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08/12/2021 10:38 1/4 Avaliação II - Individual (Cod.:690506) Código da prova: 41976506 Disciplina: Biologia Molecular (17527) Período para responder: 02/12/2021 - 17/12/2021 Peso: 1,50 1 - A genômica estrutural busca determinar qual é esse local e onde estão os marcadores associados a cada um dos genes encontrados. Sobre os termos utilizados para denominar os locais de um cromossomo, assinale a alternativa CORRETA: A ) O alelo se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo. B ) O termo locus se refere ao local ou posição ocupada por um gene em um determinado cromossomo. C ) O termo locus se refere a uma das formas em que um gene pode ser encontrado em um cromossomo. D ) O termo homólogo se refere aos diferentes cromossomos, que apresentam genes heterógenos. 2 - As informações obtidas no processo de digestão proteica são relativas à m/z dos diferentes peptídeos. Contudo, é de grande interesse que as sequências de aminoácidos que compõem as proteínas sejam também identificadas. De acordo com a detecção da sequência dos aminoácidos de uma proteína, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) No processo de fragmentação dos íons peptídicos, são utilizadas técnicas que favorecem a formação de fragmentos que sejam opostos e complementares. ( ) A sequência de aminoácidos dos peptídeos pode ser deduzida por softwares apropriados para o sequenciamento, que podem formar a sequência completa da proteína. ( ) Os processos de dissociação induzida por colisão (CID) ou por transferência de elétrons (ETD) formam íons de massa molecular elevada, que são aplicados ao primeiro ciclo de cromatografia líquida. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A ) F - F - V. B ) V - V - F. C ) V - F - F. D ) V - F - V. 3 - A interação entre proteínas e o DNA é de extrema importância na genômica funcional, especialmente pelo fato de que diversas proteínas são reguladoras da expressão gênica. Com base nas técnicas utilizadas para identificar os locais de interação, classifique V para as sentenças verdadeiras e F para as falsas: ( ) A MNase (nuclease microcócica), uma nuclease específica, capaz de clivar o DNA em pequenos fragmentos, é modificada com a adição de uma proteína, a proteína A (pA) no sequenciamento CUT & RUN. ( ) A MNase modificada com a pA forma regiões de interação entre a proteína e o DNA que podem ser imunoprecipitadas, formando uma amostra rica de precipitados de regiões de interação da proteína de interesse com o DNA. ( ) No sequenciamento ChIP, a proteína de interesse é reticulada ao DNA, ou seja, são formadas ligações covalentes entre a proteína e o DNA por meio da adição de anticorpos específicos para essa proteína. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A ) V - F - V. B ) F - F - V. C ) V - V - F. D ) F - V - F. 4 - Existem diferentes técnicas de ionização que podem ser aplicadas aos peptídeos, sendo as principais delas a ionização/dessorção a laser assistida por matriz (MALDI) e a ionização por eletro spray (ESI). Sobre os Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce 08/12/2021 10:38 2/4 processos de ionização utilizados nas análises de proteômica, assinale a alternativa CORRETA: A ) A ionização ESI utiliza cristais que são bombardeados por laser, sendo sublimados (convertidos em fase gasosa) e ionizados durante o processo. B ) A ionização por MALDI permite degradação de moléculas como DNA e proteínas. C ) A ionização por MALDI é considerada branda, sendo aplicável a moléculas sensíveis como DNA e proteínas. D ) A ionização ESI é considerada agressiva por desnaturar amostras peptídicas. 5 - A grande vantagem da utilização do RNA-seq é que, nesta tecnologia, não é necessário que se tenha prévio conhecimento do genoma ou dos transcritos que serão avaliados. Algumas das aplicações relacionadas a essa técnica são: a avaliação da expressão gênica diferencial, análise do perfil do transcriptoma e a investigação de SNPs. Com base nas etapas para do método da transcriptoma RNA-seq, ordene os itens a seguir: I- Fragmentar as moléculas por ação de enzimas de restrição, sonicação ou nebulização, formando fragmentos que serão ligados a adaptadores (pequenas sequências de nucleotídeos que indicam onde o sequenciamento deve ser iniciado em cada molécula). II- Isolar e fragmentar o RNA a ser sequenciado e convertê-lo em cDNA. III- Aplicar métodos de sequenciamento para sequenciar pequenas porções, compostas por 30 a 200 pb (pares de bases), de cada um dos fragmentos. Assinale a alternativa que apresenta a sequência CORRETA: A ) II - III - I. B ) I - III - II. C ) II - I - III. D ) I - II - III. 6 - Durante o Projeto Genoma Humano, duas grandes frentes de trabalho independentes foram organizadas, uma formada por cerca de 5.000 cientistas em um consórcio público e a segunda por meio da iniciativa privada da empresa Celera Genomics, cujo objetivo era patentear os genes sequenciados. Com base nas técnicas utilizadas para o sequenciamento, analise as sentenças a seguir: I- O shotgun hierárquico sequenciava através da fragmentação do DNA total, que era clonado a partir de diferentes tamanhos de fragmentos de 2 mil, 10 mil e 130 mil pares de base. II- O shotgun de genoma inteiro formava três bibliotecas de DNA, com diferentes tamanhos de fragmentos. III- O shotgun hierárquico utilizava como vetor plasmídeos bacterianos comuns, a fim de sequenciar diferentes tamanhos de fragmentos do genoma completo. Assinale a alternativa CORRETA: A ) As sentenças I e III estão corretas. B ) Somente a sentença III está correta. C ) As sentenças I e II estão corretas. D ) Somente a sentença II está correta. 7 - O proteoma representa todo o conjunto de proteínas expressas em determinado momento, em um determinado organismo, tecido, célula ou até mesmo em bio-fluídos, como plasma ou muco. Através desta avaliação, é possível conhecer as proteínas que compõem esse proteoma, bem como processos biológicos em que elas possam estar envolvidas. Com base na avaliação de proteínas, analise as sentenças a seguir: I- O método 2D-DIGE (eletroforese de fluorescência diferencial em gel 2D) tornou possível a avaliação concomitante das proteínas presentes em duas ou mais amostras, executando as corridas no mesmo gel. II- O método clássico para a avaliação de proteínas consiste na aplicação da técnica de eletroforese bidimensional em gel de acrilamida (2DE), o qual se aplica para a análise da expressão diferencial das Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce 08/12/2021 10:38 3/4 proteínas entre duas amostras distintas. III- Os métodos 2DE e 2D-DIGE são muito eficientes e são capazes de identificar a sequência de aminoácidos que compõem uma proteína. Assinale a alternativa CORRETA: A ) Somente a sentença II está correta. B ) Somente a sentença I está correta. C ) As sentenças I e II estão corretas. D ) As sentenças I e III estão corretas. 8 - Conhecendo estes conceitos básicos e sabendo que o processo de recombinação gênica que acontece na meiose é um processo ordenado em eucariotos, é possível inferir a frequência em que essa recombinação ocorre para cada um dos genes e, assim, determinar sua posição relativa no cromossomo. Sobre a recombinação cromossômica, avalie as asserções a seguir e a relação proposta entre elas: I- Genes heterozigotos não geram nova conformação de alelo, uma vez que ambos os alelos são iguais. PORQUE II- Genes homozigotos apresentam dois genes que podem se apresentar como dominantes ou recessivos. Assinale a alternativa CORRETA: A ) As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justificativa da I. B ) A asserção I é uma proposição falsa, e a II é uma proposição verdadeira. C ) As asserções I e II são proposições falsas. D ) As asserções I e II são proposições verdadeiras, e a II é uma justificativa da I. 9 - A determinação da região de um gene no cromossomo pode ser realizada pela técnica de eletroforese em gel de campo pulsado.Sobre essa técnica, assinale a alternativa CORRETA: A ) Essa técnica é utilizada para detecção de grandes cromossomos somente, pois os pequenos cromossomos não conseguem ser isolados nas bandas do gel. B ) Essa técnica identifica a presença ou não de DNA na amostra, não sendo possível indicar sua localização. C ) O campo pulsado se deve à corrente elétrica que se alterna perpendicularmente ao gel. D ) O campo pulsado se deve à correte elétrica comum aplicada à eletroforese em gel. 10 - Uma das descobertas mais intrigantes do projeto genoma humano foi identificar que somente uma pequena porcentagem de todo genoma codificava uma proteína. Com base nas sequências codificadoras e não codificadoras de proteínas, analise as sentenças a seguir: I- Sequências codificadoras são chamadas de éxons e são responsáveis por originar sequências de aminoácidos específicas, que corresponde a uma proteína. II- Sequências não codificadoras são denominadas de íntrons, não tendo função conhecida no genoma humano. III- Sequências reguladoras são aquelas denominadas como éxons, regulando quando e quanto de um gene será expresso. Assinale a alternativa CORRETA: A ) As sentenças I e II estão corretas. B ) As sentenças II e III estão corretas. C ) Somente a sentença II está correta. D ) Somente a sentença III está correta. Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce Hurã'Santos Realce 08/12/2021 10:38 4/4
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