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Ácidos nucleicos e síntese de proteínas Aula 7 – Bioquímica Estrutura do DNA DNA é composto por 4 moléculas básicas chamadas nucleotídeos. Cada nucleotídeo é formado por 3 unidades: Uma pentose chamada desoxiribose Um grupamento fosfato Uma base nitrogenada Base nitrogenada Desoxiribose fosfato Estrutura do DNA A diferença entre os 4 nucleotídeos está na composição das bases nitrogenadas. As bases nitrogenadas podem ser de dois tipos: Púricas: Apresentam duas cadeias cíclicas de carbono. Representadas pela Adenina e Guanina Pirimídicas: Apresentam apenas uma cadeia cíclica de carbono Representadas pela Timina e citosina Estrutura do DNA Ligação fosfodiéster Os nucleotídeos livres apresentam 3 grupos fosfato Os nucleotídeos se ligam uns aos outros para formar as fitas de DNA através de ligações fosfodiéster A quebra da ligação entre os grupos fosfatos gera energia para a reação A ligação ocorre entre o grupo fosfato α (ligado ao carbono 5’ da pentose) e o grupo OH (hidroxila) do carbono 3’ da outra molécula Ligação fosfodiéster Estrutura do DNA O DNA está dispostos na forma de uma dupla fita helicoidal As fitas mantém pareadas por pontes de H As fitas devem estar num arranjo antiparalelo para formação das pontes de H Estrutura do DNA Sulco menor Sulco maior DNA em cromossomos DNA em cromossomos Estrutura do RNA Ribonucleotídeos são as unidades formadoras do RNA. São formadas por três unidades: Uma base nitrogenada Pode ser de 4 tipos (adenina, guanina, citosina e uracila) Uma pentose chamada ribose Um grupamento fosfato RNAs informacionais e funcionais RNAs informacionais São os RNAs mensageiros (mRNAs) São cópias dos segmentos funcionais do DNA (genes) Nos eucariotos o transcrito primário passa por 3 processamentos Adição do CAP Adição da cauda poli-A Splicing ou remoção de íntrons RNAs informacionais e funcionais RNAs funcionais São os RNAs que nunca são traduzidos em proteínas Podem ser de 5 tipos: RNA transportador (tRNA) RNA ribossômico (rRNA) RNA nuclear pequeno (snRNA) RNA citoplasmático pequeno (scRNA) RNA de interferência (RNAi) Os procariotos apresentam apenas o tRNA e o rRNA, enquanto que os eucariotos apresentam os 5 tipos. Funções dos RNAs funcionais tRNA: Transportam os aminoácidos até os ribossomos no processo de tradução rRNA: Combinam-se com diversas proteínas para formar os ribossomos snRNA: Combinam-se com diversas proteínas para formar ribonucleoproteínas (snRNA) que atuam no processo de splicing scRNA: Dirigem o tráfego de proteínas dentro da célula RNAi: Atuam no processo de regulação pós-transcricional (degrada mRNAs) Síntese de proteínas Transcrição A transcrição sempre se inicia em pontos específicos do cromossomo (regiões promotoras) Os promotores são reconhecidos por proteínas chamadas fatores de transcrição Os fatores de transcrição auxiliam a RNA polimerase iniciar a transcrição Transcrição Apenas uma das fitas de DNA é utilizada como molde para confecção do mRNA A RNA polimerase cataliza a reação de ligação fosfodiéster entre um ribonucleotídeo livre e último da cadeia. Transcrição O mRNA passa por 3 processamentos antes de ser traduzido: Splicing alternativo Tradução A ordem dos aminoácidos na cadeia é dependente da informação contida na molécula de mRNA. O processo de síntese de proteínas baseado na decodificação da informação contida em sequencias de bases do mRNA em sequencias de aminoácidos Este processo é chamado de tradução Tradução O processo de tradução é dependente de 5 fatores: Código genético Chave para a conversão da seqüência de nucleotídeos do mRNA em aminoácidos tRNA Adicionar transportar os aminoácidos da nova cadeia polipeptídica (baseado no código) Aminoacil sintetases Ligam os aminoácidos aos tRNAs de maneira específica Peptidil transferase Catalizam a ligação entre os aminoácidos (lig. peptídica) Ribossomos Responsáveis por reunir num único complexo todas as moléculas necessárias à síntese O código genético Características do código genético: Três bases codificam um aminoácido Estas três bases consecutivas do mRNA formam um códon O código não é superposto As bases do mRNA são lidas de 3 em 3. O código é polarizado A molécula de mRNA é lida a partir de uma única ponta O código é redundante Como existem 64 possibilidades (24) e apenas 20 tipos de aminoácidos Presença de códons finalizadores São códons que informam o final da montagem da cadeia. O código genético P ri m ei ra b as e d o c ó d o n ( m R N A ) Segunda base do códon (mRNA) Terceira b ase d o có d o n (m R N A ) RNA transportador Molecula de RNA que após sua formação assume a conformação de um trevo (dobrado em L), compondo 4 braços: Braço de ligação do aminoácido Braço com a alça do anticódon Braço da alça TΨC Braço da alça DHU Aminoacil sintetases O tRNA não reconhece o aminoácido a ser transportado. A função de ligar o aminoácido correto ao respectivo tRNA é realizada pela aminoacil sintetase. Ribossomos São organelas formadas por rRNA e proteínas. São compostos por 2 subunidades: subunidade maior e menor Os ribossomos de procariotos e eucariotos diferem em composição. Ribossomos Eles contém sítios específicos de ligação ao mRNA, tRNA e outras enzimas relacionadas ao processo de tradução. Existem três sítios de ligação ao tRNA: Sítio P (peptidil) Sítio de ligação do tRNA que carrega a cadeia em crescimento Sítio A (aminoacil) Sítio de ligação do tRNA que carrega o novo aminoácido a ser adicionado a cadeia Sítio E (exit) Sítio de liberação do tRNA Ribossomos Peptidil-transferase A ligação de adição de novos aminoácidos à cadeia é chamada de ligação peptídica. Esta reação ocorre no ribossomo quando a cadeia crescente está presa ao tRNA. Esta reação é catalizada pela peptidil transferase. Início da tradução Extensão da cadeia Término Poliribossomos Formação da proteína
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