aol 3 quimica medicinal avançada

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1. Pergunta 1
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A aplicação da técnica por homologia em estudos e predição de compostos bioativos se desenvolve a partir do uso de ferramentas computacionais para determinação de estruturas 3D de proteínas. Em que ponto esse método é baseado para justificar essa denominação?
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1. 
Na função de cada proteína
2. 
Em propriedades físico-químicas da micromolécula
3. 
Em confluência de dados parametrizados
4. 
Em função da densidade eletrônica
5. 
Na similaridade entre moléculas proteicas
Resposta correta
2. Pergunta 2
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A complexidade da estrutura proteica depende do tipo e da quantidade de aminoácidos constituintes. Existem proteínas constituídas por uma única cadeia polipeptídica, já outras podem ser constituídas por duas ou mais cadeias polipeptídicas. Quando essas cadeias são idênticas, a proteína é dita oligomérica, e as subunidades são chamadas de protômeros. Dois fatores limitam o tamanho da proteína, assinale a alternativa que apresente um fator que embora ocorra em baixa quantidade pode representar um problema complicado na síntese de proteínas grandes.
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1. 
A capacidade genética da célula
2. 
A frequência de erros durante a síntese
Resposta correta
3. 
O percentual de aminoácidos aromáticos
4. 
A fonte de informações biológicas para a síntese
5. 
A precisão da síntese proteica
3. Pergunta 3
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O formato PDB permite armazenamento de informações sobre a técnica experimental usada para determinação da estrutura, detalhes sobre a macromolécula, origem, fonte, forma de obtenção, referências dos artigos relacionados à estrutura depositada e as coordenadas atômicas, devido a qual característica das listadas abaixo?
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1. 
Capacidade de restringir informações
2. 
Pela flexibilidade do formato
3. 
Por ser o mais utilizado
4. 
Por ser rígido
Resposta correta
5. 
Domínio público
4. Pergunta 4
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Para que se possa descobrir e estudar a forma como atua um fármaco no organismo, é necessário conhecer também a estrutura da macromolécula receptora que se constitui no alvo farmacológico. Qual é a estratégia ‘in silico’ mais utilizada para esse estudo atualmente?
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1. 
PDB
2. 
SBDD
Resposta correta
3. 
LBDD
4. 
ISIS
5. 
CADD
5. Pergunta 5
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A complementariedade, na interação fármaco-receptor, foi explicada por vários modelos, hoje sendo compreendida por meio das propriedades interativas características da estrutura molecular da micromolécula que definem o grau de afinidade pela molécula receptora e o percentual de resposta que determinará as condições para que a resposta terapêutica esperada aconteça. Assinale abaixo a alternativa que indica o fenômeno responsável para que os grupamentos funcionais e as propriedades estruturais do fármaco exerçam a complementariedade no sítio receptor da macromolécula.
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1. 
A estereoespecificidade da molécula bioativa
Resposta correta
2. 
A natureza química da molécula receptora
3. 
Os ângulos de torção do fármaco
4. 
A natureza química do fármaco
5. 
O pH do meio reacional
6. Pergunta 6
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O enovelamento da proteína será definido pelos ângulos de torção anteriores e posteriores ao carbono central (o alfa) na cadeia peptídica, sendo de fundamental importância o programa identificar esses ângulos. Qual das alternativas aponta a contribuição do Diagrama de Ramachandran para a identificação dos ângulos de torção.
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1. 
A disponibilidade de informações de ângulos diedros
2. 
O cálculo angular
3. 
A esquematização em gráficos para cada resíduo de aminoácido
Resposta correta
4. 
O sistema facilitado de diagramação
5. 
A facilidade de decodificação do diagrama
7. Pergunta 7
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Avançando-se para o processo de otimização e visualização da molécula proposta, ainda que tenham sido utilizados programas que atenderam à qualidade pretendida, frequentemente se faz necessário usar recursos de minimização de energia e análise conformacional interativamente para otimizar essa molécula. Assinale, entre as alternativas abaixo, aquela que justifica esse procedimento.
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1. 
A incapacidade do programa em gerar figuras
2. 
Instabilidade do banco de dados
3. 
Ambiguidade de geometrias para as moléculas geradas
4. 
Distorções frequentes na estrutura da molécula gerada
Resposta correta
5. 
O desconhecimento da estrutura tridimensional
8. Pergunta 8
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Dentre as inúmeras contribuições que a interdisciplinaridade constituída pela Química e a Informática, certamente a mais significativa tem sido o suporte tecnológico para a compreensão dos problemas da química experimental. Em ‘quimioinformática destaca-se a importância do uso de descritores moleculares para a representação de uma estrutura química. Qual seria a maior vantagem, em relação a outros métodos, com o uso desses descritores?
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1. 
A aplicação de similaridade química
2. 
Aumento da capacidade de incorporar informações
Resposta correta
3. 
A possibilidade de representação tridimensional
4. 
A demonstração da disposição dos átomos envolvidos
5. 
O suporte de informações relevantes
9. Pergunta 9
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Em modelagem Molecular de Proteínas existe a opção de se empregar um método muito eficiente para a análise da complementariedade e efetividade no processo de interação entre o fármaco e a proteína receptora, trata-se da ‘docagem molecular’. Aponte, entre as alternativas abaixo, aquela que revela a principal vantagem desse método, em relação ao tempo de acoplamento.
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1. 
Apresenta igual tempo computacional às demais técnicas
2. 
A vantagem consiste na rapidez dos cálculos paramétricos
3. 
O tempo computacional não interfere nesse caso
4. 
Apresenta menor tempo computacional que as demais técnicas
Resposta correta
5. 
A vantagem consiste na obtenção da estrutura 3D do receptor
10. Pergunta 10
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Em uma situação real na qual o pesquisador precisa escolher a melhor estratégia, em termos da química computacional, para iniciar o processo de modelagem, qual seria o um dos pontos fundamentais a serem considerados, em relação à infraestrutura?
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1. 
Custo computacional
2. 
Quantidade de máquinas
Resposta correta
3. 
Tamanho do sistema a ser estudado
4. 
Especificação de métodos para a extração de características
5.