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1 UNI-ANHANGUERA CENTRO UNIVERSITÁRIO DE GOIÁS PRO-REITORIA DE GRADUAÇÃO GABARITO - ESTUDO DIRIGIDO SOBRE AMINOÁCIDOS e PROTEÍNAS 1. Escrever a estrutura geral dos aminoácidos, indicando as características estruturais comuns a todos e o radical responsável pela identidade de cada aminoácido. R. H H3N– C – COO - R Aminoácidos são os blocos construtores ou unidades monoméricas das proteínas. Todos os 20 -aminoácidos encontrados nas proteínas possuem a fórmula geral apresentada acima. Atualmente, a selenocisteína é reconhecido como aminoácido natural e, portanto, o 21º aminoácido encontrado nas proteínas. Os aminoácidos diferem entre si pela estrutura da cadeia lateral (grupamento R). Em geral, o grupo carboxila e o grupo amino se dissociam reversivelmente (eletrólitos fracos), cuja força como ácido ou base é indicada pelos valores de pK. 2. Classificar os cinco grupos de aminoácidos com base na polaridade e na carga (em pH 7,0) dos seus grupos R, dando exemplo de aminoácido(s) (nome e estrutura química) de cada classe. R. AMINOÁCIDOS APOLARES com cadeia alifática = Ex: alanina, valina, leucina, isoleucina. com cadeia aromática = Ex: fenilalanina, tirosina. AMINOÁCIDOS POLARES não carregados = Ex: serina, treonina, asparagina, glutamina. carregados positivamente = Ex: lisina, arginina, histidina. 1972 - + Grupo -carboxila Grupo -amínico Grupamento R ou cadeia lateral C - átomo de carbono assimétrico (ligado a quatro grupos diferentes) 2 carregados negativamente = Ex: ácido aspártico, ácido glutâmico Obs 1: A importância dessa classificação reside no fato de que as propriedades das cadeias laterais definem a conformação das proteínas e, portanto, sua função biológica. Obs 2: A característica de uma substância ser polar relaciona-se diretamente com a tendência da mesma interagir com a água em pH biológico (pH=7) 3. Os aminoácidos ligam-se uns aos outros por meio de que tipo de ligação? R. Duas moléculas de aminoácidos podem estar de forma covalentemente unidas por meio de uma ligação amida substituída, chamada de ligação peptídica, para produzir um dipeptídeo. Tal ligação é formada pela remoção de uma molécula da água (desidratação) de um grupo - carboxila de um aminoácido e um grupo -amino do outro. 4. Conceituar proteína, descrevendo suas principais funções celulares. R – São macromoléculas compostas de uma ou mais cadeias polipeptídicas, em que cada cadeia possui uma seqüência característica de aminoácidos unidos por ligações peptídicas. Suas principais funções são: (a) enzimas: grupo de proteínas mais variado e mais altamente especializado, exibe atividade catalítica e possui alta especificidade. (b) transportadoras: proteínas que transportam grupos específicos de moléculas, como o oxigênio, aminoácidos, lipídeos, glicose etc. (c) armazenamento de energia/nutrientes: proteínas nutrientes necessárias para desencadear o crescimento e desenvolvimento do ser vivo, como a ovalbumina, principal proteína da clara do ovo; caseína, principal proteína do leite; ferritina, principal proteína armazenadora do átomo de ferro. (d) contráteis ou de motilidade: proteínas que habilitam a célula e organismos com a capacidade de contraírem-se, de mudarem de forma, ou de se deslocarem no meio ambiente; actina e miosina funcionam no sistema contrátil do músculo esquelético e também em muitas células não musculares. (e) estruturais: proteínas que servem 3 como filamentos de suporte, cabos ou lâminas para fornecer proteção ou resistência as estruturas biológicas, como exemplos o colágeno, elastina, queratina. (f) de defesa: proteínas que defendem os organismos contra a invasão de outras espécies ou os protegem de ferimentos; como exemplos a imunoglobulina, o fibrinogênio e a trombina. (g) reguladoras: proteínas que auxiliam a regular a atividade celular ou fisiológica, como os hormônios. (h) exóticas: proteínas cujas funções são de difícil classificação, uma vez que realizam funções atípicas como a monelina que é uma proteína de uma planta africana com características de um sabor intensamente doce. Outro exemplo é a proteína de alguns peixes da Antártica com características anticongelantes, cuja função é proteger do congelamento o sangue desses animais. 5. Citar os quatro níveis de estrutura protéica, descrevendo a principal característica de cada nível estrutural. R - Estruturas primária, secundária, terciária e quaternária. Estrutura primária: consiste de uma seqüência de aminoácidos unidos por ligações peptídicas e inclui quaisquer ligações dissulfeto. Estrutura secundária: refere-se a arranjos particularmente estáveis de resíduos de aminoácidos dando origem a padrões estruturais recorrentes. Estrutura terciária: descreve todos os aspectos do enovelamento de um polipetídeo sob vários eixos Estrutura quaternária: é o arranjo no espaço de uma proteína que possui duas ou mais subunidades polipeptídicas. 6. Descreva as principais características da estrutura secundária -hélice. Dê exemplos de proteínas contendo essa estrutura. R- -hélice caracteriza-se por arranjos regulares e recorrentes no espaço de resíduos de aminoácidos adjacentes em uma cadeia polipeptídica, cujos grupos R (cadeia lateral) dos resíduos dos aminoácidos projetam-se para fora do esqueleto helicoidal. Essa estrutura secundária estabiliza-se por pontes de hidrogênio intracadeia, ou seja, pontes de hidrogênio entre o N do grupo –NH de um resíduo aminoacídico e o O do grupo –C=O de outro resíduo, constituintes das unidades peptídicas, além das ligações peptídicas propriamente ditas. Caso as cadeias polipeptídicas próximas contenham o aminoácido cisteína, pontes de enxofre podem ocorrer entre dois resíduos de cisteína, que passam a ser denominada cistina. Distinguem-se das demais de sua classe porque distendem frente ao calor. Proteínas que possuem essa estrutura são: -queratina do cabelo, unha, pena de aves, chifre etc. 4 7. Descreva as principais características da estrutura secundária - conformação . Dê exemplos de proteínas contendo essa estrutura. R - Conformação organiza as cadeias polipeptídicas em folhas, a qual caracteriza-se por arranjos regulares e recorrentes no espaço de resíduos de aminoácidos adjacentes em cadeias polipeptídicas, cujos principais aminoácidos constituintes são aminoácidos com pequenas cadeias laterais como a glicina, alanina e serina. Essa estrutura secundária estabiliza-se por pontes de hidrogênio intercadeia (entre as cadeias), além das ligações peptídicas propriamente ditas. Não possuem o aminoácido cisteína, portanto, não há pontes de enxofre entre suas cadeias. As cadeias polipeptídicas estão estendidas em zigue-zague e, portanto, não ocorre distensão quando aquecidas. Nesta conformação, as cadeias polipeptídicas podem ser paralelas (tendo todas as cadeias a mesma orientação: amino terminal para carboxila terminal) ou anti-paralelas (tendo as cadeias orientação amino terminal para carboxila terminal opostas entre si). Proteínas que possuem essa estrutura são: -queratina da teia de aranha, das escamas de peixe e das conchas. 8. Descreva as principais características das estruturas terciária e quaternária. Dê exemplos de proteínas contendo cada estrutura mencionada anteriormente. R - São proteínas que apresentam suas cadeias polipeptídicas enoveladas em vários eixos, possuem estrutura esférica e compacta e são solúveis em água. As forças intermoleculares que estabilizam essa estrutura são: ligações peptídicas, pontes de hidrogênio, interações hidrofóbicas, interações eletrostáticas e pontes de enxofre. Vários tipos diferentes de estrutura secundária são freqüentementeencontrados no interior da estrutura tridimensional de uma proteína que possui estrutura terciária. Estrutura quaternária é a estrutura de proteínas que contêm várias cadeias polipeptídicas ou subunidades separadas, as quais entre si podem ser iguais ou diferentes em estrutura. Essa estrutura especifica a relação espacial dos polipeptídeos ou subunidades no interior de uma proteína oligomérica. As interações entre as subunidades são guiadas e estabilizadas pelas mesmas forças que mantêm e estabilizam a estrutura terciária. Enquanto a estrutura secundária da cadeia polipeptídica é determinada pelo relacionamento estrutural de curta distância dos aminoácidos, a estrutura terciária e quaternária é conferida pelas interações entre os aminoácidos situados a longas distâncias entre si, dentro da seqüência primária. Os aminoácidos que estão muito longe uns dos outros na seqüência polipeptídica e 5 situam-se em diferentes tipos de estrutura secundária podem interagir quando a proteína é enovelada 9. As proteínas podem ser classificadas com base nos níveis estruturais mais complexos em proteínas fibrosas e proteínas globulares. Descreva a definição de cada uma delas e suas principais características e funções. R - Proteínas fibrosas são proteínas que possuem cadeias polipeptídicas arranjadas em longos filamentos ou folhas. Essas proteínas consistem, em grande parte, de um tipo único de estrutura secundária e desempenham papéis estruturais importantes na anatomia e na fisiologia dos organismos vivos, fornecendo proteção externa, suporte e forma. Proteínas globulares são proteínas que possuem cadeias polipeptídicas enoveladas em uma forma esférica ou globular com alta solubilidade em água. Essas proteínas tendem a ser estruturalmente complexas, contendo, em geral, vários tipos de estrutura secundária. A maior parte das enzimas e dos hormônios peptídicos são proteínas globulares. 10. O que são proteínas simples e proteínas conjugadas? R - Proteínas simples são proteínas constituídas apenas por aminoácidos. Enquanto proteínas conjugadas são proteínas que contêm além de aminoácidos outros componentes químicos. 11. Definir grupo prostético de uma proteína. R - Grupo prostético é a parte não aminoacídica de uma proteína conjugada. 12. Classificar as proteínas conjugadas com base na natureza química dos seus grupos prostéticos. Exemplificar cada tipo de proteína conjugada. R- Classe Grupos prostético Exemplo Lipoproteínas Lipídeos 1-lipoproteína do sangue Glicoproteínas carboidratos Imunoglobulina G fosfoproteínas Fosfato Caseína do leite flavoproteínas Nucleotídeos de flavina Succinato desidrogenase metaloproteínas Íon metálico: ferro Ferritina Íon metálico: cálcio Calmodulina Íon metálico: cobre plastocianina Hemeproteínas Heme (ferro porfirina) hemoglobina 6 13. O que significa o termo “proteínas nativas”? R - Significa que são proteínas com a conformação original, ou seja, da forma que foram sintetizadas e processadas no retículo endoplasmático rugoso. A conformação nativa capacita as proteínas a desempenharem suas funções biológicas. 14. Quais as forças que atuam nas estruturas apresentadas pelas proteínas fibrosas e pelas proteínas globulares? R - Proteínas fibrosas: ligação peptídica, pontes de hidrogênio e pontes de enxofre (-hélice). Proteínas globulares: ligação peptídica, pontes de hidrogênio, pontes de enxofre, interações hidrofóbicas e interações eletrostáticas. 15. Dê exemplos de proteínas fibrosas e de proteínas globulares. R- Proteínas fibrosas: α – queratinas, β- queratinas, colágeno, elastina, tubulina. Proteínas globulares: enzimas, hormônios peptídicos, proteínas de armazenamento. 16. O que são α – queratinas? Dar exemplos. R - São proteínas com estrutura helicoidal simples e constituem quase que todo o peso seco dos cabelos, lã, penas, unhas, chifres, cascos, carapaças de tartaruga, camada externa da pele. Essas proteínas compartilham propriedades que dão resistência e/ou elasticidade às estruturas anatômicas nas quais elas ocorrem. Elas possuem estruturas moleculares relativamente simples e são todas insolúveis em água, uma propriedade que lhes é conferida pela grande concentração de aminoácidos hidrofóbicos, quer no interior da proteína quer na superfície. α – queratinas são ricas nos resíduos hidrofóbicos dos aminoácidos fenilalanina, isoleucina, valina, metionina e alanina. 17. O que são β- queratinas? R- São proteínas com estrutura tipo folha β pregueada e constituem quase que todo o peso seco da fibroína da seda e da proteína constituinte dos fios da teia de aranha. Essas proteínas compartilham propriedades que dão resistência e/ou elasticidade às estruturas anatômicas nas quais elas ocorrem. Elas possuem estruturas moleculares relativamente simples e são todas insolúveis em água, uma propriedade que lhes é conferida pela grande concentração de aminoácidos hidrofóbicos, como a glicina e alanina. 7 18. Quais as forças que estabilizam a estrutura terciária de proteínas globulares? R - Ligação peptídica, pontes de hidrogênio, pontes de enxofre, interações hidrofóbicas e interações eletrostáticas. 19. Definir desnaturação de uma proteína. R - Desnaturação é a perda total da estrutura tridimensional que está quase invariavelmente associada a perda de sua função. Nesse processo há rompimento das interações não covalentes (pontes de hidrogênio, interações hidrofóbicas, interações eletrostática) e da ligação covalente pontes de enxofre; porém não há quebra das ligações peptídicas. 20. Citar os fatores que causam desnaturação de uma proteína. R - Fator físico como temperatura e fatores químicos com pH, solventes orgânicos: etanol, acetona, ureia e detergentes.
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