bioinformatica pdf1

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08/11/2023, 00:13 Estácio: Alunos
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Exercício por
Temas
 avalie sua aprendizagem
Na era pós-moderna, com o advento e a consolidação da revolução robótica no século XX, foi possível aprimorar a
criação de tecnologias computacionais nas mais variadas áreas do conhecimento, o que tem provocado profundas
mudanças sociais em âmbito individual e coletivo. Nesse cenário, a bioinformática ou biocomputação surge na
década de 1980, a �m de superar as fronteiras das ciências pelo desenvolvimento de novas abordagens capazes de
promover a análise e a apresentação de dados biológicos, bem como de garantir a investigação de novos métodos
para a resolução de complexas perguntas.
Fonte: ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8. Sobre a
bioinformática analise as a�rmativas a seguir:
I. A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que combina diferentes disciplinas, com destaque para a
Estatística, biologia, química, informática e física.
II. A bioinformática possibilitou a interpretação da linguagem dos de genes por algoritmos.
III. Atualmente, os programas de computadores estão muito modernos, e é possível realizar todas grandes análises
de forma rápida e precisa, como prever a ligação de diferentes átomos em uma molécula.
É correto o que se a�rma em:
BIOINFORMÁTICA
Lupa  
 
SDE4449_202008692407_TEMAS
Aluno: ELAINE DA SILVA SANTOS Matr.: 202008692407
Disc.: BIOINFORMÁTICA  2023.3 FLEX (G) / EX
Prezado (a) Aluno(a),
Você fará agora seu EXERCÍCIO! Lembre-se que este exercício é opcional, mas não valerá ponto para sua avaliação. O
mesmo será composto de questões de múltipla escolha.
Após responde cada questão, você terá acesso ao gabarito comentado e/ou à explicação da mesma. Aproveite para se
familiarizar com este modelo de questões que será usado na sua AV e AVS.
03017 - INTRODUÇÃO À BIOINFORMÁTICA
 
1.
I e III.
I.
II.
III.
I e II.
Data Resp.: 08/11/2023 00:03:09
Explicação:
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:voltar();
javascript:diminui();
javascript:diminui();
javascript:aumenta();
javascript:aumenta();
08/11/2023, 00:13 Estácio: Alunos
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Nos organismos __________ a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está, as
___________ regulam essa compactação. A reação de _________ ocorre o maior enovelamento, já a reação de ____________
faz com que o DNA �que mais relaxado, possibilitando sua expressão. 
Desde a descoberta da estrutura do DNA e do desenvolvimento da biologia molecular, o homem vem buscando
novas alternativas que o auxiliem na busca por maior �uidez nos trabalhos de pesquisa, acelerando a geração de
processos e produtos. A bioinformática tem contribuído para avanços na pesquisa básica, mas também na ciência
aplicada (....).
Fonte: adaptado de ARAÚJO, N. D.; et al. A era da bioinformática. Estud Biol. 2008 jan/dez;30(70/71/72):143-8.
A seguir são listadas algumas aplicações da bioinformática.  Analise as a�rmativas a seguir:
I. Identi�cação de alvos proteicos com potencial para serem modi�cados diretamente pela interação com fármacos.
II. A identi�cação de moléculas que poderão atuar como princípio ativo na elaboração de produtos terapêuticos,
inibindo ou acelerando certas reações bioquímicas, poderá apresentar efeitos sobre a cura ou a atenuação da
doença.
III. Proporcionar melhor entendimento dos processos evolutivos e das relações �logenéticas.
IV. Ampli�cação do material genético para a veri�cação quantitativa e qualitativa de um determinado DNA em uma
amostra biológica. 
V. Identi�car a expressão gênica durante um tumor, identi�car suas alterações para que genes defeituosos,
ausentes ou superativados sejam reconstruídos ou desligados, para garantir o desenvolvimento de medidas
terapêuticas ou preventivas contra tumores e agentes infecciosos.
Assinale a opção correta.
Existem diversas ciências envolvidas com a bioinformática, que desfrutam do seu avanço, entretanto as áreas
mais intimamente ligadas de acordo com a questão 17 são: Estatística, biologia, química, informática e física.
Essa nova ciência permitiu que algoritmos fossem criados auxiliando na interpretação de genes, alinhamentos
dos genes, descobrir sequências e funções de genes desconhecidas. No entanto, ainda precisamos de programas
de computadores mais avançados, para por exemplo, analisar as dinâmicas moleculares (interação de átomos de
diferentes proteínas), mas complexas e mais longas.
 
2.
eucariotos / polimerases / acetilação / metilação
 eucariotos / histona / metilação / acetilação
procariotos / polimerase / metilação / acetilação
procariotos / histona / metilação /acetilação
 procariotos / polimerase /acetilação / metilação
Data Resp.: 08/11/2023 00:04:02
Explicação:
Nos organismos eucariotos a expressão de um determinado gene é dependente do quão enovelado o DNA está,
as histonas regulam essa compactação. A reação de metilação ocorre o maior enovelamento, já a reação de
acetilação faz com que o DNA �que mais relaxado, possibilitando sua expressão. Os organismos procariotos
apresentam outro tipo de regulação, como a presença do operon lac. As polimerases são enzimas responsáveis
enzima que catalisa a reação de polimerização de ácidos nucleicos a partir dos seus monômeros.
 
3.
Apenas I.
I, II e III.
I, II, III e V.
Apenas III e IV.
Apenas II.
Data Resp.: 08/11/2023 00:06:59
Explicação:
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(adaptada de IBADE - 2018 - Prefeitura de Presidente Kennedy - ES - Biólogo ) As informações genéticas nos seres
vivos são codi�cadas por bases nitrogenadas que constituem os ácidos nucléicos. Analise as sequências de
nucleotídeos a seguir.
Fita 1 - CCCTATACGCTAGCATGACTT
Fita 2 - GGGATATGCGATCGTACTGAA
A seguir são listadas algumas características sobre as �tas de nucleotídeo 1 e 2. Assinale a alternativa correta:
(ADAPTADA DE ENADE 2013- biomedicina)
Os mecanismos envolvidos na expressão e interação dos genes, assim como a compreensão das redes funcionais
estabelecidas pelas proteínas, fazem com que, no cenário cientí�co atual, a genômica e a proteômica estejam cada
vez mais em evidência. Quatro são os principais bancos de dados utilizados para as diferentes análises de
nucleotídeos. Um deles é o INSDC (INTERNATIONAL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE), que disponibiliza
um repertório de sequências e é resultado da associação de três bancos de dados parceiros, o DDBJ (DATA BANK
OF JAPAN), o EMBL (EMBL NUCLEOTIDE SEQUENCE DATABASE) e o GenBank. Devido à sua designação como
provedor de dados primários, EMBL/DDBJ/GenBak é fonte inicial de muitos bancos de dados em biologia
molecular. Como exemplos de bancos de dados de sequências genômicas secundárias, pode-se citar o Ensembl, o
RefSeq e o Genome Review, que representa uma versão da sequência original de um cromossomo ou plasmídeo,
com informações importadas de fontes que incluem o UniProt (UNIVERSAL PROTEIN RESOURCE), o Gene
Ontology (GO), o projeto GOA (GO ANNOTATION), o InterPro e o HoGenom, além de serem disponibilizadas
referências cruzadas com 18 bancos de dados.
Fonte: ESPINDOLA, F. S. et al. Recursos de bioinformática aplicados às ciências ômicas como genômica,
transcriptômica, proteômica, interatômica e metabolômica. Bioscience Journal, Uberlândia, v. 26, n. 3, p. 463-477,
Maio/Junho 2010 (adaptado).
I. As informações disponíveis nos bancos de dados de sequências possibilitam o desenvolvimento de pesquisas in
sílico (realizadas em programas de computador), dependendo dos métodos interpretativos e programas de análises
envolvidos.  
PORQUE
II. Os bancos de dados de sequências fornecem informações sobre diversos genes, que podem ser utilizadas de
forma rápida, independentemente do tipo de processamento.
A bioinformática é a ciência integra essencialmente o desenvolvimento de programas computacionais para
tratar dados biológicos preexistentes e identi�car sequênciasde genes, predizer a con�guração tridimensional
das proteínas, identi�car inibidores enzimáticos, promover o agrupamento de proteínas, estabelecer árvores
�logenéticas e analisar experimentos da expressão gênica. No entanto, ela não ampli�ca o DNA para a sua
detecção em uma amostra biológica, essa análise é realizada pela reação de polimerase da cadeia, que pode
apenas detectar a presença (qualitativa) ou então veri�car a concentração (quantitativa). As demais alternativas
estão corretas.
 
4.
Na �ta 1 e 2 existem 21 códons e 07 nucleotídeos
Se considerarmos a �ta 1 como a �la molde, o RNAm formado por esta sequência apresentará as mesmas
bases nitrogenadas da �ta 2.
As �tas 1 e 2 são complementares, formando juntas um segmento do DNA.
As �tas analisadas constituem um segmento de uma molécula de RNA.
Na �ta 1 existem 30 códons e 15 nucleotídeos.
Data Resp.: 08/11/2023 00:07:47
Explicação:
Tanto a sequência de nucleotídeos 1 e 2 apresentam 21 nucleotídeos e 7 códons (um códon equivale a 3
nucleotídeos). Como ambas as �tas apresentam as bases C, G, A e T elas são representativas do DNA e não do
RNA. Para ser uma �ta de RNA deveria apresentar as bases C, G, A e U. Além disso, se observarmos as �tas
vemos que 1 e 2 são complementares, ou seja, no lugar que temos uma base C na outra �ta equivale a G, e no
lugar que temos uma base A na outra �ta equivale a t e vice-versa, representando as duas �tas de DNA, que são
complementares entre si.
 
5.
08/11/2023, 00:13 Estácio: Alunos
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A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
A bioinformática é uma disciplina interdisciplinar que apresenta diferentes aplicabilidades e tem sido bastante
empregada para o desenvolvimento de novas metodologias de análise e garantindo diferentes avanços cientí�cos.
A seguir são listadas algumas técnicas da bioinformática. Assinale a alternativa que indica a técnica que tenta
prever a atividade biológica de um composto baseado em equações estatísticas.
A determinação da estrutura do Ácido Desoxirribonucléico foi um marco importante para a Biologia, esclarecendo
como a informação hereditária é codi�cada em sequências de nucleotídeos de DNA nas células. A respeito desse
tema, analise as alternativas a seguir:
I. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de segmentos relativamente curtos de DNA, que
codi�cam proteínas (íntrons), intercalados com longos segmentos de DNA não codi�cantes (éxons).
II. As sequências de íntrons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de éxons são removidas por meio de
um processo conhecido como splicing.
III. O dogma central da biologia nos mostra o �uxo de informações que vai do DNA até a formação de uma unidade
proteica, na ordem DNA > transcrição > RNAm > tradução > proteína
IV. Eucromatina é o nome dado ao padrão de cromatina desenovelado do DNA.
É correto o que se a�rma em:
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
As asserções I e II são proposições falsas.
Data Resp.: 08/11/2023 00:09:18
Explicação:
Em relação a proposição I e II são verdadeiras, pois as informações disponíveis nos bancos de dados, como
sequências de genes, quanto proteínas) possibilitam a sua utilização em pesquisa in sílico de forma rápida.
 
6.
Dinâmica molecular
Modelagem molecular
Ancoramento molecular
Alinhamento molecular
QSAR
Data Resp.: 08/11/2023 00:10:49
Explicação:
O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de dados a partir de descritores, visa buscar uma equação que
quando resolvida tenta prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor. O alinhamento
molecular visa identi�car genes que compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também
usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O ancoramento
molecular infere a modelagem molecular, para construir um modelo tridimensional e é utilizado para obter uma
pose do ligante com o alvo e a dinâmica molecular para analisar como as interações acontecem, mimetizando o
organismo.
 
7.
I e II.
II e IV.
II e III.
III e IV.
08/11/2023, 00:13 Estácio: Alunos
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Em 2017 a revista "Nature" publicou o artigo "Physical properties of the HIV-1 capsid from all-atom molecular
dynamics simulations" de Perilla & Schulten (2017), onde um supercomputador conseguiu fazer uma simulação de
todos os átomos presentes no capsídeo do vírus HIV-1 por 400 nanossegundos, foram cerca de 4 milhões de
átomos. Qual técnica da bioinformática permite realizar essa análise?
O alinhamento molecular é a técnica importante dentro da bioinformática e para o desenvolvimento de um novo
alvo terapêutico representa a primeira etapa a ser realizada. Com relação ao alinhamento molecular marque a
alternativa correta:
I e III.
Data Resp.: 08/11/2023 00:11:26
Explicação:
As sequências de éxons são transcritas em RNAm enquanto as sequências de íntrons são removidas por meio de
um processo conhecido como splicing de RNA. Os genes humanos são de grande tamanho e são constituídos de
segmentos relativamente curtos de DNA. Durante a regulação de quais genes irão ser transcritos, temos a
formação de regiões mais condensadas, que não são transcritos a heterocromatina e regiões com padrão de
cromatina desenovelado que o DNA assume quando está aberto para a chegada da maquinaria de expressão ou
replicação. O padrão desnovelado recebe o nome de eucromatina.
 
8.
Dinâmica molecular
Ancoramento molecular
Modelagem molecular
Alinhamento molecular
QSAR
Data Resp.: 08/11/2023 00:12:00
Explicação:
A dinâmica molecular é um modelo de ajuste induzido que tenta mimetizar o que acontece no ambiente real. Na
dinâmica molecular cada átomo, seja da proteína, do ligante ou da água é levado em consideração para calcular a
movimentação de todo o sistema por alguns nano ou milissegundos e entender as movimentações existentes e
assim concluir como as interações acontecem. O ancoramento molecular utiliza o modelo chave-fechadura, pois
a variável tempo não é levada em consideração. O alinhamento molecular visa identi�car genes que
compartilham funções ou determinada ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar
proteínas moldes, durante a etapa de modelagem molecular. O QSAR é uma técnica estatística de tratamento de
dados a partir de descritores, visa prever a atividade de uma molécula nova contra determinado receptor.
 
9.
É a técnica responsável por combinar duas sequencias de DNA ou proteínas para que possamos identi�car
qual é a correta.
O alinhamento é capaz de armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em RNAm.
É a técnica responsável por alinhar proteínas que serão utilizadas em uma simulação, dentro de um ambiente
virtual, o mais próximo possível da realidade.
É capaz de identi�car se diferentes espécies possuem alguma relação evolutiva ou gene com função em
comum.
 O alinhamento é capaz de modelar proteínas tridimensionais, que irão auxiliar em diversas outras técnicas de
bioinformática.
Data Resp.: 08/11/2023 00:13:12
Explicação:
O alinhamento molecular é feito pela correlação de duas ou mais sequencias de DNA ou proteínas, a partir de
um algoritmo de pontuação. Assim podemos identi�car genes que compartilham funções ou determinada
ancestralidade, podemos também usar o alinhamento para encontrar proteínas moldes, durante a etapa de
modelagem molecular. O alinhamento não armazenar informações que serão usadas para transcrever o DNA em
RNAm, não compara sequencias para dizer qual é a correta, não realiza o modelamento de proteínas e não
realiza a modelagem molecular, etapa posterior ao alinhamento e não tem a �nalidade de alinhar proteínas o
08/11/2023, 00:13 Estácio: Alunos
https://simulado.estacio.br/alunos/6/6
Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as a�rmativas a seguir:
I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade.
PORQUE
II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e
tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela
modelagem threading.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
mais próximo da realidade, e sim encontrar os melhores alinhamentos entre as proteínas já cadastradas no
banco de dados.
 
10.
As asserções I e II são proposições falsas.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
Data Resp.: 08/11/2023 00:14:46
Explicação:
O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela
modelagem por homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos
modelagem por treading, caso não realizamos a modelagem por ab initio.
    Não Respondida      Não Gravada     Gravada
Exercício por Temas inciado em 08/11/2023 00:01:45.