Baixe o app para aproveitar ainda mais
Prévia do material em texto
Capítulo 4 • Estrutura e função das proteínas 161 aprender mais como as proteínas e enzimas exploram suas conformações únicas para desempenhar suas funções biológicas, nossa capacidade de produzir novas proteínas com funções úteis só tende a evoluir. Obviamente, para sermos capazes de estudar a atividade de proteínas mo- dificadas em organismos vivos – e sermos beneficiados por ela –, o DNA que codifica essas proteínas deve ser introduzido nas células de alguma maneira. No- vamente, graças às técnicas de engenharia genética, somos capazes de realizar essa tarefa. Discutimos esses métodos em mais detalhes no Capítulo 10. A relação evolutiva entre proteínas ajuda a predizer a sua estrutura e função Foi feito um enorme progresso no conhecimento da estrutura e da função de proteí- nas nos últimos 150 anos (ver Tabela 4-2, p. 159). Esses avanços são fruto de déca- das de pesquisas no isolamento de proteínas, desenvolvidas com o trabalho incan- sável de cientistas sobre proteínas, ou sobre famílias de proteínas, algumas vezes ao longo de toda a sua carreira. No futuro, no entanto, mais e mais estudos acerca da conformação e atividade de proteínas poderão ser realizados em grande escala. A evolução da capacidade de sequenciamento rápido de genomas comple- tos, e o desenvolvimento de métodos como a espectrometria de massas, am- pliaram a capacidade de determinação de sequências de aminoácidos para um gigantesco número de proteínas. Milhões de sequências únicas de proteínas para milhares de espécies distintas estão disponíveis em bancos de dados públicos, e espera-se que o número de dados dobre a cada dois anos. A comparação de se- quências de aminoácidos de todas essas proteínas revela que a maioria pertence a famílias de proteínas que compartilham “padrões de sequências” específicos – sequências de aminoácidos que se enovelam em domínios distintos. Em algumas dessas famílias, as proteínas contêm apenas um único domínio estrutural. Em outras, as proteínas possuem múltiplos domínios organizados em combinações inéditas (Figura 4-51). Embora o número de famílias com múltiplos domínios esteja crescendo ra- pidamente, a descoberta de novos domínios parece estar diminuindo. Essa dimi- nuição sugere que a grande maioria das proteínas pode apresentar um número limitado de domínios estruturais – talvez algo em torno de 10.000 a 20.000. Para diversas famílias compostas por um único domínio, a estrutura de pelo menos um membro da família é conhecida. O conhecimento da estrutura de um dos membros da família permite algumas inferências acerca das estruturas dos de- mais membros. Por essa razão, quase três quartos de todas as proteínas pre- sentes nos bancos de dados possuem alguma informação estrutural disponível (Animação 4.13). Objetivos futuros incluem o desenvolvimento da capacidade de deduzir a es- trutura de uma proteína a partir da sua sequência de aminoácidos e obter informa- ções acerca de sua função. Estamos perto de sermos capazes de predizer a estru- tura de uma proteína a partir de informações da sua sequência, mas ainda há um longo caminho a percorrer. Predições acerca do funcionamento de uma proteína individual, como parte de um complexo, ou como parte de uma via metabólica da célula, são mais difíceis. No entanto, conforme nos aproximamos destas respostas, mais perto estaremos de compreender as bases fundamentais da vida. (A) Famílias de proteínas compostas por um único domínio (B) Família de proteínas compostas por dois domínios Família 1 Família 2 Figura 4-50 Companhias de biotecno- logia produzem grandes quantidades de proteínas de aplicação prática. Na fotografia, são mostrados os fermenta- dores utilizados para o crescimento de célu- las necessárias à produção de proteínas em grande escala. (Cortesia de Bioengineering AG, Suíça.) Figura 4-51 A maioria das proteínas pertence a famílias relacionadas estru- turalmente. (A) Mais de dois terços de todas as proteínas bem caracterizadas contêm um único domínio estrutural. Os membros destas famílias de um único domínio podem apresentar diferentes sequências de aminoácidos, mas se enovelam em uma conformação similar. (B) Durante a evolução, domínios estru- turais foram combinados de diferentes maneiras para dar origem às famílias de múltiplos domínios. Quase toda a originalidade na estrutura de uma proteína é derivada do modo como esses domínios estão organizados. O número de famí- lias de múltiplos domínios adicionado aos bancos de dados ainda está aumen- tando rapidamente, ao contrário do número de famílias de único domínio. Alberts_04.indd 161Alberts_04.indd 161 16/01/2017 09:25:0616/01/2017 09:25:06
Compartilhar