As células T ativam os macrófagos por meio da liberação de citocinas, como o interferon-gama (IFN-γ) e o fator de necrose tumoral (TNF), que se ligam aos receptores de citocinas nos macrófagos. Essas citocinas ativam a via de sinalização JAK-STAT, que leva à ativação de genes envolvidos na resposta imune. Os macrófagos ativados respondem ao killing dos microrganismos ingeridos por meio de várias estratégias, incluindo a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) e nitrogênio (RNS), que são tóxicas para os microrganismos. Além disso, os macrófagos ativados também podem fagocitar e degradar os microrganismos por meio de enzimas lisossômicas.
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