É correto afirmar que a estrutura básica de um aminoácido é composta por um carbono assimétrico ligado a um grupo carboxila, um grupo amina, um átomo de hidrogênio e uma cadeia lateral ou grupo R, o qual difere entre os aminoácidos. No entanto, o estado de ionização dos grupos carboxila e amina pode variar em diferentes fluídos do organismo humano, dependendo do pH do meio em que se encontram. Em soluções ácidas, os grupos carboxila tendem a estar protonados (COOH), enquanto os grupos amina tendem a estar em sua forma não ionizada (NH2). Em soluções básicas, os grupos amina tendem a estar protonados (NH3+), enquanto os grupos carboxila tendem a estar em sua forma ionizada (COO-).
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