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FUNDAMENTOS DA BIOQUÍMICA Profa. Cristina Belchior, M.D. Bioquímica Descreve ao nível molecular as estruturas, mecanismos e processos químicos presentes em todos os seres vivos Fundamentos essenciais ao entendimento da bioquímica • Celular • Químico • Físico • Genético O estudo da bioquímica mostra como o conjunto de moléculas inanimadas, que constitui os organismos vivos, interage para manter e perpertuar a vida, exclusivamente, pelas leis físicas e químicas que regem o universo inanimado. Fundamentos celulares • Membrana citoplasmática • Citosol – metabólitos, coenzimas, íons inorgânicos, enzimas e genes dentro de um nucleóide (procariota) ou núcleo (eucariota) • Organismos fototróficos X chemiotróficos • Bactérias X Eucariotas • Complexos supramoleculares Níveis celulares Macromoléculas • Biomoléculas de alto peso molecular • Estrutura quimica complexa • Formadas a partir de unidades fundamentais Macromolecula Un. fundamental % peso celular Função Proteinas Aminoácidos 15 Estrutural e metabólica Carboidratos Monossacarídeos 3 Energ ia , es t ru tu ra l , reconhecimento celular Lipídios Ácidos graxos 2 A rmazenamen to de energia, estrutura de membranas Ácidos Nucleicos Nucleotídeos 7 A r m a z e n a m e n t o e t r a n s m i s s a o d a informacao genetica Classes de biomoléculas Simplicidade no complexo: ü Existem somente 4 classe de macromoléculas na bioquímica cada uma formada por seu respectivo conjunto de blocos construtivos Proteínas Polissacarídeos Ácidos nucléicos Lipídeos UNIDADE CONSTITUINTE (TIJOLO) O O- N O H H OH H H O O O O O O EXEMPLO insulina RNA (ácido ribonucléico) celulose Triacil glicerol (banha) CLASSE Amino ácido nucleotídeo açúcar Ácido graxo (também glicerol e outros componentes) Fundamentos Químicos • Ligações carbono-carbono (C-C), grupos funcionais • Estruturas lineares X tridimensionais X função • Configuração X Conformação Formação da ligação covalente Ligações covalentes simples, dupla e tripla Moléculas, Compostos químicos. Molécula. Dois ou mais átomos ligados entre si através de ligação química covalente formam uma molécula. Ex.: H2O O2 , C6H12O6, Compostos químicos. Substâncias constituídas por um único tipo de molécula são denominadas compostos, como por exemplo o cloreto de sódio, que é formado por átomos de sódio e cloro. Compostos químicos Compostos orgânicos. são formados por moléculas que apresentam carbono na sua composição, normalmente, fazendo ligação covalente com o oxigênio, nitrogênio, enxofre e fósforo. Todas as biomoléculas são compostos orgânicos. Ex.: C6H12O6, Compostos inorgânicos. As moléculas que não apresentam carbono são denominadas compostos inorgânicos. Como exemplo temos: HCl, H2SO4, HNO3, etc. ABC da bioquímica Grupos funcionais presentes nas biomoléculas Hidrocarbonetos Grupamentos contendo oxigênio Grupamentos contendo nitrogênio Grupamentos contendo enxofre Grupamentos contendo fosfato Grupos funcionais presentes nas biomoléculas (cont.) Funcionalidade nos sistemas biológicos Nos sistemas biológicos tudo tem função desde membros, órgãos e tecidos Olhosàvisão Pernasàlocomoção Intestinoàdigestão Isso também é verdade ao nível celular Eritrócitos (hemácias, células vermelhas do sangue)àtransporte de O2 Neurôniosàsinalização e processamento nervoso E também é verdade no nível molecular. Tanto para moléculas como para vias metabólicas Anticorpos(proteínas) Enzimas(proteínas) Glicose Via glicolítica Via da biossíntese de glicogênio Compreender a função de cada sistema bioquímico é muito importante porque só assim é possível saber porque, afinal de contas, ele existe e como ele interage com outros sistemas cada um com sua função àResposta imune àCatálise àCombustível biológico àObtenção de energia pela oxidação da glicose àArmazenamento de combustível na forma de glicogênio Macromoléculas biológicas Macromolécula Polimerização Unidade construtiva Característica notável OBS Proteínas Polímero linear Aminoácido Catálise Muitas funções Extremamente versátil quanto à forma e à função Ácidos nucléicos Polímero linear Nucleotídeo Auto replicação Polissacarídeos Polímero linear/ ramificado Monos- sacarídeos Usado como § Reserva de energia § Estruturas muito resistentes A celulose á a biomolécula mais abundante na Terra Lipídeos Não são polímeros Ácido graxo e outros Forma membranas Muito variados quanto as unidades constitutivas Composição percentual de biomoléculas em uma célula bacteriana % do peso total Número de moléculas deste tipo Água 70 1 Proteínas 15 3.000 Ácidos nucléicos DNA 1 1 RNA 6 >3.000 Polissacarídeos 3 ~5 Lipídeos 2 ~20 Monômeros e intermediários 2 ~500 Íon inorgânicos (Ca2+, Na+, K+, PO42-...) 1 ~20 % do peso seco 50 3,3 20 10 6,6 6,6 3,3 Hierarquia estrutural na organização molecular da célula Célula Organelas Macromoléculas Unidades Monoméricas Nível 4 Nível 3 Nível 2 Nível 1 Poucos dos 112 elementos são utilizados nos organismos vivos H + O > 70% H+O+C>95% H+O+C+P>98% macroelementos Microelementos (oligoelementos) Bactéria que se alimenta de arsênio Cientistas norte-americanos descobrem bactéria que se alimenta de arsênio, elemento considerado altamente tóxico, em substituição a outro que seria essencial à sua condição de ser vivo. Publicado em 02/12/2010 | Atualizado em 08/12/2010 ü “A vida como nós a conhecemos exige elementos químicos específicos e exclui outros”, afirma um dos autores do artigo, Ariel Anbar ü Esse é o primeiro caso em que um microrganismo é capaz de substituir algum dos seis elementos essenciais à vida (carbono, hidrogênio, nitrogênio, oxigênio, enxofre e fósforo). ü De acordo com os pesquisadores, as bactérias são capazes de incorporar esse novo elemento ao próprio DNA. O lago em que foi encontrada a nova bactéria é conhecido por ser altamente salino e ter altas concentrações de arsênio http://cienciahoje.uol.com.br/noticias 99,4% 0,6% Composição percentual elementar do corpo humano macroelementos microelementos (oligoelementos) Tanto os macroelementos como os oligoelementos são igualmente essenciais à vida!!! Abundância relativa dos elementos (%) Crosta Terrestre Corpo Humano O 47,0 H 63,0 Si 28,0 O 25,5 Al 7,9 C 9,5 Fe 4,5 N 1,4 Ca 3,5 Ca 0,31 Na 2,5 P 0,22 K 2,5 Cl 0,08 Mg 2,2 K 0,06 Ti 0,46 S 0,05 H 0,22 Na 0,03 C 0,19 Mg 0,01 alanina (aminoácido) glicose 0,5nm 89Da 0,7nm 180Da 3,5nm Mioglobina (uma proteína pequena) 16.900Da Fosfolipídeo 750Da Escala de tamanho em bioquímica Escala de tamanho das estruturas biológicas Metro (m) 100 metro Milímetro (mm) 10-3 metro Micrômetro (µm) 10-6 metro Nanômetro (nm) 10-9 metro alanina (0,5nm) glicose 0,7nm Vírus do mosaico do tabaco 300nm Mitocôndria 1,5µm Hemácia 9µm Humano 1,7 m Hemoglobina 6,8nm Célula do fígado 20µm Vírus ΦX-174 25nm Origem das biomoléculas Aparelho para demonstrar a abiótica formação de biomoléculas simulando as condições da atmosfera primitiva Mistura de NH3 (amônia) H2(hidrogênio) CH4 (metano) e água 80oC Ce nt el ha s Condensador Eletrodos Compostos produzidos neste experimento ü Glicina (aminoácido) ü Alanina (aminoácido) ü Acido α-aminobutírico ü N-metil alanina ü Ác. Aspártico (aminoácido) ü Ác. glutâmico (aminoácido) ü Ác. Acético ü Ác succínico (intermediário do ciclo de Krebs) ü Uréia ...muitos outros Um esquema possível para a evolução molecular Surgimento do genoma de DNA Desenvolvimentode um sistema de tradução primitivo. Genoma de RNA e catalizadores RNA-Proteína Co-evolução do RNA e das proteínas Síntese de peptídeos catalizada por RNA Surgimento de moléculas de RNA com atividade catalítica auto-replicativa Produção de pequenas moléculas de RNA com seqüências aleatórias “Sopa” pré-biótica contendo diversas biomoléculas originadas de precursores na atmosfera primitiva 4,5 Bilhões de anos Surgimento da Terra 3,5 Bilhões de anos Primeiro microorganismo fóssil 4,0 Bilhões de anos Formação dos oceanos e continentes Carbono - estrutura Carbono - estrutura Isomeria Cis-Trans Isomeria Cis-Trans Isomeria espacial Estereoisômeros Isomeria Fórmulas de projeção de Fisher Fórmulas de perspectiva Fundamentos Físicos • Reação química • ΔG • Equilibrio Fundamentos Genéticos • Informação genética • Replicação • Seqüência linear DNA X função protéica • Montagem espontânea em complexos macromoleculares QUESTÕES PARA DISCUSSÃO 1. O que faz o átomo de carbono ser tāo especial e eleito majoritário nos organismos vivos 2. Existe diferença, quanto aos constituintes químicos, entre os seres humanos? 3. Diferencie: molécula, composto químico, compostos organicos e inorganicos. 4. Quais as classes das biomoléculas? 5. Qual a hierarquia estrutural na organização molecular da célula?
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