As responsabilidades civil e administrativa são independentes da criminal, sendo possível existir o questionamento sobre a existência ou a autoria ...

Correto. As responsabilidades civil e administrativa são independentes da criminal, ou seja, a decisão em um processo não interfere na decisão dos outros processos. É possível que a pessoa seja considerada inocente em um processo criminal, mas ainda assim seja responsabilizada em um processo civil ou administrativo.