O alinhamento local de sequências é o processo de encontrar regiões de similaridade entre duas ou mais sequências biológicas, como sequências de DNA ou proteínas. Diferentemente do alinhamento global, que busca alinhar as sequências por completo, o alinhamento local foca em identificar regiões específicas de similaridade, permitindo a identificação de trechos conservados ou de interesse em meio a sequências mais divergentes. Isso é útil para identificar domínios funcionais, sítios de ligação ou regiões conservadas em proteínas, por exemplo.
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