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Regulação da expressão gênica As propriedades biológicas de cada tipo de célula eucariótica são amplamente determinadas pelas proteínas expressas dentro dela. ✓ Organismos procariontes e eucariontes são sensíveis à pequenas variações do meio ambiente, tais como a disponibilidade de nutrientes, sinais hormonais, etc. ✓ Assim a regulação da expressão dos seus genes às necessidades celulares objetiva uma melhor adaptação às variações do meio. ✓ Genes para os produtos que são requeridos durante todo o tempo são expressos em níveis constantes. São os chamados genes da economia doméstica (housekeeping). ✓ A expressão invariável destes genes é denominada de expressão gênica constitutiva. Ex. Enzimas do Ciclo de Krebs ✓ Genes que são expressos em resposta a sinais moleculares enquadram-se na expressão gênica regulada. Estes genes podem ser induzidos ou reprimidos de acordo com as necessidades celulares Princípios da regulação gênica Essa constelação de proteínas expressas determina uma grande parte da arquitetura da célula, suas atividades enzimáticas, suas interações com o seu ambiente e muitas outras propriedades fisiológicas. •Regulação gênica é o processo de controlar quais genes no DNA da célula são expressos (usados para produzir um produto funcional como uma proteína). •Diferentes células em um organismo multicelular podem expressar conjuntos de genes muito diferentes, apesar de possuírem o mesmo DNA. •O conjunto de genes expressos em uma célula determina o grupo de proteínas e RNAs funcionais que ela possui, conferindo-lhe suas características únicas. Se o produto final é uma proteína, a regulação pode ser alcançada por meio do controle da transcrição do DNA em RNA ou da tradução do RNA em proteína. • Regulação gênica transcricional. • Regulação gênica pós-transcricional. • Regulação gênica pós-traducional • Mecanismos epigenéticos. Os padrões de expressão gênica eucariótica podem ser extraordinariamente complexos A quantidade de transcritos produzida variam amplamente entre os genes eucarióticos. Um gene pode ser transcrito apenas durante um estágio do desenvolvimento e outro apenas na presença de uma infecção viral. Finalmente, a maioria dos genes em uma célula eucariótica está desligada em qualquer momento. Com base nessas considerações isoladamente, a regulação gênica eucariótica deve ser capaz de: ✓Assegurar que a expressão da maior parte dos genes no genoma esteja desligada em qualquer momento enquanto ocorre a ativação de um subgrupo de genes. ✓Gerar milhares de padrões de expressão gênica. Constitutivos Genes tecido-específicos A regulação da transcrição de genes não é simplesmente dependente da presença ou ausência de fatores de transcrição DNA-binding que por sua vez ligam ou desligam genes, mas também envolve processos que determinam a capacidade de fatores de transcrição acessarem e se ligarem em seu DNA alvo. Regulação Gênica em Eucariotos Genes A iniciação da transcrição é o ponto mais crítico do controle da expressão gênica; por isso os genes eucarióticos possuem muito mais regiões regulatórias upstream da ‘open reading frame’. ✓ Estrutura de promotores ✓ Elementos de controle cis e trans ✓ Alteração de cromatina ✓ Acetilação de histonas ✓ Metilações da ilhas de CpG encontradas nos sítios de início da transcrição Controle transcricional Em genética, chama-se fase de leitura aberta a cada uma das sequências de DNA compreendidas entre um códon de início da tradução e um códon de terminação Controle transcricional Como os genes eucarióticos são capazes de exibir enorme número e diversidade de padrões de expressão? O maquinário necessário para a geração de tantos padrões de transcrição gênica in vivo apresenta muitos componentes, incluindo as proteínas reguladoras de ação trans e as sequências de DNA reguladoras de ação cis. ✓ Inicio da transcrição: Proteínas de ação trans interagem com sequências reguladoras de ação cis no DNA denominadas elementos proximais do promotor. ✓Os Fatores de transcrição se ligam às sequências reguladoras de ação cis no DNA denominadas acentuadores. Como os genes eucarióticos são capazes de exibir enorme número e diversidade de padrões de expressão? • Elementos trans – proteínas codificadas por outra molécula de DNA ou por genes distantes que precisam se locomover para chegar ao promotor que será regulado. • Elementos cis – sequências presentes no promotor ou no enhancer do gene regulado. Elementos de ação Cis Cerne promotor e elementos proximais ao promotor. ✓O cerne promotor, refere-se a região do sítio de início da transcrição. Incluindo o TATA box (O TATA box é um dos principais promotores eucarióticos conhecidos e encontra-se a 5' do ponto de início da transcrição da grande maioria dos genes). ✓ Este promotor é incapaz de mediar por si mesmo, uma transcrição eficiente. ✓Os elementos proximais ao promotor estão dentro do sítio de inicio da transcrição. Elementos de ação Cis Cerne promotor e elementos proximais ao promotor. ✓O cerne promotor, refere-se a região do sítio de início da transcrição. Incluindo o TATA box (O TATA box é um dos principais promotores eucarióticos conhecidos e encontra-se a 5' do ponto de início da transcrição da grande maioria dos genes). ✓ Este promotor é incapaz de mediar por si mesmo, uma transcrição eficiente. ✓Os elementos proximais ao promotor estão dentro do sítio de inicio da transcrição. Acentuadores: Sequências de ação cis que podem aumentar muito a taxa de transcrição dos promotores na mesma molécula de DNA. Silenciadores: Sequência de ação cis que são ligados a repressores, inibindo assim os ativadores e reduzindo a transcrição. Elementos de ação cis independentes da distância. ✓ Proteína que se liga ao TATA box (TATA-Binding Protein TBP) Para que a transcrição realmente se inicie é necessário que haja o reconhecimento do TATA box por uma proteína específica, conhecida como TBP – TATA Binding Protein. Essa enzima faz parte do fator de transcrição TFIID e tem uma alta afinidade pela sequência consenso desse elemento. ✓ Fatores transcricionais (TFIIA, TFIIB, TFIID, TFIIE, TFIIF,TFIIH) Elementos de ação Trans ✓ Modificações de histonas, por acetilação: Consiste na adição de um radical acetil (COCH3) nos resíduos de lisina das histonas e ocorre por meio de enzimas chamadas Histona Acetil-Transferases (HATs). A acetilação das histonas resulta na descompactação da cromatina, o que permite a expressão gênica. Mecanismos moleculares que medeiam a remodelação da cromatina: Mecanismos moleculares que medeiam a remodelação da cromatina: ✓ Adição de grupos químicos às bases do DNA, como metilação das ilhas CpGs - A metilação consiste na adição de um radical metil (CH3) no carbono 5 da base nitrogenada citosina. Após a adição do radical metil, a base nitrogenada metilada passa a se chamar 5-metil-citosina. Promotores que apresentam metilação de ilhas CpG se mostram transcricionalmente silentes: a inativação do gene se dá pelo reconhecimento dessa marca de metilação por proteínas do tipo MBD que, por sua vez, recruta enzimas que promovem a remodelação de cromatina, tais como HDAC e HMT, tornando o lócus inativo. Por outro lado, promotores não metilados são permissivos à transcrição gênica. ✓ Controle pós-transcricional ✓ Splicing alternativo ✓ Estabilidade do mRNA ✓ Estratégias de regulação pós-traducional ✓ miRNAs: pequenos RNA citoplasmáticos envolvidos no silenciamento do RNAm. E-mail Jorge.ferreira@faminasbh.edu.br Obrigado Jorge Ferreira mailto:Jorge.ferreira@faminasbh.edu.br