Bioinformatica- Simulado 1

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14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
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Aprendizado
 
Teste seu conhecimento acumulado
Disc.: BIOINFORMÁTICA   
Aluno(a): NAYARA LIMA SOARES 202104456581
Acertos: 1,6 de 2,0 25/09/2023
Acerto: 0,2  / 0,2
As proteínas são biomoléculas construídas a partir de ligações peptídicas formadas no ribossomo, com a sua
sequência dada pela ordem dos códons de RNAm, que foram transcritos do DNA. A forma que as proteínas se
consolidam depende dos resíduos de aminoácidos que as compõem. Dentre os aminoácidos existem quatro
classes: com carga (positivo ou negativo), polares (sem carga), apolares e os casos especiais (que se comportam
de forma única). Sobre esse assunto analise as a�rmativas a seguir:
I. Os aminoácidos são classi�cados em dois grandes grupos, são eles polares ou apolares.
II. O conjunto total das interações entre os resíduos forma a conformação �nal da proteína (basicamente a
forma tridimensional que ela assume) e esta é fundamental para sua função.
III. A interação entre os aminoácidos ligações de hidrogênio formando α-hélices ou dobrando sua estrutura.
 É correto o que se a�rma em:
 II e III, apenas.
I e II, apenas.
I, apenas.
I e III, apenas.
II, apenas.
Respondido em 25/09/2023 14:39:20
Explicação:
Existem quatro classes que os aminoácidos podem se incluir são eles: com carga polares (positivo ou negativo), polares
sem carga, apolares e os casos especiais (que se comportam de forma única). Dependendo da carga dos aminoácidos
que compõem uma sequência de peptídeos pode ocorrer uma interação do tipo ligação de hidrogênio e assim formar
uma α-hélice ou dobrar a sua estrutura, ou uma repulsão. Essas interações podem irão fornecer a estrutura de cada
proteína. Cada conformação tridimensional é de extrema importância para o funcionamento da proteína, pois irá
possibilitar interação com enzimas, cofatores, funcionar como um canal para a passagem seletiva de alguma
substância, entre outras funções.
Acerto: 0,2  / 0,2
O PubMed é um dos bancos de dados disponíveis no portal do NCBI. A partir dele, podemos buscar por artigos
cientí�cos da área biomédica publicados por cientistas em todo o mundo. Caso você queira direcionar a sua
busca para obter artigos mais adequados ao seu interesse, o que poderia ser feito?
 Questão / 1
a
 Questão / 2
a
https://simulado.estacio.br/alunos/inicio.asp
https://simulado.estacio.br/alunos/inicio.asp
javascript:voltar();
javascript:voltar();
14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
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Pagar uma assinatura mensal ao PubMed para que ele direcione automaticamente suas buscas de
acordo com os critérios que você deseja.
Não existe a possibilidade de direcionar a busca, é necessário avaliar todos os títulos que aparecem
como resultado para escolher aqueles mais adequados.
 Utilizar os �ltros de busca, que incluem ano e tipo de artigo, por exemplo, ou, ainda, optar pela busca
avançada.
Acessar o PubMed por meio de rede de Internet de instituição pública, como universidades ou
bibliotecas. Só assim é possível direcionar a busca por artigos.
Cadastrar seus dados pro�ssionais e receber uma autorização para acessar a parte restrita do PubMed
que permite buscas avançadas.
Respondido em 25/09/2023 14:44:12
Explicação:
Qualquer usuário pode acessar ao PubMed, via NCBI, e fazer buscas direcionadas usando �ltro ou o modo avançado.
Pode acontecer de alguns dos artigos que aparecem como resultados não estejam disponíveis para leitura de todo o
conteúdo, mas isso depende da revista em que o artigo foi publicado, e não do PubMed.
Acerto: 0,2  / 0,2
A sequência de Shine-Delgarno e as sequências das ¿pontas¿ dos íntrons são exemplos de sinais na sequência de
DNA. Esses sinais são sequências características conservadas, que marcam as regiões necessárias para que a
transcrição e tradução ocorram. Qual processo de bioinformática inclui a identi�cação desses sinais?
Montagem do genoma.
 Predição gênica.
Extração do DNA.
Construção de árvore �logenética.
Sequenciamento do genoma.
Respondido em 25/09/2023 14:44:43
Explicação:
Durante a etapa de predição gênica, uma das formas de identi�car a região de um gene ao longo da sequência de DNA
é a busca por sinais que indiquem que aquela sequencias será transcrita e traduzida. Alguns desses sinais são
diferentes entre procariotos e eucariotos, uma das razões de diferentes programas serem usados para predição
gênica desses grupos de organismos. Montagem de genomas é o processo de unir pequenos fragmentos sequenciados
na intensão de obter sequências maiores. Extração do DNA é o método que visa extrair o DNA da célula para futura
análise, como, por exemplo, o PCR e, posteriormente, o sequenciamento de uma determinada região desse material
genético, o que permite se chegar à sequência de nucleotídeos que estamos buscando. Árvores �logenéticas
representam hipóteses sobre as relações evolutivas em um grupo de organismos. Uma árvore �logenética pode ser
construída usando-se características morfológicas (formato do corpo), bioquímicas, comportamentais ou moleculares
de espécies ou outros grupos.
Acerto: 0,2  / 0,2
Durante uma análise cadeia Markoviana Monte Carlo (MCMC), o que determina quando uma cadeia se move da
árvore atual para uma nova árvore?
A cadeia rejeitará uma proposta que produza uma probabilidade de log maior do que o estado atual.
A cadeia Markoviana sempre aceitará uma proposta que seja consistente com a anterior.
 Questão / 3
a
 Questão / 4
a
14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
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A probabilidade de aceitar uma proposta depende da razão entre as probabilidades posteriores entre o
estado atual e proposto.
A cadeia Markoviana aceitará uma proposta com uma probabilidade que é �xada no início da pesquisa.
 A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado
atual.
Respondido em 25/09/2023 14:45:01
Explicação:
Gabarito: A cadeia sempre aceitará uma proposta que produza uma probabilidade posterior maior do que o estado
atual.
Justi�cativa: Uma geração MCMC sempre aceita o novo estado se a probabilidade, ou log, for maior que o estado
atual. A geração MCMC não é calculada por uma razão, nem possui uma probabilidade �xada de início. Na cadeia
Markoviana, o novo estado é sempre aceito quando possui melhor probabilidade. As vezes a cadeia Markoviana
Monte Carlo pode aceitar um ponto pior do que o anterior. Isso ocorre raramente.
Acerto: 0,2  / 0,2
A bioinformática ou biocomputação associa conhecimentos em distintas áreas do conhecimento a �m de
decifrar o código genético contido nas biomoléculas pelo estabelecimento de modelos lógico-matemáticos e
estatísticos. Tais estratégias têm assegurado a interpretação e elucidação de eventos biológicos gerados a partir
do sequenciamento de genes e proteínas. Bancos de dados de informações biológicas cada vez mais crescentes,
o desenvolvimento de novas abordagens para análise e apresentação desses dados e a investigação de novas e
complexas perguntas são as forças motrizes da bioinformática. A partir do advento dos projetos genomas,
biologistas moleculares passam a empregar ferramentas computacionais capazes de analisar grandes
quantidades de dados biológicos, a predizer funções dos genes e a demonstrar relações entre genes e proteínas.
A internet e sua capacidade de compartilhar dados, além do desenvolvimento de processadores mais rápidos e
com maior memória, desempenharam um papel decisivo para a consolidação da bioinformática como potencial
campo do conhecimento cientí�co. A partir disso, diferentes técnicas foram criadas permitindo o
reconhecimento da genética atual. Sobre as técnicas da bioinformática analise a relação entre as a�rmativas a
seguir:
I. A modelagem molecular é a técnica capaz de utilizar um modelo de ajuste induzido, a partir de uma simulação
molecular.
PORQUE
II. Visa mimetizar um ambiente o mais próximo possível do reale com isso obter diversas informações sobre a
interação entre uma proteína e o receptor.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
 As asserções I e II são proposições falsas.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
Respondido em 25/09/2023 14:45:26
Explicação:
A dinâmica molecular é a técnica capaz de utilizar um modelo de ajusto induzido, a partir de uma simulação molecular,
onde um sistema é inserido em uma caixa com água visando mimetizar um ambiente o mais próximo possível do real e
com isso obter diversas informações sobre a interação entre um ligante e o receptor. A modelagem molecular visa
achar proteínas moldes.
 Questão / 5
a
14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
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Acerto: 0,2  / 0,2
Aline é biomédica e trabalha em um laboratório para diagnóstico de doenças genéticas. Um dos genes mais
pesquisados é o brca1, que quando sofre mutações especí�cas está associado ao risco aumentado de câncer.
Para identi�car as mutações, é necessário comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência
referência não mutada. Qual banco de dados, disponível no NCBI, Aline pode consultar para conseguir uma
sequência referência curada para o gene brca1?
 RefSeq.
KEGG.
PubMed.
BLAST.
GenBank.
Respondido em 25/09/2023 14:45:49
Explicação:
O RefSeq é um banco de dados de sequências de nucleotídeos de referência, curado por funcionários do NCBI, que é o
banco que a biomédica deveria usar para conseguir comparar a sequência obtida do paciente com uma sequência
referência não mutada de forma curada. O GenBank também é um banco de dados de sequências de nucleotídeos,
mas ele não é curado. O PubMed é banco de dados de textos biomédicos. O KEGG é um banco de dados de vias
metabólicas, principalmente. Já o BLAST não é um banco de dados, e sim uma ferramenta para alinhamento de
sequências.
Acerto: 0,2  / 0,2
(Adaptado de UFCE - 2015 - Engenheiro - Área Engenharia de Pesca)
A transcritômica ou transcriptômica é a ciência que estuda o transcritoma produzido por determinada célula,
tecido ou organismo. Sobre esse tema, é correto a�rmar que:
Independente de estágio de desenvolvimento, o transcriptoma é o mesmo.
Apesar de sua aplicação em diversos campos da biologia, a transcriptômica não pode ser pesquisada a
partir de técnicas de alto desempenho e sequenciamento de nova geração (NGS).
A transcriptômica estuda o conjunto de proteínas.
 Podem haver vários transcriptomas em um único organismo.
O transcriptoma é o mesmo em todos tecidos e órgãos.
Respondido em 25/09/2023 14:46:24
Explicação:
O transcriptoma estuda o conjunto de RNAs, que varia de acordo com a condição a qual a célula está exposta,
portanto, se estudar diferentes tipos de células o transcriptoma será distinto. Além disso, o transcriptoma depende do
estágio de desenvolvimento e em cada indivíduo pode haver vários transcriptomas. O transcriptoma pode ser
estudado pelo sequenciamento de nova geração, realizando a pré-etapa de síntese do DNA complementar.
Acerto: 0,0  / 0,2
Observe o caldograma abaixo:
 Questão / 6
a
 Questão / 7
a
 Questão / 8
a
14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
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Imagem: Leandro Pederneiras
A seguir são listadas alguns grupos de espécies. Analise as alternativas que, segundo o cladograma, se refere a
um grupo poli�lético.
O conjunto de espécies W X Y
 O conjunto de espécies N O P
 O conjunto de espécies H I
O conjunto de espécies S T
O conjunto de espécies A B C D
Respondido em 25/09/2023 14:46:42
Explicação:
Gabarito: O conjunto de espécies H I
Justi�cativa: O grupo poli�lético é um conjunto de táxons que não inclui o ancestral comum de todos os seus
membros. Ao analisar as alternativas, aquela que representa um grupo proli�lético, é o conjunto de espécies H I
porque possuem origem em linhagens amplamente desconexas. Os conjuntos de espécies listados nas outras
alternativas (conjunto de espécies N, O, P; conjunto de espécies W X Y; conjunto de espécies A B C D e o conjunto de
espécies S T) apresentam um ancestral comum.
Acerto: 0,0  / 0,2
Sobre a técnica de modelagem molecular analise a relação entre as a�rmativas a seguir:
I. O método de modelagem a ser escolhido depende da igualdade.
PORQUE
II. Uma igualdade superior a 25% podemos optar pela modelagem por homologia. Se for abaixo desse valor e
tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos modelagem por ab initio, caso não, optamos pela
modelagem threading.
A respeito dessas asserções, assinale a opção correta:
 As asserções I e II são proposições verdadeiras e a II é uma justi�cativa da I.
 As asserções I e II são proposições falsas.
As asserções I e II são proposições verdadeiras, mas a II não é uma justi�cativa da I.
A asserção I é uma proposição verdadeira enquanto a II é falsa.
 Questão / 9
a
14/11/2023, 09:33 Estácio: Alunos
https://simulado.estacio.br/alunos/ 6/6
A asserção I é uma proposição falsa e a II é uma proposição verdadeira.
Respondido em 25/09/2023 14:47:13
Explicação:
O método de modelagem a ser escolhido depende da identidade, caso seja acima de 25% podemos optar pela
modelagem por homologia, se for abaixo desse valor e tivermos o enovelamento do molde conhecido usamos
modelagem por treading, caso não realizamos a modelagem por ab initio.
Acerto: 0,2  / 0,2
Em uma análise utilizando a PCR, Lucas encontrou como resultado a ampli�cação de várias regiões
diferentes do DNA das amostras analisadas. O que ele esperava era encontrar apenas uma região
ampli�cada, somente nas amostras positivas. Para solucionar o problema, seu chefe sugeriu, então, que ele
desenhasse um novo par de primers e prestasse atenção no comprimento em nucleotídeos, para melhorar a
especi�cidade. Você diria para Lucas desenhar um novo par de primers com um comprimento maior ou
menor que o par de primers que ele havia usado primeiro?
Menor, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
 Maior, pois assim aumenta a chance dos primers se ligarem somente na região alvo.
Menor, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
Maior, dessa forma os primers podem se ligar a diferentes regiões ao longo do genoma.
Igual, pois o comprimento não interfere na especi�cidade dos primers.
Respondido em 25/09/2023 14:47:31
Explicação:
A especi�cidade de um primer garante que a região copiada seja realmente a que você deseja, e não outra qualquer.
No caso exposto, houve ampli�cação de várias sequências não desejadas e, para melhorar a especi�cidade, faz-se
necessário aumentar o número de nucleotídeos, pois quanto maior o comprimento de um primer, mais especí�co ele é.
Sequências pequenas de primers podem ocorrer aleatoriamente ao longo do DNA, e não somente na região de
interesse. Quando você usa mais nucleotídeos, você especí�ca melhor o alvo e permite que ele seja ampli�cado
apenas na região desejada.
 Questão / 10
a