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UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARÁ INSTITUTO DE CIÊNCIAS BIOLÓGICAS Transcrição e Processamento do RNA Transcrição e Processamento do RNA O que é a Transcrição? DNA PROTEÍNA Transcrição e Processamento do RNA Aspectos Comuns: Polaridade 5’ 3’; Necessidade de um molde; Inicia a partir de uma sequência específica – sequência de iniciação 3 fases: Iniciação (reconhecimento do promotor), alongamento e terminação (acoplada ao processamento) Aspectos Diferenciais: Não requer “primer” (iniciador); Apenas um segmento de DNA é Transcrito; Uma das fitas de DNA serve como molde; Transcrição X Replicação OS GENES SÃO SEGMENTOS DE DNA Transcrição e Processamento do RNA A RNA polimerase copia uma das fitas do DNA em RNA Fita senso ou codificante: sequência “idêntica” a do mRNA Fita antisenso ou molde: sequência complementar a do mRNA 5’-AUG AAG UUC UCC ACC UUU UUG GCA GUA GGG GCU GCC CUU GAA UAA-3’ 5’-ATG AAG TTC TCC ACC TTT TTG GCA GTA GGG GCT GCC CTT GAA TAA-3’ 3’-TAC TTC AAG AGG TGG AAA AAC CGT CAT CCC CGA CGG GAA CTT ATT-5’ DNA M K F S T F L A V G A A L E stop N-terminal C-terminal Proteína Síntese Protéica (Tradução) Transcrição Qual das 2 fitas foi a molde ??? mRNA Transcrição e Processamento do RNA Diferenças entre DNA e RNA DNA x RNA Transcrição e Processamento do RNA Principais tipos de RNA RNA Transportador RNA Ribossômico RNA Mensageiro RNA Funcional Transcrição e Processamento do RNA Tipos de RNA Transcrição e Processamento do RNA Estrutura do RNAt: Transcrição e Processamento do RNA RNA Polimerase em Procariontes: Holoenzima: a2bb’s. Fator s: início da transcrição. Cerne da enzima: a2bb: alongamento da cadeia. Iniciação das cadeias de RNA • Envolve 3 etapas: –Ligação da holoenzima da RNA polimerase à região promotora (DNA) –Deselicoidização localizada –Formação das ligações fosfodiéster do RNA nascente • A holoenzima permanece até 6 a 8 nucleotídeos do RNA nascente • Fator sigma é liberado – Cerne - Alongamento Transcrição e Processamento do RNA Iniciação da Transcrição Promotor Holoenzima RNApol de E. coli + iniciação Alongamento RNA nascente Desligamento do transcrito + + Cerne de RNApol b a a s b a a s b b ' a a b b ' a a Região Promotora • Regiões de reconhecimento e ligação da RNApol na cadeia de DNA. • Pontos -35 e -10 variam pouco de gene para gene – seqüências consenso • Box -10 5’ TATAAT 3’ - deselicoidização • Box -35 5’ TTGACA 3’ – liga-se a subunidade s Transcrição e Processamento do RNA AACTGT TTGACA Box -35 A T A T T A T A T A A T Início da transcrição 5-9 pb A ou G T C ou 3’ 5’ 3’ 5’ 16-19pb PribnowBox Alongamento das cadeias de RNA • Catalisado pelo cerne da enzima da RNApol • Adição dos ribonucleotídeos ocorre dentro da “bolha de transcrição” • Deselicoidização e helicoidização. • Estabilidade – complexo DNA/RNA/RNApol Transcrição e Processamento do RNA Término das cadeias de RNA • Sinal de término • Complexo transcricional se dissocia. • Dois tipos de terminadores: – Proteína rô (r) – Terminadores rô-dependentes – Terminadores rô-independentes Transcrição e Processamento do RNA Transcrição e Processamento do RNA Terminadores rô-independentes Região rica em G:C seguida de 6 pb A(molde):T Estrutura em forma de grampo Terminadores rô-dependentes • A proteína rô é hexamérica que interage com o crescimento do RNA transcrito e rompe a associação entre o RNA nascente e o DNA molde. • As seqüências de terminação rô-dependentes tem de 50 a 90pb e especificam transcritos ricos em unidades C (desprovidos de G) • Se liga a um sítio chamado “rut” • Mecanismo pouco conhecido Transcrição e Processamento do RNA Transcrição e Processamento do RNA Transcrição em Eucariontes Transcrição em eucariotos • O mecanismo básico da transcrição em eucariotos é similar ao de procariotos. • Existem muito mais proteínas associadas a transcrição de eucariotos, resultando em um processo mais complexo. Transcrição e Processamento do RNA Um tipo de TFII chamado TBP são proteínas que se ligam ao sítio TATA e que têm função de atrair outros fatores gerais de transcrição para essas regiões promotoras... A montagem do complexo de iniciação é dependente da entrada orquestrada de vários fatores gerais de transcrição (GTF). GTF são chamadas de TFIIA, TFIIB...: função de identificar onde a RNApol deverá se ligar. Transcrição e Processamento do RNA 5´ 3´ Início da Transcrição Promotor Região 5´ não- traduzida (5´UTR) Códon iniciador Códon finalizador Sinal de poliadenilação Íntrons Éxons Região 3´ não-traduzida (3´UTR) Término da cadeia de RNA • Pontas 3’ produzidas por clivagem endonucleotídica; • Seqüência conservada AAUAAA – 11 pb • Adição da cauda poli(A) – Poli(A) polimerase Transcrição e Processamento do RNA Transcrição e Processamento do RNA Adição da cauda poli A ao pré-RNA mensageiro Transcrição e Processamento do RNA Diferenças • Há três RNA polimerases • Cada enzima codifica diferentes classes de genes • Requer mais fatores acessórios para ligação ao promotor e iniciação da transcrição • Os transcritos de eucariotos sofrem modificações para o transporte no citoplasma – tradução. – Revestimento CAP – 5’ – Caudas poli-A – 3’ – Splicing Transcrição e Processamento do RNA RNA Polimerase Eucariótica 3 RNA polimerases, onde cada uma transcreve um tipo de RNA. Enzima Produto RNA pol I rRNA RNA pol II mRNA RNA pol III tRNA; rRNA 5S e pequenos RNAs nucleares Transcrição e Processamento do RNA Processamento do RNA • Adição da estrutura CAP na extremidade 5’ • Adição da cauda poli(A) na extremidade 3’ • Splicing nuclear do pré-mRNA Modificações químicas nas extremidades dos mRNAs eucarióticos • As 2 extremidades do RNAm são modificadas de diferentes maneiras • A extremidade 5' são revestidas e as 3' poliadeniladas. 1. Todos os RNAs-m formam um "quepe" – O nucleotídeo m7G é adicionado à um RNA-m após a transcrição, através de um processo de duas etapas, com a metilação ocorrendo somente após a adição de uma base G padronizada. – a ligação na estrutura "CAP" ocorre entre os carbonos 5' de dois nucleotídeos adjacentes 2. A maioria dos RNAm eucarióticos são poliadenilados • A adição de um longo segmento com mais de 250 nucleotídeos de Adenina, na extremidade 3' da molécula, produzindo a "CAUDA POLI-A": ...pNpNpApApA... • A poliadenilação não ocorre na extremidade 3' do transcrito primário. • Os poucos nucleotídeos finais são removidos por clivagem entre 10-30 nucleotídeos "downstream" de um sinal específico de poliadenilação (a seqüência consenso 5'-AAUAAA-3‘) produzindo uma extremidade 3' intermediária, à qual a cauda de poli-A é subseqüentemente adicionada pela enzima POLI-A POLIMERASE. • O tamanho da cauda poli-A determina o tempo de sobrevivência do RNA-m no citoplasma. Modificações químicas nas extremidades dos mRNAs eucarióticos EDIÇÃO DO RNA • Na edição a seqüência de nucleotídeos do RNAm é alterada pela inserçãode novos nucleotídeos, ou pela deleção ou mudança daqueles que já existem. • O fenômeno tem de ocorrer com absoluta precisão, senão a mensagem genética será embaralhada. Transcrição e Processamento do RNA Recomposição do Pré-mRNA: Spliceossomos Recomposição do Pré- mRNA nuclear: RNA/Proteína: Spliceossomos. Spliceossomos: Conj de pequenas mol de RNA (snRNA) + 40 proteínas diferentes. Transcrição e Processamento do RNA Transcrição e Processamento do RNA Sítios de Splicing • Apenas Eucariotos • Remove partes internas do novo transcrito de RNA. • Ocorre no núcleo da célula Transcrição e Processamento do RNA Splicing DNA RNA Transcrito Introns removidos por splicing mRNA Diferentes combinações de éxons podem ser usados para fazer diferentes proteínas (splicing alternativo) um gene Uma proteina Transcrição e Processamento do RNA Os íntrons são removidos antes do mRNA sair do núcleo Splicing Alternativo Splicing Alternativo • Diferentes padrões de splicing da mesma sequencia de mRNA. Diferentes produtos do mesmo gene. • Diferentes orgãos, diferentes estagios do desenvolvimento da mesma célula. Transcrição e Processamento do RNA
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