A β-oxidação envolve ativação para acil-CoA por conjugação com coenzima A no citosol, conversão para acilcarnitina para transporte através da membrana mitocondrial e conversão de volta para acil-CoA dentro da mitocôndria onde a oxidação de ácidos graxos (β-oxidação) ocorre. A β-oxidação envolve uma seqüência repetida de quatro atividades enzimáticas que resultam na liberação de uma unidade acetil-CoA, uma molécula de FADH2 e uma molécula de NADH + H +.Como o ácido palmítico, por exemplo, um ácido-graxos de 16 carbonos, que vai sofrer sete reações oxidativas, perdendo em cada uma delas dois átomos de carbono na forma de acetil-CoA. Portanto, essas moléculas são utlizadas como fonte de energia no ciclo de krebs. Um transportador deve ser subsequentemente utilizada, a carnitina , para translocar moléculas de CoA de acilo na matriz mitocondrial , uma vez que a membrana mitocondrial interna é impermeável a acil-CoA.
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