As células T ativam os macrófagos por meio da liberação de citocinas, como o interferon-gama (IFN-γ) e o fator de necrose tumoral (TNF), que se ligam aos receptores de citocinas nos macrófagos. Essas citocinas ativam a via de sinalização JAK-STAT, que leva à ativação de genes envolvidos na resposta imune. Os macrófagos ativados, por sua vez, realizam a fagocitose dos microrganismos ingeridos e os matam por meio de mecanismos como a produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) e nitrogênio (RNS), a liberação de enzimas lisossômicas e a ativação da via de morte celular programada conhecida como apoptose. Além disso, os macrófagos ativados também apresentam antígenos aos linfócitos T, contribuindo para a amplificação da resposta imune.
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