://vis.sciencemag.org/.)
Assinale a alternativa que preenche corretamente as lacunas na frase a seguir.
Os vírus injetados nas crianças foram capazes de (i) ________, restaurando a produção (ii) _________, que passaram, então, a controlar adequadamente (iii)
_________.
	
	
	
	(i) atingir a medula espinhal e remover dos neurônios a cópia defeituosa do gene; (ii) de hormônios; (iii) a geração de impulsos elétricos e os músculos.
	
	
	 (i) atingir a medula óssea e induzir a produção de linfócitos do sangue; (ii) de anticorpos contra o vírus; (iii) a infecção, restaurando os movimentos das
crianças.
	
	
	 (i) atingir a medula óssea e induzir a produção de linfócitos na linfa; (ii) de anticorpos contra o vírus; (iii) a infecção, restaurando os movimentos das
crianças.
	
	
	(i) atingir a medula espinhal e introduzir nos neurônios a cópia normal do gene; (ii) da proteína essencial à função dos neurônios da medula; (iii) os músculos.
	
	
	(i) atingir a medula óssea e introduzir nas células-tronco a cópia normal do gene; (ii) de neurônios no cérebro; (iii) a medula espinhal e, portanto, os músculos.
	
Explicação:
Os vírus foram capazes de atingir a medula espinhal e de introduzir nos neurônios a cópia do gene normal. Dessa forma, os neurônios foram capazes de sintetizar a proteína essencial ao funcionamento da medula, possibilitando o controle dos músculos.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Segundo o dogma central da Biologia Molecular, o fluxo de informações genéticas ocorre em uma determinada ordem. Marque a alternativa que representa corretamente tal fluxo.
	
	
	
	RNA - proteínas - DNA
	
	
	proteínas - DNA - RNA
	
	
	proteínas - RNA - DNA
	
	
	DNA - RNA - proteínas
	
	
	DNA - proteinas - RNA
	
Explicação:
O dogma central obedece ao fluxo da informação genética que se origina a partir do DNA, ocorrendo a transcrição do RNA e, em seguida, a tradução que corresponde à síntese proteica.
	
	
	
	 
		
	
		3.
		1. A imagem abaixo mostra um processo denominado splicing de mRNA::
Sobre splicing é correto afirmar que:
 
	
	
	
	Consiste na retirada de sequências não codificadoras denominadas éxons.
	
	
	Consiste num processamento realizado pelo RNAm.
	
	
	Consiste em um processamento necessário para tornar o mRNA funcional, exclusivo dos organismos pertencentes aos domínios Archaea e Eukarya.
	
	
	Durante o processamento ocorre a adição de bases nitrogenadas na extremidade 3¿ (cap de guanina), que protegem o mRNA da degradação.
	
	
	Antes considerados DNA lixo, sabe-se atualmente que os íntrons permitem a codificação de múltiplas proteínas por um mesmo gene, através do splicing alternativo.
	
Explicação:
Retornar na aula 4, no tópico de splicing.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Sobre o splicing, é incorreto afirmar que:
	
	
	
	Mecanismo complexo, altamente regulado, onde uma mutação em um elemento regulador, pode ocasionar uma falha no processo.
	
	
	Consiste na retirada de sequências não codificadoras denominadas íntrons.
	
	
	Necessária a formação de grandes arranjos compostos por snRNPs e precursores de RNAm.
	
	
	Consiste em um processamento necessário para tornar o mRNA funcional.
	
	
	Antes considerados DNA lixo, sabe-se atualmente que os éxons permitem a codificação de múltiplas proteínas porum mesmo gene, através do splicing alternativo.
	
Explicação:
Antes considerados DNA lixo, sabe-se atualmente que os íntrons permitem a codificação de múltiplas proteínas por um mesmo gene, através do splicing alternativo.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		Qual das alternativas abaixo não está relacionada ao controle pós-transcricional de um gene?
	
	
	
	Adição de cauda poli-A e do CAP 5'. 
	
	
	Remoção de íntrons e união dos éxons.
	
	
	Modificação covalente de ambas as extremidades do RNA.
	
	
	Ocorrência após a RNA-polimerase ter se ligado ao promotor do gene e iniciado a síntese do RNA.
	
	
	Atuação de ativadores e de repressores eucarióticos por meio de vários mecanismos.
	
Explicação:
Os ativadores e os repressores eucarióticos atuam por meio de vários mecanismos ¿ geralmente alterando a estrutura local da cromatina e controlando a associação dos fatores gerais de transcrição e da RNA-polimerase no promotor e estão envolvidos no controle transcricional do gene.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		 A regulação da expressão gênica resulta em respostas fisiológicas bastante variadas nos diversos organismos, como o desaparecimento da cauda em girinos e a utilização de determinados tipos de ¿açúcares¿ (carboidratos) em bactérias. Acerca desse assunto, assinale a opção correta
	
	
	
	Em bactérias, um exemplo de controle da expressão gênica é o exercido pelo operon lac, que é ativado quando a lactose presente no meio induz a ligação de um coativador à região promotora do gene da lactase.
	
	
	A associação do DNA com proteínas chamadas histonas não exerce papel regulatório sobre a transcrição de genes em eucariotos, mas sim, na manutenção da integridade do material genético.
	
	
	O sistema operon trp (triptofano) pode ser ativado em humanos por uma dieta rica em triptofano, como, por exemplo, o consumo da carne de peru.
	
	
	A acetilação e a desacetilação de histonas são processos que influenciam no controle da expressão gênica. A acetilação, em geral, promove a transcrição de genes e desacetilação a inibe.
	
	
	Metilações podem ocorrer tanto no DNA quanto em histonas, promovidas pela ação de uma mesma enzima. Em ambos os casos, o resultado é a diminuição da transcrição do gene localizado naquela parte do DNA.
	
Explicação:
RETORNAR NA AULA 3, TÓPICO DE EXPRESSÃO GÊNICA.
	
	
	
	 
		
	
		7.
		[UEL 2011] Doping pode ser compreendido como a utilização de substâncias ou método que possa melhorar o desempenho esportivo e atente contra a ética esportiva em determinado tempo e lugar, com ou sem prejuízo à saúde do esportista. Em uma época em que as ciências do esporte aportam cada vez mais decisivamente elementos para a melhoria do desempenho esportivo dos praticantes de esporte de alto rendimento, em particular, e de atividades físicas, em geral, ganham em importância discussões acerca da utilização de metodologias biomoleculares e substâncias em suas mais amplas aplicações.
Quer do ponto de vista sanitário ou ético, o doping genético tem suscitado debates tão intensos quanto questionáveis do ponto de vista científico. A questão que se coloca consiste em indagar se o recurso obtido com tecnologias biomoleculares se choca com a ideia de espírito esportivo, essência do Olimpismo, pautado pela busca do equilíbrio entre corpo, mente e espírito.
(Adaptado de: RAMIREZ, A.; RIBEIRO, Á. Doping genético e esporte.)
 
Com base no texto e nos conhecimentos sobre terapia gênica, considere as afirmativas a seguir.
 
I. Um gene funcional pode ser inserido em local não específico do genoma para a substituição de um gene não funcional.
II. Um gene não funcional pode ser substituído por um gene funcional por recombinação genética.
III. Um gene não funcional pode ser corrigido por apoptose, o que retorna o gene à sua composição normal.
IV. Uma cópia funcional do alelo pode ser adicionada em substituição ao alelo não funcional.
 
Assinale a alternativa correta.
	
	
	
	. Somente as afirmativas II, III e IV são corretas.
	
	
	Somente as afirmativas I, II e IV são corretas.
	
	
	Somente as afirmativas III e IV são corretas.
	
	
	Somente as afirmativas I e III são corretas.
	
	
	Somente as afirmativas I e II são corretas.
	
Explicação:
Retornar na aula 3, no tópico de terapia gênica.
	
	
	
	 
		
	
		8.
		O Dogma Central da Biologia Molecular mostra os processos pelos quais os ácidos nucleicos podem passar. O DNA, por exemplo, pode dar origem a uma nova molécula de DNA por meio de um processo chamado de:
	
	
	
	replicação.
	
	
	transcrição reversa.
	
	
	 tradução.
	
	
	reprodução.
	
	
	transcrição.
	
Explicação:
A replicação do DNA, também chamada de duplicação do DNA, é um processo em que uma molécula de DNA dá origem à outra fita idêntica à original.
	
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		Em relação a banco de dados públicos, qual o único banco em que encontramos um repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas  biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucléicos. Assinale a alternativa que é referente a esse banco. 
	
	
	
	Blastn
	
	
	GenBank
	
	
	Blastx
	
	
	Gene Ontology
	
	
	 Protein Data Bank (PDB)
	
Explicação:
O Protein Data Bank (PDB) é o único repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Qual a aplicabilidade do Banco de Dados Protein Data Bank (PDB)?
	
	
	
	Anotar a função de genes é um processo basicamente comparativo
	
	
	único repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos.
	
	
	é uma coleção de todas as sequências de DNA disponíveis ao público.
	
	
	é um banco de dados extremamente completo
	
	
	é um banco que armazena a anotação detalhada de proteínas
	
Explicação:
Leia sobre a definição e atividade da plataforma PDB.
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Em qual dos bancos de dados abaixo, podemos encontrar informações correpondentes a atividades metabólica deum determinado gene, por exemplo. Assinale abaixo a alternatica correta.
	
	
	
	Swiss-Prot.
	
	
	NCBI
	
	
	 UniProt
	
	
	Gene Ontology
	
	
	KEGG
	
Explicação:
É possível extrair do KEGG informações como em qual via ou processo celular aquela proteína está inserida, incluindo exatamente o momento em que ela entra em ação.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		O repositório mundial de estruturas 3D de grandes moléculas biológicas, incluindo proteínas e ácidos nucleicos é o:
	
	
	
	PDB.
	
	
	KEGG.
	
	
	SWISS-Prot.
	
	
	GenBank.
	
	
	Gene Ontology (GO).
	
Explicação:
PDB: Protein Data Banking
	
	
	
	 
		
	
		5.
		Qual das alternativas abaixo NÃO é um banco de dados biológico?
	
	
	
	PDB.
	
	
	KEGG.
	
	
	GenBank.
	
	
	SWISS-Prot.
	
	
	BLAST.
	
Explicação:
BLAST é um algoritmo de alinhamento local.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		"O ____________ busca usar um número limitado de palavras para descrever três conjuntos de informações sobre uma proteína. O conjunto "biological process" (processo biológico) representa objetivos específicos que o organismo é geneticamente programado para atingir, como por exemplo o processo biológico da divisão celular resulta na criação de duas células filhas a partir de uma única célula-mãe. Qual opção completa corretamente a lacuna?
	
	
	
	KEGG.
	
	
	PDB.
	
	
	GenBank.
	
	
	Gene Ontology (GO).
	
	
	CARD.
	
Explicação:
A descrição corresponde ao banco Gene Ontology.
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se queeste exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		Escolha a sequência correta de etapas envolvidas no processo de interpretação do genoma de um organismo:
	
	
	
	predição gênica -> extração do DNA -> anotação funcional -> sequenciamento.
	
	
	sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional -> extração do DNA.
	
	
	extração do DNA -> sequenciamento -> predição gênica -> anotação funcional.
	
	
	extração do DNA -> sequenciamento -> anotação funcional -> predição gênica.
	
	
	extração do DNA -> predição gênica -> sequenciamento -> anotação funcional.
	
Explicação:
Primeiro é necessário obter o material biológico (DNA), determinar sua sequência de bases nitrogenadas, encontrar os genes e por fim determinar a função dessses genes.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		A função dos genes que possuem o código para a síntese de uma proteína pode ser estabelecida da seguinte maneira:
	
	
	
	A função do gene é igual à função da proteína codificada por ele.
	
	
	A função do gene é diferente à função da proteína codificada por ele.
	
	
	A função do gene e da proteína codificada por ele mesmo.
	
	
	A função do gene é igual à função da proteína que não será codificada por ele.
	
	
	A função do gene não tem relação com função da proteína codificada por ele.
	
Explicação:
Retorne na aula sobre a explicação de genes.
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Em que consiste o GenBank?
	
	
	
	é uma coleção de todas as sequências de DNA disponíveis ao público.
	
	
	é um banco de dados extremamente completo
	
	
	é um algoritmo para alinhamento de sequências
	
	
	é um banco que armazena a anotação detalhada de proteínas
	
	
	Anotar a função de genes é um processo basicamente comparativo
	
Explicação:
Retorne no tópico sobre GenBank.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Em que consiste o bando de dados KEGG?
	
	
	
	é uma coleção de todas as sequências de DNA disponíveis ao público.
	
	
	é um banco de dados extremamente completo
	
	
	é um banco que armazena a anotação detalhada de proteínas
	
	
	é um algoritmo para alinhamento de sequências
	
	
	Anotar a função de genes é um processo basicamente comparativo
	
Explicação:
Retorne a explicação e definição sobre KEGG.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		Através de estudos usando a bioinformática, um pesquisador identificou que um gene chamado p53 estava modificado em pacientes com câncer de pulmão agressivo em relação a outros pacientes que vêm tendo uma evolução mais lenta e favorável da doença. Caso esse pesquisador queira descobrir a FUNÇÃO desse gene usando a bioinformática, o que você recomendaria a ele?
	
	
	
	Identificar o códon de iniciação e o códon de parada do gene p53.
	
	
	Não é possível determinar a função de um gene usando apenas métodos de bioinformática.
	
	
	Silenciar esse gene no genoma de células em laboratório, e após isso observar as consequências.
	
	
	Produzir um embrião com ausência desse gene, e acompanhar o desenvolvimento desse indivíduo geneticamente modificado ao longo da vida.
	
	
	Comparar a sequência de nucleotídeos do gene p53 com outras sequências de genes com funções conhecidas, usando para isso bancos de dados biológicos.
	
Explicação:
A alternativa descreve a etapa da anotação funcional, que pertence a anotação gênica.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		A anotação funcional de um gene inclui saber a função da proteína codificada pelo gene e também identificar a qual processo biológico aquela proteína faz parte. Dentre os processos que ocorrem em uma célula podemos incluir as reações metabólicas e o processamento da informação genética.  Qual dos bancos de dados abaixo auxilia na busca por informações sobre processos biológicos?
	
	
	
	PDB.
	
	
	SWISS-Prot.
	
	
	KEGG.
	
	
	GenBank.
	
	
	Nenhuma das opções anteriores.
	
Explicação:
KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) é um banco de dados extremamente completo. Conseguimos extrair dele informações como qual via metabólica a proteína está inserida, doenças relacionadas, dentre outras.
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		A metagenômica é uma técnica que permite estudar os genomas de microrganismos___________.
	
	
	
	de um nicho ecológico sem necessidade de fazer culturas coletivas.
	
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas individuais.
	
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas coletivas.
	
	
	​​​​​de um nicho ecológico sem necessidade de fazer culturas individuais.
	
	
	de um nicho ecológico com necessidade de fazer culturas individuais e coletivas.
	
Explicação:
Retornar a definição de metagenômica.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Com relação aos bancos de dados e uma melhor cobertura das análises metabolômicas, podemos afirmar que: 
	
	
	
	As ferramentas usadas para as análises de transcriptômica e proteômica são totalmente apropriadas para as análises metabolômicas. 
	
	
	Atualmente, os bancos de dados são atualizados o suficiente para garantir uma ampla cobertura sem entradas replicadas. 
	
	
	Os dados gerados por microarranjos de DNA são suficientes para gerar bancos de dados completos. 
	
	
	Para garantir maior confiabilidade, as análises não devem se restringir ao uso de uma única base de dados . 
	
	
	A normalização dos dados é desnecessária em quaisquer análises metabolômicas.
	
Explicação:
A única alternativa correta é a letra "a".
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Uma das formas de definirmos as sequências, é em relação, a quantidade de sequencias que participam do processo de alinhamento. Nesse caso, temos o que chamamos de sequências simples e multiplas. Qual seria a principal definição listada abaixo relacionada a uma sequência simples?
	
	
	
	São sequências que apresentam apenas Timina e Adenina.
	
	
	Não podem ser realizadas pelo programa Blast.
	
	
	Ocorre quando temos uma sequência com as mesmas bases nitrogenadas.
	
	
	Ocorre quando é possível comparar três ou mais sequências.
	
	
	Ocorre quando comparamos apenas duas sequências entre si.
	
Explicação:
Nesse tipo de alinhamento é possível compararmos duas sequências entre si.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Em relação a análise da precisão dos alinhamentos, eles podem ser definidos por:
	
	
	
	Simples e Múltiplo
	
	
	Algoritmo Needleman-Wunsch.
	
	
	Heurístico e Ótimo
	
	
	Blast e Clustal W
	
	
	Local e Global
	
Explicação:
Algo que deve ser levado em consideração sempre que se deseja fazer alinhamentos de seqüências é o fato de que o alinhamento desejado seja o melhor possível de ser obtido através de ferramentas computacionais ou se desejamos apenas uma aproximação válida desse melhor resultado. É evidente que, em condições normais, desejaríamos sempre obter o melhor resultado de alinhamento possível e, portanto, utilizaríamos os algoritmos que produzem resultados ótimos. Entretanto, algumas vezes precisamos obter uma maior rapidez de busca e, portanto, aceitamos que o resultado obtido não seja ¿o melhor possível¿ e, assim, utilizamos algoritmos que apresentam algum tipo de heurística.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		Qual a primeira ferramenta utilizada para desenho de primers, sondas e comparação de sequências?
	
	
	
	NCBI
	
	
	Blast
	
	
	Blastp
	
	
	Blastx
	
	
	Blastn
	
Explicação:
Retorne ao tópicoNCBI e suas aplicabilidades.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Em relação ao alinhamento de sequência, ela pode ocorrer sendo alinhamento global ou local. Em relação ao alinhamento global, é correto, afirmar que:
	
	
	
	Localiza similaridades apenas de um ponto específico da sequência.
	
	
	identificam regiões de similaridade dentro de sequencias longas que são geralmente bastante divergentes em um todo.
	
	
	Ocorre pelo programa clustal W
	
	
	É realizado através do desenho primer
	
	
	é uma forma de otimização global que "força" o alinhamento a cobrir todo o comprimento de todas as sequencias interrogadas (query).
	
Explicação:
É um tipo de alinhamento, aonde ocorre a leitura de toda a sequência para que posteriormente, possam ser analisados os pontos de similaridade.
	
	
	
	 
		
	
		7.
		Em relação ao desenho de primers, é incorreto, afirmar que:
	
	
	
	Repetições não aumenta o potencial de anelamento incorreto/inespecífco
	
	
	O tamanho dos primers determina especificidade e afeta seu anelamento com o DNA molde
	
	
	Primers de tamanho muito curto leva a  baixa especifcidade, resultando em amplifcação não específca
	
	
	Incompatibilidade signifcativa do par de primers pode levar à má amplifcação
	
	
	O número máximo de repetições aceitável é de 4 dinucleotdeos
	
Explicação:
Repetições longas aumenta o potencial de anelamento inespecífco, pois pode ocorrer um erro de leitura da fita. O ideal é que no desenho de primers, não exista repetições longas para que não ocorra o anelamento inespecífico.
	
	
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		Á respeito da temática "alinhamento genômico" marque a opção correta.
	
	
	
	Softwares de alinhamento genômico analisam os diferentes tipos de alinhamentos e nos sugerem o ¿alinhamento ótimo¿ no final do processo. 
	
	
	O BLAST é uma ferramenta de busca por alinhamento global básico par-a-par 
	
	
	Os traços que podem aparecer nas sequencias após o alinhamento  são os indels, que representam as translocações que foram realizadas naquele genoma.
	
	
	Os alinhamentos genômicos são técnicas de comparação entre sequências biológicas, que utilizam algoritmos computacionais apenas para apontar as diferenças localizadas na mesma posição das sequências analisadas
	
	
	Os alinhamentos multiplos globais são método  que exigem pouca capacidade computacional e, dependendo da quantidade de sequências envolvidas, pode requerer tempos curtos para processamento.
	
Explicação:
Resposta correta letra C
	
	
	
	 
		
	
		2.
		O blast é um software de alinhamento local básico gerenciado pelo NCBI e muito utilizado nos estudos em bioinformática. A respeito desta ferramenta, marque a alternativa correta.
	
	
	
	O blastp usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína
	
	
	É uma ferramenta que compara uma sequência desconhecida com aquelas depositadas no computador do usuário.
	
	
	O blastn usa uma sequência de nucleotídeo de entrada e da como resultado uma sequência de proteína
	
	
	É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar serem exatas apresentam um tempo de processamento alto.
 
	
	
	É um algoritmo capaz de realizar buscas baseadas em alinhamento que, apesar de não serem exatas, são confiáveis e muito rápidas.
	
Explicação:
Resposta letra A. O blast é uma ferramenta confiavel para análises rápidas e iniciais de um trabalho. 
	
	
	
	 
		
	
		3.
		O BLAST permite um alinhamento localizado de fragmentos de sequência a partir da seleção das sequências mais similares. O resultado da busca é apresentado em valores de score que expressam a significância do alinhamento.Em relação ao algortimo blast assinale a alternatica correta:
	
	
	
	O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis mas não são rápidos. Isto faz com que o programa não ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
	
	O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos  são fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
	
	O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa não ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
	
	O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém não confiáveis e nem rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
	
	O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
Explicação:
O algoritmo do BLAST realiza buscas baseadas em alinhamentos que não são tão fidedignos, porém são confiáveis e rápidos. Isto faz com que o programa ofereça vantagens em relação a outras ferramentas de alinhamento.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Para isolar um determinado gene, podemos utilizar uma técnica de Biologia Molecular chamada de PCR (Polymerase chain reaction). Para realizar ua PCR, nós necessitamos de nucleotídeos, da enzima DNA polimerase, do cofator enzimático e de um par de____________.
Complete a lacuna com a alternativa correta:
	
	
	
	Genomas
	
	
	Primers
	
	
	nucleotídeos
	
	
	Polimerases
	
	
	Helicases
	
Explicação:
Para realizar ua PCR, nós necessitamos de nucleotídeos, da enzima DNA polimerase, do cofator enzimático e de um par de primers.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		A respeito dos alinhamentos genômicos, marque a alternativa correta.
	
	
	
	O alinhamento global busca o maior número de matches do início ao final das sequências
	
	
	O alinhamento global buscam pequenas regiões de similaridade.
	
	
	O ClustalW é programas de alinhamento local do genoma.
	
	
	O alinhamento local é aquele que levam em consideração toda a extensão das sequências.
	
	
	Nos alinhamentos busca-se a menor quantidade de similaridade
	
Explicação:
O alinhamento global analisa toda a extensão da sequência, buscando o maior número de matches. 
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Com relação aos bancos de dados genômicos e alinhamento de sequências, marque a (s) alternativas que você julga como CORRETA(S) com V e a(S) INCORRETA(S) com F.
 
	
	
	          
	O alinhamento múltiplo de sequências pode ser local ou global
	
	          
	O NCBI (National Center for Biotechnology Information) mantém o GenBank, que é uma coleção anotada de sequências de DNA disponíveis publicamente.
	
	          
	Os métodos progressivos de alinhamento múltiplo de n sequências possibilitam calcular, na última fase, o alinhamento de todos os possíveis pares de sequências.
	
	          
	O CLUSTALW é uma das ferramentas mais comuns para alinhamento múltiplo de sequências.
	
	          
	A análise filogenética usa geralmente o alinhamento múltiplo de sequências.
	
Explicação:
A unica incorreta é a letra  C  . Nos alinhamentos progressivos são Inicialmente realizados alinhamentos par-a-par de todos os possíveis pares. Nesta comparação, verifica-se apenas o número de caracteres diferentes entre as duas sequências (distância evolutiva).O algoritmo construirá um alinhamento através de programação dinâmica para estas duas sequências. A partir deste primeiro alinhamento, estas duas sequências serão agora tratadas como uma, e serão alinhadas à próximasequência filogeneticamente relacionada. Todo o restante das sequências será alinhado baseando-se neste primeiro par. É um método rápido e amplamente utilizado para alinhar um grande número de sequências.
	
	
	
	 
		
	
		7.
		A respeito da confecção dos primers, marque a resposta correta.
	
	
	
	O programa PRIMER 3 é utilizado de forma customizada para a confecção de primers para uma sequência dada.
	
	
	O primer deve ter um conteúdo de GC de cerca de 75%.
	
	
	Primers são iniciados específicos confeccionados com tamanho variando de 50 a 100 pares de bases
	
	
	Primers devem apresentar hompolinucleotídeos na sua sequência.
 
	
	
	O primer deve apresentar temperatura de melt inferior a 50ºC.
	
Explicação:
Resposta correta letra C. 
	
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		(ESFCEX) Em relação às contribuições das pesquisas genômicas com vistas ao controle da doença, analise as afirmativas abaixo e, a seguir, assinale a alternativa correta.
I. Estudos em genômica permitirão a manipulação do código, alterando-se o significado dos códons.
II. O conhecimento da totalidade dos genes do vetor resultará na desejada erradicação da espécie.
III. O conhecimento do inseto vetor no nível molecular pode conduzir a novas estratégias terapêuticas contra a doença.
IV. A análise dos genomas dos insetos situados em diferentes regiões geográficas revela a história evolutiva do grupo.
Assinale a alternativa correta.
	
	
	
	Somente I e III estão corretas
	
	
	Somente II e III estão corretas.
	
	
	Somente III e IV estão corretas.
	
	
	Somente II e IV estão corretas.
	
	
	Somente I e IV estão corretas.
	
Explicação:
Retornar ao tópico sobrte explicação genomica.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Dentre as vertentes das ômicas, marque a alternativa CORRETA.
	
	
	
	Técnicas muito comuns usadas na metabolômica são a ressonância nuclear e as cromatografias.
	
	
	A genômica estrutural é sinônimo transcriptômica, já que as duas avaliam a expressão gênica
	
	
	A metabolômica avalia apenas metabólitos de origem proteica e lipídica.
	
	
	A transcriptômica tem como objetivo avaliar os genes transcritos em determinado organismo sobre determinada condição. Para isto a transcriptômica utiliza técnicas como a Eletroforese.
	
	
	A proteômica estuda a estrutura das proteínas e uma das técnicas utilizadas nesta ciência é o sequenciador automático.
	
Explicação:
Resposta correta letra C. RMN e cromografias são as técnicas mais utilizadas para identificação e caracterização dos metabólitos 
	
	
	
	 
		
	
		3.
		Em relação às ômicas e sua importância para as pesquisas científicas, qual das alternativas a seguir está incorreta:
	
	
	
	A genômica pode ser estrutural ou funcional; a primeira objetiva a caracterização da natureza física dos genomas completos e a segunda busca caracterizar a função biológica dos genes.
	
	
	Um projeto de pesquisa só pode ser iniciado a partir de sequências genômicas conhecidas, não havendo possibilidade de efetuar estudos com sequências desconhecidas.
	
	
	A metabolômica pode auxiliar na demonstração de como os genótipos estão associados aos fenótipos, além de permitir simulações de mecanismos celulares em larga escala.
	
	
	Entre os grandes dificultadores nos estudos de biologia molecular estão a necessidade de acesso a várias fontes de dados para responder uma questão simples e a utilização de ferramentas de análise sofisticadas.
	
	
	A tecnologia de microarranjos de DNA possibilita a avaliação simultânea da expressão de milhares de genes em diferentes tecidos de um determinado organismo, e em diferentes estágios de desenvolvimento ou condições ambientais.
	
Explicação:
Um projeto de pesquisa pode iniciar com uma série de sequências genômicas, conhecidas ou não. As sequências desconhecidas podem ser submetidas a uma busca em bancos de dados por sequências similares, como será visto na próxima aula, ou podem ter suas identidades e funções preditas por meio do uso de algoritmos computacionais.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		São aspectos relacionados à transcriptômica, exceto:
	
	
	
	Uma de suas limitações está relacionada ao fato de que a abundância do mRNA nem sempre é bem correlacionada com a abundância da proteína.
	
	
	Sua análise é característica de cada tipo de célula, e pode diferir em função de diferentes situações fisiológicas ou patológicas.
	
	
	Tem como objetivo determinar os perfis da expressão de todos os genes presentes em um genoma.
	
	
	Várias técnicas podem ser aplicadas para seu estudo, a exemplo dos microarranjos de DNA.
	
	
	Tem sido utilizada para o estudo das respostas metabólicas de organismos a fatores bióticos e abióticos.
	
Explicação:
A metabolômica estuda as mudanças na expressão de pequenas moléculas orgânicas, conhecidas como metabólitos.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		A análise proteômica e a proteômica quantitativa são áreas da química de proteínas que vem se desenvolvendo com grande rapidez ao longo dos últimos anos. Sobre o tema, assinale a alternativa incorreta.
	
	
	
	Uma vantagem da análise proteômica sobre a análise da expressão gênica no nível de RNA é que a proteômica identifica produtos gênicos que são de fato expressos e não apenas mRNAs que podem não ser traduzidos.
	
	
	A análise proteômica é limitada a proteínas solúveis, não sendo aplicável a proteínas mais complexas como as proteínas de membrana.
	
	
	Uma das grandes limitações atuais da análise proteômica reside no número de proteínas que pode ser analisada em cada experimento, que sempre representará apenas uma fração das proteínas expressas em determinada situação.
	
	
	A análise proteômica permite a detecção de modificações pós-traducionais, o que amplia a relevância biológica dos dados obtidos.
	
	
	Um dos pré-requisitos básicos da proteômica é que o organismo analisado já tenha seu genoma sequenciado, ou pelo menos uma boa coleção de cDNAs esteja disponível.
	
Explicação:
A análise proteômica pode ser realizada em qualquer proteína, independente da sua composição.
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Em relação ao estudo da genômica, podemos encontrá-las divididas em dois diferentes grupos, sendo chamados de genômica funcional e estrutural, em relação a genômica estrutural, assinale a alternativa correta:
	
	
	
	Busca caracterizar a função biológica dos genes.
	
	
	Caracteriza a atividade genética dos genes.
	
	
	 Objetiva a caracterização da natureza física dos genomas completos.
	
	
	Visa avaliar e comparar os genomas do indivíduo
	
	
	Busca entender a classificação dos genes.
	
Explicação:
Retorne a definição do trecho de genomica da aula 6.
	
	
	
	 
		
	
		7.
		(FIOCRUZ) Em última análise, as interações estabelecidas entre os aminoácidos componentes de uma dada cadeia polipetídica irão, em conjunto com outros fatores, definir a estrutura tridimensional que a cadeia irá assumir em solução. A determinação desta estrutura pode, em muitas das vezes, auxilar a compreensão do mecanismo de ação desta cadeia polipeptídica, e permitir o esclarecimento de suas funções em um determinado organismo que a produz. Assinale abaixo a afirmativa que não expressa uma estratégia experimental aplicável para a caracterização da estrutura tridimensional das cadeias polipeptídicas.
 
	
	
	
	Citometria de fluxo.
	
	
	Ressonância magnética nuclear.
	
	
	Método Ad initio.
	
	
	Modelagem comparativa por homologia.
	
	
	Dicroismo circular.
	
Explicação:
A citometria de fluxo permite avaliar estudos populacionais, inclusive de classes de proteínas.8.
		Em relação ao estudo da genômica, podemos encontrá-las divididas em dois diferentes grupos, sendo chamados de genômica funcional e estrutural, em relação a genômica funcional, assinale a alternativa correta:
	
	
	
	Busca entender a classificação dos genes.
	
	
	Objetiva a caracterização da natureza física dos genomas completos.
	
	
	Busca caracterizar a função biológica dos genes.
	
	
	Visa avaliar e comparar os genomas do indivíduo
	
	
	Caracteriza a atividade genética dos genes.
	
Explicação:
Retorne a definição de genômica estrutural e funcional.
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		(MPU2007) Um pesquisador deseja isolar um gene de uma espécie de planta hipotética que codifica uma proteína capaz de inibir a proliferação de fungos que crescem sobre a superfície das suas folhas. O pesquisador tem disponível em seu laboratório uma biblioteca genômica, várias bibliotecas de cDNA, uma biblioteca de expressão dessa espécie de planta e a proteína purificada. O pesquisador encontrará mais rapidamente o gene desejado se:
	
	
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca genômica e procurar os ESTs.
	
	
	seqüenciar o DNA da biblioteca de cDNA e pesquisar os quadros de leitura.
	
	
	clonar o cDNA da espécie e com ele triar a biblioteca genômica.
	
	
	seqüenciar os aminoácidos das proteínas produzidas na biblioteca de expressão até identificar a proteína desejada.
	
	
	produzir um anticorpo específico para essa proteína e com ele triar a biblioteca de expressão.
	
Explicação:
Aula 5, retornar em sequenciamento.
	
	
	
	 
		
	
		2.
		A respeito dos sequenciadores, marque a alternativa INCORRETA.
	
	
	
	Os sequenciadores de 1º geração produzem fragmentos sequenciados maiores, porém os de 2º geração são muito mais rápidos.  
	
	
	 O pirossequenciador mede a liberação do pirofosfato por quimioluminescência
	
	
	No SoLiD, a reação de sequenciamento é catalisada por uma DNA ligase e não pela DNA polimerase
	
	
	O Ion Torrent que é um equipamento entre 2º e 3º geração utiliza a variação do pH como mecanismo de detecção.
	
	
	O Ilumina assim  como o método de Sanger realiza síntese usando DNA polimerase e dideoxinucleotídeos marcados e não constrói biblioteca.
	
Explicação:
Resposta letra D. O Ilumina utiliza didesoxinucleotídeos assim como o sequenciamento por Sanger, porém ele constrói bibliotecas a a partir do PCR de emulsão.
	
	
	
	 
		
	
		3.
		A respeito do sequenciamento de Sanger e o Pirossequenciamento, marque V para as verdadeiras e F para as falsas.
	
	
	          
	No pirossequenciamento a liberação do pirofosfato proveniente da formação da ligação fosfodiester, é convertido em luz e lido no sequenciador.
	
	          
	O Pirossequenciador e o Sequenciador automático de Sanger pertencem a 1º geração dos sequenciadores.
	
	          
	O Pirossequenciador é um aparelho classificado na segunda geração
	
	          
	O pirossequenciador é classificado como de 3º geração e o sequenciamento automático de Sanger como 1º geração.
	
	          
	No sequenciamento automático de Sanger, a reação da fita complementar é interrompida pela adição dos didesoxirribonucleotídeos.
	
Explicação:
O pirossequenciador é um aparelho classificado como de 2º geração
	
	
	
	 
		
	
		4.
		Uma fita de DNA apresenta a seguinte sequência:
TCAAGT
Marque a alternativa que indica corretamente a sequência encontrada na fita complementar:
	
	
	
	AGUUCA
	
	
	UCTTGU
	
	
	AGTTCA
	
	
	AGUUGA
	
	
	ATAAUA
	
Explicação:
 É importante perceber que o DNA é composto por duas fitas e que uma complementa a outra. Sabemos que na molécula de DNA a adenina sempre se une à timina e que a citosina sempre se liga à guanina. Sendo assim, uma sequência TCAAGT liga-se a uma sequência AGTTCA.
	
	
	
	 
		
	
		5.
		(PCERJ) O DNA (ácido desoxirribonucléico) é constituído por uma longa fita dupla de nucleotídeos. O sequenciamento de DNA é um processo que determina a ordem desses nucleotídeos. A fita dupla é formada pelo pareamento das bases. Desta forma, referente ao pareamento desses nucleotídeos, não é correto afirmar:
	
	
	
	Adenina se pareia com timina
	
	
	As bases dos nucleotídeos são adenina (A), timina (T), guanina (G) e citosina (C)
	
	
	A guanina se pareia com adenina
	
	
	A guanina se pareia com citosina.
	
	
	A sequência desse pareamento é responsável pelas características genéticas do homem e de todos os seres vivos
	
Explicação:
Retornar na aula 5, no topico de sequenciamento
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Marque a alternativa que melhor define um gene.
	
	
	
	O gene é uma sequência de nucleotídeos em que está contida a informação que será usada para a síntese de proteínas.
	
	
	O gene é uma porção da molécula de RNA que determina uma característica.
	
	
	Trecho do RNA que contém sequências de nucleotídeos que são usados para a síntese de proteínas.
	
	
	 O gene é uma região do DNA que é responsável pela síntese de carboidratos, determinando nossas características.
	
	
	O gene é uma porção da célula.
	
Explicação:
O gene é uma porção de DNA (sequência de nucleotídeos) onde estão contidas as informações que serão essenciais para a formação das proteínas.
	
	
	
	 
		
	
		7.
		Assinale a alternativa CORRETA:
 
	
	
	
	O método de sequenciamento de DNA por interrupção de cadeia é idêntico ao modelo original descrito por Sanger e Coulson (1977) e também se mantém o método confiável em termos de qualidade das sequências.
	
	
	O método de Sanger e Coulson (1977) foi o primeiro método que permitiu aos cientistas determinar a sequência de nucleotídeos de uma determinada molécula de DNA.
	
	
	O método de Sanger e Coulson (1977) para sequenciamento de DNA também é conhecido como método de sequenciamento por interrupção de cadeia.
	
	
	O projeto original e, na verdade, o primeiro método de sequenciamento de DNA por interrupção de cadeia, data de 1976, cujos autores são Allan Maxam e Walter Gilbert.
	
	
	É atribuído a Sanger e Coulson o mérito do sequenciamento do DNA por interrupção de cadeia, porque a técnica foi desenvolvida em 1975 e demorou 2 anos para ser publicada.
	
Explicação:
Primeiro método se sequenciamento de primeira geração.
		Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu TESTE DE CONHECIMENTO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
	
	 
		
	
		1.
		Sobre as etapas da extração do DNA marque a alternativa correta.
	
	
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo fazer a lise das membranas celulares utilizando fenol-cloroformio.
	
	
	A terceira etapa consiste na remoção do RNA
	
	
	A segunda etapa do processo é a lise das membranas lipídicas.
	
	
	A primeira etapa da extração tem por objetivo inativar nucleases e retirar outras proteínas contaminantes.
	
	
	A segunda etapa é a precipitação do DNA após lavagens sequenciais com soluções alcoólicas e centrifugação
	
Explicação:
Resposta letra C
	
	
	
	 
		
	
		2.
		Eduardo está desenvolvendo uma pesquisa para investigar a associado de mutações em células da mucosa da laringe com o desenvolvimento de câncer. Assim, ele recrutou pacientes saudáveis e com câncer de laringe para fazer a coleta do material. Após a biopsia Eduardo não sabia como armazenar este espécime clinico e de umaforma precisa e correta sua amiga Luana o orientou a: 
	
	
	
	 
Manter o tecido no freezer (-70ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
	
	 
Manter o tecido no freezer (2º a 8ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
	
	Manter  o tecido em geladeira (2º a 8ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
	
	 
Armazenar o tecido em nitrogênio líquido (-196ºC) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
	
	
	 
Armazenar o tecido no freezer (-10ºC ) para posterior extração do DNA das células do tecido da laringe
 
	
Explicação:
Para a extração da DNA é suficiente armazenar em freezer -70º graus
	
	
	
	 
		
	
		3.
		EM QUE CONSISTE UMA HIPÓTESE NULA?
 
	
	
	
	É aquela que anula os resultados do estudo.
	
	
	È aquela que não avalia a relação de causa e efeito
	
	
	​​​​​​É definida como aquela que declara que não existe uma relação de causa-efeito no experimento.
	
	
	Consiste em uma hipótese que não leva nenhum dado em consideração.
	
	
	É definida como aquela que declara que existe uma causa-efeito no experimento.
	
Explicação:
Retonar na aula 4, tópico de hipóteses.
	
	
	
	 
		
	
		4.
		A variabilidade genética é gerada por eventos espontâneos que contribuem para o processo evolutivo como a mutação. A respeito da mutação marque a alternativa INCORRETA
 
	
	
	
	 A substituição de nucleotídeos que gera um códon de parada é chamanda de mutação sem sentido (nonsense mutation).
	
	
	A substituição corresponde a troca de nucleotídeos incorporados na sequência do DNA.
	
	
	A inserção e a deleção um ou alguns nucleotídeos geralmente levam a alterações mais drásticas nos códons e como consequência na proteína resultante. 
	
	
	As mutações conhecidas como mutação de fase de leitura (frameshift mutations) alteram a fase de leitura de todas as trincas de pares de bases no gene depois do sítio mutado.
	
	
	A substituição de nucleotídeos que gerar um novo códon sem alterar o aminoácido é chamada de mutação e de sentido trocado  (missense mutation).
	
Explicação:
Resposta letra D. A substituição de nucleotídeos que gerar um novo códon sem alterar o aminoácido é chamada de mutação silenciosa. 
	
	
	
	 
		
	
		5.
		O processo de extração tem como objetivo isolar o ácidos nucleico dos demais componentes celulares. Baseado neste processo marque a alternativa incorreta
	
	
	
	A precipitação do ácido nucleico pode se realizada com etanol ou álcool isopropílico.
	
	
	Substâncias com ação de detergentes podem ser utilizadas para remoção dos lipídios da amostra
	
	
	O fenol clorofórmio é um insumo muito utilizado para promover a precipitação de proteínas.
	
	
	A primeira etapa da extração é a lise de membranas onde são utilizados substância com ação de solvente
	
	
	A remoção do RNA é uma etapa exclusiva da extração de DNA
	
Explicação:
Letra A. São substância detergentes e não solventes. 
	
	
	
	 
		
	
		6.
		Gabriela irá realizar a técnica de eletroforese para avaliar qualitativamente e quantitativa o RNA extraído de células bucais que será utilizado no seu projeto de mestrado. Porém, Gabriela tem duvidas quanto ao príncipio e aplicação da técnicas. Marque a alternativa  da melhor explicação que você daria a Gabriela.
	
	
	
	 
A eletroforese é uma técnica que utiliza corantes fluorescente como iodina  para detectar e quantificar substâncias.
 
	
	
	 A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz transmitida com a quantidade da substância na amostra.
 
	
	
	A eletroforese é uma técnica ótica que associa a quantidade de luz absorvida com a quantidade da substância na amostra.
 
	
	
	A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com o peso molecular e afinidade.
 
 
	
	
	 A eletroforese é técnica que utiliza campo elétrico para separar moléculas de acordo com carga e peso molecular
 
	
Explicação:
Resposta correta letra E.
	
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