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MICROBIOLOGIA DO SOLO UNIVERSIDADE FEDERAL RURAL DO RIO DE JANEIRO INSTITUTO DE VETERINÁRIA DEPARTAMENTO DE MICROBIOLOGIA E IMUNOLOGIA VETERINÁRIA IV-244 MICROBIOLOGIA AMBIENTAL Irene da Silva Coelho Microrganismos São abundantes ▪ 1.000.000.000.000.000.000.000.000.000.00 0 (nonilhão) = 1030 células microbianas Pelo menos duas a três ordens de grandeza a mais do que todas as células vegetais e animais juntas Estimava-se que que nosso planeta era habitado por quase 10 milhões de espécies (107) Estimativa baseada quase exclusivamente em espécies que podem ser vistas a olho nu. Microrganismos Microrganismos Alta diversidade 99,999% das espécies não foram identificadas (1012) ▪ Grande reservatório de microrganismos ▪ Grande abundância e diversidade de microrganismos Solos Um grama de solo pode conter até 1 bilhão (1 x 109) de bactérias e cem milhões (1 x 108) de espécies (Fierer, 2017) ▪ Direta ou indiretamente recebe todos os dejetos dos seres vivos ▪ Local de transformação da matéria orgânica – IMPORTANCIA NO CICLO BIOGEOQUÍMICO Solos A ABNT (NBR 6502) define solo como “Material proveniente da decomposição das rochas pela ação de agentes físicos ou químicos, podendo ou não ter matéria orgânica”, ou simplesmente, produto da decomposição e desintegração da rocha pela ação de agentes atmosféricos. Conceito de solo Solo como habitat para microrganismos Fierer, 2017 O efeito rizosférico Rizosfera: Representa o volume do solo que se estende de 1 mm a vários milímetros a partir da superfície das raízes, sendo caracterizada por altas concentrações de material orgânico prontamente disponível. Raízes de plantas Distribuição dos microrganismos no solo • Condições físico-químicas (textura do solo, disponibilidade de água, oxigênio, pH etc) • Disponibilidade de matéria orgânica •Componente minerais intemperizados • Raízes • Disponibilidade de luz •etc MICRORGANISMOS PODEM SER UTILIZADOS COMO INDICADORES DE QUALIDADE DE SOLO Distribuição dos microrganismos ao longo do perfil do solo Profundidade Concentração decrescente de microorganismos com a profundidade, acompanhando a matéria orgânica do solo. Distribuição de microrganismos no perfil do solo (no x 103 . g-1) Profundidade (cm) Bactérias aeróbicas Bactérias anaeróbicas Actinomicetos Fungos Algas 3-8 7800 1950 2080 119 25 20-25 1800 379 245 50 5 35-40 472 96 49 14 0,5 65-75 10 1 5 6 0,1 135-145 1 0,40 - - - Distribuição dos microrganismos no solo Tamanho, número e biomassa dos grupos de organismos encontrados no solo Grupo Exemplo Tamanho (m) Número (nº. g-1) Biomassa (Kg massa fresca ha-1 ) Vírus Bactérias Actinomicetos Fungos Algas Protozoários Nematóides Minhocas TMV Pseudomonas Streptomyces Mucor Chlorella Euglena Pratylenchus Lumbricus 0,02 x0,3 0,5 x 1,5 0,5 x 2,0 8,0* 5 x 13 15x 50 1.000** 100.000** 1010 -1011 108 – 109 107 – 108 105 – 106 103 – 106 103 – 105 101 – 102 300 – 3.000 300 – 3.000 500 – 5.000 10 – 1.500 5 –200 1 – 100 10 – 1.000 *diâmetro; ** comprimento Total: 1.200 – 14.000 Kg ha-1 Distribuição dos microrganismos no solo 1- Gênese do solo: espécies fotossintéticas e fixadoras do nitrogêneo (Algas, Cianobactérias e fungos - liquens) Liquens – associação simbiótica entre algas ou cianobactérias e fungos Anabaena Papel dos microrganismos nos solos ▪ O metabolismo das algas é importante para formação do solo porque: (a) durante seu crescimento, produzem e liberam ácido carbônico, que auxilia na intemperização de partículas minerais ao seu redor; (b) fornecem um aporte de carbono orgânico por meio da fotossíntese; (c) produzem grandes quantidades de exopolissacarídeos que na agregação de partículas orgânicas e minerais do solo Papel dos microrganismos nos solos 2- Agregação do solo: • À medida que um solo é colonizado, as partículas constituintes são unidas por microrganismos filamentosos que crescem na superfície de partículas adjacentes, criando uma extensa rede de hifas que conectam as partículas de solo. • Microrganismos e as raízes das plantas contribuem para a formação dos agregados por meio da produção de exopolissacarídeos. Papel dos microrganismos nos solos • Ciclo do C – fixação de CO2 (bactérias fotoautotróficas e quimioautotróficas); Respiração aeróbica, anaeróbica e fermentação ; metanogênese e metanotrofia • Ciclo do N – FBN, nitrificação, desnitrificação; etc. •...; Ciclo do S; Ciclo do P.... FERTILIDADE DOS SOLOS Papel dos microrganismos nos solos Decomposição da matéria orgânica Decomposição da matéria orgânica Aumento da eficiência da planta na absorção de água, fósforo, nitrogênio e outros nutrientes Bactérias diazotróficas, bactérias promotoras de crescimento, fungos micorrízicos, etc. FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO (FBN) Processo pelo qual o nitrogênio atmosfério (N2) é captado da atmosfera, e convertido em compostos nitrogenados como amônia BACTÉRIAS DIAZOTRÓFICAS COMPLEXO NITROGENASE Reação de redução do N2 atmosférico pela nitrogenase (N≡N) N2 + 8e + 8H+ 2NH3 + H2 ATP, Mg Nitrogenase FIXAÇÃO BIOLÓGICA DE NITROGÊNIO (FBN) BACTÉRIAS DIAZOTRÓFICAS - De vida livre – Azotobacter, Beijerinckia, Azospirillum - MUTUALÍSTICAS – Rhizobium, Frankia, algumas cianobactérias ASSOCIAÇAO MUTUALÍSTICA ENTRE BACTÉRIAS DIAZOTRÓFICAS E PLANTAS LEGUMINOSAS Nódulos radiculares da soja. Os nódulos se desenvolvem pela infecção por Rhizobium sp. ASSOCIAÇAO MUTUALÍSTICA ENTRE BACTÉRIAS DIAZOTRÓFICAS E PLANTAS LEGUMINOSAS Plantação de soja em solo pobre em nitrogênio (A) Plantas desprovidas de nódulos (B) Plantas noduladas Associações mutualísticas entre fungos do solo e raízes de plantas Fungos micorrízicos MICORRIZAS Gimnospermas: Pinus, Pinheiro,Acacia, Cedrus, Sequola, Angiospermas: Milho, arroz, coco, trigo, alho, cebola Feijao, amendoim, soja, lentilha, acerola http://www.acceleronsas.com/ResourceLibrary/Articles/ Pages/Mycorrhizae.aspx Benefícios dos fungos micorrízicos Raízes Crescimento da raiz • Promoção para maior crescimento das raízes Eficiência na absorção água • Maior alcance à agua do solo • Fornece maior área superficial para maior absorção de água • Aumento da área superficial das raízes (aumento de 50X na absorção de água e nutrientes) Eficiência na absorção de nutrientes • Maior alcance aos nutrientes do solo • Excreção de ácidos orgânicos → liberação de nutrientes Sem micorriza Com micorriza http://www.acceleronsas.com/ResourceLibrary/Articles/Pages/Mycorrhizae.aspx http://www.acceleronsas.com/ResourceLibrary/Articles/Pages/Mycorrhizae.aspx ❖ Controle biológico de doenças e pragas da agricultura (Bactéria: Bacillus thurigiensis e fungo: Metahizium anisopliae) Bacillus thuringiensis (Bactéria) x insetos-praga - Bactéria em forma de bastonete gram-positiva, anaeróbica facultativa, produtora de esporos - Entomopatogênica –parasita de insetos Bacillus thuringiensis (Bactéria) x insetos-praga - Cry1, que atua sobre lepidópteros (borboletas); - Cry3, que atua sobre coleópteros (besouros); - Cry4, que atua sobre dípteros (moscas e mosquitos) ❖ Biorremediação “Processos que usam microrganismos de ocorrência natural (leveduras, fungos e bactérias) visando à decomposição e, ou degradação de substâncias nocivas a compostos menos tóxicos ou inócuos.” (EPA-USA) “Estratégia ou processo que usa microrganismos, plantas ou ambos, visando à transformação ou degradação de contaminantes presentes no solo ou em outros ambientes.” ❖ Biorremediação http://archive.bio.ed.ac.uk/jdeacon/microbes/penicill.htm ❖ Bioprospecção de metabólitos como antibióticos Slide 1: MICROBIOLOGIA DO SOLO Slide 2 Slide 3 Slide 4 Slide 5 Slide 6 Slide 7 Slide 8 Slide 9 Slide 10 Slide 11 Slide 12 Slide 13 Slide 14 Slide 15 Slide 16 Slide 17 Slide 18 Slide 19Slide 20 Slide 21 Slide 22 Slide 23 Slide 24 Slide 25 Slide 26 Slide 27 Slide 28 Slide 29 Slide 30 Slide 31 Slide 32 Slide 33