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GENÉTICA BÁSICA E EVOLUÇÃO A4: Replicação de DNA e recombinação Elvino Ferreira h ttp s: //p t. w ik ip ed ia .o rg /w ik i/C ar l_ S a ga n CARL SAGAN A vida não extinta... Hereditariedade! A maioria das descobertas científicas foi a descoberta da ignorância. http ://w w w . scielo.br/sc ie lo.p hp? scrip t= sci_ a rttext& p id = S 0 36 5-05 96 20 07 00 0 40 0 011 Ex.: Sindrome de Bloom Doença autossômica recessiva rara. Caracteriza-se por fotossensibilidade, retardo de crescimento, hipogonadismo, imunodeficiência e predisposição para desenvolvimento de malignidades. É causada por mutação no gene BLM (15q26.1), que codifica a proteína DNA helicase, essencial à manutenção da estabilidade cromossômica. Há aumento de quebras e rearranjos, com trocas entre cromátides irmãs e formação de figuras tri ou quadri-radiais. A instabilidade cromossômica é responsável pelo fenótipo e pela tendência para malignidades dos pacientes. A rápida e acurada replicação do DNA é fundamental para as funções normais e saúde da célula In a schoolyard game, a verbal message, such as “John’s brown dog ran away from home,” is whispered to a child, who runs to a second child and repeats the message. Fazer na turma... ht tp s: //r ev is ta op al a di no .b lo gs po t.c om .b r/ 20 16 /1 1/ o- he re ge -7 -o -e fe ito -t el e fo ne -s e m -f io .h tm l Ex.: Um zigoto humano unicelular contém 6 bilhões de pares de base de DNA. Um erro/ 1 milhão de pares = 6.000 erros, cometidos a cada vez que a célula se dividisse e se acumulando a cada uma das milhões de divisões celulares que ocorrem no desenvolvimento humano. ht tp :// w w w .d a ce lu la ao si st em a. uf f. br /? p= 4 6 2 Replicação do DNA = “duplicação” = cópias completas de seus genes (informações) PRECISÃO!!!! Ex.: Mesmo a uma taxa de erro 0,01% (1 erro/10.000 nucleotídeos) = alterações significativas nos genes de um organismo de multiplicação rápida, como uma bactéria, transformando sequencias vitais e sequencias sem sentido. h ttp :/ /w w w 5 .u sp .b r/ ta g/ la b or at o rio -d e -m e ta b ol is m o- e - re pr o du ca o- de -o rg an is m os -a q ua tic os / Cópia do DNA = precisa e rápida!!!! Ex.: Para o cromossomo circular único de E. coli : 4,7 milhões pares de bases;. Taxa de replicação de mais de 1000 nucleotideos/minuto = ~3 dias (copiar tudo) X E coli são capazes de se dividir em 20 minutos. Realmente replica seu DNA a uma taxa de 1000 nucleotídeos por segundo, com menos de um erro por bilhão. Como este processo extraordinariamente preciso e rápido é realizado? ht tp s: //w w w .r e su m o e sc ol a r. co m .b r/ bi o lo g ia /e - co li/ Resposta... Replicação SEMICONSERVATIVA Experimento de Meselson & Stahl MODOS DE REPLICAÇÃO Diferenças em relação ao DNA circular e linear Quantidades de forquilhas Unidades individuais = replicons (Or) •Replicação Teta •Replicação em bulbo •Replicação Linear (eucariotos) http://www.bionova.org.es/biocast/documentos/figura/figtem19/imagenest19/imagepages/image21.html John Cairns (Theta replication, 1963) Síntese a partir 3´-OH terminal DNA-polimerases (adicionar nucleótidos apenas nos 3´ e NÃO nos 5 ´) Alongamento sempre de 5´ para 3´ Antiparalelismos http://bioweb.uwlax.edu/GenWeb/Molecular/Theory/DNA%20structure/dna_structure.htm ?????????? http s://w w w .yo u tu be .c o m /w a tch ? v= P M 3D 1U 0M V P M http://p t.slid esh a re.n e t/sara b r/a u la 3- replicacao União dos nucleotídeos da ponta 3’ A principal complexidade da replicação do DNA é que os dois filamentos não podem ser tratados do mesmo modo. ht tp s: //t w itt er .c om /o ka za ki 24 8 Tuneko Okazaki Reiji Okazaki Replicação contínua (5´ para 3´) = leading strand Replicação descontínua (3´para 5´) = lagging strand Fragmentos de Okazaki Todas DNA polimerase precisam de um nucleotídeo com um grupo 3’-OH ao qual um novo nucleotídeo pode ser adicionado (então... Primer) http://arch ive. cnx.org/conte nts/d81 4406 6 -8d 3c-45c4 -a 8c1-3c5 925 3 ff99d@ 3/dn a -replication ht tp :// cn x. or g/ co nt en ts /d a8 ba c1 1- 2 7f 4 -4 8 be -8 3d e- ba 9 84 89 1c 89 e@ 5 /d n a- re pl ic at io n MECANISMOS DE REPLICAÇÃO Inicialização Relaxamento Elongamento Terminação Ex.: replicação bacteriana Inicialização oriC (245 pb) Relaxamento Helicase (quebra das pontes de H) Single-Strand-Binding (SSB) proteins = estabilidade Elongamento DNA girase (Topoisomerases) Primase (sintetisa Primers = R-3’ OH) DNA polimerase Terminação DNA ligase Acesse: https://www.youtube.com/watch?v=dRBgmZ8Iozc FIDELIDADE DA REPLICAÇÃO < 1 erro/ bilhão de nucleotídeos Síntese = revisão (proofreading) Situações de “reparo incompatível” (mismatch repair) Tomas Lindahl, Paul Modrich e Aziz Sancar (esq. para a dir.), que receberam o Prêmio Nobel de Química (Justin Tallis/AFP) ht tp s: //v ej a .a br il. co m .b r/ ci en ci a /r e p ar o -d e -d n a- e - fu n da m e nt a l-p ar a -p re ve nc ao -e -t ra ta m en to -d o -c a nc er / http://www2.nau.edu/~fpm/bio205/lect8.html I. Comparison of Prokaryotes vs Eukaryotes genomes Organism genome size # chromosomes shape 1. Virus (s stranded) 5 x 103 bp 1 circular 2. E. coli 5 x 106 bp 1 circular 3. Yeast 1.5 x 109 bp 16 linear 4. Human 3 x 109 bp 23 linear Alguns pensaram: o genoma em E. coli é 5 x106 bp = 1,7 x 106 nm = 1,7 x 103mm. No entanto, o tamanho da E. coli é de apenas 5 mm !!! Como eles podem empacotar tanta informação genética em uma área tão pequena? https://pt.wikipedia.org/wiki/Helicase Primer = iniciador RNA polimerase III coloca o primer – primase (primossomo) DNA polimerase I continua a síntese e/ou remove o Okazaki Fragmentos unidos pela DNA Ligase Problema topológico: DNA = hélice (dupla) X duplicação = “deselicolização” Ex.: DNA E coli tem 4.000 kb, ou 400.000 giros da hélice de comprimento e precisa ser duplicada em 20 minutos. A consequência disso é que, a dupla hélice giraria a uma velocidade de 20.000 rpm. Enzimas que deseliconizam a dupla hélice são chamadas de DNA topoisomerases, e se agrupam em 3 classes (I-5’; I-3’ e a II = DNA girase) Não há de fato o giro da dupla hélice e sim quebras transitórias (separação diante da forquilha; “ziper” = NÃO). E para os CROMOSSOMAS??? h ttp :// w w w .te lo m er o. co m .b r/ se ca o/ nu tr ig en et ic a /o - p ro ce ss o- e nv el he ci m e nt o /8 7 4/ te lo m er o s- e- a -t el om er a se Limite de Hayflick: Na extremidade do cromossomo não há fragmento de Okazaki vizinho para fornecer a hidroxila necessária, resultando na replicação incompleta da extremidade do cromossomo. Ex.: Protozoário Tetrahymana TELÔMERO: a extremidade livre de um cromossomo, formada por sequências repetidas de ADN, cuja função é garantir que cada ciclo de replicação seja completado. http://faculty.jsd.claremont.edu/ewiley/about.php Telomerase Obs.: Também está envolvida no desenvolvimento de cânceres https://www.youtube.com/watch?v=2hXmzMq13J4 BASES MOLECULAR DA RECOMBINAÇÃO Cromossomas homólogos Recombinação (variabilidade) Precisão entre moléculas Há evidências genéticas que o CO ocorre depois da síntese do DNA Mecanismos pouco compreendidos h ttp :// ib bi o .p b w or ks .c o m /w /p ag e/ 36 70 33 35 /T o pi c% 20 10 % 3A % 20 G e ne tic s% 20 H L Modelo Holliday Obs.: NINIDRINA •Reação com PTNs (-NH2) •Com a degradação > exposiçãodo –NH2 e > evidenciação ht tp s: // b ra in ly .c o m .b r/ ta re fa /2 32 2 5 5 78 ht tp s: // w w w .r e se ar ch g a te .n et /fi gu re /Im pr e ss ao -d ig ita l- re ve la d a- co m -n in id rin a -e m -p a pe l_ fig 2_ 2 62 4 30 57 5 BENJAMIM A. PIERCE. Genética: Um enfoque conceitual.. www.whfreeman.com/pierce - Chapter 12: Overview of replication; Bidirecional replication of DNA; Coordination of leadings and lagging strand synthesis; Nucleotide polymerization by DNA polymerase. VASCONCELLOS, L. F. R. et al . Síndrome psicótica evoluindo com demência como manifestação clinica de deleção do DNA mitocondrial. Arq. Neuro-Psiquiatr., São Paulo , v. 65, n. 1, p. 114-117, Mar. 2007. Available from <http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0004- 282X2007000100023&lng=en&nrm=iso>. access on 06 Sept. 2017. TAREFA: Herança mitocondrial: Sindrome de Merrf (myoclonic epilepsy with ragged red fibers) https://es.slideshare.net/DanielLira92/enfermedades-mitocondriales-44131660 h ttp s: //r a di o no va e ra b ra si lia .w or d pr es s. co m /ta g /b ud a/ ALAN WATTS “Desejar sentimentos positivos é um sentimento negativo. Aceitar sentimentos negativos e um sentimento positivo”. “A ideia de que quanto mais tentamos nos sentir bem o tempo todo, mas insatisfeitos ficamos, pois a busca por alguma coisa só reforça o fato de que não a temos”. h tt p: //w w w 2. u ol .c o m .b r/ vi ve rm en te /a rt ig o s/ b ot ox _a lte ra _e xp re ss o es _ fa ci a is _ e_ in flu e nc ia _ se nt im en to s. h t m l Slide 1 Slide 2 Slide 3 Slide 4 Slide 5 Slide 6 Slide 7 Slide 8 Slide 9 Slide 10 Slide 11 Slide 12 Slide 13 Slide 14 Slide 15 Slide 16 Slide 17 Slide 18 Slide 19 Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Slide 32 Slide 33 Slide 34 Slide 35 Slide 36 Slide 37 Slide 38 Slide 39 Slide 40 Slide 41 Slide 42 Slide 43