As enzimas de restrição são endonucleases que reconhecem sequências específicas de DNA e cortam a molécula nesses locais, permitindo a manipulação do DNA para clonagem molecular. Analisando as alternativas: A) Endonucleases sítio-específicas. — Correto, pois as enzimas de restrição são endonucleases que cortam o DNA em locais específicos. B) Proteases que clivam peptídeos em sequências específicas. — Incorreto, proteases atuam em proteínas, não em DNA. C) Ribonucleases que degradam RNA mensageiro após a sua síntese. — Incorreto, ribonucleases atuam em RNA, não em DNA. D) Enzimas que agem na membrana, restringindo a entrada de moléculas na célula. — Incorreto, não é função das enzimas de restrição. E) Capazes de unir fragmentos de DNA. — Incorreto, essa função é das ligases, não das enzimas de restrição. Portanto, a alternativa correta é: A) Endonucleases sítio-específicas.